MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
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UBR4 | polymorphism_automatic | 0.249241466586954 | simple_aae | affected | M4867L | single base exchange | rs12584 | show file | |||
UBR4 | polymorphism_automatic | 0.249241466586954 | simple_aae | affected | M4867L | single base exchange | rs12584 | show file | |||
UBR4 | polymorphism_automatic | 0.249241466586954 | simple_aae | affected | M574L | single base exchange | rs12584 | show file | |||
UBR4 | polymorphism_automatic | 0.249241466586954 | simple_aae | affected | M4860L | single base exchange | rs12584 | show file | |||
UBR4 | polymorphism_automatic | 0.249241466586954 | simple_aae | affected | M4843L | single base exchange | rs12584 | show file | |||
UBR4 | polymorphism_automatic | 0.249241466586954 | simple_aae | affected | M531L | single base exchange | rs12584 | show file | |||
UBR4 | polymorphism_automatic | 0.249241466586954 | simple_aae | affected | M390L | single base exchange | rs12584 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.750758533413046 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr1:19413261T>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | UBR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000375254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_020765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q5T4S7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.14599A>T cDNA.14627A>T g.123510A>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | M4867L Score: 15 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 4867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs12584
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regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
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splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 15552 / 15552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 5184 / 5184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 15580 / 15580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 29 / 29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 15516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 15437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 15552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 14599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 14627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 123510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 19413261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLERLVV SSLEALESCF AVGPIIEKER NKNAAQELAT LLLSLPAPAS VQQQSKSLLA SLHTSRSAYH SHKDQALLSK AVQCLNTSSK EGKDLDPEVF QRLVITARSI AIMRPNNLVH FTESKLPQME TEGMDEGKEP QKQLEGDCCS FITQLVNHFW KLHASKPKNA FLAPACLPGL THIEATVNAL VDIIHGYCTC ELDCINTASK IYMQMLLCPD PAVSFSCKQA LIRVLRPRNK RRHVTLPSSP RSNTPMGDKD DDDDDDADEK MQSSGIPNGG HIRQESQEQS EVDHGDFEMV SESMVLETAE NVNNGNPSPL EALLAGAEGF PPMLDIPPDA DDETMVELAI ALSLQQDQQG SSSSALGLQS LGLSGQAPSS SSLDAGTLSD TTASAPASDD EGSTAATDGS TLRTSPADHG GSVGSESGGS AVDSVAGEHS VSGRSSAYGD ATAEGHPAGP GSVSSSTGAI STTTGHQEGD GSEGEGEGET EGDVHTSNRL HMVRLMLLER LLQTLPQLRN VGGVRAIPYM QVILMLTTDL DGEDEKDKGA LDNLLSQLIA ELGMDKKDVS KKNERSALNE VHLVVMRLLS VFMSRTKSGS KSSICESSSL ISSATAAALL SSGAVDYCLH VLKSLLEYWK SQQNDEEPVA TSQLLKPHTT SSPPDMSPFF LRQYVKGHAA DVFEAYTQLL TEMVLRLPYQ IKKITDTNSR IPPPVFDHSW FYFLSEYLMI QQTPFVRRQV RKLLLFICGS KEKYRQLRDL HTLDSHVRGI KKLLEEQGIF LRASVVTASS GSALQYDTLI SLMEHLKACA EIAAQRTINW QKFCIKDDSV LYFLLQVSFL VDEGVSPVLL QLLSCALCGS KVLAALAASS GSSSASSSSA PVAASSGQAT TQSKSSTKKS KKEEKEKEKD GETSGSQEDQ LCTALVNQLN KFADKETLIQ FLRCFLLESN SSSVRWQAHC LTLHIYRNSS KSQQELLLDL MWSIWPELPA YGRKAAQFVD LLGYFSLKTP QTEKKLKEYS QKAVEILRTQ NHILTNHPNS NIYNTLSGLV EFDGYYLESD PCLVCNNPEV PFCYIKLSSI KVDTRYTTTQ QVVKLIGSHT ISKVTVKIGD LKRTKMVRTI NLYYNNRTVQ AIVELKNKPA RWHKAKKVQL TPGQTEVKID LPLPIVASNL MIEFADFYEN YQASTETLQC PRCSASVPAN PGVCGNCGEN VYQCHKCRSI NYDEKDPFLC NACGFCKYAR FDFMLYAKPC CAVDPIENEE DRKKAVSNIN TLLDKADRVY HQLMGHRPQL ENLLCKVNEA APEKPQDDSG TAGGISSTSA SVNRYILQLA QEYCGDCKNS FDELSKIIQK VFASRKELLE YDLQQREAAT KSSRTSVQPT FTASQYRALS VLGCGHTSST KCYGCASAVT EHCITLLRAL ATNPALRHIL VSQGLIRELF DYNLRRGAAA MREEVRQLMC LLTRDNPEAT QQMNDLIIGK VSTALKGHWA NPDLASSLQY EMLLLTDSIS KEDSCWELRL RCALSLFLMA VNIKTPVVVE NITLMCLRIL QKLIKPPAPT SKKNKDVPVE ALTTVKPYCN EIHAQAQLWL KRDPKASYDA WKKCLPIRGI DGNGKAPSKS ELRHLYLTEK YVWRWKQFLS RRGKRTSPLD LKLGHNNWLR QVLFTPATQA ARQAACTIVE ALATIPSRKQ QVLDLLTSYL DELSIAGECA AEYLALYQKL ITSAHWKVYL AARGVLPYVG NLITKEIARL LALEEATLST DLQQGYALKS LTGLLSSFVE VESIKRHFKS RLVGTVLNGY LCLRKLVVQR TKLIDETQDM LLEMLEDMTT GTESETKAFM AVCIETAKRY NLDDYRTPVF IFERLCSIIY PEENEVTEFF VTLEKDPQQE DFLQGRMPGN PYSSNEPGIG PLMRDIKNKI CQDCDLVALL EDDSGMELLV NNKIISLDLP VAEVYKKVWC TTNEGEPMRI VYRMRGLLGD ATEEFIESLD STTDEEEDEE EVYKMAGVMA QCGGLECMLN RLAGIRDFKQ GRHLLTVLLK LFSYCVKVKV 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mutated AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLERLVV SSLEALESCF AVGPIIEKER NKNAAQELAT LLLSLPAPAS VQQQSKSLLA SLHTSRSAYH SHKDQALLSK AVQCLNTSSK EGKDLDPEVF QRLVITARSI AIMRPNNLVH FTESKLPQME TEGMDEGKEP QKQLEGDCCS FITQLVNHFW KLHASKPKNA FLAPACLPGL THIEATVNAL VDIIHGYCTC ELDCINTASK IYMQMLLCPD PAVSFSCKQA LIRVLRPRNK RRHVTLPSSP RSNTPMGDKD DDDDDDADEK MQSSGIPNGG HIRQESQEQS EVDHGDFEMV SESMVLETAE NVNNGNPSPL EALLAGAEGF PPMLDIPPDA DDETMVELAI ALSLQQDQQG SSSSALGLQS LGLSGQAPSS SSLDAGTLSD TTASAPASDD EGSTAATDGS TLRTSPADHG GSVGSESGGS AVDSVAGEHS VSGRSSAYGD ATAEGHPAGP GSVSSSTGAI STTTGHQEGD GSEGEGEGET EGDVHTSNRL HMVRLMLLER LLQTLPQLRN VGGVRAIPYM QVILMLTTDL DGEDEKDKGA LDNLLSQLIA ELGMDKKDVS KKNERSALNE VHLVVMRLLS VFMSRTKSGS KSSICESSSL ISSATAAALL SSGAVDYCLH VLKSLLEYWK SQQNDEEPVA TSQLLKPHTT SSPPDMSPFF LRQYVKGHAA DVFEAYTQLL TEMVLRLPYQ IKKITDTNSR IPPPVFDHSW FYFLSEYLMI QQTPFVRRQV RKLLLFICGS KEKYRQLRDL HTLDSHVRGI KKLLEEQGIF LRASVVTASS GSALQYDTLI SLMEHLKACA EIAAQRTINW QKFCIKDDSV LYFLLQVSFL VDEGVSPVLL QLLSCALCGS KVLAALAASS GSSSASSSSA PVAASSGQAT TQSKSSTKKS KKEEKEKEKD GETSGSQEDQ LCTALVNQLN KFADKETLIQ FLRCFLLESN SSSVRWQAHC LTLHIYRNSS KSQQELLLDL MWSIWPELPA YGRKAAQFVD LLGYFSLKTP QTEKKLKEYS QKAVEILRTQ NHILTNHPNS NIYNTLSGLV EFDGYYLESD PCLVCNNPEV PFCYIKLSSI KVDTRYTTTQ QVVKLIGSHT ISKVTVKIGD LKRTKMVRTI NLYYNNRTVQ AIVELKNKPA RWHKAKKVQL TPGQTEVKID LPLPIVASNL MIEFADFYEN YQASTETLQC PRCSASVPAN PGVCGNCGEN VYQCHKCRSI NYDEKDPFLC NACGFCKYAR FDFMLYAKPC CAVDPIENEE DRKKAVSNIN TLLDKADRVY HQLMGHRPQL ENLLCKVNEA APEKPQDDSG TAGGISSTSA SVNRYILQLA QEYCGDCKNS FDELSKIIQK VFASRKELLE YDLQQREAAT KSSRTSVQPT FTASQYRALS VLGCGHTSST KCYGCASAVT EHCITLLRAL ATNPALRHIL VSQGLIRELF DYNLRRGAAA MREEVRQLMC LLTRDNPEAT QQMNDLIIGK VSTALKGHWA NPDLASSLQY EMLLLTDSIS KEDSCWELRL RCALSLFLMA VNIKTPVVVE NITLMCLRIL QKLIKPPAPT SKKNKDVPVE ALTTVKPYCN EIHAQAQLWL KRDPKASYDA WKKCLPIRGI DGNGKAPSKS ELRHLYLTEK YVWRWKQFLS RRGKRTSPLD LKLGHNNWLR QVLFTPATQA ARQAACTIVE ALATIPSRKQ QVLDLLTSYL DELSIAGECA AEYLALYQKL ITSAHWKVYL AARGVLPYVG NLITKEIARL LALEEATLST DLQQGYALKS LTGLLSSFVE VESIKRHFKS RLVGTVLNGY LCLRKLVVQR TKLIDETQDM LLEMLEDMTT GTESETKAFM AVCIETAKRY NLDDYRTPVF IFERLCSIIY PEENEVTEFF VTLEKDPQQE DFLQGRMPGN PYSSNEPGIG PLMRDIKNKI CQDCDLVALL EDDSGMELLV NNKIISLDLP VAEVYKKVWC TTNEGEPMRI VYRMRGLLGD ATEEFIESLD STTDEEEDEE EVYKMAGVMA QCGGLECMLN RLAGIRDFKQ GRHLLTVLLK LFSYCVKVKV NRQQLVKLEM NTLNVMLGTL NLALVAEQES KDSGGAAVAE QVLSIMEIIL DESNAEPLSE DKGNLLLTGD KDQLVMLLDQ INSTFVRSNP SVLQGLLRII PYLSFGEVEK MQILVERFKP YCNFDKYDED HSGDDKVFLD CFCKIAAGIK NNSNGHQLKD LILQKGITQN ALDYMKKHIP SAKNLDADIW KKFLSRPALP FILRLLRGLA IQHPGTQVLI GTDSIPNLHK LEQVSSDEGI GTLAENLLEA LREHPDVNKK IDAARRETRA EKKRMAMAMR QKALGTLGMT TNEKGQVVTK TALLKQMEEL IEEPGLTCCI CREGYKFQPT KVLGIYTFTK RVALEELENK PRKQQGYSTV SHFNIVHYDC HLAAVRLARG REEWESAALQ NANTKCNGLL PVWGPHVPES AFATCLARHN TYLQECTGQR EPTYQLNIHD IKLLFLRFAM EQSFSADTGG GGRESNIHLI PYIIHTVLYV LNTTRATSRE EKNLQGFLEQ PKEKWVESAF EVDGPYYFTV LALHILPPEQ WRATRVEILR RLLVTSQARA VAPGGATRLT DKAVKDYSAY RSSLLFWALV DLIYNMFKKV PTSNTEGGWS CSLAEYIRHN DMPIYEAADK ALKTFQEEFM PVETFSEFLD VAGLLSEITD PESFLKDLLN SVP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.91 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.750758533413046 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr1:19413261T>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | UBR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000375267 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q5T4S7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.14599A>T cDNA.14603A>T g.123510A>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | M4867L Score: 15 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 4867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs12584
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 15615 / 15615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 5205 / 5205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 15619 / 15619 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 5 / 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 15555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 15500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 15615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 14599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 14603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 123510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 19413261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLERLVV SSLEALESCF AVGPIIEKER NKNAAQELAT LLLSLPAPAS VQQQSKSLLA SLHTSRSAYH SHKDQALLSK AVQCLNTSSK EGKDLDPEVF QRLVITARSI AIMRPNNLVH FTESKLPQME TEGMDEGKEP QKQLEGDCCS FITQLVNHFW KLHASKPKNA FLAPACLPGL THIEATVNAL VDIIHGYCTC ELDCINTASK IYMQMLLCPD PAVSFSCKQA LIRVLRPRNK RRHVTLPSSP RSNTPMGDKD DDDDDDADEK MQSSGIPNGG HIRQESQEQS EVDHGDFEMV SESMVLETAE NVNNGNPSPL EALLAGAEGF PPMLDIPPDA DDETMVELAI ALSLQQDQQG SSSSALGLQS LGLSGQAPSS SSLDAGTLSD TTASAPASDD EGSTAATDGS TLRTSPADHG GSVGSESGGS AVDSVAGEHS VSGRSSAYGD ATAEGHPAGP GSVSSSTGAI STTTGHQEGD GSEGEGEGET EGDVHTSNRL HMVRLMLLER LLQTLPQLRN VGGVRAIPYM QVILMLTTDL DGEDEKDKGA LDNLLSQLIA ELGMDKKDVS KKNERSALNE VHLVVMRLLS VFMSRTKSGS KSSICESSSL ISSATAAALL SSGAVDYCLH VLKSLLEYWK SQQNDEEPVA TSQLLKPHTT SSPPDMSPFF LRQYVKGHAA DVFEAYTQLL TEMVLRLPYQ IKKITDTNSR IPPPVFDHSW FYFLSEYLMI QQTPFVRRQV RKLLLFICGS KEKYRQLRDL HTLDSHVRGI KKLLEEQGIF LRASVVTASS GSALQYDTLI SLMEHLKACA EIAAQRTINW QKFCIKDDSV LYFLLQVSFL VDEGVSPVLL QLLSCALCGS KVLAALAASS GSSSASSSSA PVAASSGQAT TQSKSSTKKS KKEEKEKEKD GETSGSQEDQ LCTALVNQLN KFADKETLIQ FLRCFLLESN SSSVRWQAHC LTLHIYRNSS KSQQELLLDL MWSIWPELPA YGRKAAQFVD LLGYFSLKTP QTEKKLKEYS QKAVEILRTQ NHILTNHPNS NIYNTLSGLV EFDGYYLESD PCLVCNNPEV PFCYIKLSSI KVDTRYTTTQ QVVKLIGSHT ISKVTVKIGD LKRTKMVRTI NLYYNNRTVQ AIVELKNKPA RWHKAKKVQL TPGQTEVKID LPLPIVASNL MIEFADFYEN YQASTETLQC PRCSASVPAN PGVCGNCGEN VYQCHKCRSI NYDEKDPFLC NACGFCKYAR FDFMLYAKPC CAVDPIENEE DRKKAVSNIN TLLDKADRVY HQLMGHRPQL ENLLCKVNEA APEKPQDDSG TAGGISSTSA SVNRYILQLA QEYCGDCKNS FDELSKIIQK VFASRKELLE YDLQQREAAT KSSRTSVQPT FTASQYRALS VLGCGHTSST KCYGCASAVT EHCITLLRAL ATNPALRHIL VSQGLIRELF DYNLRRGAAA MREEVRQLMC LLTRDNPEAT QQMNDLIIGK VSTALKGHWA NPDLASSLQY EMLLLTDSIS KEDSCWELRL RCALSLFLMA VNIKTPVVVE NITLMCLRIL QKLIKPPAPT SKKNKDVPVE ALTTVKPYCN EIHAQAQLWL KRDPKASYDA WKKCLPIRGI DGNGKAPSKS ELRHLYLTEK YVWRWKQFLS RRGKRTSPLD LKLGHNNWLR QVLFTPATQA ARQAACTIVE ALATIPSRKQ QVLDLLTSYL DELSIAGECA AEYLALYQKL ITSAHWKVYL AARGVLPYVG NLITKEIARL LALEEATLST DLQQGYALKS LTGLLSSFVE VESIKRHFKS RLVGTVLNGY LCLRKLVVQR TKLIDETQDM LLEMLEDMTT GTESETKAFM AVCIETAKRY NLDDYRTPVF IFERLCSIIY PEENEVTEFF VTLEKDPQQE DFLQGRMPGN PYSSNEPGIG PLMRDIKNKI CQDCDLVALL EDDSGMELLV NNKIISLDLP VAEVYKKVWC TTNEGEPMRI VYRMRGLLGD ATEEFIESLD STTDEEEDEE EVYKMAGVMA QCGGLECMLN RLAGIRDFKQ GRHLLTVLLK LFSYCVKVKV NRQQLVKLEM NTLNVMLGTL NLALVAEQES KDSGGAAVAE QVLSIMEIIL DESNAEPLSE DKGNLLLTGD KDQLVMLLDQ INSTFVRSNP SVLQGLLRII PYLSFGEVEK MQILVERFKP YCNFDKYDED HSGDDKVFLD CFCKIAAGIK NNSNGHQLKD LILQKGITQN ALDYMKKHIP SAKNLDADIW KKFLSRPALP FILRLLRGLA IQHPGTQVLI GTDSIPNLHK LEQVSSDEGI GTLAENLLEA LREHPDVNKK IDAARRETRA EKKRMAMAMR QKALGTLGMT TNEKGQVVTK TALLKQMEEL IEEPGLTCCI CREGYKFQPT KVLGIYTFTK RVALEEMENK PRKQQGYSTV SHFNIVHYDC HLAAVRLARG REEWESAALQ NANTKCNGLL PVWGPHVPES AFATCLARHN TYLQECTGQR EPTYQLNIHD IKLLFLRFAM EQSFSADTGG GGRESNIHLI PYIIHTVLYV LNTTRATSRE EKNLQGFLEQ PKEKWVESAF EVDGPYYFTV LALHILPPEQ WRATRVEILR RLLVTSQARA VAPGGATRLT DKAVKDYSAY RSSLLFWALV DLIYNMFKKQ TTPTVGGIDT GSLEPCVCEK VPTSNTEGGW SCSLAEYIRH NDMPIYEAAD KALKTFQEEF MPVETFSEFL DVAGLLSEIT DPESFLKDLL NSVP* | 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mutated AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLERLVV SSLEALESCF AVGPIIEKER NKNAAQELAT LLLSLPAPAS VQQQSKSLLA SLHTSRSAYH SHKDQALLSK AVQCLNTSSK EGKDLDPEVF QRLVITARSI AIMRPNNLVH FTESKLPQME TEGMDEGKEP QKQLEGDCCS FITQLVNHFW KLHASKPKNA FLAPACLPGL THIEATVNAL VDIIHGYCTC ELDCINTASK IYMQMLLCPD PAVSFSCKQA LIRVLRPRNK RRHVTLPSSP RSNTPMGDKD DDDDDDADEK MQSSGIPNGG HIRQESQEQS EVDHGDFEMV SESMVLETAE NVNNGNPSPL EALLAGAEGF PPMLDIPPDA DDETMVELAI ALSLQQDQQG SSSSALGLQS LGLSGQAPSS SSLDAGTLSD TTASAPASDD EGSTAATDGS TLRTSPADHG GSVGSESGGS AVDSVAGEHS VSGRSSAYGD ATAEGHPAGP GSVSSSTGAI STTTGHQEGD GSEGEGEGET EGDVHTSNRL HMVRLMLLER LLQTLPQLRN VGGVRAIPYM QVILMLTTDL DGEDEKDKGA LDNLLSQLIA ELGMDKKDVS KKNERSALNE VHLVVMRLLS VFMSRTKSGS KSSICESSSL ISSATAAALL SSGAVDYCLH VLKSLLEYWK SQQNDEEPVA TSQLLKPHTT SSPPDMSPFF LRQYVKGHAA DVFEAYTQLL TEMVLRLPYQ IKKITDTNSR IPPPVFDHSW FYFLSEYLMI QQTPFVRRQV RKLLLFICGS KEKYRQLRDL HTLDSHVRGI KKLLEEQGIF LRASVVTASS GSALQYDTLI SLMEHLKACA EIAAQRTINW QKFCIKDDSV LYFLLQVSFL VDEGVSPVLL QLLSCALCGS KVLAALAASS GSSSASSSSA PVAASSGQAT TQSKSSTKKS KKEEKEKEKD GETSGSQEDQ LCTALVNQLN KFADKETLIQ FLRCFLLESN SSSVRWQAHC LTLHIYRNSS KSQQELLLDL MWSIWPELPA YGRKAAQFVD LLGYFSLKTP QTEKKLKEYS QKAVEILRTQ NHILTNHPNS NIYNTLSGLV EFDGYYLESD PCLVCNNPEV PFCYIKLSSI KVDTRYTTTQ QVVKLIGSHT ISKVTVKIGD LKRTKMVRTI NLYYNNRTVQ AIVELKNKPA RWHKAKKVQL TPGQTEVKID LPLPIVASNL MIEFADFYEN YQASTETLQC PRCSASVPAN PGVCGNCGEN VYQCHKCRSI NYDEKDPFLC NACGFCKYAR FDFMLYAKPC CAVDPIENEE DRKKAVSNIN TLLDKADRVY HQLMGHRPQL ENLLCKVNEA APEKPQDDSG TAGGISSTSA SVNRYILQLA QEYCGDCKNS FDELSKIIQK VFASRKELLE YDLQQREAAT KSSRTSVQPT FTASQYRALS VLGCGHTSST KCYGCASAVT EHCITLLRAL ATNPALRHIL VSQGLIRELF DYNLRRGAAA MREEVRQLMC LLTRDNPEAT QQMNDLIIGK VSTALKGHWA NPDLASSLQY EMLLLTDSIS KEDSCWELRL RCALSLFLMA VNIKTPVVVE NITLMCLRIL QKLIKPPAPT SKKNKDVPVE ALTTVKPYCN EIHAQAQLWL KRDPKASYDA WKKCLPIRGI DGNGKAPSKS ELRHLYLTEK YVWRWKQFLS RRGKRTSPLD LKLGHNNWLR QVLFTPATQA ARQAACTIVE ALATIPSRKQ QVLDLLTSYL DELSIAGECA AEYLALYQKL ITSAHWKVYL AARGVLPYVG NLITKEIARL LALEEATLST DLQQGYALKS LTGLLSSFVE VESIKRHFKS RLVGTVLNGY LCLRKLVVQR TKLIDETQDM LLEMLEDMTT GTESETKAFM AVCIETAKRY NLDDYRTPVF IFERLCSIIY PEENEVTEFF VTLEKDPQQE DFLQGRMPGN PYSSNEPGIG PLMRDIKNKI CQDCDLVALL EDDSGMELLV NNKIISLDLP VAEVYKKVWC TTNEGEPMRI VYRMRGLLGD ATEEFIESLD STTDEEEDEE EVYKMAGVMA QCGGLECMLN RLAGIRDFKQ GRHLLTVLLK LFSYCVKVKV NRQQLVKLEM NTLNVMLGTL NLALVAEQES KDSGGAAVAE QVLSIMEIIL DESNAEPLSE DKGNLLLTGD KDQLVMLLDQ INSTFVRSNP SVLQGLLRII PYLSFGEVEK MQILVERFKP YCNFDKYDED HSGDDKVFLD CFCKIAAGIK NNSNGHQLKD LILQKGITQN ALDYMKKHIP SAKNLDADIW KKFLSRPALP FILRLLRGLA IQHPGTQVLI GTDSIPNLHK LEQVSSDEGI GTLAENLLEA LREHPDVNKK IDAARRETRA EKKRMAMAMR QKALGTLGMT TNEKGQVVTK TALLKQMEEL IEEPGLTCCI CREGYKFQPT KVLGIYTFTK RVALEELENK PRKQQGYSTV SHFNIVHYDC HLAAVRLARG REEWESAALQ NANTKCNGLL PVWGPHVPES AFATCLARHN TYLQECTGQR EPTYQLNIHD IKLLFLRFAM EQSFSADTGG GGRESNIHLI PYIIHTVLYV LNTTRATSRE EKNLQGFLEQ PKEKWVESAF EVDGPYYFTV LALHILPPEQ WRATRVEILR RLLVTSQARA VAPGGATRLT DKAVKDYSAY RSSLLFWALV DLIYNMFKKQ TTPTVGGIDT GSLEPCVCEK VPTSNTEGGW SCSLAEYIRH NDMPIYEAAD KALKTFQEEF MPVETFSEFL DVAGLLSEIT DPESFLKDLL NSVP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.87 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.750758533413046 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr1:19413261T>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | UBR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000375224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q5T4S7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.1720A>T cDNA.2204A>T g.123510A>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | M574L Score: 15 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs12584
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 2673 / 2673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 891 / 891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 3157 / 3157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 485 / 485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 3093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 2558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 2673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 1720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 2204 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 123510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 19413261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLEDMTTGTE SETKAFMAVC IETAKRYNLD DYRTPVFIFE RLCSIIYPEE NEVTEFFVTL EKDPQQEDFL QGRMPGNPYS SNEPGIGPLM RDIKNKICQD CDLVALLEDD SGMELLVNNK IISLDLPVAE VYKKVWCTTN EGEPMRIVYR MRGLLGDATE EFIESLDSTT DEEEDEEEVY KMAGVMAQCG GLECMLNRLA GIRDFKQGRH LLTVLLKLFS YCVKVKVNRQ QLVKLEMNTL NVMLGTLNLA LVAEQESKDS GGAAVAEQVL SIMEIILDES NAEPLSEDKG NLLLTGDKDQ LVMLLDQINS TFVRSNPSVL QGLLRIIPYL SFGEVEKMQI LVERFKPYCN FDKYDEDHSG DDKVFLDCFC KIAAGIKNNS NGHQLKDLIL QKGITQNALD YMKKHIPSAK NLDADIWKKF LSRPALPFIL RLLRGLAIQH PGTQVLIGTD SIPNLHKLEQ VSSDEGIGTL AENLLEALRE HPDVNKKIDA ARRETRAEKK RMAMAMRQKA LGTLGMTTNE KGQVVTKTAL LKQMEELIEE PGLTCCICRE GYKFQPTKVL GIYTFTKRVA LEEMENKPRK QQGYSTVSHF NIVHYDCHLA AVRLARGREE WESAALQNAN TKCNGLLPVW GPHVPESAFA TCLARHNTYL QECTGQREPT YQLNIHDIKL LFLRFAMEQS FSADTGGGGR ESNIHLIPYI IHTVLYVLNT TRATSREEKN LQGFLEQPKE KWVESAFEVD GPYYFTVLAL HILPPEQWRA TRVEILRRLL VTSQARAVAP GGATRLTDKA VKDYSAYRSS LLFWALVDLI YNMFKKVPTS NTEGGWSCSL AEYIRHNDMP IYEAADKALK TFQEEFMPVE TFSEFLDVAG LLSEITDPES FLKDLLNSVP * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MLEDMTTGTE SETKAFMAVC IETAKRYNLD DYRTPVFIFE RLCSIIYPEE NEVTEFFVTL EKDPQQEDFL QGRMPGNPYS SNEPGIGPLM RDIKNKICQD CDLVALLEDD SGMELLVNNK IISLDLPVAE VYKKVWCTTN EGEPMRIVYR MRGLLGDATE EFIESLDSTT DEEEDEEEVY KMAGVMAQCG GLECMLNRLA GIRDFKQGRH LLTVLLKLFS YCVKVKVNRQ QLVKLEMNTL NVMLGTLNLA LVAEQESKDS GGAAVAEQVL SIMEIILDES NAEPLSEDKG NLLLTGDKDQ LVMLLDQINS TFVRSNPSVL QGLLRIIPYL SFGEVEKMQI LVERFKPYCN FDKYDEDHSG DDKVFLDCFC KIAAGIKNNS NGHQLKDLIL QKGITQNALD YMKKHIPSAK NLDADIWKKF LSRPALPFIL RLLRGLAIQH PGTQVLIGTD SIPNLHKLEQ VSSDEGIGTL AENLLEALRE HPDVNKKIDA ARRETRAEKK RMAMAMRQKA LGTLGMTTNE KGQVVTKTAL LKQMEELIEE PGLTCCICRE GYKFQPTKVL GIYTFTKRVA LEELENKPRK QQGYSTVSHF NIVHYDCHLA AVRLARGREE WESAALQNAN TKCNGLLPVW GPHVPESAFA TCLARHNTYL QECTGQREPT YQLNIHDIKL LFLRFAMEQS FSADTGGGGR ESNIHLIPYI IHTVLYVLNT TRATSREEKN LQGFLEQPKE KWVESAFEVD GPYYFTVLAL HILPPEQWRA TRVEILRRLL VTSQARAVAP GGATRLTDKA VKDYSAYRSS LLFWALVDLI YNMFKKVPTS NTEGGWSCSL AEYIRHNDMP IYEAADKALK TFQEEFMPVE TFSEFLDVAG LLSEITDPES FLKDLLNSVP * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 1.02 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.750758533413046 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr1:19413261T>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | UBR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000375217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q5T4S7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.14578A>T cDNA.14582A>T g.123510A>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | M4860L Score: 15 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 4860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs12584
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regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
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distance from splice site | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 15531 / 15531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 5177 / 5177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 15535 / 15535 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 5 / 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 15471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 15416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 15531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 14578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 14582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 123510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 19413261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLERLVV SSLEALESCF AVGPIIEKER NKNAAQELAT LLLSLPAPAS VQQQSKSLLA SLHTSRSAYH SHKDQALLSK AVQCLNTSSK EGKDLDPEVF QRLVITARSI AIMRPNNLVH FTESKLPQME TDCFFPRCAC WSLGIVGILI GAPLETPSPE GMDEGKEPQK QLEGDCCSFI TQLVNHFWKL HASKPKNAFL APACLPGLTH IEATVNALVD IIHGYCTCEL DCINTASKIY MQMLLCPDPA VSFSCKQALI RVLRPRNKRR HVTLPSSPRS NTPMGDKDDD DDDDADEKMQ SSGIPNGGHI RQESQEQSEV DHGDFEMVSE SMVLETAENV NNGNPSPLEA LLAGAEGFPP MLDIPPDADD ETMVELAIAL SLQQDQQAPA SDDEGSTAAT DGSTLRTSPA DHGGSVGSES GGSAVDSVAG EHSVSGRSSA YGDATAEGHP AGPGSVSSST GAISTTTGHQ EGDGSEGEGE GETEGDVHTS NRLHMVRLML LERLLQTLPQ LRNVGGVRAI PYMQVILMLT TDLDGEDEKD KGALDNLLSQ LIAELGMDKK DVSKKNERSA LNEVHLVVMR LLSVFMSRTK SGSKSSICES SSLISSATAA ALLSSGAVDY CLHVLKSLLE YWKSQQNDEE PVATSQLLKP HTTSSPPDMS PFFLRQYVKG HAADVFEAYT QLLTEMVLRL PYQIKKITDT NSRIPPPVFD HSWFYFLSEY LMIQQTPFVR RQVRKLLLFI CGSKEKYRQL RDLHTLDSHV RGIKKLLEEQ GIFLRASVVT ASSGSALQYD TLISLMEHLK ACAEIAAQRT INWQKFCIKD DSVLYFLLQV SFLVDEGVSP VLLQLLSCAL CGSKVLAALA ASSGSSSASS SSAPVAASSG QATTQSKSST KKSKKEEKEK EKDGETSGSQ EDQLCTALVN QLNKFADKET LIQFLRCFLL ESNSSSVRWQ AHCLTLHIYR NSSKSQQELL LDLMWSIWPE LPAYGRKAAQ FVDLLGYFSL KTPQTEKKLK EYSQKAVEIL RTQNHILTNH PNSNIYNTLS GLVEFDGYYL ESDPCLVCNN PEVPFCYIKL SSIKVDTRYT TTQQVVKLIG SHTISKVTVK IGDLKRTKMV RTINLYYNNR TVQAIVELKN KPARWHKAKK VQLTPGQTEV KIDLPLPIVA SNLMIEFADF YENYQASTET LQCPRCSASV PANPGVCGNC GENVYQCHKC RSINYDEKDP FLCNACGFCK YARFDFMLYA KPCCAVDPIE NEEDRKKAVS NINTLLDKAD RVYHQLMGHR PQLENLLCKV NEAAPEKPQD DSGTAGGISS TSASVNRYIL QLAQEYCGDC KNSFDELSKI IQKVFASRKE LLEYDLQQRE AATKSSRTSV QPTFTASQYR ALSVLGCGHT SSTKCYGCAS AVTEHCITLL RALATNPALR HILVSQGLIR ELFDYNLRRG AAAMREEVRQ LMCLLTRDNP EATQQMNDLI IGKVSTALKG HWANPDLASS LQYEMLLLTD SISKEDSCWE LRLRCALSLF LMAVNIKTPV VVENITLMCL RILQKLIKPP APTSKKNKDV PVEALTTVKP YCNEIHAQAQ LWLKRDPKAS YDAWKKCLPI RGIDGNGKAP SKSELRHLYL TEKYVWRWKQ FLSRRGKRTS PLDLKLGHNN WLRQVLFTPA TQAARQAACT IVEALATIPS RKQQVLDLLT SYLDELSIAG ECAAEYLALY QKLITSAHWK VYLAARGVLP YVGNLITKEI ARLLALEEAT LSTDLQQGYA LKSLTGLLSS FVEVESIKRH FKSRLVGTVL NGYLCLRKLV VQRTKLIDET QDMLLEMLED MTTGTESETK AFMAVCIETA KRYNLDDYRT PVFIFERLCS IIYPEENEVT EFFVTLEKDP QQEDFLQGRM PGNPYSSNEP GIGPLMRDIK NKICQDCDLV ALLEDDSGME LLVNNKIISL DLPVAEVYKK VWCTTNEGEP MRIVYRMRGL LGDATEEFIE SLDSTTDEEE DEEEVYKMAG VMAQCGGLEC MLNRLAGIRD FKQGRHLLTV LLKLFSYCVK VKVNRQQLVK LEMNTLNVML GTLNLALVAE QESKDSGGAA VAEQVLSIME IILDESNAEP LSEDKGNLLL TGDKDQLVML LDQINSTFVR SNPSVLQGLL RIIPYLSFGE VEKMQILVER FKPYCNFDKY DEDHSGDDKV FLDCFCKIAA GIKNNSNGHQ LKDLILQKGI TQNALDYMKK HIPSAKNLDA DIWKKFLSRP ALPFILRLLR GLAIQHPGTQ VLIGTDSIPN LHKLEQVSSD EGIGTLAENL LEALREHPDV NKKIDAARRE TRAEKKRMAM AMRQKALGTL GMTTNEKGQV VTKTALLKQM EELIEEPGLT CCICREGYKF QPTKVLGIYT FTKRVALEEM ENKPRKQQGY STVSHFNIVH YDCHLAAVRL ARGREEWESA ALQNANTKCN GLLPVWGPHV PESAFATCLA RHNTYLQECT GQREPTYQLN IHDIKLLFLR FAMEQSFSAD TGGGGRESNI HLIPYIIHTV LYVLNTTRAT SREEKNLQGF LEQPKEKWVE SAFEVDGPYY FTVLALHILP PEQWRATRVE ILRRLLVTSQ ARAVAPGGAT RLTDKAVKDY SAYRSSLLFW ALVDLIYNMF KKVPTSNTEG GWSCSLAEYI RHNDMPIYEA ADKALKTFQE EFMPVETFSE FLDVAGLLSE ITDPESFLKD LLNSVP* | 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mutated AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLERLVV SSLEALESCF AVGPIIEKER NKNAAQELAT LLLSLPAPAS VQQQSKSLLA SLHTSRSAYH SHKDQALLSK AVQCLNTSSK EGKDLDPEVF QRLVITARSI AIMRPNNLVH FTESKLPQME TDCFFPRCAC WSLGIVGILI GAPLETPSPE GMDEGKEPQK QLEGDCCSFI TQLVNHFWKL HASKPKNAFL APACLPGLTH IEATVNALVD IIHGYCTCEL DCINTASKIY MQMLLCPDPA VSFSCKQALI RVLRPRNKRR HVTLPSSPRS NTPMGDKDDD DDDDADEKMQ SSGIPNGGHI RQESQEQSEV DHGDFEMVSE SMVLETAENV NNGNPSPLEA LLAGAEGFPP MLDIPPDADD ETMVELAIAL SLQQDQQAPA SDDEGSTAAT DGSTLRTSPA DHGGSVGSES GGSAVDSVAG EHSVSGRSSA YGDATAEGHP AGPGSVSSST GAISTTTGHQ EGDGSEGEGE GETEGDVHTS NRLHMVRLML LERLLQTLPQ LRNVGGVRAI PYMQVILMLT TDLDGEDEKD KGALDNLLSQ LIAELGMDKK DVSKKNERSA LNEVHLVVMR LLSVFMSRTK SGSKSSICES SSLISSATAA ALLSSGAVDY CLHVLKSLLE YWKSQQNDEE PVATSQLLKP HTTSSPPDMS PFFLRQYVKG HAADVFEAYT QLLTEMVLRL PYQIKKITDT NSRIPPPVFD HSWFYFLSEY LMIQQTPFVR RQVRKLLLFI CGSKEKYRQL RDLHTLDSHV RGIKKLLEEQ GIFLRASVVT ASSGSALQYD TLISLMEHLK ACAEIAAQRT INWQKFCIKD DSVLYFLLQV SFLVDEGVSP VLLQLLSCAL CGSKVLAALA ASSGSSSASS SSAPVAASSG QATTQSKSST KKSKKEEKEK EKDGETSGSQ EDQLCTALVN QLNKFADKET LIQFLRCFLL ESNSSSVRWQ AHCLTLHIYR NSSKSQQELL LDLMWSIWPE LPAYGRKAAQ FVDLLGYFSL KTPQTEKKLK EYSQKAVEIL RTQNHILTNH PNSNIYNTLS GLVEFDGYYL ESDPCLVCNN PEVPFCYIKL SSIKVDTRYT TTQQVVKLIG SHTISKVTVK IGDLKRTKMV RTINLYYNNR TVQAIVELKN KPARWHKAKK VQLTPGQTEV KIDLPLPIVA SNLMIEFADF YENYQASTET LQCPRCSASV PANPGVCGNC GENVYQCHKC RSINYDEKDP FLCNACGFCK YARFDFMLYA KPCCAVDPIE NEEDRKKAVS NINTLLDKAD RVYHQLMGHR PQLENLLCKV NEAAPEKPQD DSGTAGGISS TSASVNRYIL QLAQEYCGDC KNSFDELSKI IQKVFASRKE LLEYDLQQRE AATKSSRTSV QPTFTASQYR ALSVLGCGHT SSTKCYGCAS AVTEHCITLL RALATNPALR HILVSQGLIR ELFDYNLRRG AAAMREEVRQ LMCLLTRDNP EATQQMNDLI IGKVSTALKG HWANPDLASS LQYEMLLLTD SISKEDSCWE LRLRCALSLF LMAVNIKTPV VVENITLMCL RILQKLIKPP APTSKKNKDV PVEALTTVKP YCNEIHAQAQ LWLKRDPKAS YDAWKKCLPI RGIDGNGKAP SKSELRHLYL TEKYVWRWKQ FLSRRGKRTS PLDLKLGHNN WLRQVLFTPA TQAARQAACT IVEALATIPS RKQQVLDLLT SYLDELSIAG ECAAEYLALY QKLITSAHWK VYLAARGVLP YVGNLITKEI ARLLALEEAT LSTDLQQGYA LKSLTGLLSS FVEVESIKRH FKSRLVGTVL NGYLCLRKLV VQRTKLIDET QDMLLEMLED MTTGTESETK AFMAVCIETA KRYNLDDYRT PVFIFERLCS IIYPEENEVT EFFVTLEKDP QQEDFLQGRM PGNPYSSNEP GIGPLMRDIK NKICQDCDLV ALLEDDSGME LLVNNKIISL DLPVAEVYKK VWCTTNEGEP MRIVYRMRGL LGDATEEFIE SLDSTTDEEE DEEEVYKMAG VMAQCGGLEC MLNRLAGIRD FKQGRHLLTV LLKLFSYCVK VKVNRQQLVK LEMNTLNVML GTLNLALVAE QESKDSGGAA VAEQVLSIME IILDESNAEP LSEDKGNLLL TGDKDQLVML LDQINSTFVR SNPSVLQGLL RIIPYLSFGE VEKMQILVER FKPYCNFDKY DEDHSGDDKV FLDCFCKIAA GIKNNSNGHQ LKDLILQKGI TQNALDYMKK HIPSAKNLDA DIWKKFLSRP ALPFILRLLR GLAIQHPGTQ VLIGTDSIPN LHKLEQVSSD EGIGTLAENL LEALREHPDV NKKIDAARRE TRAEKKRMAM AMRQKALGTL GMTTNEKGQV VTKTALLKQM EELIEEPGLT CCICREGYKF QPTKVLGIYT FTKRVALEEL ENKPRKQQGY STVSHFNIVH YDCHLAAVRL ARGREEWESA ALQNANTKCN GLLPVWGPHV PESAFATCLA RHNTYLQECT GQREPTYQLN IHDIKLLFLR FAMEQSFSAD TGGGGRESNI HLIPYIIHTV LYVLNTTRAT SREEKNLQGF LEQPKEKWVE SAFEVDGPYY FTVLALHILP PEQWRATRVE ILRRLLVTSQ ARAVAPGGAT RLTDKAVKDY SAYRSSLLFW ALVDLIYNMF KKVPTSNTEG GWSCSLAEYI RHNDMPIYEA ADKALKTFQE EFMPVETFSE FLDVAGLLSE ITDPESFLKD LLNSVP* | 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speed | 0.89 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.750758533413046 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr1:19413261T>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | UBR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000375226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q5T4S7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.14527A>T cDNA.14531A>T g.123510A>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | M4843L Score: 15 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 4843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs12584
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regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
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splice sites |
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distance from splice site | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 15480 / 15480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 5160 / 5160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 15484 / 15484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 5 / 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 15420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 15365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 15480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 14527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 14531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 123510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 19413261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLESSET ESLTKLDRLV VSSLEALESC FAVGPIIEKE RNKNAAQELA TLLLSLPAPA SVQQQSKSLL ASLHTSRSAY HSHKDQALLS KAVQCLNTSS KEGKDLDPEV FQRLVITARS IAIMRPNNLV HFTESKLPQM ETEGMDEGKE PQKQLEGDCC SFITQLVNHF WKLHASKPKN AFLAPACLPG LTHIEATVNA LVDIIHGYCT CELDCINTAS KIYMQMLLCP DPAVSFSCKQ ALIRVLRPRN KRRHVTLPSS PRSNTPMGDK DDDDDDDADE KMQSSGIPNG GHIRQESQEQ SEVDHGDFEM VSESMVLETA ENVNNGNPSP LEALLAGAEG FPPMLDIPPD ADDETMVELA IALSLQQDQQ APASDDEGST AATDGSTLRT SPADHGGSVG SESGGSAVDS VAGEHSVSGR SSAYGDATAE GHPAGPGSVS SSTGAISTTT GHQEGDGSEG EGEGETEGDV HTSNRLHMVR LMLLERLLQT LPQLRNVGGV RAIPYMQVIL MLTTDLDGED EKDKGALDNL LSQLIAELGM DKKDVSKKNE RSALNEVHLV VMRLLSVFMS RTKSGSKSSI CESSSLISSA TAAALLSSGA VDYCLHVLKS LLEYWKSQQN DEEPVATSQL LKPHTTSSPP DMSPFFLRQY VKGHAADVFE AYTQLLTEMV LRLPYQIKKI TDTNSRIPPP VFDHSWFYFL SEYLMIQQTP FVRRQVRKLL LFICGSKEKY RQLRDLHTLD SHVRGIKKLL EEQGIFLRAS VVTASSGSAL QYDTLISLME HLKACAEIAA QRTINWQKFC IKDDSVLYFL LQVSFLVDEG VSPVLLQLLS CALCGSKVLA ALAASSGSSS ASSSSAPVAA SSGQATTQSK SSTKKSKKEE KEKEKDGETS GSQEDQLCTA LVNQLNKFAD KETLIQFLRC FLLESNSSSV RWQAHCLTLH IYRNSSKSQQ ELLLDLMWSI WPELPAYGRK AAQFVDLLGY FSLKTPQTEK KLKEYSQKAV EILRTQNHIL TNHPNSNIYN TLSGLVEFDG YYLESDPCLV CNNPEVPFCY IKLSSIKVDT RYTTTQQVVK LIGSHTISKV TVKIGDLKRT KMVRTINLYY NNRTVQAIVE LKNKPARWHK AKKVQLTPGQ TEVKIDLPLP IVASNLMIEF ADFYENYQAS TETLQCPRCS ASVPANPGVC GNCGENVYQC HKCRSINYDE KDPFLCNACG FCKYARFDFM LYAKPCCAVD PIENEEDRKK AVSNINTLLD KADRVYHQLM GHRPQLENLL CKVNEAAPEK PQDDSGTAGG ISSTSASVNR YILQLAQEYC GDCKNSFDEL SKIIQKVFAS RKELLEYDLQ QREAATKSSR TSVQPTFTAS QYRALSVLGC GHTSSTKCYG CASAVTEHCI TLLRALATNP ALRHILVSQG LIRELFDYNL RRGAAAMREE VRQLMCLLTR DNPEATQQMN DLIIGKVSTA LKGHWANPDL ASSLQYEMLL LTDSISKEDS CWELRLRCAL SLFLMAVNIK TPVVVENITL MCLRILQKLI KPPAPTSKKN KDVPVEALTT VKPYCNEIHA QAQLWLKRDP KASYDAWKKC LPIRGIDGNG KAPSKSELRH LYLTEKYVWR WKQFLSRRGK RTSPLDLKLG HNNWLRQVLF TPATQAARQA ACTIVEALAT IPSRKQQVLD LLTSYLDELS IAGECAAEYL ALYQKLITSA HWKVYLAARG VLPYVGNLIT KEIARLLALE EATLSTDLQQ GYALKSLTGL LSSFVEVESI KRHFKSRLVG TVLNGYLCLR KLVVQRTKLI DETQDMLLEM LEDMTTGTES ETKAFMAVCI ETAKRYNLDD YRTPVFIFER LCSIIYPEEN EVTEFFVTLE KDPQQEDFLQ GRMPGNPYSS NEPGIGPLMR DIKNKICQDC DLVALLEDDS GMELLVNNKI ISLDLPVAEV YKKVWCTTNE GEPMRIVYRM RGLLGDATEE FIESLDSTTD EEEDEEEVYK MAGVMAQCGG LECMLNRLAG IRDFKQGRHL LTVLLKLFSY CVKVKVNRQQ LVKLEMNTLN VMLGTLNLAL VAEQESKDSG GAAVAEQVLS IMEIILDESN AEPLSEDKGN LLLTGDKDQL VMLLDQINST FVRSNPSVLQ GLLRIIPYLS FGEVEKMQIL VERFKPYCNF DKYDEDHSGD DKVFLDCFCK IAAGIKNNSN GHQLKDLILQ KGITQNALDY MKKHIPSAKN LDADIWKKFL SRPALPFILR LLRGLAIQHP GTQVLIGTDS IPNLHKLEQV SSDEGIGTLA ENLLEALREH PDVNKKIDAA RRETRAEKKR MAMAMRQKAL GTLGMTTNEK GQVVTKTALL KQMEELIEEP GLTCCICREG YKFQPTKVLG IYTFTKRVAL EEMENKPRKQ QGYSTVSHFN IVHYDCHLAA VRLARGREEW ESAALQNANT KCNGLLPVWG PHVPESAFAT CLARHNTYLQ ECTGQREPTY QLNIHDIKLL FLRFAMEQSF SADTGGGGRE SNIHLIPYII HTVLYVLNTT RATSREEKNL QGFLEQPKEK WVESAFEVDG PYYFTVLALH ILPPEQWRAT RVEILRRLLV TSQARAVAPG GATRLTDKAV KDYSAYRSSL LFWALVDLIY NMFKKVPTSN TEGGWSCSLA EYIRHNDMPI YEAADKALKT FQEEFMPVET FSEFLDVAGL LSEITDPESF LKDLLNSVP* | 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mutated AA sequence | MATSGGEEAA AAAPAPGTPA TGADTTPGWE VAVRPLLSAS YSAFEMKELP QLVASVIESE SEILHHEKQY EPFYSSFVAL STHYITTVCS LIPRNQLQSV AAACKVLIEF SLLRLENPDE ACAVSQKHLI LLIKGLCTGC SRLDRTEIIT FTAMMKSAKL PQTVKTLSDV EDQKELASPV SPELRQKEVQ MNFLNQLTSV FNPRTVASQP ISTQTLVEGE NDEQSSTDQA SAIKTKNVFI AQNVASLQEL GGSEKLLRVC LNLPYFLRYI NRFQDAVLAN SFFIMPATVA DATAVRNGFH SLVIDVTMAL DTLSLPVLEP LNPSRLQDVT VLSLSCLYAG VSVATCMAIL HVGSAQQVRT GSTSSKEDDY ESDAATIVQK CLEIYDMIGQ AISSSRRAGG EHYQNFQLLG AWCLLNSLFL ILNLSPTALA DKGKEKDPLA ALRVRDILSR TKEGVGSPKL GPGKGHQGFG VLSVILANHA IKLLTSLFQD LQVEALHKGW ETDGPPAALS IMAQSTSIQR IQRLIDSVPL MNLLLTLLST SYRKACVLQR QRKGSMSSDA SASTDSNTYY EDDFSSTEED SSQDDDSEPI LGQWFEETIS PSKEKAAPPP PPPPPPLESS PRVKSPSKQA PGEKGNILAS RKDPELFLGL ASNILNFITS SMLNSRNNFI RNYLSVSLSE HHMATLASII KEVDKDGLKG SSDEEFAAAL YHFNHSLVTS DLQSPNLQNT LLQQLGVAPF SEGPWPLYIH PQSLSVLSRL LLIWQHKASA QGDPDVPECL KVWDRFLSTM KQNALQGVVP SETEDLNVEH LQMLLLIFHN FTETGRRAIL SLFVQIIQEL SVNMDAQMRF VPLILARLLL IFDYLLHQYS KAPVYLFEQV QHNLLSPPFG WASGSQDSNS RRATTPLYHG FKEVEENWSK HFSSDAVPHP RFYCVLSPEA SEDDLNRLDS VACDVLFSKL VKYDELYAAL TALLAAGSQL DTVRRKENKN VTALEACALQ YYFLILWRIL GILPPSKTYI NQLSMNSPEM SECDILHTLR WSSRLRISSY VNWIKDHLIK QGMKAEHASS LLELASTTKC SSVKYDVEIV EEYFARQISS FCSIDCTTIL QLHEIPSLQS IYTLDAAISK VQVSLDEHFS KMAAETDPHK SSEITKNLLP ATLQLIDTYA SFTRAYLLQN FNEEGTTEKP SKEKLQGFAA VLAIGSSRCK ANTLGPTLVQ NLPSSVQTVC ESWNNINTNE FPNIGSWRNA FANDTIPSES YISAVQAAHL GTLCSQSLPL AASLKHTLLS LVRLTGDLIV WSDEMNPPQV IRTLLPLLLE SSTESVAEIS SNSLERILGP AESDEFLARV YEKLITGCYN ILANHADPNS GLDESILEEC LQYLEKQLES SQARKAMEEF FSDSGELVQI MMATANENLS AKFCNRVLKF FTKLFQLTEK SPNPSLLHLC GSLAQLACVE PVRLQAWLTR MTTSPPKDSD QLDVIQENRQ LLQLLTTYIV RENSQVGEGV CAVLLGTLTP MATEMLANGD GTGFPELMVV MATLASAGQG AGHLQLHNAA VDWLSRCKKY LSQKNVVEKL NANVMHGKHV MILECTCHIM SYLADVTNAL SQSNGQGPSH LSVDGEERAI EVDSDWVEEL AVEEEDSQAE DSDEDSLCNK LCTFTITQKE FMNQHWYHCH TCKMVDGVGV CTVCAKVCHK DHEISYAKYG SFFCDCGAKE DGSCLALVKR TPSSGMSSTM KESAFQSEPR ISESLVRHAS TSSPADKAKV TISDGKVADE EKPKKSSLCR TVEGCREELQ NQANFSFAPL VLDMLNFLMD AIQTNFQQAS AVGSSSRAQQ ALSELHTVEK AVEMTDQLMV PTLGSQEGAF ENVRMNYSGD QGQTIRQLIS AHVLRRVAMC VLSSPHGRRQ HLAVSHEKGK ITVLQLSALL KQADSSKRKL TLTRLASAPV PFTVLSLTGN PCKEDYLAVC GLKDCHVLTF SSSGSVSDHL VLHPQLATGN FIIKAVWLPG SQTELAIVTA DFVKIYDLCV DALSPTFYFL LPSSKIRDVT FLFNEEGKNI IVIMSSAGYI YTQLMEEASS AQQGPFYVTN VLEINHEDLK DSNSQVAGGG VSVYYSHVLQ MLFFSYCQGK SFAATISRTT LEVLQLFPIN IKSSNGGSKT SPALCQWSEV MNHPGLVCCV QQTTGVPLVV MVKPDTFLIQ EIKTLPAKAK IQDMVAIRHT ACNEQQRTTM ILLCEDGSLR IYMANVENTS YWLQPSLQPS SVISIMKPVR KRKTATITTR TSSQVTFPID FFEHNQQLTD VEFGGNDLLQ VYNAQQIKHR LNSTGMYVAN TKPGGFTIEI SNNNSTMVMT GMRIQIGTQA IERAPSYIEI FGRTMQLNLS RSRWFDFPFT REEALQADKK LNLFIGASVD PAGVTMIDAV KIYGKTKEQF GWPDEPPEEF PSASVSNICP SNLNQSNGTG DSDSAAPTTT SGTVLESSET ESLTKLDRLV VSSLEALESC FAVGPIIEKE RNKNAAQELA TLLLSLPAPA SVQQQSKSLL ASLHTSRSAY HSHKDQALLS KAVQCLNTSS KEGKDLDPEV FQRLVITARS IAIMRPNNLV HFTESKLPQM ETEGMDEGKE PQKQLEGDCC SFITQLVNHF WKLHASKPKN AFLAPACLPG LTHIEATVNA LVDIIHGYCT CELDCINTAS KIYMQMLLCP DPAVSFSCKQ ALIRVLRPRN KRRHVTLPSS PRSNTPMGDK DDDDDDDADE KMQSSGIPNG GHIRQESQEQ SEVDHGDFEM VSESMVLETA ENVNNGNPSP LEALLAGAEG FPPMLDIPPD ADDETMVELA IALSLQQDQQ APASDDEGST AATDGSTLRT SPADHGGSVG SESGGSAVDS VAGEHSVSGR SSAYGDATAE GHPAGPGSVS SSTGAISTTT GHQEGDGSEG EGEGETEGDV HTSNRLHMVR LMLLERLLQT LPQLRNVGGV RAIPYMQVIL MLTTDLDGED EKDKGALDNL LSQLIAELGM DKKDVSKKNE RSALNEVHLV VMRLLSVFMS RTKSGSKSSI CESSSLISSA TAAALLSSGA VDYCLHVLKS LLEYWKSQQN DEEPVATSQL LKPHTTSSPP DMSPFFLRQY VKGHAADVFE AYTQLLTEMV LRLPYQIKKI TDTNSRIPPP VFDHSWFYFL SEYLMIQQTP FVRRQVRKLL LFICGSKEKY RQLRDLHTLD SHVRGIKKLL EEQGIFLRAS VVTASSGSAL QYDTLISLME HLKACAEIAA QRTINWQKFC IKDDSVLYFL LQVSFLVDEG VSPVLLQLLS CALCGSKVLA ALAASSGSSS ASSSSAPVAA SSGQATTQSK SSTKKSKKEE KEKEKDGETS GSQEDQLCTA LVNQLNKFAD KETLIQFLRC FLLESNSSSV RWQAHCLTLH IYRNSSKSQQ ELLLDLMWSI WPELPAYGRK AAQFVDLLGY FSLKTPQTEK KLKEYSQKAV EILRTQNHIL TNHPNSNIYN TLSGLVEFDG YYLESDPCLV CNNPEVPFCY IKLSSIKVDT RYTTTQQVVK LIGSHTISKV TVKIGDLKRT KMVRTINLYY NNRTVQAIVE LKNKPARWHK AKKVQLTPGQ TEVKIDLPLP IVASNLMIEF ADFYENYQAS TETLQCPRCS ASVPANPGVC GNCGENVYQC HKCRSINYDE KDPFLCNACG FCKYARFDFM LYAKPCCAVD PIENEEDRKK AVSNINTLLD KADRVYHQLM GHRPQLENLL CKVNEAAPEK PQDDSGTAGG ISSTSASVNR YILQLAQEYC GDCKNSFDEL SKIIQKVFAS RKELLEYDLQ QREAATKSSR TSVQPTFTAS QYRALSVLGC GHTSSTKCYG CASAVTEHCI TLLRALATNP ALRHILVSQG LIRELFDYNL RRGAAAMREE VRQLMCLLTR DNPEATQQMN DLIIGKVSTA LKGHWANPDL ASSLQYEMLL LTDSISKEDS CWELRLRCAL SLFLMAVNIK TPVVVENITL MCLRILQKLI KPPAPTSKKN KDVPVEALTT VKPYCNEIHA QAQLWLKRDP KASYDAWKKC LPIRGIDGNG KAPSKSELRH LYLTEKYVWR WKQFLSRRGK RTSPLDLKLG HNNWLRQVLF TPATQAARQA ACTIVEALAT IPSRKQQVLD LLTSYLDELS IAGECAAEYL ALYQKLITSA HWKVYLAARG VLPYVGNLIT KEIARLLALE EATLSTDLQQ GYALKSLTGL LSSFVEVESI KRHFKSRLVG TVLNGYLCLR KLVVQRTKLI DETQDMLLEM LEDMTTGTES ETKAFMAVCI ETAKRYNLDD YRTPVFIFER LCSIIYPEEN EVTEFFVTLE KDPQQEDFLQ GRMPGNPYSS NEPGIGPLMR DIKNKICQDC DLVALLEDDS GMELLVNNKI ISLDLPVAEV YKKVWCTTNE GEPMRIVYRM RGLLGDATEE FIESLDSTTD EEEDEEEVYK MAGVMAQCGG LECMLNRLAG IRDFKQGRHL LTVLLKLFSY CVKVKVNRQQ LVKLEMNTLN VMLGTLNLAL VAEQESKDSG GAAVAEQVLS IMEIILDESN AEPLSEDKGN LLLTGDKDQL VMLLDQINST FVRSNPSVLQ GLLRIIPYLS FGEVEKMQIL VERFKPYCNF DKYDEDHSGD DKVFLDCFCK IAAGIKNNSN GHQLKDLILQ KGITQNALDY MKKHIPSAKN LDADIWKKFL SRPALPFILR LLRGLAIQHP GTQVLIGTDS IPNLHKLEQV SSDEGIGTLA ENLLEALREH PDVNKKIDAA RRETRAEKKR MAMAMRQKAL GTLGMTTNEK GQVVTKTALL KQMEELIEEP GLTCCICREG YKFQPTKVLG IYTFTKRVAL EELENKPRKQ QGYSTVSHFN IVHYDCHLAA VRLARGREEW ESAALQNANT KCNGLLPVWG PHVPESAFAT CLARHNTYLQ ECTGQREPTY QLNIHDIKLL FLRFAMEQSF SADTGGGGRE SNIHLIPYII HTVLYVLNTT RATSREEKNL QGFLEQPKEK WVESAFEVDG PYYFTVLALH ILPPEQWRAT RVEILRRLLV TSQARAVAPG GATRLTDKAV KDYSAYRSSL LFWALVDLIY NMFKKVPTSN TEGGWSCSLA EYIRHNDMPI YEAADKALKT FQEEFMPVET FSEFLDVAGL LSEITDPESF LKDLLNSVP* | 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speed | 0.85 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.750758533413046 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr1:19413261T>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | UBR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000543981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q5T4S7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.1591A>T cDNA.1603A>T g.123510A>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | M531L Score: 15 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs12584
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 2544 / 2544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 848 / 848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 2556 / 2556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 13 / 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 2492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 2429 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 2544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 1591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 1603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 123510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 19413261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MAVCIETAKR YNLDDYRTPV FIFERLCSII YPEENEVTEF FVTLEKDPQQ EDFLQGRMPG NPYSSNEPGI GPLMRDIKNK ICQDCDLVAL LEDDSGMEGE PMRIVYRMRG LLGDATEEFI ESLDSTTDEE EDEEEVYKMA GVMAQCGGLE CMLNRLAGIR DFKQGRHLLT VLLKLFSYCV KVKVNRQQLV KLEMNTLNVM LGTLNLALVA EQESKDSGGA AVAEQVLSIM EIILDESNAE PLSEDKGNLL LTGDKDQLVM LLDQINSTFV RSNPSVLQGL LRIIPYLSFG EVEKMQILVE RFKPYCNFDK YDEDHSGDDK VFLDCFCKIA AGIKNNSNGH QLKDLILQKG ITQNALDYMK KHIPSAKNLD ADIWKKFLSR PALPFILRLL RGLAIQHPGT QVLIGTDSIP NLHKLEQVSS DEGIGTLAEN LLEALREHPD VNKKIDAARR ETRAEKKRMA MAMRQKALGT LGMTTNEKGQ VVTKTALLKQ MEELIEEPGL TCCICREGYK FQPTKVLGIY TFTKRVALEE MENKPRKQQG YSTVSHFNIV HYDCHLAAVR LARGREEWES AALQNANTKC NGLLPVWGPH VPESAFATCL ARHNTYLQEC TGQREPTYQL NIHDIKLLFL RFAMEQSFSA DTGGGGRESN IHLIPYIIHT VLYVLNTTRA TSREEKNLQG FLEQPKEKWV ESAFEVDGPY YFTVLALHIL PPEQWRATRV EILRRLLVTS QARAVAPGGA TRLTDKAVKD YSAYRSSLLF WALVDLIYNM FKKVPTSNTE GGWSCSLAEY IRHNDMPIYE AADKALKTFQ EEFMPVETFS EFLDVAGLLS EITDPESFLK DLLNSVP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MAVCIETAKR YNLDDYRTPV FIFERLCSII YPEENEVTEF FVTLEKDPQQ EDFLQGRMPG NPYSSNEPGI GPLMRDIKNK ICQDCDLVAL LEDDSGMEGE PMRIVYRMRG LLGDATEEFI ESLDSTTDEE EDEEEVYKMA GVMAQCGGLE CMLNRLAGIR DFKQGRHLLT VLLKLFSYCV KVKVNRQQLV KLEMNTLNVM LGTLNLALVA EQESKDSGGA AVAEQVLSIM EIILDESNAE PLSEDKGNLL LTGDKDQLVM LLDQINSTFV RSNPSVLQGL LRIIPYLSFG EVEKMQILVE RFKPYCNFDK YDEDHSGDDK VFLDCFCKIA AGIKNNSNGH QLKDLILQKG ITQNALDYMK KHIPSAKNLD ADIWKKFLSR PALPFILRLL RGLAIQHPGT QVLIGTDSIP NLHKLEQVSS DEGIGTLAEN LLEALREHPD VNKKIDAARR ETRAEKKRMA MAMRQKALGT LGMTTNEKGQ VVTKTALLKQ MEELIEEPGL TCCICREGYK FQPTKVLGIY TFTKRVALEE LENKPRKQQG YSTVSHFNIV HYDCHLAAVR LARGREEWES AALQNANTKC NGLLPVWGPH VPESAFATCL ARHNTYLQEC TGQREPTYQL NIHDIKLLFL RFAMEQSFSA DTGGGGRESN IHLIPYIIHT VLYVLNTTRA TSREEKNLQG FLEQPKEKWV ESAFEVDGPY YFTVLALHIL PPEQWRATRV EILRRLLVTS QARAVAPGGA TRLTDKAVKD YSAYRSSLLF WALVDLIYNM FKKVPTSNTE GGWSCSLAEY IRHNDMPIYE AADKALKTFQ EEFMPVETFS EFLDVAGLLS EITDPESFLK DLLNSVP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.80 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.750758533413046 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr1:19413261T>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | UBR4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000429347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q5T4S7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.1168A>T cDNA.1236A>T g.123510A>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | M390L Score: 15 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs12584
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 2121 / 2121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 707 / 707 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 2189 / 2189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 69 / 69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 2125 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 2006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 2121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 1168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 1236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 123510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 19413261 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGATGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AGCGGGTAGCCTTGGAGGAGTTGGAGAATAAGCCCCGGAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MRIVYRMRGL LGDATEEFIE SLDSTTDEEE DEEEVYKMAG VMAQCGGLEC MLNRLAGIRD FKQGRHLLTV LLKLFSYCVK VKVNRQQLVK LEMNTLNVML GTLNLGNLLL TGDKDQLVML LDQINSTFVR SNPSVLQGLL RIIPYLSFGE VEKMQILVER FKPYCNFDKY DEDHSGDDKV FLDCFCKIAA GIKNNSNGHQ LKDLILQKGI TQNALDYMKK HIPSAKNLDA DIWKKFLSRP ALPFILRLLR GLAIQHPGTQ VLIGTDSIPN LHKLEQVSSD EGIGTLAENL LEALREHPDV NKKIDAARRE TRAEKKRMAM AMRQKALGTL GMTTNEKGQV VTKTALLKQM EELIEEPGLT CCICREGYKF QPTKVLGIYT FTKRVALEEM ENKPRKQQGY STVSHFNIVH YDCHLAAVRL ARGREEWESA ALQNANTKCN GLLPVWGPHV PESAFATCLA RHNTYLQECT GQREPTYQLN IHDIKLLFLR FAMEQSFSAD TGGGGRESNI HLIPYIIHTV LYVLNTTRAT SREEKNLQGF LEQPKEKWVE SAFEVDGPYY FTVLALHILP PEQWRATRVE ILRRLLVTSQ ARAVAPGGAT RLTDKAVKDY SAYRSSLLFW ALVDLIYNMF KKVPTSNTEG GWSCSLAEYI RHNDMPIYEA ADKALKTFQE EFMPVETFSE FLDVAGLLSE ITDPESFLKD LLNSVP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MRIVYRMRGL LGDATEEFIE SLDSTTDEEE DEEEVYKMAG VMAQCGGLEC MLNRLAGIRD FKQGRHLLTV LLKLFSYCVK VKVNRQQLVK LEMNTLNVML GTLNLGNLLL TGDKDQLVML LDQINSTFVR SNPSVLQGLL RIIPYLSFGE VEKMQILVER FKPYCNFDKY DEDHSGDDKV FLDCFCKIAA GIKNNSNGHQ LKDLILQKGI TQNALDYMKK HIPSAKNLDA DIWKKFLSRP ALPFILRLLR GLAIQHPGTQ VLIGTDSIPN LHKLEQVSSD EGIGTLAENL LEALREHPDV NKKIDAARRE TRAEKKRMAM AMRQKALGTL GMTTNEKGQV VTKTALLKQM EELIEEPGLT CCICREGYKF QPTKVLGIYT FTKRVALEEL ENKPRKQQGY STVSHFNIVH YDCHLAAVRL ARGREEWESA ALQNANTKCN GLLPVWGPHV PESAFATCLA RHNTYLQECT GQREPTYQLN IHDIKLLFLR FAMEQSFSAD TGGGGRESNI HLIPYIIHTV LYVLNTTRAT SREEKNLQGF LEQPKEKWVE SAFEVDGPYY FTVLALHILP PEQWRATRVE ILRRLLVTSQ ARAVAPGGAT RLTDKAVKDY SAYRSSLLFW ALVDLIYNMF KKVPTSNTEG GWSCSLAEYI RHNDMPIYEA ADKALKTFQE EFMPVETFSE FLDVAGLLSE ITDPESFLKD LLNSVP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.83 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||