MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
CHD4 | polymorphism_automatic | 8.66235353309541e-05 | simple_aae | E136D | single base exchange | rs1639122 | show file | ||||
CHD4 | polymorphism_automatic | 8.66235353309541e-05 | simple_aae | E139D | single base exchange | rs1639122 | show file | ||||
CHD4 | polymorphism_automatic | 8.66235353309541e-05 | simple_aae | E139D | single base exchange | rs1639122 | show file | ||||
CHD4 | polymorphism_automatic | 0.000347242677905979 | simple_aae | E132D | single base exchange | rs1639122 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999913376464669 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr12:6711147C>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000544484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.408G>T cDNA.555G>T g.5496G>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | E136D Score: 45 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs1639122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K9me1, Histone, Histone 3 Lysine 9 mono-methylation H4K20me1, Histone, Histone 4 Lysine 20 mono-methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites | no abrogation of potential splice sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5814 / 5814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1938 / 1938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 5961 / 5961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 148 / 148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5746 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 6711147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPEDPEEDL SETETPKLKK KKKPKKPRDP KIPKSKRQKK ERMLLCRQLG DSSGEGPEFV EEEEEVALRS DSEGSDYTPG KKKKKKLGPK KEKKSKSKRK EEEEEEDDDD DSKEPKSSAQ LLEDWGMEDI DHVFSEEDYR TLTNYKAFSQ FVRPLIAAKN PKIAVSKMMM VLGAKWREFS TNNPFKGSSG ASVAAAAAAA VAVVESMVTA TEVAPPPPPV EVPIRKAKTK EGKGPNARRK PKGSPRVPDA KKPKPKKVAP LKIKLGGFGS KRKRSSSEDD DLDVESDFDD ASINSYSVSD GSTSRSSRSR KKLRTTKKKK KGEEEVTAVD GYETDHQDYC EVCQQGGEII LCDTCPRAYH MVCLDPDMEK APEGKWSCPH CEKEGIQWEA KEDNSEGEEI LEEVGGDLEE EDDHHMEFCR VCKDGGELLC CDTCPSSYHI HCLNPPLPEI PNGEWLCPRC TCPALKGKVQ KILIWKWGQP PSPTPVPRPP DADPNTPSPK PLEGRPERQF FVKWQGMSYW HCSWVSELQL ELHCQVMFRN YQRKNDMDEP PSGDFGGDEE KSRKRKNKDP KFAEMEERFY RYGIKPEWMM IHRILNHSVD KKGHVHYLIK WRDLPYDQAS WESEDVEIQD YDLFKQSYWN HRELMRGEEG RPGKKLKKVK LRKLERPPET PTVDPTVKYE RQPEYLDATG GTLHPYQMEG LNWLRFSWAQ GTDTILADEM GLGKTVQTAV FLYSLYKEGH SKGPFLVSAP LSTIINWERE FEMWAPDMYV VTYVGDKDSR AIIRENEFSF EDNAIRGGKK ASRMKKEASV KFHVLLTSYE LITIDMAILG SIDWACLIVD EAHRLKNNQS KFFRVLNGYS LQHKLLLTGT PLQNNLEELF HLLNFLTPER FHNLEGFLEE FADIAKEDQI KKLHDMLGPH MLRRLKADVF KNMPSKTELI VRVELSPMQK KYYKYILTRN FEALNARGGG NQVSLLNVVM DLKKCCNHPY LFPVAAMEAP KMPNGMYDGS ALIRASGKLL LLQKMLKNLK EGGHRVLIFS QMTKMLDLLE DFLEHEGYKY ERIDGGITGN MRQEAIDRFN APGAQQFCFL LSTRAGGLGI NLATADTVII YDSDWNPHND IQAFSRAHRI GQNKKVMIYR FVTRASVEER ITQVAKKKMM LTHLVVRPGL GSKTGSMSKQ ELDDILKFGT EELFKDEATD GGGDNKEGED SSVIHYDDKA IERLLDRNQD ETEDTELQGM NEYLSSFKVA QYVVREEEMG EEEEVEREII KQEESVDPDY WEKLLRHHYE QQQEDLARNL GKGKRIRKQV NYNDGSQEDR GVCGRPRPPP MGRSTRAVGP AHLPSLPPDW QDDQSDNQSD YSVASEEGDE DFDERSEAPR RPSRKGLRND KDKPLPPLLA RVGGNIEVLG FNARQRKAFL NAIMRYGMPP QDAFTTQWLV RDLRGKSEKE FKAYVSLFMR HLCEPGADGA ETFADGVPRE GLSRQHVLTR IGVMSLIRKK VQEFEHVNGR WSMPELAEVE ENKKMSQPGS PSPKTPTPST PGDTQPNTPA PVPPAEDGIK IEENSLKEEE SIEGEKEVKS TAPETAIECT QAPAPASEDE KVVVEPPEGE EKVEKAEVKE RTEEPMETEP KGAADVEKVE EKSAIDLTPI VVEDKEEKKE EEEKKEVMLQ NGETPKDLND EKQKKNIKQR FMFNIADGGF TELHSLWQNE ERAATVTKKT YEIWHRRHDY WLLAGIINHG YARWQDIQND PRYAILNEPF KGEMNRGNFL EIKNKFLARR FKLLEQALVI EEQLRRAAYL NMSEDPSHPS MALNTRFAEV ECLAESHQHL SKESMAGNKP ANAVLHKVLK QLEELLSDMK ADVTRLPATI ARIPPVAVRL QMSERNILSR LANRAPEPTP QQVAQQQ* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPEDPEEDL SETETPKLKK KKKPKKPRDP KIPKSKRQKK ERMLLCRQLG DSSGEGPEFV EEEEEVALRS DSEGSDYTPG KKKKKKLGPK KEKKSKSKRK EEEEEDDDDD DSKEPKSSAQ LLEDWGMEDI DHVFSEEDYR TLTNYKAFSQ FVRPLIAAKN PKIAVSKMMM VLGAKWREFS TNNPFKGSSG ASVAAAAAAA VAVVESMVTA TEVAPPPPPV EVPIRKAKTK EGKGPNARRK PKGSPRVPDA KKPKPKKVAP LKIKLGGFGS KRKRSSSEDD DLDVESDFDD ASINSYSVSD GSTSRSSRSR KKLRTTKKKK KGEEEVTAVD GYETDHQDYC EVCQQGGEII LCDTCPRAYH MVCLDPDMEK APEGKWSCPH CEKEGIQWEA KEDNSEGEEI LEEVGGDLEE EDDHHMEFCR VCKDGGELLC CDTCPSSYHI HCLNPPLPEI PNGEWLCPRC TCPALKGKVQ KILIWKWGQP PSPTPVPRPP DADPNTPSPK PLEGRPERQF FVKWQGMSYW HCSWVSELQL ELHCQVMFRN YQRKNDMDEP PSGDFGGDEE KSRKRKNKDP KFAEMEERFY RYGIKPEWMM IHRILNHSVD KKGHVHYLIK WRDLPYDQAS WESEDVEIQD YDLFKQSYWN HRELMRGEEG RPGKKLKKVK LRKLERPPET PTVDPTVKYE RQPEYLDATG GTLHPYQMEG LNWLRFSWAQ GTDTILADEM GLGKTVQTAV FLYSLYKEGH SKGPFLVSAP LSTIINWERE FEMWAPDMYV VTYVGDKDSR AIIRENEFSF EDNAIRGGKK ASRMKKEASV KFHVLLTSYE LITIDMAILG SIDWACLIVD EAHRLKNNQS KFFRVLNGYS LQHKLLLTGT PLQNNLEELF HLLNFLTPER FHNLEGFLEE FADIAKEDQI KKLHDMLGPH MLRRLKADVF KNMPSKTELI VRVELSPMQK KYYKYILTRN FEALNARGGG NQVSLLNVVM DLKKCCNHPY LFPVAAMEAP KMPNGMYDGS ALIRASGKLL LLQKMLKNLK EGGHRVLIFS QMTKMLDLLE DFLEHEGYKY ERIDGGITGN MRQEAIDRFN APGAQQFCFL LSTRAGGLGI NLATADTVII YDSDWNPHND IQAFSRAHRI GQNKKVMIYR FVTRASVEER ITQVAKKKMM LTHLVVRPGL GSKTGSMSKQ ELDDILKFGT EELFKDEATD GGGDNKEGED SSVIHYDDKA IERLLDRNQD ETEDTELQGM NEYLSSFKVA QYVVREEEMG EEEEVEREII KQEESVDPDY WEKLLRHHYE QQQEDLARNL GKGKRIRKQV NYNDGSQEDR GVCGRPRPPP MGRSTRAVGP AHLPSLPPDW QDDQSDNQSD YSVASEEGDE DFDERSEAPR RPSRKGLRND KDKPLPPLLA RVGGNIEVLG FNARQRKAFL NAIMRYGMPP QDAFTTQWLV RDLRGKSEKE FKAYVSLFMR HLCEPGADGA ETFADGVPRE GLSRQHVLTR IGVMSLIRKK VQEFEHVNGR WSMPELAEVE ENKKMSQPGS PSPKTPTPST PGDTQPNTPA PVPPAEDGIK IEENSLKEEE SIEGEKEVKS TAPETAIECT QAPAPASEDE KVVVEPPEGE EKVEKAEVKE RTEEPMETEP KGAADVEKVE EKSAIDLTPI VVEDKEEKKE EEEKKEVMLQ NGETPKDLND EKQKKNIKQR FMFNIADGGF TELHSLWQNE ERAATVTKKT YEIWHRRHDY WLLAGIINHG YARWQDIQND PRYAILNEPF KGEMNRGNFL EIKNKFLARR FKLLEQALVI EEQLRRAAYL NMSEDPSHPS MALNTRFAEV ECLAESHQHL SKESMAGNKP ANAVLHKVLK QLEELLSDMK ADVTRLPATI ARIPPVAVRL QMSERNILSR LANRAPEPTP QQVAQQQ* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.80 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999913376464669 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr12:6711147C>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000309577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.417G>T cDNA.581G>T g.5496G>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | E139D Score: 45 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs1639122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K9me1, Histone, Histone 3 Lysine 9 mono-methylation H4K20me1, Histone, Histone 4 Lysine 20 mono-methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites | no abrogation of potential splice sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5823 / 5823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1941 / 1941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 5987 / 5987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 165 / 165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 6711147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPENEEDPE EDLSETETPK LKKKKKPKKP RDPKIPKSKR QKKERMLLCR QLGDSSGEGP EFVEEEEEVA LRSDSEGSDY TPGKKKKKKL GPKKEKKSKS KRKEEEEEED DDDDSKEPKS SAQLLEDWGM EDIDHVFSEE DYRTLTNYKA FSQFVRPLIA AKNPKIAVSK MMMVLGAKWR EFSTNNPFKG SSGASVAAAA AAAVAVVESM VTATEVAPPP PPVEVPIRKA KTKEGKGPNA RRKPKGSPRV PDAKKPKPKK VAPLKIKLGG FGSKRKRSSS EDDDLDVESD FDDASINSYS VSDGSTSRSS RSRKKLRTTK KKKKGEEEVT AVDGYETDHQ DYCEVCQQGG EIILCDTCPR AYHMVCLDPD MEKAPEGKWS CPHCEKEGIQ WEAKEDNSEG EEILEEVGGD LEEEDDHHME FCRVCKDGGE LLCCDTCPSS YHIHCLNPPL PEIPNGEWLC PRCTCPALKG KVQKILIWKW GQPPSPTPVP RPPDADPNTP SPKPLEGRPE RQFFVKWQGM SYWHCSWVSE LQLELHCQVM FRNYQRKNDM DEPPSGDFGG DEEKSRKRKN KDPKFAEMEE RFYRYGIKPE WMMIHRILNH SVDKKGHVHY LIKWRDLPYD QASWESEDVE IQDYDLFKQS YWNHRELMRG EEGRPGKKLK KVKLRKLERP PETPTVDPTV KYERQPEYLD ATGGTLHPYQ MEGLNWLRFS WAQGTDTILA DEMGLGKTVQ TAVFLYSLYK EGHSKGPFLV SAPLSTIINW EREFEMWAPD MYVVTYVGDK DSRAIIRENE FSFEDNAIRG GKKASRMKKE ASVKFHVLLT SYELITIDMA ILGSIDWACL IVDEAHRLKN NQSKFFRVLN GYSLQHKLLL TGTPLQNNLE ELFHLLNFLT PERFHNLEGF LEEFADIAKE DQIKKLHDML GPHMLRRLKA DVFKNMPSKT ELIVRVELSP MQKKYYKYIL TRNFEALNAR GGGNQVSLLN VVMDLKKCCN HPYLFPVAAM EAPKMPNGMY DGSALIRASG KLLLLQKMLK NLKEGGHRVL IFSQMTKMLD LLEDFLEHEG YKYERIDGGI TGNMRQEAID RFNAPGAQQF CFLLSTRAGG LGINLATADT VIIYDSDWNP HNDIQAFSRA HRIGQNKKVM IYRFVTRASV EERITQVAKK KMMLTHLVVR PGLGSKTGSM SKQELDDILK FGTEELFKDE ATDGGGDNKE GEDSSVIHYD DKAIERLLDR NQDETEDTEL QGMNEYLSSF KVAQYVVREE EMGEEEEVER EIIKQEESVD PDYWEKLLRH HYEQQQEDLA RNLGKGKRIR KQVNYNDGSQ EDRGVCGRPR PPPMGRSTRA VGPAHLPSLP PDWQDDQSDN QSDYSVASEE GDEDFDERSE APRRPSRKGL RNDKDKPLPP LLARVGGNIE VLGFNARQRK AFLNAIMRYG MPPQDAFTTQ WLVRDLRGKS EKEFKAYVSL FMRHLCEPGA DGAETFADGV PREGLSRQHV LTRIGVMSLI RKKVQEFEHV NGRWSMPELA EVEENKKMSQ PGSPSPKTPT PSTPGDTQPN TPAPVPPAED GIKIEENSLK EEESIEGEKE VKSTAPETAI ECTQAPAPAS EDEKVVVEPP EGEEKVEKAE VKERTEEPME TEPKGAADVE KVEEKSAIDL TPIVVEDKEE KKEEEEKKEV MLQNGETPKD LNDEKQKKNI KQRFMFNIAD GGFTELHSLW QNEERAATVT KKTYEIWHRR HDYWLLAGII NHGYARWQDI QNDPRYAILN EPFKGEMNRG NFLEIKNKFL ARRFKLLEQA LVIEEQLRRA AYLNMSEDPS HPSMALNTRF AEVECLAESH QHLSKESMAG NKPANAVLHK VLKQLEELLS DMKADVTRLP ATIARIPPVA VRLQMSERNI LSRLANRAPE PTPQQVAQQQ * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPENEEDPE EDLSETETPK LKKKKKPKKP RDPKIPKSKR QKKERMLLCR QLGDSSGEGP EFVEEEEEVA LRSDSEGSDY TPGKKKKKKL GPKKEKKSKS KRKEEEEEDD DDDDSKEPKS SAQLLEDWGM EDIDHVFSEE DYRTLTNYKA FSQFVRPLIA AKNPKIAVSK MMMVLGAKWR EFSTNNPFKG SSGASVAAAA AAAVAVVESM VTATEVAPPP PPVEVPIRKA KTKEGKGPNA RRKPKGSPRV PDAKKPKPKK VAPLKIKLGG FGSKRKRSSS EDDDLDVESD FDDASINSYS VSDGSTSRSS RSRKKLRTTK KKKKGEEEVT AVDGYETDHQ DYCEVCQQGG EIILCDTCPR AYHMVCLDPD MEKAPEGKWS CPHCEKEGIQ WEAKEDNSEG EEILEEVGGD LEEEDDHHME FCRVCKDGGE LLCCDTCPSS YHIHCLNPPL PEIPNGEWLC PRCTCPALKG KVQKILIWKW GQPPSPTPVP RPPDADPNTP SPKPLEGRPE RQFFVKWQGM SYWHCSWVSE LQLELHCQVM FRNYQRKNDM DEPPSGDFGG DEEKSRKRKN KDPKFAEMEE RFYRYGIKPE WMMIHRILNH SVDKKGHVHY LIKWRDLPYD QASWESEDVE IQDYDLFKQS YWNHRELMRG EEGRPGKKLK KVKLRKLERP PETPTVDPTV KYERQPEYLD ATGGTLHPYQ MEGLNWLRFS WAQGTDTILA DEMGLGKTVQ TAVFLYSLYK EGHSKGPFLV SAPLSTIINW EREFEMWAPD MYVVTYVGDK DSRAIIRENE FSFEDNAIRG GKKASRMKKE ASVKFHVLLT SYELITIDMA ILGSIDWACL IVDEAHRLKN NQSKFFRVLN GYSLQHKLLL TGTPLQNNLE ELFHLLNFLT PERFHNLEGF LEEFADIAKE DQIKKLHDML GPHMLRRLKA DVFKNMPSKT ELIVRVELSP MQKKYYKYIL TRNFEALNAR GGGNQVSLLN VVMDLKKCCN HPYLFPVAAM EAPKMPNGMY DGSALIRASG KLLLLQKMLK NLKEGGHRVL IFSQMTKMLD LLEDFLEHEG YKYERIDGGI TGNMRQEAID RFNAPGAQQF CFLLSTRAGG LGINLATADT VIIYDSDWNP HNDIQAFSRA HRIGQNKKVM IYRFVTRASV EERITQVAKK KMMLTHLVVR PGLGSKTGSM SKQELDDILK FGTEELFKDE ATDGGGDNKE GEDSSVIHYD DKAIERLLDR NQDETEDTEL QGMNEYLSSF KVAQYVVREE EMGEEEEVER EIIKQEESVD PDYWEKLLRH HYEQQQEDLA RNLGKGKRIR KQVNYNDGSQ EDRGVCGRPR PPPMGRSTRA VGPAHLPSLP PDWQDDQSDN QSDYSVASEE GDEDFDERSE APRRPSRKGL RNDKDKPLPP LLARVGGNIE VLGFNARQRK AFLNAIMRYG MPPQDAFTTQ WLVRDLRGKS EKEFKAYVSL FMRHLCEPGA DGAETFADGV PREGLSRQHV LTRIGVMSLI RKKVQEFEHV NGRWSMPELA EVEENKKMSQ PGSPSPKTPT PSTPGDTQPN TPAPVPPAED GIKIEENSLK EEESIEGEKE VKSTAPETAI ECTQAPAPAS EDEKVVVEPP EGEEKVEKAE VKERTEEPME TEPKGAADVE KVEEKSAIDL TPIVVEDKEE KKEEEEKKEV MLQNGETPKD LNDEKQKKNI KQRFMFNIAD GGFTELHSLW QNEERAATVT KKTYEIWHRR HDYWLLAGII NHGYARWQDI QNDPRYAILN EPFKGEMNRG NFLEIKNKFL ARRFKLLEQA LVIEEQLRRA AYLNMSEDPS HPSMALNTRF AEVECLAESH QHLSKESMAG NKPANAVLHK VLKQLEELLS DMKADVTRLP ATIARIPPVA VRLQMSERNI LSRLANRAPE PTPQQVAQQQ * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.86 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999913376464669 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr12:6711147C>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000357008 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.417G>T cDNA.581G>T g.5496G>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | E139D Score: 45 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs1639122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K9me1, Histone, Histone 3 Lysine 9 mono-methylation H4K20me1, Histone, Histone 4 Lysine 20 mono-methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites | no abrogation of potential splice sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5739 / 5739 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1913 / 1913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 5903 / 5903 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 165 / 165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5739 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 6711147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPENEEDPE EDLSETETPK LKKKKKPKKP RDPKIPKSKR QKKERMLLCR QLGDSSGEGP EFVEEEEEVA LRSDSEGSDY TPGKKKKKKL GPKKEKKSKS KRKEEEEEED DDDDSKEPKS SAQLLEDWGM EDIDHVFSEE DYRTLTNYKA FSQFVRPLIA AKNPKIAVSK MMMVLGAKWR EFSTNNPFKG SSGASVAAAA AAAVAVVESM VTATEVAPPP PPVEVPIRKA KTKEGKGPNA RRKPKGSPRV PDAKKPKPKK VAPLKIKLGG FGSKRKRSSS EDDDLDVESD FDDASINSYS VSDGSTSRSS RSRKKLRTTK KKKKGEEEVT AVDGYETDHQ DYCEVCQQGG EIILCDTCPR AYHMVCLDPD MEKAPEGKWS CPHCEKEGIQ WEAKEDNSEG EEILEEVGGD LEEEDDHHME FCRVCKDGGE LLCCDTCPSS YHIHCLNPPL PEIPNGEWLC PRCTCPALKG KVQKILIWKW GQPPSPTPVP RPPDADPNTP SPKPLEGRPE RQFFVKWQGM SYWHCSWVSE LQLELHCQVM FRNYQRKNDM DEPPSGDFGG DEEKSRKRKN KDPKFAEMEE RFYRYGIKPE WMMIHRILNH SVDKKGHVHY LIKWRDLPYD QASWESEDVE IQDYDLFKQS YWNHRELMRG EEGRPGKKLK KVKLRKLERP PETPTVDPTV KYERQPEYLD ATGGTLHPYQ MEGLNWLRFS WAQGTDTILA DEMGLGKTVQ TAVFLYSLYK EGHSKGPFLV SAPLSTIINW EREFEMWAPD MYVVTYVGDK DSRAIIRENE FSFEDNAIRG GKKASRMKKE ASVKFHVLLT SYELITIDMA ILGSIDWACL IVDEAHRLKN NQSKFFRVLN GYSLQHKLLL TGTPLQNNLE ELFHLLNFLT PERFHNLEGF LEEFADIAKE DQIKKLHDML GPHMLRRLKA DVFKNMPSKT ELIVRVELSP MQKKYYKYIL TRNFEALNAR GGGNQVSLLN VVMDLKKCCN HPYLFPVAAM EAPKMPNGMY DGSALIRASG KLLLLQKMLK NLKEGGHRVL IFSQMTKMLD LLEDFLEHEG YKYERIDGGI TGNMRQEAID RFNAPGAQQF CFLLSTRAGG LGINLATADT VIIYDSDWNP HNDIQAFSRA HRIGQNKKVM IYRFVTRASV EERITQVAKK KMMLTHLVVR PGLGSKTGSM SKQELDDILK FGTEELFKDE ATDGGGDNKE GEDSSVIHYD DKAIERLLDR NQDETEDTEL QGMNEYLSSF KVAQYVVREE EMGEEEEVER EIIKQEESVD PDYWEKLLRH HYEQQQEDLA RNLGKGKRIR KQVNYNDGSQ EDRDWQDDQS DNQSDYSVAS EEGDEDFDER SEAPRRPSRK GLRNDKDKPL PPLLARVGGN IEVLGFNARQ RKAFLNAIMR YGMPPQDAFT TQWLVRDLRG KSEKEFKAYV SLFMRHLCEP GADGAETFAD GVPREGLSRQ HVLTRIGVMS LIRKKVQEFE HVNGRWSMPE LAEVEENKKM SQPGSPSPKT PTPSTPGDTQ PNTPAPVPPA EDGIKIEENS LKEEESIEGE KEVKSTAPET AIECTQAPAP ASEDEKVVVE PPEGEEKVEK AEVKERTEEP METEPKGAAD VEKVEEKSAI DLTPIVVEDK EEKKEEEEKK EVMLQNGETP KDLNDEKQKK NIKQRFMFNI ADGGFTELHS LWQNEERAAT VTKKTYEIWH RRHDYWLLAG IINHGYARWQ DIQNDPRYAI LNEPFKGEMN RGNFLEIKNK FLARRFKLLE QALVIEEQLR RAAYLNMSED PSHPSMALNT RFAEVECLAE SHQHLSKESM AGNKPANAVL HKVLKQLEEL LSDMKADVTR LPATIARIPP VAVRLQMSER NILSRLANRA PEPTPQQVAQ QQ* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPENEEDPE EDLSETETPK LKKKKKPKKP RDPKIPKSKR QKKERMLLCR QLGDSSGEGP EFVEEEEEVA LRSDSEGSDY TPGKKKKKKL GPKKEKKSKS KRKEEEEEDD DDDDSKEPKS SAQLLEDWGM EDIDHVFSEE DYRTLTNYKA FSQFVRPLIA AKNPKIAVSK MMMVLGAKWR EFSTNNPFKG SSGASVAAAA AAAVAVVESM VTATEVAPPP PPVEVPIRKA KTKEGKGPNA RRKPKGSPRV PDAKKPKPKK VAPLKIKLGG FGSKRKRSSS EDDDLDVESD FDDASINSYS VSDGSTSRSS RSRKKLRTTK KKKKGEEEVT AVDGYETDHQ DYCEVCQQGG EIILCDTCPR AYHMVCLDPD MEKAPEGKWS CPHCEKEGIQ WEAKEDNSEG EEILEEVGGD LEEEDDHHME FCRVCKDGGE LLCCDTCPSS YHIHCLNPPL PEIPNGEWLC PRCTCPALKG KVQKILIWKW GQPPSPTPVP RPPDADPNTP SPKPLEGRPE RQFFVKWQGM SYWHCSWVSE LQLELHCQVM FRNYQRKNDM DEPPSGDFGG DEEKSRKRKN KDPKFAEMEE RFYRYGIKPE WMMIHRILNH SVDKKGHVHY LIKWRDLPYD QASWESEDVE IQDYDLFKQS YWNHRELMRG EEGRPGKKLK KVKLRKLERP PETPTVDPTV KYERQPEYLD ATGGTLHPYQ MEGLNWLRFS WAQGTDTILA DEMGLGKTVQ TAVFLYSLYK EGHSKGPFLV SAPLSTIINW EREFEMWAPD MYVVTYVGDK DSRAIIRENE FSFEDNAIRG GKKASRMKKE ASVKFHVLLT SYELITIDMA ILGSIDWACL IVDEAHRLKN NQSKFFRVLN GYSLQHKLLL TGTPLQNNLE ELFHLLNFLT PERFHNLEGF LEEFADIAKE DQIKKLHDML GPHMLRRLKA DVFKNMPSKT ELIVRVELSP MQKKYYKYIL TRNFEALNAR GGGNQVSLLN VVMDLKKCCN HPYLFPVAAM EAPKMPNGMY DGSALIRASG KLLLLQKMLK NLKEGGHRVL IFSQMTKMLD LLEDFLEHEG YKYERIDGGI TGNMRQEAID RFNAPGAQQF CFLLSTRAGG LGINLATADT VIIYDSDWNP HNDIQAFSRA HRIGQNKKVM IYRFVTRASV EERITQVAKK KMMLTHLVVR PGLGSKTGSM SKQELDDILK FGTEELFKDE ATDGGGDNKE GEDSSVIHYD DKAIERLLDR NQDETEDTEL QGMNEYLSSF KVAQYVVREE EMGEEEEVER EIIKQEESVD PDYWEKLLRH HYEQQQEDLA RNLGKGKRIR KQVNYNDGSQ EDRDWQDDQS DNQSDYSVAS EEGDEDFDER SEAPRRPSRK GLRNDKDKPL PPLLARVGGN IEVLGFNARQ RKAFLNAIMR YGMPPQDAFT TQWLVRDLRG KSEKEFKAYV SLFMRHLCEP GADGAETFAD GVPREGLSRQ HVLTRIGVMS LIRKKVQEFE HVNGRWSMPE LAEVEENKKM SQPGSPSPKT PTPSTPGDTQ PNTPAPVPPA EDGIKIEENS LKEEESIEGE KEVKSTAPET AIECTQAPAP ASEDEKVVVE PPEGEEKVEK AEVKERTEEP METEPKGAAD VEKVEEKSAI DLTPIVVEDK EEKKEEEEKK EVMLQNGETP KDLNDEKQKK NIKQRFMFNI ADGGFTELHS LWQNEERAAT VTKKTYEIWH RRHDYWLLAG IINHGYARWQ DIQNDPRYAI LNEPFKGEMN RGNFLEIKNK FLARRFKLLE QALVIEEQLR RAAYLNMSED PSHPSMALNT RFAEVECLAE SHQHLSKESM AGNKPANAVL HKVLKQLEEL LSDMKADVTR LPATIARIPP VAVRLQMSER NILSRLANRA PEPTPQQVAQ QQ* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.80 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999652757322094 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr12:6711147C>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CHD4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000544040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q14839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.396G>T cDNA.599G>T g.5496G>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | E132D Score: 45 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs1639122
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K9me1, Histone, Histone 3 Lysine 9 mono-methylation H4K20me1, Histone, Histone 4 Lysine 20 mono-methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites | no abrogation of potential splice sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5718 / 5718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1906 / 1906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 5921 / 5921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 204 / 204 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 599 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 6711147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGATGATTCAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPENEEDPE EDLSETETPK LKKKKKPKKP RDPKIPKSKR QKKELGDSSG EGPEFVEEEE EVALRSDSEG SDYTPGKKKK KKLGPKKEKK SKSKRKEEEE EEDDDDDSKE PKSSAQLLED WGMEDIDHVF SEEDYRTLTN YKAFSQFVRP LIAAKNPKIA VSKMMMVLGA KWREFSTNNP FKGSSGASVA AAAAAAVAVV ESMVTATEVA PPPPPVEVPI RKAKTKEGKG PNARRKPKGS PRVPDAKKPK PKKVAPLKIK LGGFGSKRKR SSSEDDDLDV ESDFDDASIN SYSVSDGSTS RSSRSRKKLR TTKKKKKGEE EVTAVDGYET DHQDYCEVCQ QGGEIILCDT CPRAYHMVCL DPDMEKAPEG KWSCPHCEKE GIQWEAKEDN SEGEEILEEV GGDLEEEDDH HMEFCRVCKD GGELLCCDTC PSSYHIHCLN PPLPEIPNGE WLCPRCTCPA LKGKVQKILI WKWGQPPSPT PVPRPPDADP NTPSPKPLEG RPERQFFVKW QGMSYWHCSW VSELQLELHC QVMFRNYQRK NDMDEPPSGD FGGDEEKSRK RKNKDPKFAE MEERFYRYGI KPEWMMIHRI LNHSVDKKGH VHYLIKWRDL PYDQASWESE DVEIQDYDLF KQSYWNHREL MRGEEGRPGK KLKKVKLRKL ERPPETPTVD PTVKYERQPE YLDATGGTLH PYQMEGLNWL RFSWAQGTDT ILADEMGLGK TVQTAVFLYS LYKEGHSKGP FLVSAPLSTI INWEREFEMW APDMYVVTYV GDKDSRAIIR ENEFSFEDNA IRGGKKASRM KKEASVKFHV LLTSYELITI DMAILGSIDW ACLIVDEAHR LKNNQSKFFR VLNGYSLQHK LLLTGTPLQN NLEELFHLLN FLTPERFHNL EGFLEEFADI AKEDQIKKLH DMLGPHMLRR LKADVFKNMP SKTELIVRVE LSPMQKKYYK YILTRNFEAL NARGGGNQVS LLNVVMDLKK CCNHPYLFPV AAMEAPKMPN GMYDGSALIR ASGKLLLLQK MLKNLKEGGH RVLIFSQMTK MLDLLEDFLE HEGYKYERID GGITGNMRQE AIDRFNAPGA QQFCFLLSTR AGGLGINLAT ADTVIIYDSD WNPHNDIQAF SRAHRIGQNK KVMIYRFVTR ASVEERITQV AKKKMMLTHL VVRPGLGSKT GSMSKQELDD ILKFGTEELF KDEATDGGGD NKEGEDSSVI HYDDKAIERL LDRNQDETED TELQGMNEYL SSFKVAQYVV REEEMGEEEE VEREIIKQEE SVDPDYWEKL LRHHYEQQQE DLARNLGKGK RIRKQVNYND GSQEDRDWQD DQSDNQSDYS VASEEGDEDF DERSEAPRRP SRKGLRNDKD KPLPPLLARV GGNIEVLGFN ARQRKAFLNA IMRYGMPPQD AFTTQWLVRD LRGKSEKEFK AYVSLFMRHL CEPGADGAET FADGVPREGL SRQHVLTRIG VMSLIRKKVQ EFEHVNGRWS MPELAEVEEN KKMSQPGSPS PKTPTPSTPG DTQPNTPAPV PPAEDGIKIE ENSLKEEESI EGEKEVKSTA PETAIECTQA PAPASEDEKV VVEPPEGEEK VEKAEVKERT EEPMETEPKG AADVEKVEEK SAIDLTPIVV EDKEEKKEEE EKKEVMLQNG ETPKDLNDEK QKKNIKQRFM FNIADGGFTE LHSLWQNEER AATVTKKTYE IWHRRHDYWL LAGIINHGYA RWQDIQNDPR YAILNEPFKG EMNRGNFLEI KNKFLARRFK LLEQALVIEE QLRRAAYLNM SEDPSHPSMA LNTRFAEVEC LAESHQHLSK ESMAGNKPAN AVLHKVLKQL EELLSDMKAD VTRLPATIAR IPPVAVRLQM SERNILSRLA NRAPEPTPQQ VAQQQ* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MASGLGSPSP CSAGSEEEDM DALLNNSLPP PHPENEEDPE EDLSETETPK LKKKKKPKKP RDPKIPKSKR QKKELGDSSG EGPEFVEEEE EVALRSDSEG SDYTPGKKKK KKLGPKKEKK SKSKRKEEEE EDDDDDDSKE PKSSAQLLED WGMEDIDHVF SEEDYRTLTN YKAFSQFVRP LIAAKNPKIA VSKMMMVLGA KWREFSTNNP FKGSSGASVA AAAAAAVAVV ESMVTATEVA PPPPPVEVPI RKAKTKEGKG PNARRKPKGS PRVPDAKKPK PKKVAPLKIK LGGFGSKRKR SSSEDDDLDV ESDFDDASIN SYSVSDGSTS RSSRSRKKLR TTKKKKKGEE EVTAVDGYET DHQDYCEVCQ QGGEIILCDT CPRAYHMVCL DPDMEKAPEG KWSCPHCEKE GIQWEAKEDN SEGEEILEEV GGDLEEEDDH HMEFCRVCKD GGELLCCDTC PSSYHIHCLN PPLPEIPNGE WLCPRCTCPA LKGKVQKILI WKWGQPPSPT PVPRPPDADP NTPSPKPLEG RPERQFFVKW QGMSYWHCSW VSELQLELHC QVMFRNYQRK NDMDEPPSGD FGGDEEKSRK RKNKDPKFAE MEERFYRYGI KPEWMMIHRI LNHSVDKKGH VHYLIKWRDL PYDQASWESE DVEIQDYDLF KQSYWNHREL MRGEEGRPGK KLKKVKLRKL ERPPETPTVD PTVKYERQPE YLDATGGTLH PYQMEGLNWL RFSWAQGTDT ILADEMGLGK TVQTAVFLYS LYKEGHSKGP FLVSAPLSTI INWEREFEMW APDMYVVTYV GDKDSRAIIR ENEFSFEDNA IRGGKKASRM KKEASVKFHV LLTSYELITI DMAILGSIDW ACLIVDEAHR LKNNQSKFFR VLNGYSLQHK LLLTGTPLQN NLEELFHLLN FLTPERFHNL EGFLEEFADI AKEDQIKKLH DMLGPHMLRR LKADVFKNMP SKTELIVRVE LSPMQKKYYK YILTRNFEAL NARGGGNQVS LLNVVMDLKK CCNHPYLFPV AAMEAPKMPN GMYDGSALIR ASGKLLLLQK MLKNLKEGGH RVLIFSQMTK MLDLLEDFLE HEGYKYERID GGITGNMRQE AIDRFNAPGA QQFCFLLSTR AGGLGINLAT ADTVIIYDSD WNPHNDIQAF SRAHRIGQNK KVMIYRFVTR ASVEERITQV AKKKMMLTHL VVRPGLGSKT GSMSKQELDD ILKFGTEELF KDEATDGGGD NKEGEDSSVI HYDDKAIERL LDRNQDETED TELQGMNEYL SSFKVAQYVV REEEMGEEEE VEREIIKQEE SVDPDYWEKL LRHHYEQQQE DLARNLGKGK RIRKQVNYND GSQEDRDWQD DQSDNQSDYS VASEEGDEDF DERSEAPRRP SRKGLRNDKD KPLPPLLARV GGNIEVLGFN ARQRKAFLNA IMRYGMPPQD AFTTQWLVRD LRGKSEKEFK AYVSLFMRHL CEPGADGAET FADGVPREGL SRQHVLTRIG VMSLIRKKVQ EFEHVNGRWS MPELAEVEEN KKMSQPGSPS PKTPTPSTPG DTQPNTPAPV PPAEDGIKIE ENSLKEEESI EGEKEVKSTA PETAIECTQA PAPASEDEKV VVEPPEGEEK VEKAEVKERT EEPMETEPKG AADVEKVEEK SAIDLTPIVV EDKEEKKEEE EKKEVMLQNG ETPKDLNDEK QKKNIKQRFM FNIADGGFTE LHSLWQNEER AATVTKKTYE IWHRRHDYWL LAGIINHGYA RWQDIQNDPR YAILNEPFKG EMNRGNFLEI KNKFLARRFK LLEQALVIEE QLRRAAYLNM SEDPSHPSMA LNTRFAEVEC LAESHQHLSK ESMAGNKPAN AVLHKVLKQL EELLSDMKAD VTRLPATIAR IPPVAVRLQM SERNILSRLA NRAPEPTPQQ VAQQQ* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.62 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||