MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
NIN | polymorphism_automatic | 3.64805220098852e-06 | simple_aae | affected | Q1221E | single base exchange | rs2295847 | show file | |||
NIN | polymorphism_automatic | 4.93479595498059e-06 | simple_aae | affected | Q1221E | single base exchange | rs2295847 | show file | |||
NIN | polymorphism_automatic | 0.000357395645748992 | simple_aae | affected | Q1934E | single base exchange | rs2295847 | show file | |||
NIN | polymorphism_automatic | 0.000357395645748992 | simple_aae | affected | Q1934E | single base exchange | rs2295847 | show file | |||
NIN | polymorphism_automatic | 0.000357395645748992 | simple_aae | affected | Q1934E | single base exchange | rs2295847 | show file | |||
NIN | polymorphism_automatic | 0.000357395645748992 | simple_aae | affected | Q1934E | single base exchange | rs2295847 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999996351947799 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:51202311G>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | NIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000382043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_016350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8N4C6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.3661C>G cDNA.3698C>G g.95529C>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | Q1221E Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2295847
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 4134 / 4134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1378 / 1378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 4171 / 4171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 38 / 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 3977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 3889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 4134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 3661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3698 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 95529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 51202311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR YESEKLQQEN SILRNEITTL NEEDSISNLK LGTLNGSQEE MWQKTETVKQ ENAAVQKMVE NLKKQISELK IKNQQLDLEN TELSQKNSQN QEKLQELNQR LTEMLCQKEK EPGNSALEER EQEKFNLKEE LERCKVQSST LVSSLEAELS EVKIQTHIVQ QENHLLKDEL EKMKQLHRCP DLSDFQQKIS SVLSYNEKLL KEKEALSEEL NSCVDKLAKS SLLEHRIATM KQEQKSWEHQ SASLKSQLVA SQEKVQNLED TVQNVNLQMS RMKSDLRVTQ QEKEALKQEV MSLHKQLQNA GGKSWAPEIA THPSGLHNQQ KRLSWDKLDH LMNEEQQLLW QENERLQTMV QNTKAELTHS REKVRQLESN LLPKHQKHLN PSGTMNPTEQ EKLSLKRECD QFQKEQSPAN RKVSQMNSLE QELETIHLEN EGLKKKQVKL DEQLMEMQHL RSTATPSPSP HAWDLQLLQQ QACPMVPREQ FLQLQRQLLQ AERINQHLQE ELENRTSETN TPQGNQEQLV TVMEERMIEV EQKLKLVKRL LQEKVNQLKE QVSLPGHLCS PTSHSSFNSS FTSLYCH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR YESEKLQQEN SILRNEITTL NEEDSISNLK LGTLNGSQEE MWQKTETVKQ ENAAVQKMVE NLKKQISELK IKNQQLDLEN TELSQKNSQN QEKLQELNQR LTEMLCQKEK EPGNSALEER EQEKFNLKEE LERCKVQSST LVSSLEAELS EVKIQTHIVQ QENHLLKDEL EKMKQLHRCP DLSDFQQKIS SVLSYNEKLL KEKEALSEEL NSCVDKLAKS SLLEHRIATM KQEQKSWEHQ SASLKSQLVA SQEKVQNLED TVQNVNLQMS RMKSDLRVTQ QEKEALKQEV MSLHKQLQNA GGKSWAPEIA THPSGLHNQQ KRLSWDKLDH LMNEEQQLLW QENERLQTMV QNTKAELTHS REKVRQLESN LLPKHQKHLN PSGTMNPTEQ EKLSLKRECD QFQKEQSPAN RKVSQMNSLE EELETIHLEN EGLKKKQVKL DEQLMEMQHL RSTATPSPSP HAWDLQLLQQ QACPMVPREQ FLQLQRQLLQ AERINQHLQE ELENRTSETN TPQGNQEQLV TVMEERMIEV EQKLKLVKRL LQEKVNQLKE QVSLPGHLCS PTSHSSFNSS FTSLYCH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.51 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999995065204045 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:51202311G>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | NIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000389868 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8N4C6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.3661C>G cDNA.3852C>G g.95529C>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | Q1221E Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2295847
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 3831 / 3831 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1277 / 1277 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 4022 / 4022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 192 / 192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 4306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 4064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 3831 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 3661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 95529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 51202311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR YESEKLQQEN SILRNEITTL NEEDSISNLK LGTLNGSQEE MWQKTETVKQ ENAAVQKMVE NLKKQISELK IKNQQLDLEN TELSQKNSQN QEKLQELNQR LTEMLCQKEK EPGNSALEER EQEKFNLKEE LERCKVQSST LVSSLEAELS EVKIQTHIVQ QENHLLKDEL EKMKQLHRCP DLSDFQQKIS SVLSYNEKLL KEKEALSEEL NSCVDKLAKS SLLEHRIATM KQEQKSWEHQ SASLKSQLVA SQEKVQNLED TVQNVNLQMS RMKSDLRVTQ QEKEALKQEV MSLHKQLQNA GGKSWAPEIA THPSGLHNQQ KRLSWDKLDH LMNEEQQLLW QENERLQTMV QNTKAELTHS REKVRQLESN LLPKHQKHLN PSGTMNPTEQ EKLSLKRECD QFQKEQSPAN RKVSQMNSLE QELETIHLEN EGLKKKQVKL DEQLMENSVV GSSREGCSSL PEIVCEDAAP EVHCDA* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR YESEKLQQEN SILRNEITTL NEEDSISNLK LGTLNGSQEE MWQKTETVKQ ENAAVQKMVE NLKKQISELK IKNQQLDLEN TELSQKNSQN QEKLQELNQR LTEMLCQKEK EPGNSALEER EQEKFNLKEE LERCKVQSST LVSSLEAELS EVKIQTHIVQ QENHLLKDEL EKMKQLHRCP DLSDFQQKIS SVLSYNEKLL KEKEALSEEL NSCVDKLAKS SLLEHRIATM KQEQKSWEHQ SASLKSQLVA SQEKVQNLED TVQNVNLQMS RMKSDLRVTQ QEKEALKQEV MSLHKQLQNA GGKSWAPEIA THPSGLHNQQ KRLSWDKLDH LMNEEQQLLW QENERLQTMV QNTKAELTHS REKVRQLESN LLPKHQKHLN PSGTMNPTEQ EKLSLKRECD QFQKEQSPAN RKVSQMNSLE EELETIHLEN EGLKKKQVKL DEQLMENSVV GSSREGCSSL PEIVCEDAAP EVHCDA* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 1.39 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999642604354251 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:51202311G>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | NIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000382041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_182946 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8N4C6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.5800C>G cDNA.5991C>G g.95529C>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | Q1934E Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2295847
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 6273 / 6273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 2091 / 2091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6464 / 6464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 192 / 192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 6270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 6028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 6273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 5800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 95529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 51202311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEQELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEM QHLRSTATPS PSPHAWDLQL LQQQACPMVP REQFLQLQRQ LLQAERINQH LQEELENRTS ETNTPQGNQE QLVTVMEERM IEVEQKLKLV KRLLQEKVNQ LKEQVSLPGH LCSPTSHSSF NSSFTSLYCH * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEEELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEM QHLRSTATPS PSPHAWDLQL LQQQACPMVP REQFLQLQRQ LLQAERINQH LQEELENRTS ETNTPQGNQE QLVTVMEERM IEVEQKLKLV KRLLQEKVNQ LKEQVSLPGH LCSPTSHSSF NSSFTSLYCH * | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.96 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999642604354251 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:51202311G>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | NIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000453196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_182944 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8N4C6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.5800C>G cDNA.5991C>G g.95529C>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | Q1934E Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2295847
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 6141 / 6141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 2047 / 2047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6332 / 6332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 192 / 192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 6270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 6028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 6141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 5800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 95529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 51202311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEQELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEM QHLRSTATPS PSPHAWDLQL LQQQACPMVP REQFLQLQRQ LLQAERINQH LQEELENRTS ETNTPQALLP EQRAVHADSY RRIGHL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEEELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEM QHLRSTATPS PSPHAWDLQL LQQQACPMVP REQFLQLQRQ LLQAERINQH LQEELENRTS ETNTPQALLP EQRAVHADSY RRIGHL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.52 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999642604354251 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:51202311G>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | NIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000245441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_020921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8N4C6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.5800C>G cDNA.5991C>G g.95529C>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | Q1934E Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2295847
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 6402 / 6402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 2134 / 2134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6593 / 6593 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 192 / 192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 6384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 6142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 6402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 5800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 95529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 51202311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEQELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEM QHLRSTATPS PSPHAWDLQL LQQQACPMVP REQFLQLQRQ LLQAERINQH LQEELENRTS ETNTPQGNQE QLVTVMEERM IEVEQKLKLV KRLLQEKVNQ LKEQLCKNTK ADAMVKDLYV ENAQLLKALE VTEQRQKTAE KKNYLLEEKI ASLSNIVRNL TPAPLTSTPP LRS* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEEELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEM QHLRSTATPS PSPHAWDLQL LQQQACPMVP REQFLQLQRQ LLQAERINQH LQEELENRTS ETNTPQGNQE QLVTVMEERM IEVEQKLKLV KRLLQEKVNQ LKEQLCKNTK ADAMVKDLYV ENAQLLKALE VTEQRQKTAE KKNYLLEEKI ASLSNIVRNL TPAPLTSTPP LRS* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 1.40 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999642604354251 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:51202311G>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | NIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000324330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8N4C6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.5800C>G cDNA.5991C>G g.95529C>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | Q1934E Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2295847
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5970 / 5970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1990 / 1990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6161 / 6161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 192 / 192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 6331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 6089 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 5800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 95529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 51202311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAACAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTCAGATGAATTCCCTTGAAGAAGAATTAGAAACAATTCAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEQELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEN SVVGSSREGC SSLPEIVCED AAPEVHCDA* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDEVEQDQHE ARLKELFDSF DTTGTGSLGQ EELTDLCHML SLEEVAPVLQ QTLLQDNLLG RVHFDQFKEA LILILSRTLS NEEHFQEPDC SLEAQPKYVR GGKRYGRRSL PEFQESVEEF PEVTVIEPLD EEARPSHIPA GDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQ LRFWNPDDLN ASQSGSSPPQ DWIEEKLQEV CEDLGITRDG HLNRKKLVSI CEQYGLQNVD GEMLEEVFHN LDPDGTMSVE DFFYGLFKNG KSLTPSASTP YRQLKRHLSM QSFDESGRRT TTSSAMTSTI GFRVFSCLDD GMGHASVERI LDTWQEEGIE NSQEILKALD FSLDGNINLT ELTLALENEL LVTKNSIHQA ALASFKAEIR HLLERVDQVV REKEKLRSDL DKAEKLKSLM ASEVDDHHAA IERRNEYNLR KLDEEYKERI AALKNELRKE REQILQQAGK QRLELEQEIE KAKTEENYIR DRLALSLKEN SRLENELLEN AEKLAEYENL TNKLQRNLEN VLAEKFGDLD PSSAEFFLQE ERLTQMRNEY ERQCRVLQDQ VDELQSELEE YRAQGRVLRL PLKNSPSEEV EANSGGIEPE HGLGSEECNP LNMSIEAELV IEQMKEQHHR DICCLRLELE DKVRHYEKQL DETVVSCKKA QENMKQRHEN ETHTLEKQIS DLKNEIAELQ GQAAVLKEAH HEATCRHEEE KKQLQVKLEE EKTHLQEKLR LQHEMELKAR LTQAQASFER EREGLQSSAW TEEKVRGLTQ ELEQFHQEQL TSLVEKHTLE KEELRKELLE KHQRELQEGR EKMETECNRR TSQIEAQFQS DCQKVTERCE SALQSLEGRY RQELKDLQEQ QREEKSQWEF EKDELTQECA EAQELLKETL KREKTTSLVL TQEREMLEKT YKEHLNSMVV ERQQLLQDLE DLRNVSETQQ SLLSDQILEL KSSHKRELRE REEVLCQAGA SEQLASQRLE RLEMEHDQER QEMMSKLLAM ENIHKATCET ADRERAEMST EISRLQSKIK EMQQATSPLS MLQSGCQVIG EEEVEGDGAL SLLQQGEQLL EENGDVLLSL QRAHEQAVKE NVKMATEISR LQQRLQKLEP GLVMSSCLDE PATEFFGNTA EQTEQFLQQN RTKQVEGVTR RHVLSDLEDD EVRDLGSTGT SSVQRQEVKI EESEASVEGF SELENSEETR TESWELKNQI SQLQEQLMML CADCDRASEK KQDLLFDVSV LKKKLKMLER IPEASPKYKL LYEDVSREND CLQEELRMME TRYDEALENN KELTAEVFRL QDELKKMEEV TETFLSLEKS YDEVKIENEG LNVLVLRLQG KIEKLQESVV QRCDCCLWEA SLENLEIEPD GNILQLNQTL EECVPRVRSV HHVIEECKQE NQYLEGNTQL LEKVKAHEIA WLHGTIQTHQ ERPRVQNQVI LEENTTLLGF QDKHFQHQAT IAELELEKTK LQELTRKLKE RVTILVKQKD VLSHGEKEEE LKAMMHDLQI TCSEMQQKVE LLRYESEKLQ QENSILRNEI TTLNEEDSIS NLKLGTLNGS QEEMWQKTET VKQENAAVQK MVENLKKQIS ELKIKNQQLD LENTELSQKN SQNQEKLQEL NQRLTEMLCQ KEKEPGNSAL EEREQEKFNL KEELERCKVQ SSTLVSSLEA ELSEVKIQTH IVQQENHLLK DELEKMKQLH RCPDLSDFQQ KISSVLSYNE KLLKEKEALS EELNSCVDKL AKSSLLEHRI ATMKQEQKSW EHQSASLKSQ LVASQEKVQN LEDTVQNVNL QMSRMKSDLR VTQQEKEALK QEVMSLHKQL QNAGGKSWAP EIATHPSGLH NQQKRLSWDK LDHLMNEEQQ LLWQENERLQ TMVQNTKAEL THSREKVRQL ESNLLPKHQK HLNPSGTMNP TEQEKLSLKR ECDQFQKEQS PANRKVSQMN SLEEELETIH LENEGLKKKQ VKLDEQLMEN SVVGSSREGC SSLPEIVCED AAPEVHCDA* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.93 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||