MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
SYNE2 | polymorphism_automatic | 1.25207955115059e-10 | simple_aae | affected | I2975V | single base exchange | rs3829767 | show file | |||
SYNE2 | polymorphism_automatic | 1.25207955115059e-10 | simple_aae | affected | I2942V | single base exchange | rs3829767 | show file | |||
SYNE2 | polymorphism_automatic | 1.25207955115059e-10 | simple_aae | affected | I2942V | single base exchange | rs3829767 | show file | |||
SYNE2 | polymorphism_automatic | 0.000637375099269977 | without_aae | affected | single base exchange | rs3829767 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999874792 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:64519455A>GN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | SYNE2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000554584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8WXH0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.8923A>G cDNA.8974A>G g.199773A>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | I2975V Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 2975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs3829767
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features |
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length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 20457 / 20457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 6819 / 6819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 20508 / 20508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 52 / 52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 20263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 20161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 20457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 8923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 8974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 199773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 64519455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MASSPELPTE DEQGSWGIDD LHISLQAEQE DTQKKAFTCW INSQLARHTS PSVISDLFTD IKKGHVLLDL LEVLSGQQLP RDKGSNTFQC RINIEHALTF LRNRSIKLIN IHVTDIIDGN PSIILGLIWT IILHFHIEKL AQTLSCNYNQ PSLDDVSVVD SSPASSPPAK KCSKVQARWQ MSARKALLLW AQEQCATYES VNVTDFKSSW RNGMAFLAII HALRPDLIDM KSVKHRSNKD NLREAFRIAE QELKIPRLLE PEDVDVVDPD EKSIMTYVAQ FLQYSKDAPG TGEEAQGKVK DAMGWLTLQK EKLQKLLKDS ENDTYFKKYN SLLSFMESFN EEKKSFLDVL SIKRDLDELD KDHLQLREAW DGLDHQINAW KIKLNYALPP PLHQTEAWLQ EVEELMDEDL SASQDHSQAV TLIQEKMTLF KSLMDRFEHH SNILLTFENK DENHLPLVPP NKLEEMKRRI NNILEKKFIL LLEFHYYKCL VLGLVDEVKS KLDIWNIKYG SRESVELLLE DWHKFIEEKE FLARLDTSFQ KCGEIYKNLA GECQNINKQY MMVKSDVCMY RKNIYNVKST LQKVLACWAT YVENLRLLRA CFEETKKEEI KEVPFETLAQ WNLEHATLNE AGNFLVEVSN DVVGSSISKE LRRLNKRWRK LVSKTQLEMN LPLMIKKQDQ PTFDNSGNIL SKEEKATVEF STDMSVELPE NYNQNIKAGE KHEKENEEFT GQLKVAKDVE KLIGQVEIWE AEAKSVLDQD DVDTSMEESL KHLIAKGSMF DELMARSEDM LQMDIQNISS QESFQHVLTT GLQAKIQEAK EKVQINVVKL IAALKNLTDV SPDLDIRLKM EESQKELESY MMRAQQLLGQ RESPGELISK HKEALIISNT KSLAKYLKAV EELKNNVTED IKMSLEEKSR DVCAKWESLH HELSLYVQQL KIDIEKGKLS DNILKLEKQI NKEKKLIRRG RTKGLIKEHE ACFSEEGCLY QLNHHMEVLR ELCEELPSQK SQQEVKRLLK DYEQKIERLL KCASEIHMTL QPTAGGTSKN EGTITTSENR GGDPHSEAPF AKSDNQPSTE KAMEPTMKFS LASVLRPLQE ESIMEKDYSA SINSLLERYD TYRDILEHHL QNNKFRITSD FSSEEDRSSS CLQAKLTDLQ VIKNETDARW KEFEIISLKL ENHVNDIKKP FVIKERDTLK ERERELQMTL NTRMESLETA LRLVLPVEKA SLLLCGSDLP LHKMAIQGFH LIDADRIYQH LRNIQDSIAK QIEICNRLEE PGNFVLKELH PFDLHAMQNI ILKYKTQFEG MNHRVQRSED TLKALEDFLA SLRTAKLSAE PVTDLSASDT QVAQENTLTV KNKEGEIHLM KDKAKHLDKC LKMLDMSFKD AERGDDTSCE NLLDAFSIKL SETHGYGVQE EFTEENKLLE ACIFKNNELL KNIQDVQSQI SKIGLKDPTV PAVKHRKKSL IRLDKVLDEY EEEKRHLQEM ANSLPHFKDG REKTVNQQCQ NTVVLWENTK ALVTECLEQC GRVLELLKQY QNFKSILTTL IQKEESVISL QASYMGKENL KKRIAEIEIV KEEFNEHLEV VDKINQVCKN LQFYLNKMKT FEEPPFEKEA NIIVDRWLDI NEKTEDYYEN LGRALALWDK LFNLKNVIDE WTEKALQKME LHQLTEEDRE RLKEELQVHE QKTSEFSRRV AEIQFLLQSS EIPLELQVME SSILNKMEHV QKCLTGESNC HALSGSTAEL REDLDQAKTQ IGMTESLLKA LSPSDSLEIF TKLEEIQQQI LQQKHSMILL ENQIGCLTPE LSELKKQYES VSDLFNTKKS VLQDHFSKLL NDQCKNFNDW FSNIKVNLKE CFESSETKKS VEQKLQKLSD FLTLEGRNSK IKQVDSVLKH VKKHLPKAHV KELISWLVGQ EFELEKMESI CQARAKELED SLQQLLRLQD DHRNLRKWLT NQEEKWKGME EPGEKTELFC QALARKREQF ESVAQLNNSL KEYGFTEEEE IIMEATCLMD RYQTLLRQLS EIEEEDKLLP TEDQSFNDLA HDVIHWIKEI KESLMVLNSS EGKMPLEERI QKIKEIILLK PEGDARIETI MKQAESSEAP LVQKTLTDIS NQWDNTLHLA STYLSHQEKL LLEGEKYLQS KEDLRLMLIE LKKKQEAGFA LQHGLQEKKA QLKIYKKFLK KAQDLTSLLK ELKSQGNYLL ECTKNPSFSE EPWLEIKHLH ESLLQQLQDS VQNLDGHVRE HDSYQVCVTD LNTTLDNFSK EFVSFSDKPV DQIAVEEKLQ KLQELENRLS LQDGTLKKIL ALAKSVKQNT SSVGQKIIKD DIKSLQCKQK DLENRLASAK QEMECCLNSI LKSKRSTEKK GKFTLPGREK QATSDVQEST QESAAVEKLE EDWEINKNFV ENVMAVSKNC HHSMYIFESI VKNFISDEMQ DSAVEMAMSK QLSLNAQESM KNTEDERKVN ELQNQPLELD TMLRNEQLEE IEKLYTQLEA KKAAIKPLEQ TECLNKTETG ALVLHNIGYS AQHLDNLLQA LITLKKNKES QYCVLRDFQE YLAAVESSMK ALLTDKESLK VGPLDSVTYL DKIKKFIASI EKEKDSLGNL KIKWENLSNH VTDMDKKLLE SQIKQLEHGW EQVEQQIQKK YSQQVVEYDE FTTLMNKVQD TEISLQQQQQ HLQLRLKSPE ERAGNQSMIA LTTDLQATKH GFSVLKGQAE LQMKRIWGEK EKKNLEDGIN NLKKQWETLE PLHLEAENQI KKCDIRNKMK ETILWAKNLL GELNPSIPLL PDDILSQIRK CKVTHDGILA RQQSVESLAE EVKDKVPSLT TYEGSDLNNT LEDLRNQYQM LVLKSTQRSQ QLEFKLEERS NFFAIIRKFQ LMVQESETLI IPRVETAATE AELKHHHVTL EASQKELQEI DSGISTHLQE LTNIYEELNV FERLFLEDQL KNLKIRTNRI QRFIQNTCNE VEHKIKFCRQ FHEKTSALQE EADSIQRNEL LLNQEVNKGV KEEIYNLKDR LTAIKCCILQ VLKLKKVFDY IGLNWDFSQL DQLQTQVFEK EKELEEKIKQ LDTFEEEHGK YQALLSKMRA IDLQIKKMTE VVLKAPDSSP ESRRLNAQIL SQRIEKAKCL CDEIIKKLNE NKTFDDSFKE KEILQIKLNA EENDKLYKVL QNMVLELSPK ELDEKNCQDK LETSLHVLNQ IKSQLQQPLL INLEIKHIQN EKDNCEAFQE QVWAEMCSIK AVTAIEKQRE ENSSEASDVE TKLREFEDLQ MQLNTSIDLR TNVLNDAYEN LTRYKEAVTR AVESITSLEA IIIPYRVDVG NPEESLEMPL RKQEELESTV AHIQDLTEKL GMISSPEAKL QLQYTLQELV SKNSAMKEAF KAQETEAERY LENYKCYRKM EEDIYTNLSK METVLGQSMS SLPLSYREAL ERLEQSKALV SNLISTKEEL MKLRQILRLL RLRCTENDGI CLLKIVSALW EKWLSLLEAA KEWEMWCEEL KQEWKFVSEE IEREAIILDN LQEELPEISK TKEAATTEEL SELLDCLCQY GENVEKQQLL LTLLLQRIRS IQNVPESSGA VETVPAFQEI TSMKERCNKL LQKVQKNKEL VQTEIQERHS FTKEIIALKN FFQQTTTSFQ NMAFQDHPEK SEQFEELQSI LKKGKLTFEN IMEKLRIKYS EMYTIVPAEI ESQVEECRKA LEDIDEKISN EVLKSSPSYA MRRKIEEINN GLHNVEKMLQ QKSKNIEKAQ EIQKKMWDEL DLWHSKLNEL DSEVQDIVEQ DPGQAQEWMD NLMIPFQQYQ QVSQRAECRT SQLNKATVKM EEYSDLLKST EAWIENTSHL LANPADYDSL RTLSHHASTV QMALEDSEQK HNLLHSIFMD LEDLSIIFET DELTQSIQEL SNQVTALQQK IMESLPQIQR MADDVVAIES EVKSMEKRVS KIKTILLSKE IFDFSPEEHL KHGEVILENI RPMKKTIAEI VSYQVELRLP QTGMKPLPVF QRTNQLLQDI KLLENVTQEQ NELLKVVIKQ TNEWDEEIEN LKQILNNYSA QFSLEHMSPD QADKLPQLQG EIERMEKQIL SLNQRKEDLL VDLKATVLNL HQHLKQEQEG VERDRLPAVT SEEGGVAERD ASERKLNRRG SMSYLAAVEE EVEESSVKSD HDKDMEEDRA SSSSGTIVQE AYGKISTSDN SMAQILTPDS LNTEQGPECS LRPNQTEEGT TPPIEADTLD SSDAQGGLEP RVEKTRPEPT EVLHACKTQV AELELWLQQA NVAVEPETLN ADMQQVLEQQ LVGCQAMLTE IEHKVAFLLE TCKDQGLGDN GATQHEAEAL SLKLKTVKCN LEKVQMMLQE KHSEDQHPTI LKKSSEPEHQ EALQPVNLSE LESIVTERPQ FSRQKDFQQQ QVLELKPMEQ KDFIKFIEFN AKKMWPQYCQ HDNDTTQESS ARYPTTEELK TYTTQLEDLR QEASNLQTQE NMTEEAYINL DKKLFELFLT LSQCLSSVEE MLEMPRLYRE DGSGQQVHYE TLALELKKLY LALSDKKGDL LKAMTWPGEN TNLLLECFDN LQVCLEHTQA AAVCRSKSLK AGLDYNRSYQ KADAYTVELE NAESRVAKLR DEGERLHLPY ALLQEVYKLE DVLDSMWGML RARYTELSSP FVTESQQDAL LQGMVELVKI GKEKLAHGHL KQTKSKVALQ AQIENHKVFF QKLVADMLLI QAYSAKILPS LLQNRETFWA EQVTEVKILE EKSRQCGMKL QSLLQKWEEF DENYASLEKD LEILISTLPS VSLVEETEER LVERISFYQQ IKRNIGGKHA RLYQTLNEGK QLVASVSCPE LEGQIAKLEE QWLSLNKKID HELHRLQALL KHLLSYNRDS DQLTKWLESS QHTLNYWKEQ SLNVSQDLDT IRSNINNFFE FSKEVDEKSS LKTAVISIGN QLLHLKETDT ATLRASLAQF EQKWTMLITQ LPDIQEKLHQ LQMEKLPSRK AITEMISWMN NVEHQTSDED SVHSPSSASQ VKHLLQKHKE FRMEMDYKQW IVDFVNQSLL QLSTCDVESK RYERTEFAEH LGEMNRQWHR VHGMLNRKIQ HLEQLLESIT ESENKIQILN NWLEAQEERL KTLQKPESVI SVQKLLLDCQ DIENQLAIKS KALDELKQSY LTLESGAVPL LEDTASRIDE LFQKRSSVLT QVNQLKTSMQ SVLQEWKIYD QLYDEVNMMT IRFWYCMEHS KPVVLSLETL RCQVENLQSL QDEAESSEGS WEKLQEVIGK LKGLCPSVAE IIEEKCQNTH KRWTQVNQAI ADQLQKAQSL LQLWKAYSNA HGEAAARLKQ QEAKFQQLAN ISMSGNNLAE ILPPALQDIK ELQHDVQKTK EAFLQNSSVL DRLPQPAESS THMLLPGPLH SLQRAAYLEK MLLVKANEFE NHVLALTAQS PDIEHLNEVS LKLPLSDVAV KTLQNMNRQW IRATATALER CSELQGIGLN EKFLYCCEKW IQLLEKIEEA LKVDVANSLP ELLEQQKTYK MLEAEVSINQ TIADSYVTQS LQLLDTTEIE NRPEFITEFS KLTDRWQNAV QGVRQRKGDV DGLNAHVARC GGASLKKQDL RYSLHTACGA ALLCRSSHGA NKEIHFQRRR TTCALTLEAG EKLLLTTDLK TKESVGRRIS QLQDSWKDME PQLAEMIKQF QSTVETWDQC EKKIKELKSR LQVLKAQSED PLPELHEDLH NEKELIKVAI RKQEIEDRLN TWVVFNEKNK ELCAWLVQME NKVLQTADIS IEEMIEKLQK RTVGREEVPE RWECETIVSG HGTEESCFLS IRKFHQGRGL HILTCQLIPQ DCMEEINLFS ENKLQLKQMG DQLIKASNKS RAAEIDDKLN KINDRWQHLF DVIGSSMADQ TNSRWMFFQW PRGIQRTVTW PWDHLCSCAS TGHTGPFHSS VLRCFEQHIE FGIYRRTYKV NKELGGDKNG QRCPIIYPHG LVQCIRLGEP LILKRVKKLK ETFAFIQQLD KNMSNLRTWL ARIESELSKP VVYDVCDDQE IQKRLAEQQD LQRDIEQHSA GVESVFNICD VLLHDSDACA NETECDSIQQ TTRSLDRRWR NICAMSMERR MKIEETWRLW QKFLDDYSRF EDWLKSAERT AACPNSSEVL YTSAKEELKR FERQIHERLT QLELINKQYR RLARENRTDT ASRLKQMVHE GNQRWDNLQR RVTAVLRRLR HFTNQREEFE GTRESILVWL TEMDLQLTNV EHFSESDADD KMRQLNGFQQ EITLNTNKID QLIVFGEQLI QKSEPLDAVL IEDELEELHR YCQEGLEDEK EASENETDME DPREIQTDSW RKRGESEEPS SPQSLCHLVA PGHERSGCET PVSVDSIPLE WDHTGDVGGS SSHEEDEEGP YYSALSGKSI SDGHSWHVPD SPSCPEHHYK QMEGDRNVPP VPPASSTPYK PPYVSLNFTG STAYVCAFDR WEMIQAQELH NKLKIKQNLQ QLNSDISAIT TWLKKTEAEL EMLKMAKPPS DIQEIELRVK RLQEILKAFD TYKALVVSVN VSSKEFLQTE SPESTELQSR LRQLSLLWEA AQGAVDSWRG GLRQSLMQCQ DFHQLSQNLL LWLASAKNRR QKAHVTDPKA DPRALLECRR ELMQLEKELV ERQPQVDMLQ EISNSLLIKG HGEDCIEAEE KVHVIEKKLK QLREQVSQDL MALQGTQNPA SPLPSFDEVD SGDQPPATSV PAPRAKFLYP AVQSSENYRR RGGDREQGPR QHTATALLPL KGGPGSPTPA AAPPAAAAPG LPAALLRRRL QLHSGQQLCP VLLPHAEVHQ WATPHIEGIA GHSATPPA* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MASSPELPTE DEQGSWGIDD LHISLQAEQE DTQKKAFTCW INSQLARHTS PSVISDLFTD IKKGHVLLDL LEVLSGQQLP RDKGSNTFQC RINIEHALTF LRNRSIKLIN IHVTDIIDGN PSIILGLIWT IILHFHIEKL AQTLSCNYNQ PSLDDVSVVD SSPASSPPAK KCSKVQARWQ MSARKALLLW AQEQCATYES VNVTDFKSSW RNGMAFLAII HALRPDLIDM KSVKHRSNKD NLREAFRIAE QELKIPRLLE PEDVDVVDPD EKSIMTYVAQ FLQYSKDAPG TGEEAQGKVK DAMGWLTLQK EKLQKLLKDS ENDTYFKKYN SLLSFMESFN EEKKSFLDVL SIKRDLDELD KDHLQLREAW DGLDHQINAW KIKLNYALPP PLHQTEAWLQ EVEELMDEDL SASQDHSQAV TLIQEKMTLF KSLMDRFEHH SNILLTFENK DENHLPLVPP NKLEEMKRRI NNILEKKFIL LLEFHYYKCL VLGLVDEVKS KLDIWNIKYG SRESVELLLE DWHKFIEEKE FLARLDTSFQ KCGEIYKNLA GECQNINKQY MMVKSDVCMY RKNIYNVKST LQKVLACWAT YVENLRLLRA CFEETKKEEI KEVPFETLAQ WNLEHATLNE AGNFLVEVSN DVVGSSISKE LRRLNKRWRK LVSKTQLEMN LPLMIKKQDQ PTFDNSGNIL SKEEKATVEF STDMSVELPE NYNQNIKAGE KHEKENEEFT GQLKVAKDVE KLIGQVEIWE AEAKSVLDQD DVDTSMEESL KHLIAKGSMF DELMARSEDM LQMDIQNISS QESFQHVLTT GLQAKIQEAK EKVQINVVKL IAALKNLTDV SPDLDIRLKM EESQKELESY MMRAQQLLGQ RESPGELISK HKEALIISNT KSLAKYLKAV EELKNNVTED IKMSLEEKSR DVCAKWESLH HELSLYVQQL KIDIEKGKLS DNILKLEKQI NKEKKLIRRG RTKGLIKEHE ACFSEEGCLY QLNHHMEVLR ELCEELPSQK SQQEVKRLLK DYEQKIERLL KCASEIHMTL QPTAGGTSKN EGTITTSENR GGDPHSEAPF AKSDNQPSTE KAMEPTMKFS LASVLRPLQE ESIMEKDYSA SINSLLERYD TYRDILEHHL QNNKFRITSD FSSEEDRSSS CLQAKLTDLQ VIKNETDARW KEFEIISLKL ENHVNDIKKP FVIKERDTLK ERERELQMTL NTRMESLETA LRLVLPVEKA SLLLCGSDLP LHKMAIQGFH LIDADRIYQH LRNIQDSIAK QIEICNRLEE PGNFVLKELH PFDLHAMQNI ILKYKTQFEG MNHRVQRSED TLKALEDFLA SLRTAKLSAE PVTDLSASDT QVAQENTLTV KNKEGEIHLM KDKAKHLDKC LKMLDMSFKD AERGDDTSCE NLLDAFSIKL SETHGYGVQE EFTEENKLLE ACIFKNNELL KNIQDVQSQI SKIGLKDPTV PAVKHRKKSL IRLDKVLDEY EEEKRHLQEM ANSLPHFKDG REKTVNQQCQ NTVVLWENTK ALVTECLEQC GRVLELLKQY QNFKSILTTL IQKEESVISL QASYMGKENL KKRIAEIEIV KEEFNEHLEV VDKINQVCKN LQFYLNKMKT FEEPPFEKEA NIIVDRWLDI NEKTEDYYEN LGRALALWDK LFNLKNVIDE WTEKALQKME LHQLTEEDRE RLKEELQVHE QKTSEFSRRV AEIQFLLQSS EIPLELQVME SSILNKMEHV QKCLTGESNC HALSGSTAEL REDLDQAKTQ IGMTESLLKA LSPSDSLEIF TKLEEIQQQI LQQKHSMILL ENQIGCLTPE LSELKKQYES VSDLFNTKKS VLQDHFSKLL NDQCKNFNDW FSNIKVNLKE CFESSETKKS VEQKLQKLSD FLTLEGRNSK IKQVDSVLKH VKKHLPKAHV KELISWLVGQ EFELEKMESI CQARAKELED SLQQLLRLQD DHRNLRKWLT NQEEKWKGME EPGEKTELFC QALARKREQF ESVAQLNNSL KEYGFTEEEE IIMEATCLMD RYQTLLRQLS EIEEEDKLLP TEDQSFNDLA HDVIHWIKEI KESLMVLNSS EGKMPLEERI QKIKEIILLK PEGDARIETI MKQAESSEAP LVQKTLTDIS NQWDNTLHLA STYLSHQEKL LLEGEKYLQS KEDLRLMLIE LKKKQEAGFA LQHGLQEKKA QLKIYKKFLK KAQDLTSLLK ELKSQGNYLL ECTKNPSFSE EPWLEIKHLH ESLLQQLQDS VQNLDGHVRE HDSYQVCVTD LNTTLDNFSK EFVSFSDKPV DQIAVEEKLQ KLQELENRLS LQDGTLKKIL ALAKSVKQNT SSVGQKIIKD DIKSLQCKQK DLENRLASAK QEMECCLNSI LKSKRSTEKK GKFTLPGREK QATSDVQEST QESAAVEKLE EDWEINKNFV ENVMAVSKNC HHSMYIFESI VKNFISDEMQ DSAVEMAMSK QLSLNAQESM KNTEDERKVN ELQNQPLELD TMLRNEQLEE IEKLYTQLEA KKAAIKPLEQ TECLNKTETG ALVLHNIGYS AQHLDNLLQA LITLKKNKES QYCVLRDFQE YLAAVESSMK ALLTDKESLK VGPLDSVTYL DKIKKFIASI EKEKDSLGNL KIKWENLSNH VTDMDKKLLE SQIKQLEHGW EQVEQQIQKK YSQQVVEYDE FTTLMNKVQD TEISLQQQQQ HLQLRLKSPE ERAGNQSMIA LTTDLQATKH GFSVLKGQAE LQMKRIWGEK EKKNLEDGIN NLKKQWETLE PLHLEAENQI KKCDIRNKMK ETILWAKNLL GELNPSIPLL PDDILSQIRK CKVTHDGILA RQQSVESLAE EVKDKVPSLT TYEGSDLNNT LEDLRNQYQM LVLKSTQRSQ QLEFKLEERS NFFAIIRKFQ LMVQESETLI IPRVETAATE AELKHHHVTL EASQKELQEI DSGISTHLQE LTNIYEELNV FERLFLEDQL KNLKIRTNRI QRFIQNTCNE VEHKVKFCRQ FHEKTSALQE EADSIQRNEL LLNQEVNKGV KEEIYNLKDR LTAIKCCILQ VLKLKKVFDY IGLNWDFSQL DQLQTQVFEK EKELEEKIKQ LDTFEEEHGK YQALLSKMRA IDLQIKKMTE VVLKAPDSSP ESRRLNAQIL SQRIEKAKCL CDEIIKKLNE NKTFDDSFKE KEILQIKLNA EENDKLYKVL QNMVLELSPK ELDEKNCQDK LETSLHVLNQ IKSQLQQPLL INLEIKHIQN EKDNCEAFQE QVWAEMCSIK AVTAIEKQRE ENSSEASDVE TKLREFEDLQ MQLNTSIDLR TNVLNDAYEN LTRYKEAVTR AVESITSLEA IIIPYRVDVG NPEESLEMPL RKQEELESTV AHIQDLTEKL GMISSPEAKL QLQYTLQELV SKNSAMKEAF KAQETEAERY LENYKCYRKM EEDIYTNLSK METVLGQSMS SLPLSYREAL ERLEQSKALV SNLISTKEEL MKLRQILRLL RLRCTENDGI CLLKIVSALW EKWLSLLEAA KEWEMWCEEL KQEWKFVSEE IEREAIILDN LQEELPEISK TKEAATTEEL SELLDCLCQY GENVEKQQLL LTLLLQRIRS IQNVPESSGA VETVPAFQEI TSMKERCNKL LQKVQKNKEL VQTEIQERHS FTKEIIALKN FFQQTTTSFQ NMAFQDHPEK SEQFEELQSI LKKGKLTFEN IMEKLRIKYS EMYTIVPAEI ESQVEECRKA LEDIDEKISN EVLKSSPSYA MRRKIEEINN GLHNVEKMLQ QKSKNIEKAQ EIQKKMWDEL DLWHSKLNEL DSEVQDIVEQ DPGQAQEWMD NLMIPFQQYQ QVSQRAECRT SQLNKATVKM EEYSDLLKST EAWIENTSHL LANPADYDSL RTLSHHASTV QMALEDSEQK HNLLHSIFMD LEDLSIIFET DELTQSIQEL SNQVTALQQK IMESLPQIQR MADDVVAIES EVKSMEKRVS KIKTILLSKE IFDFSPEEHL KHGEVILENI RPMKKTIAEI VSYQVELRLP QTGMKPLPVF QRTNQLLQDI KLLENVTQEQ NELLKVVIKQ TNEWDEEIEN LKQILNNYSA QFSLEHMSPD QADKLPQLQG EIERMEKQIL SLNQRKEDLL VDLKATVLNL HQHLKQEQEG VERDRLPAVT SEEGGVAERD ASERKLNRRG SMSYLAAVEE EVEESSVKSD HDKDMEEDRA SSSSGTIVQE AYGKISTSDN SMAQILTPDS LNTEQGPECS LRPNQTEEGT TPPIEADTLD SSDAQGGLEP RVEKTRPEPT EVLHACKTQV AELELWLQQA NVAVEPETLN ADMQQVLEQQ LVGCQAMLTE IEHKVAFLLE TCKDQGLGDN GATQHEAEAL SLKLKTVKCN LEKVQMMLQE KHSEDQHPTI LKKSSEPEHQ EALQPVNLSE LESIVTERPQ FSRQKDFQQQ QVLELKPMEQ KDFIKFIEFN AKKMWPQYCQ HDNDTTQESS ARYPTTEELK TYTTQLEDLR QEASNLQTQE NMTEEAYINL DKKLFELFLT LSQCLSSVEE MLEMPRLYRE DGSGQQVHYE TLALELKKLY LALSDKKGDL LKAMTWPGEN TNLLLECFDN LQVCLEHTQA AAVCRSKSLK AGLDYNRSYQ KADAYTVELE NAESRVAKLR DEGERLHLPY ALLQEVYKLE DVLDSMWGML RARYTELSSP FVTESQQDAL LQGMVELVKI GKEKLAHGHL KQTKSKVALQ AQIENHKVFF QKLVADMLLI QAYSAKILPS LLQNRETFWA EQVTEVKILE EKSRQCGMKL QSLLQKWEEF DENYASLEKD LEILISTLPS VSLVEETEER LVERISFYQQ IKRNIGGKHA RLYQTLNEGK QLVASVSCPE LEGQIAKLEE QWLSLNKKID HELHRLQALL KHLLSYNRDS DQLTKWLESS QHTLNYWKEQ SLNVSQDLDT IRSNINNFFE FSKEVDEKSS LKTAVISIGN QLLHLKETDT ATLRASLAQF EQKWTMLITQ LPDIQEKLHQ LQMEKLPSRK AITEMISWMN NVEHQTSDED SVHSPSSASQ VKHLLQKHKE FRMEMDYKQW IVDFVNQSLL QLSTCDVESK RYERTEFAEH LGEMNRQWHR VHGMLNRKIQ HLEQLLESIT ESENKIQILN NWLEAQEERL KTLQKPESVI SVQKLLLDCQ DIENQLAIKS KALDELKQSY LTLESGAVPL LEDTASRIDE LFQKRSSVLT QVNQLKTSMQ SVLQEWKIYD QLYDEVNMMT IRFWYCMEHS KPVVLSLETL RCQVENLQSL QDEAESSEGS WEKLQEVIGK LKGLCPSVAE IIEEKCQNTH KRWTQVNQAI ADQLQKAQSL LQLWKAYSNA HGEAAARLKQ QEAKFQQLAN ISMSGNNLAE ILPPALQDIK ELQHDVQKTK EAFLQNSSVL DRLPQPAESS THMLLPGPLH SLQRAAYLEK MLLVKANEFE NHVLALTAQS PDIEHLNEVS LKLPLSDVAV KTLQNMNRQW IRATATALER CSELQGIGLN EKFLYCCEKW IQLLEKIEEA LKVDVANSLP ELLEQQKTYK MLEAEVSINQ TIADSYVTQS LQLLDTTEIE NRPEFITEFS KLTDRWQNAV QGVRQRKGDV DGLNAHVARC GGASLKKQDL RYSLHTACGA ALLCRSSHGA NKEIHFQRRR TTCALTLEAG EKLLLTTDLK TKESVGRRIS QLQDSWKDME PQLAEMIKQF QSTVETWDQC EKKIKELKSR LQVLKAQSED PLPELHEDLH NEKELIKVAI RKQEIEDRLN TWVVFNEKNK ELCAWLVQME NKVLQTADIS IEEMIEKLQK RTVGREEVPE RWECETIVSG HGTEESCFLS IRKFHQGRGL HILTCQLIPQ DCMEEINLFS ENKLQLKQMG DQLIKASNKS RAAEIDDKLN KINDRWQHLF DVIGSSMADQ TNSRWMFFQW PRGIQRTVTW PWDHLCSCAS TGHTGPFHSS VLRCFEQHIE FGIYRRTYKV NKELGGDKNG QRCPIIYPHG LVQCIRLGEP LILKRVKKLK ETFAFIQQLD KNMSNLRTWL ARIESELSKP VVYDVCDDQE IQKRLAEQQD LQRDIEQHSA GVESVFNICD VLLHDSDACA NETECDSIQQ TTRSLDRRWR NICAMSMERR MKIEETWRLW QKFLDDYSRF EDWLKSAERT AACPNSSEVL YTSAKEELKR FERQIHERLT QLELINKQYR RLARENRTDT ASRLKQMVHE GNQRWDNLQR RVTAVLRRLR HFTNQREEFE GTRESILVWL TEMDLQLTNV EHFSESDADD KMRQLNGFQQ EITLNTNKID QLIVFGEQLI QKSEPLDAVL IEDELEELHR YCQEGLEDEK EASENETDME DPREIQTDSW RKRGESEEPS SPQSLCHLVA PGHERSGCET PVSVDSIPLE WDHTGDVGGS SSHEEDEEGP YYSALSGKSI SDGHSWHVPD SPSCPEHHYK QMEGDRNVPP VPPASSTPYK PPYVSLNFTG STAYVCAFDR WEMIQAQELH NKLKIKQNLQ QLNSDISAIT TWLKKTEAEL EMLKMAKPPS DIQEIELRVK RLQEILKAFD TYKALVVSVN VSSKEFLQTE SPESTELQSR LRQLSLLWEA AQGAVDSWRG GLRQSLMQCQ DFHQLSQNLL LWLASAKNRR QKAHVTDPKA DPRALLECRR ELMQLEKELV ERQPQVDMLQ EISNSLLIKG HGEDCIEAEE KVHVIEKKLK QLREQVSQDL MALQGTQNPA SPLPSFDEVD SGDQPPATSV PAPRAKFLYP AVQSSENYRR RGGDREQGPR QHTATALLPL KGGPGSPTPA AAPPAAAAPG LPAALLRRRL QLHSGQQLCP VLLPHAEVHQ WATPHIEGIA GHSATPPA* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.61 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999874792 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:64519455A>GN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | SYNE2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000344113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_015180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8WXH0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.8824A>G cDNA.9036A>G g.199773A>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | I2942V Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 2942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs3829767
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 20658 / 20658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 6886 / 6886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 20870 / 20870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 213 / 213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 20663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 20400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 20658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 8824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 199773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 64519455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MASSPELPTE DEQGSWGIDD LHISLQAEQE DTQKKAFTCW INSQLARHTS PSVISDLFTD IKKGHVLLDL LEVLSGQQLP RDKGSNTFQC RINIEHALTF LRNRSIKLIN IHVTDIIDGN PSIILGLIWT IILHFHIEKL AQTLSCNYNQ PSLDDVSVVD SSPASSPPAK KCSKVQARWQ MSARKALLLW AQEQCATYES VNVTDFKSSW RNGMAFLAII HALRPDLIDM KSVKHRSNKD NLREAFRIAE QELKIPRLLE PEDVDVVDPD EKSIMTYVAQ FLQYSKDAPG TGEEAQGKVK DAMGWLTLQK EKLQKLLKDS ENDTYFKKYN SLLSFMESFN EEKKSFLDVL SIKRDLDELD KDHLQLREAW DGLDHQINAW KIKLNYALPP PLHQTEAWLQ EVEELMDEDL SASQDHSQAV TLIQEKMTLF KSLMDRFEHH SNILLTFENK DENHLPLVPP NKLEEMKRRI NNILEKKFIL LLEFHYYKCL VLGLVDEVKS KLDIWNIKYG SRESVELLLE DWHKFIEEKE FLARLDTSFQ KCGEIYKNLA GECQNINKQY MMVKSDVCMY RKNIYNVKST LQKVLACWAT YVENLRLLRA CFEETKKEEI KEVPFETLAQ WNLEHATLNE AGNFLVEVSN DVVGSSISKE LRRLNKRWRK LVSKTQLEMN LPLMIKKQDQ PTFDNSGNIL SKEEKATVEF STDMSVELPE NYNQNIKAGE KHEKENEEFT GQLKVAKDVE KLIGQVEIWE AEAKSVLDQD DVDTSMEESL KHLIAKGSMF DELMARSEDM LQMDIQNISS QESFQHVLTT GLQAKIQEAK EKVQINVVKL IAALKNLTDV SPDLDIRLKM EESQKELESY MMRAQQLLGQ RESPGELISK HKEALIISNT KSLAKYLKAV EELKNNVTED IKMSLEEKSR DVCAKWESLH HELSLYVQQL KIDIEKGKLS DNILKLEKQI NKEKKLIRRG RTKGLIKEHE ACFSEEGCLY QLNHHMEVLR ELCEELPSQK SQQEVKRLLK DYEQKIERLL KCASEIHMTL QPTAGGTSKN EGTITTSENR GGDPHSEAPF AKSDNQPSTE KAMEPTMKFS LASVLRPLQE ESIMEKDYSA SINSLLERYD TYRDILEHHL QNNKFRITSD FSSEEDRSSS CLQAKLTDLQ VIKNETDARW KEFEIISLKL ENHVNDIKKP FVIKERDTLK ERERELQMTL NTRMESLETA LRLVLPVEKA SLLLCGSDLP LHKMAIQGFH LIDADRIYQH LRNIQDSIAK QIEICNRLEE PGNFVLKELH PFDLHAMQNI ILKYKTQFEG MNHRVQRSED TLKALEDFLA SLRTAKLSAE PVTDLSASDT QVAQENTLTV KNKEGEIHLM KDKAKHLDKC LKMLDMSFKD AERGDDTSCE NLLDAFSIKL SETHGYGVQE EFTEENKLLE ACIFKNNELL KNIQDVQSQI SKIGLKDPTV PAVKHRKKSL IRLDKVLDEY EEEKRHLQEM ANSLPHFKDG REKTVNQQCQ NTVVLWENTK ALVTECLEQC GRVLELLKQY QNFKSILTTL IQKEESVISL QASYMGKENL KKRIAEIEIV KEEFNEHLEV VDKINQVCKN LQFYLNKMKT FEEPPFEKEA NIIVDRWLDI NEKTEDYYEN LGRALALWDK LFNLKNVIDE WTEKALQKME LHQLTEEDRE RLKEELQVHE QKTSEFSRRV AEIQFLLQSS EIPLELQVME SSILNKMEHV QKCLTGESNC HALSGSTAEL REDLDQAKTQ IGMTESLLKA LSPSDSLEIF TKLEEIQQQI LQQKHSMILL ENQIGCLTPE LSELKKQYES VSDLFNTKKS VLQDHFSKLL NDQCKNFNDW FSNIKVNLKE CFESSETKKS VEQKLQKLSD FLTLEGRNSK IKQVDSVLKH VKKHLPKAHV KELISWLVGQ EFELEKMESI CQARAKELED SLQQLLRLQD DHRNLRKWLT NQEEKWKGME EPGEKTELFC QALARKREQF ESVAQLNNSL KEYGFTEEEE IIMEATCLMD RYQTLLRQLS EIEEEDKLLP TEDQSFNDLA HDVIHWIKEI KESLMVLNSS EGKMPLEERI QKIKEIILLK PEGDARIETI MKQAESSEAP LVQKTLTDIS NQWDNTLHLA STYLSHQEKL LLEGEKYLQS KEDLRLMLIE LKKKQEAGFA LQHGLQEKKA QLKIYKKFLK KAQDLTSLLK ELKSQGNYLL ECTKNPSFSE EPWLEIKHLH ESLLQQLQDS VQNLDGHVRE HDSYQVCVTD LNTTLDNFSK EFVSFSDKPV DQIAVEEKLQ KLQELENRLS LQDGTLKKIL ALAKSVKQNT SSVGQKIIKD DIKSLQCKQK DLENRLASAK QEMECCLNSI LKSKRSTEKK GKFTLPGREK QATSDVQEST QESAAVEKLE EDWEINKDSA VEMAMSKQLS LNAQESMKNT EDERKVNELQ NQPLELDTML RNEQLEEIEK LYTQLEAKKA AIKPLEQTEC LNKTETGALV LHNIGYSAQH LDNLLQALIT LKKNKESQYC VLRDFQEYLA AVESSMKALL TDKESLKVGP LDSVTYLDKI KKFIASIEKE KDSLGNLKIK WENLSNHVTD MDKKLLESQI KQLEHGWEQV EQQIQKKYSQ QVVEYDEFTT LMNKVQDTEI SLQQQQQHLQ LRLKSPEERA GNQSMIALTT DLQATKHGFS VLKGQAELQM KRIWGEKEKK NLEDGINNLK KQWETLEPLH LEAENQIKKC DIRNKMKETI LWAKNLLGEL NPSIPLLPDD ILSQIRKCKV THDGILARQQ SVESLAEEVK DKVPSLTTYE GSDLNNTLED LRNQYQMLVL KSTQRSQQLE FKLEERSNFF AIIRKFQLMV QESETLIIPR VETAATEAEL KHHHVTLEAS QKELQEIDSG ISTHLQELTN IYEELNVFER LFLEDQLKNL KIRTNRIQRF IQNTCNEVEH KIKFCRQFHE KTSALQEEAD SIQRNELLLN QEVNKGVKEE IYNLKDRLTA IKCCILQVLK LKKVFDYIGL NWDFSQLDQL QTQVFEKEKE LEEKIKQLDT FEEEHGKYQA LLSKMRAIDL QIKKMTEVVL KAPDSSPESR RLNAQILSQR IEKAKCLCDE IIKKLNENKT FDDSFKEKEI LQIKLNAEEN DKLYKVLQNM VLELSPKELD EKNCQDKLET SLHVLNQIKS QLQQPLLINL EIKHIQNEKD NCEAFQEQVW AEMCSIKAVT AIEKQREENS SEASDVETKL REFEDLQMQL NTSIDLRTNV LNDAYENLTR YKEAVTRAVE SITSLEAIII PYRVDVGNPE ESLEMPLRKQ EELESTVAHI QDLTEKLGMI SSPEAKLQLQ YTLQELVSKN SAMKEAFKAQ ETEAERYLEN YKCYRKMEED IYTNLSKMET VLGQSMSSLP LSYREALERL EQSKALVSNL ISTKEELMKL RQILRLLRLR CTENDGICLL KIVSALWEKW LSLLEAAKEW EMWCEELKQE WKFVSEEIER EAIILDNLQE ELPEISKTKE AATTEELSEL LDCLCQYGEN VEKQQLLLTL LLQRIRSIQN VPESSGAVET VPAFQEITSM KERCNKLLQK VQKNKELVQT EIQERHSFTK EIIALKNFFQ QTTTSFQNMA 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mutated AA sequence | MASSPELPTE DEQGSWGIDD LHISLQAEQE DTQKKAFTCW INSQLARHTS PSVISDLFTD IKKGHVLLDL LEVLSGQQLP RDKGSNTFQC RINIEHALTF LRNRSIKLIN IHVTDIIDGN PSIILGLIWT IILHFHIEKL AQTLSCNYNQ PSLDDVSVVD SSPASSPPAK KCSKVQARWQ MSARKALLLW AQEQCATYES VNVTDFKSSW RNGMAFLAII HALRPDLIDM KSVKHRSNKD NLREAFRIAE QELKIPRLLE PEDVDVVDPD EKSIMTYVAQ FLQYSKDAPG TGEEAQGKVK DAMGWLTLQK EKLQKLLKDS ENDTYFKKYN SLLSFMESFN EEKKSFLDVL SIKRDLDELD KDHLQLREAW DGLDHQINAW KIKLNYALPP PLHQTEAWLQ EVEELMDEDL SASQDHSQAV TLIQEKMTLF KSLMDRFEHH SNILLTFENK DENHLPLVPP NKLEEMKRRI NNILEKKFIL LLEFHYYKCL VLGLVDEVKS KLDIWNIKYG SRESVELLLE DWHKFIEEKE FLARLDTSFQ KCGEIYKNLA GECQNINKQY MMVKSDVCMY RKNIYNVKST LQKVLACWAT YVENLRLLRA CFEETKKEEI KEVPFETLAQ WNLEHATLNE AGNFLVEVSN DVVGSSISKE LRRLNKRWRK LVSKTQLEMN LPLMIKKQDQ PTFDNSGNIL SKEEKATVEF STDMSVELPE NYNQNIKAGE KHEKENEEFT GQLKVAKDVE KLIGQVEIWE AEAKSVLDQD DVDTSMEESL KHLIAKGSMF DELMARSEDM LQMDIQNISS QESFQHVLTT GLQAKIQEAK EKVQINVVKL IAALKNLTDV SPDLDIRLKM EESQKELESY MMRAQQLLGQ RESPGELISK HKEALIISNT KSLAKYLKAV EELKNNVTED IKMSLEEKSR DVCAKWESLH HELSLYVQQL KIDIEKGKLS DNILKLEKQI NKEKKLIRRG RTKGLIKEHE ACFSEEGCLY QLNHHMEVLR ELCEELPSQK SQQEVKRLLK DYEQKIERLL KCASEIHMTL QPTAGGTSKN EGTITTSENR GGDPHSEAPF AKSDNQPSTE KAMEPTMKFS LASVLRPLQE ESIMEKDYSA SINSLLERYD TYRDILEHHL QNNKFRITSD FSSEEDRSSS CLQAKLTDLQ VIKNETDARW KEFEIISLKL ENHVNDIKKP FVIKERDTLK ERERELQMTL NTRMESLETA LRLVLPVEKA SLLLCGSDLP LHKMAIQGFH LIDADRIYQH LRNIQDSIAK QIEICNRLEE PGNFVLKELH PFDLHAMQNI ILKYKTQFEG MNHRVQRSED TLKALEDFLA SLRTAKLSAE PVTDLSASDT QVAQENTLTV KNKEGEIHLM KDKAKHLDKC LKMLDMSFKD AERGDDTSCE NLLDAFSIKL SETHGYGVQE EFTEENKLLE ACIFKNNELL KNIQDVQSQI SKIGLKDPTV PAVKHRKKSL IRLDKVLDEY EEEKRHLQEM ANSLPHFKDG REKTVNQQCQ NTVVLWENTK ALVTECLEQC GRVLELLKQY QNFKSILTTL IQKEESVISL QASYMGKENL KKRIAEIEIV KEEFNEHLEV VDKINQVCKN LQFYLNKMKT FEEPPFEKEA NIIVDRWLDI NEKTEDYYEN LGRALALWDK LFNLKNVIDE WTEKALQKME LHQLTEEDRE RLKEELQVHE QKTSEFSRRV AEIQFLLQSS EIPLELQVME SSILNKMEHV QKCLTGESNC HALSGSTAEL REDLDQAKTQ IGMTESLLKA LSPSDSLEIF TKLEEIQQQI LQQKHSMILL ENQIGCLTPE LSELKKQYES VSDLFNTKKS VLQDHFSKLL NDQCKNFNDW FSNIKVNLKE CFESSETKKS VEQKLQKLSD FLTLEGRNSK IKQVDSVLKH VKKHLPKAHV KELISWLVGQ EFELEKMESI CQARAKELED SLQQLLRLQD DHRNLRKWLT NQEEKWKGME EPGEKTELFC QALARKREQF ESVAQLNNSL KEYGFTEEEE IIMEATCLMD RYQTLLRQLS EIEEEDKLLP TEDQSFNDLA HDVIHWIKEI KESLMVLNSS EGKMPLEERI QKIKEIILLK PEGDARIETI MKQAESSEAP LVQKTLTDIS NQWDNTLHLA STYLSHQEKL LLEGEKYLQS KEDLRLMLIE LKKKQEAGFA LQHGLQEKKA QLKIYKKFLK KAQDLTSLLK ELKSQGNYLL ECTKNPSFSE EPWLEIKHLH ESLLQQLQDS VQNLDGHVRE HDSYQVCVTD LNTTLDNFSK EFVSFSDKPV DQIAVEEKLQ KLQELENRLS LQDGTLKKIL ALAKSVKQNT SSVGQKIIKD DIKSLQCKQK DLENRLASAK QEMECCLNSI LKSKRSTEKK GKFTLPGREK QATSDVQEST QESAAVEKLE EDWEINKDSA VEMAMSKQLS LNAQESMKNT EDERKVNELQ NQPLELDTML RNEQLEEIEK LYTQLEAKKA AIKPLEQTEC LNKTETGALV LHNIGYSAQH LDNLLQALIT LKKNKESQYC VLRDFQEYLA AVESSMKALL TDKESLKVGP LDSVTYLDKI KKFIASIEKE KDSLGNLKIK WENLSNHVTD MDKKLLESQI KQLEHGWEQV EQQIQKKYSQ QVVEYDEFTT LMNKVQDTEI SLQQQQQHLQ LRLKSPEERA GNQSMIALTT DLQATKHGFS VLKGQAELQM KRIWGEKEKK NLEDGINNLK KQWETLEPLH LEAENQIKKC DIRNKMKETI LWAKNLLGEL NPSIPLLPDD ILSQIRKCKV THDGILARQQ SVESLAEEVK DKVPSLTTYE GSDLNNTLED LRNQYQMLVL KSTQRSQQLE FKLEERSNFF AIIRKFQLMV QESETLIIPR VETAATEAEL KHHHVTLEAS QKELQEIDSG ISTHLQELTN IYEELNVFER LFLEDQLKNL KIRTNRIQRF IQNTCNEVEH KVKFCRQFHE KTSALQEEAD SIQRNELLLN QEVNKGVKEE IYNLKDRLTA IKCCILQVLK LKKVFDYIGL NWDFSQLDQL QTQVFEKEKE LEEKIKQLDT FEEEHGKYQA LLSKMRAIDL QIKKMTEVVL KAPDSSPESR RLNAQILSQR IEKAKCLCDE IIKKLNENKT FDDSFKEKEI LQIKLNAEEN DKLYKVLQNM VLELSPKELD EKNCQDKLET SLHVLNQIKS QLQQPLLINL EIKHIQNEKD NCEAFQEQVW AEMCSIKAVT AIEKQREENS SEASDVETKL REFEDLQMQL NTSIDLRTNV LNDAYENLTR YKEAVTRAVE SITSLEAIII PYRVDVGNPE ESLEMPLRKQ EELESTVAHI QDLTEKLGMI SSPEAKLQLQ YTLQELVSKN SAMKEAFKAQ ETEAERYLEN YKCYRKMEED IYTNLSKMET VLGQSMSSLP LSYREALERL EQSKALVSNL ISTKEELMKL RQILRLLRLR CTENDGICLL KIVSALWEKW LSLLEAAKEW EMWCEELKQE WKFVSEEIER EAIILDNLQE ELPEISKTKE AATTEELSEL LDCLCQYGEN VEKQQLLLTL LLQRIRSIQN VPESSGAVET VPAFQEITSM KERCNKLLQK VQKNKELVQT EIQERHSFTK EIIALKNFFQ QTTTSFQNMA FQDHPEKSEQ 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KKLFELFLTL SQCLSSVEEM LEMPRLYRED GSGQQVHYET LALELKKLYL ALSDKKGDLL KAMTWPGENT NLLLECFDNL QVCLEHTQAA AVCRSKSLKA GLDYNRSYQN EIKRLYHQLI KSKTSLQQSL NEISGQSVAE QLQKADAYTV ELENAESRVA KLRDEGERLH LPYALLQEVY KLEDVLDSMW GMLRARYTEL SSPFVTESQQ DALLQGMVEL VKIGKEKLAH GHLKQTKSKV ALQAQIENHK VFFQKLVADM LLIQAYSAKI LPSLLQNRET FWAEQVTEVK ILEEKSRQCG MKLQSLLQKW EEFDENYASL EKDLEILIST LPSVSLVEET EERLVERISF YQQIKRNIGG KHARLYQTLN EGKQLVASVS CPELEGQIAK LEEQWLSLNK KIDHELHRLQ ALLKHLLSYN RDSDQLTKWL ESSQHTLNYW KEQSLNVSQD LDTIRSNINN FFEFSKEVDE KSSLKTAVIS IGNQLLHLKE TDTATLRASL AQFEQKWTML ITQLPDIQEK LHQLQMEKLP SRKAITEMIS WMNNVEHQTS DEDSVHSPSS ASQVKHLLQK HKEFRMEMDY KQWIVDFVNQ SLLQLSTCDV ESKRYERTEF AEHLGEMNRQ WHRVHGMLNR KIQHLEQLLE SITESENKIQ ILNNWLEAQE ERLKTLQKPE SVISVQKLLL DCQDIENQLA IKSKALDELK QSYLTLESGA VPLLEDTASR IDELFQKRSS VLTQVNQLKT SMQSVLQEWK IYDQLYDEVN MMTIRFWYCM EHSKPVVLSL ETLRCQVENL QSLQDEAESS EGSWEKLQEV IGKLKGLCPS VAEIIEEKCQ NTHKRWTQVN QAIADQLQKA QSLLQLWKAY SNAHGEAAAR LKQQEAKFQQ LANISMSGNN LAEILPPALQ DIKELQHDVQ KTKEAFLQNS SVLDRLPQPA ESSTHMLLPG PLHSLQRAAY LEKMLLVKAN EFEFVLSQFK DFGVRLESLK GLIMHEEENL DRLHQQEKEN PDSFLNHVLA LTAQSPDIEH LNEVSLKLPL SDVAVKTLQN MNRQWIRATA TALERCSELQ GIGLNEKFLY CCEKWIQLLE KIEEALKVDV ANSLPELLEQ QKTYKMLEAE VSINQTIADS YVTQSLQLLD TTEIENRPEF ITEFSKLTDR WQNAVQGVRQ RKGDVDGLVR QWQDFTTSVE NLFRFLTDTS HLLSAVKGQE RFSLYQTRSL IHELKNKEIH FQRRRTTCAL TLEAGEKLLL TTDLKTKESV GRRISQLQDS WKDMEPQLAE MIKQFQSTVE TWDQCEKKIK ELKSRLQVLK AQSEDPLPEL HEDLHNEKEL IKELEQSLAS WTQNLKELQT MKADLTRHVL VEDVMVLKEQ IEHLHRQWED LCLRVAIRKQ EIEDRLNTWV VFNEKNKELC AWLVQMENKV LQTADISIEE MIEKLQKDCM EEINLFSENK LQLKQMGDQL IKASNKSRAA EIDDKLNKIN DRWQHLFDVI GSRVKKLKET FAFIQQLDKN MSNLRTWLAR IESELSKPVV YDVCDDQEIQ KRLAEQQDLQ RDIEQHSAGV ESVFNICDVL LHDSDACANE TECDSIQQTT RSLDRRWRNI CAMSMERRMK IEETWRLWQK FLDDYSRFED WLKSAERTAA CPNSSEVLYT SAKEELKRFE AFQRQIHERL TQLELINKQY RRLARENRTD TASRLKQMVH EGNQRWDNLQ RRVTAVLRRL RHFTNQREEF EGTRESILVW LTEMDLQLTN VEHFSESDAD DKMRQLNGFQ QEITLNTNKI DQLIVFGEQL IQKSEPLDAV LIEDELEELH RYCQEVFGRV SRFHRRLTSC 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speed | 0.56 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999874792 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:64519455A>GN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | SYNE2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000358025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_182914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8WXH0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.8824A>G cDNA.9054A>G g.199773A>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | I2942V Score: 29 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 2942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs3829767
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regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
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splice sites |
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distance from splice site | 921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features |
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length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 20724 / 20724 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 6908 / 6908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 20954 / 20954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 231 / 231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 20747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 20466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 20724 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 8824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 199773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 64519455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MASSPELPTE DEQGSWGIDD LHISLQAEQE DTQKKAFTCW INSQLARHTS PSVISDLFTD IKKGHVLLDL LEVLSGQQLP RDKGSNTFQC RINIEHALTF LRNRSIKLIN IHVTDIIDGN PSIILGLIWT IILHFHIEKL AQTLSCNYNQ PSLDDVSVVD SSPASSPPAK KCSKVQARWQ MSARKALLLW AQEQCATYES VNVTDFKSSW RNGMAFLAII HALRPDLIDM KSVKHRSNKD NLREAFRIAE QELKIPRLLE PEDVDVVDPD EKSIMTYVAQ FLQYSKDAPG TGEEAQGKVK DAMGWLTLQK EKLQKLLKDS ENDTYFKKYN SLLSFMESFN EEKKSFLDVL SIKRDLDELD KDHLQLREAW DGLDHQINAW KIKLNYALPP PLHQTEAWLQ EVEELMDEDL SASQDHSQAV TLIQEKMTLF KSLMDRFEHH SNILLTFENK DENHLPLVPP NKLEEMKRRI NNILEKKFIL LLEFHYYKCL VLGLVDEVKS KLDIWNIKYG SRESVELLLE DWHKFIEEKE FLARLDTSFQ KCGEIYKNLA GECQNINKQY MMVKSDVCMY RKNIYNVKST LQKVLACWAT YVENLRLLRA CFEETKKEEI KEVPFETLAQ WNLEHATLNE AGNFLVEVSN DVVGSSISKE LRRLNKRWRK LVSKTQLEMN LPLMIKKQDQ PTFDNSGNIL SKEEKATVEF STDMSVELPE NYNQNIKAGE KHEKENEEFT GQLKVAKDVE KLIGQVEIWE AEAKSVLDQD DVDTSMEESL KHLIAKGSMF DELMARSEDM LQMDIQNISS QESFQHVLTT GLQAKIQEAK EKVQINVVKL IAALKNLTDV SPDLDIRLKM EESQKELESY MMRAQQLLGQ RESPGELISK HKEALIISNT KSLAKYLKAV EELKNNVTED IKMSLEEKSR DVCAKWESLH HELSLYVQQL KIDIEKGKLS DNILKLEKQI NKEKKLIRRG RTKGLIKEHE ACFSEEGCLY QLNHHMEVLR ELCEELPSQK SQQEVKRLLK DYEQKIERLL KCASEIHMTL QPTAGGTSKN EGTITTSENR GGDPHSEAPF AKSDNQPSTE KAMEPTMKFS LASVLRPLQE ESIMEKDYSA SINSLLERYD TYRDILEHHL QNNKFRITSD FSSEEDRSSS CLQAKLTDLQ VIKNETDARW KEFEIISLKL ENHVNDIKKP FVIKERDTLK ERERELQMTL NTRMESLETA LRLVLPVEKA SLLLCGSDLP LHKMAIQGFH LIDADRIYQH LRNIQDSIAK QIEICNRLEE PGNFVLKELH PFDLHAMQNI ILKYKTQFEG MNHRVQRSED TLKALEDFLA SLRTAKLSAE PVTDLSASDT QVAQENTLTV KNKEGEIHLM KDKAKHLDKC LKMLDMSFKD AERGDDTSCE NLLDAFSIKL SETHGYGVQE EFTEENKLLE ACIFKNNELL KNIQDVQSQI SKIGLKDPTV PAVKHRKKSL IRLDKVLDEY EEEKRHLQEM ANSLPHFKDG REKTVNQQCQ NTVVLWENTK ALVTECLEQC GRVLELLKQY QNFKSILTTL IQKEESVISL QASYMGKENL KKRIAEIEIV KEEFNEHLEV VDKINQVCKN LQFYLNKMKT FEEPPFEKEA NIIVDRWLDI NEKTEDYYEN LGRALALWDK LFNLKNVIDE WTEKALQKME LHQLTEEDRE RLKEELQVHE QKTSEFSRRV AEIQFLLQSS EIPLELQVME SSILNKMEHV QKCLTGESNC HALSGSTAEL REDLDQAKTQ IGMTESLLKA LSPSDSLEIF TKLEEIQQQI LQQKHSMILL ENQIGCLTPE LSELKKQYES VSDLFNTKKS VLQDHFSKLL NDQCKNFNDW FSNIKVNLKE CFESSETKKS VEQKLQKLSD FLTLEGRNSK IKQVDSVLKH VKKHLPKAHV KELISWLVGQ EFELEKMESI CQARAKELED SLQQLLRLQD DHRNLRKWLT NQEEKWKGME EPGEKTELFC QALARKREQF ESVAQLNNSL KEYGFTEEEE IIMEATCLMD RYQTLLRQLS EIEEEDKLLP TEDQSFNDLA HDVIHWIKEI KESLMVLNSS EGKMPLEERI QKIKEIILLK PEGDARIETI MKQAESSEAP LVQKTLTDIS NQWDNTLHLA STYLSHQEKL LLEGEKYLQS KEDLRLMLIE LKKKQEAGFA LQHGLQEKKA QLKIYKKFLK KAQDLTSLLK ELKSQGNYLL ECTKNPSFSE EPWLEIKHLH ESLLQQLQDS VQNLDGHVRE HDSYQVCVTD LNTTLDNFSK EFVSFSDKPV DQIAVEEKLQ KLQELENRLS LQDGTLKKIL ALAKSVKQNT SSVGQKIIKD DIKSLQCKQK DLENRLASAK QEMECCLNSI LKSKRSTEKK GKFTLPGREK QATSDVQEST QESAAVEKLE EDWEINKDSA VEMAMSKQLS LNAQESMKNT EDERKVNELQ NQPLELDTML RNEQLEEIEK LYTQLEAKKA AIKPLEQTEC LNKTETGALV LHNIGYSAQH LDNLLQALIT LKKNKESQYC VLRDFQEYLA AVESSMKALL TDKESLKVGP LDSVTYLDKI KKFIASIEKE KDSLGNLKIK WENLSNHVTD MDKKLLESQI KQLEHGWEQV EQQIQKKYSQ QVVEYDEFTT LMNKVQDTEI SLQQQQQHLQ LRLKSPEERA GNQSMIALTT DLQATKHGFS VLKGQAELQM KRIWGEKEKK NLEDGINNLK KQWETLEPLH LEAENQIKKC DIRNKMKETI LWAKNLLGEL NPSIPLLPDD ILSQIRKCKV THDGILARQQ SVESLAEEVK DKVPSLTTYE GSDLNNTLED LRNQYQMLVL KSTQRSQQLE FKLEERSNFF AIIRKFQLMV QESETLIIPR VETAATEAEL KHHHVTLEAS QKELQEIDSG ISTHLQELTN IYEELNVFER LFLEDQLKNL KIRTNRIQRF IQNTCNEVEH KIKFCRQFHE KTSALQEEAD SIQRNELLLN QEVNKGVKEE IYNLKDRLTA IKCCILQVLK LKKVFDYIGL NWDFSQLDQL QTQVFEKEKE LEEKIKQLDT FEEEHGKYQA LLSKMRAIDL QIKKMTEVVL KAPDSSPESR RLNAQILSQR IEKAKCLCDE IIKKLNENKT FDDSFKEKEI LQIKLNAEEN DKLYKVLQNM VLELSPKELD EKNCQDKLET SLHVLNQIKS QLQQPLLINL EIKHIQNEKD NCEAFQEQVW AEMCSIKAVT AIEKQREENS SEASDVETKL REFEDLQMQL NTSIDLRTNV LNDAYENLTR YKEAVTRAVE SITSLEAIII PYRVDVGNPE ESLEMPLRKQ EELESTVAHI QDLTEKLGMI SSPEAKLQLQ YTLQELVSKN SAMKEAFKAQ ETEAERYLEN YKCYRKMEED IYTNLSKMET VLGQSMSSLP LSYREALERL EQSKALVSNL ISTKEELMKL RQILRLLRLR CTENDGICLL KIVSALWEKW LSLLEAAKEW EMWCEELKQE WKFVSEEIER EAIILDNLQE ELPEISKTKE AATTEELSEL LDCLCQYGEN VEKQQLLLTL LLQRIRSIQN VPESSGAVET VPAFQEITSM KERCNKLLQK VQKNKELVQT EIQERHSFTK EIIALKNFFQ QTTTSFQNMA FQDHPEKSEQ FEELQSILKK GKLTFENIME KLRIKYSEMY TIVPAEIESQ VEECRKALED IDEKISNEVL KSSPSYAMRR KIEEINNGLH NVEKMLQQKS KNIEKAQEIQ KKMWDELDLW HSKLNELDSE VQDIVEQDPG QAQEWMDNLM IPFQQYQQVS QRAECRTSQL NKATVKMEEY SDLLKSTEAW IENTSHLLAN PADYDSLRTL SHHASTVQMA LEDSEQKHNL LHSIFMDLED LSIIFETDEL TQSIQELSNQ VTALQQKIME SLPQIQRMAD DVVAIESEVK SMEKRVSKIK TILLSKEIFD FSPEEHLKHG EVILENIRPM KKTIAEIVSY QVELRLPQTG MKPLPVFQRT NQLLQDIKLL ENVTQEQNEL LKVVIKQTNE WDEEIENLKQ ILNNYSAQFS LEHMSPDQAD KLPQLQGEIE RMEKQILSLN QRKEDLLVDL KATVLNLHQH LKQEQEGVER DRLPAVTSEE GGVAERDASE RKLNRRGSMS YLAAVEEEVE ESSVKSDNGD EKAEPSPQSW SSLWKHDKDM EEDRASSSSG TIVQEAYGKI STSDNSMAQI LTPDSLNTEQ GPECSLRPNQ TEEGTTPPIE ADTLDSSDAQ GGLEPRVEKT RPEPTEVLHA CKTQVAELEL WLQQANVAVE PETLNADMQQ VLEQQLVGCQ AMLTEIEHKV AFLLETCKDQ GLGDNGATQH EAEALSLKLK TVKCNLEKVQ MMLQEKHSED QHPTILKKSS EPEHQEALQP VNLSELESIV TERPQFSRQK DFQQQQVLEL KPMEQKDFIK FIEFNAKKMW PQYCQHDNDT TQESSASNQA SSPENDVPDS ILSPQGQNGD KWQYLHHELS SKIKLPLPQL VEPQVSTNMG ILPSVTMYNF RYPTTEELKT YTTQLEDLRQ EASNLQTQEN MTEEAYINLD KKLFELFLTL SQCLSSVEEM LEMPRLYRED GSGQQVHYET LALELKKLYL ALSDKKGDLL KAMTWPGENT NLLLECFDNL QVCLEHTQAA AVCRSKSLKA GLDYNRSYQN EIKRLYHQLI KSKTSLQQSL NEISGQSVAE QLQKADAYTV ELENAESRVA KLRDEGERLH LPYALLQEVY KLEDVLDSMW GMLRARYTEL SSPFVTESQQ DALLQGMVEL VKIGKEKLAH GHLKQTKSKV ALQAQIENHK VFFQKLVADM LLIQAYSAKI LPSLLQNRET FWAEQVTEVK ILEEKSRQCG MKLQSLLQKW EEFDENYASL EKDLEILIST LPSVSLVEET EERLVERISF YQQIKRNIGG KHARLYQTLN EGKQLVASVS CPELEGQIAK LEEQWLSLNK KIDHELHRLQ ALLKHLLSYN RDSDQLTKWL ESSQHTLNYW KEQSLNVSQD LDTIRSNINN FFEFSKEVDE KSSLKTAVIS IGNQLLHLKE TDTATLRASL AQFEQKWTML ITQLPDIQEK LHQLQMEKLP SRKAITEMIS WMNNVEHQTS DEDSVHSPSS ASQVKHLLQK HKEFRMEMDY KQWIVDFVNQ SLLQLSTCDV ESKRYERTEF AEHLGEMNRQ WHRVHGMLNR KIQHLEQLLE SITESENKIQ ILNNWLEAQE ERLKTLQKPE SVISVQKLLL DCQDIENQLA IKSKALDELK QSYLTLESGA VPLLEDTASR IDELFQKRSS VLTQVNQLKT SMQSVLQEWK IYDQLYDEVN MMTIRFWYCM EHSKPVVLSL ETLRCQVENL QSLQDEAESS EGSWEKLQEV IGKLKGLCPS VAEIIEEKCQ NTHKRWTQVN QAIADQLQKA QSLLQLWKAY SNAHGEAAAR LKQQEAKFQQ LANISMSGNN LAEILPPALQ DIKELQHDVQ KTKEAFLQNS SVLDRLPQPA ESSTHMLLPG PLHSLQRAAY LEKMLLVKAN EFEFVLSQFK DFGVRLESLK GLIMHEEENL DRLHQQEKEN PDSFLNHVLA LTAQSPDIEH LNEVSLKLPL SDVAVKTLQN MNRQWIRATA TALERCSELQ GIGLNEKFLY CCEKWIQLLE KIEEALKVDV ANSLPELLEQ QKTYKMLEAE VSINQTIADS YVTQSLQLLD TTEIENRPEF ITEFSKLTDR WQNAVQGVRQ RKGDVDGLVR QWQDFTTSVE NLFRFLTDTS HLLSAVKGQE RFSLYQTRSL IHELKNKEIH FQRRRTTCAL TLEAGEKLLL TTDLKTKESV GRRISQLQDS WKDMEPQLAE MIKQFQSTVE TWDQCEKKIK ELKSRLQVLK AQSEDPLPEL HEDLHNEKEL IKELEQSLAS WTQNLKELQT MKADLTRHVL VEDVMVLKEQ IEHLHRQWED LCLRVAIRKQ EIEDRLNTWV VFNEKNKELC AWLVQMENKV LQTADISIEE MIEKLQKDCM EEINLFSENK LQLKQMGDQL IKASNKSRAA EIDDKLNKIN DRWQHLFDVI GSRVKKLKET FAFIQQLDKN MSNLRTWLAR IESELSKPVV YDVCDDQEIQ KRLAEQQDLQ RDIEQHSAGV ESVFNICDVL LHDSDACANE TECDSIQQTT RSLDRRWRNI CAMSMERRMK IEETWRLWQK FLDDYSRFED WLKSAERTAA CPNSSEVLYT SAKEELKRFE AFQRQIHERL TQLELINKQY RRLARENRTD TASRLKQMVH EGNQRWDNLQ RRVTAVLRRL RHFTNQREEF EGTRESILVW LTEMDLQLTN VEHFSESDAD DKMRQLNGFQ QEITLNTNKI DQLIVFGEQL IQKSEPLDAV LIEDELEELH RYCQEVFGRV SRFHRRLTSC TPGLEDEKEA SENETDMEDP REIQTDSWRK RGESEEPSSP QSLCHLVAPG HERSGCETPV SVDSIPLEWD HTGDVGGSSS HEEDEEGPYY SALSDVEIPE NPEAYLKMTT KTLKASSGKS ISDGHSWHVP DSPSCPEHHY KQMEGDRNVP PVPPASSTPY KPPYGKLLLP PGTDGGKEGP RVLNGNPQQE DGGLAGITEQ QSGAFDRWEM IQAQELHNKL KIKQNLQQLN SDISAITTWL KKTEAELEML KMAKPPSDIQ EIELRVKRLQ EILKAFDTYK ALVVSVNVSS KEFLQTESPE STELQSRLRQ LSLLWEAAQG AVDSWRGGLR QSLMQCQDFH QLSQNLLLWL ASAKNRRQKA HVTDPKADPR ALLECRRELM QLEKELVERQ PQVDMLQEIS NSLLIKGHGE DCIEAEEKVH VIEKKLKQLR EQVSQDLMAL QGTQNPASPL PSFDEVDSGD QPPATSVPAP RAKFRAVRTT EGEEETESRV PGSTRPQRSF LSRVVRAALP LQLLLLLLLL LACLLPSSEE DYSCTQANNF ARSFYPMLRY TNGPPPT* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MASSPELPTE DEQGSWGIDD LHISLQAEQE DTQKKAFTCW INSQLARHTS PSVISDLFTD IKKGHVLLDL LEVLSGQQLP RDKGSNTFQC RINIEHALTF LRNRSIKLIN IHVTDIIDGN PSIILGLIWT IILHFHIEKL AQTLSCNYNQ PSLDDVSVVD SSPASSPPAK KCSKVQARWQ MSARKALLLW AQEQCATYES VNVTDFKSSW RNGMAFLAII HALRPDLIDM KSVKHRSNKD NLREAFRIAE QELKIPRLLE PEDVDVVDPD EKSIMTYVAQ FLQYSKDAPG TGEEAQGKVK DAMGWLTLQK EKLQKLLKDS ENDTYFKKYN SLLSFMESFN EEKKSFLDVL SIKRDLDELD KDHLQLREAW DGLDHQINAW KIKLNYALPP PLHQTEAWLQ EVEELMDEDL SASQDHSQAV TLIQEKMTLF KSLMDRFEHH SNILLTFENK DENHLPLVPP NKLEEMKRRI NNILEKKFIL LLEFHYYKCL VLGLVDEVKS KLDIWNIKYG SRESVELLLE DWHKFIEEKE FLARLDTSFQ KCGEIYKNLA GECQNINKQY MMVKSDVCMY RKNIYNVKST LQKVLACWAT YVENLRLLRA CFEETKKEEI KEVPFETLAQ WNLEHATLNE AGNFLVEVSN DVVGSSISKE LRRLNKRWRK LVSKTQLEMN LPLMIKKQDQ PTFDNSGNIL SKEEKATVEF STDMSVELPE NYNQNIKAGE KHEKENEEFT GQLKVAKDVE KLIGQVEIWE AEAKSVLDQD DVDTSMEESL KHLIAKGSMF DELMARSEDM LQMDIQNISS QESFQHVLTT GLQAKIQEAK EKVQINVVKL IAALKNLTDV SPDLDIRLKM EESQKELESY MMRAQQLLGQ RESPGELISK HKEALIISNT KSLAKYLKAV EELKNNVTED IKMSLEEKSR DVCAKWESLH HELSLYVQQL KIDIEKGKLS DNILKLEKQI NKEKKLIRRG RTKGLIKEHE ACFSEEGCLY QLNHHMEVLR ELCEELPSQK SQQEVKRLLK DYEQKIERLL KCASEIHMTL QPTAGGTSKN EGTITTSENR GGDPHSEAPF AKSDNQPSTE KAMEPTMKFS LASVLRPLQE ESIMEKDYSA SINSLLERYD TYRDILEHHL QNNKFRITSD FSSEEDRSSS CLQAKLTDLQ VIKNETDARW KEFEIISLKL ENHVNDIKKP FVIKERDTLK ERERELQMTL NTRMESLETA LRLVLPVEKA SLLLCGSDLP LHKMAIQGFH LIDADRIYQH LRNIQDSIAK QIEICNRLEE PGNFVLKELH PFDLHAMQNI ILKYKTQFEG MNHRVQRSED TLKALEDFLA SLRTAKLSAE PVTDLSASDT QVAQENTLTV KNKEGEIHLM KDKAKHLDKC LKMLDMSFKD AERGDDTSCE NLLDAFSIKL SETHGYGVQE EFTEENKLLE ACIFKNNELL KNIQDVQSQI SKIGLKDPTV PAVKHRKKSL IRLDKVLDEY EEEKRHLQEM ANSLPHFKDG REKTVNQQCQ NTVVLWENTK ALVTECLEQC GRVLELLKQY QNFKSILTTL IQKEESVISL QASYMGKENL KKRIAEIEIV KEEFNEHLEV VDKINQVCKN LQFYLNKMKT FEEPPFEKEA NIIVDRWLDI NEKTEDYYEN LGRALALWDK LFNLKNVIDE WTEKALQKME LHQLTEEDRE RLKEELQVHE QKTSEFSRRV AEIQFLLQSS EIPLELQVME SSILNKMEHV QKCLTGESNC HALSGSTAEL REDLDQAKTQ IGMTESLLKA LSPSDSLEIF TKLEEIQQQI LQQKHSMILL ENQIGCLTPE LSELKKQYES VSDLFNTKKS VLQDHFSKLL NDQCKNFNDW FSNIKVNLKE CFESSETKKS VEQKLQKLSD FLTLEGRNSK IKQVDSVLKH VKKHLPKAHV KELISWLVGQ EFELEKMESI CQARAKELED SLQQLLRLQD DHRNLRKWLT NQEEKWKGME EPGEKTELFC QALARKREQF ESVAQLNNSL KEYGFTEEEE IIMEATCLMD RYQTLLRQLS EIEEEDKLLP TEDQSFNDLA HDVIHWIKEI KESLMVLNSS EGKMPLEERI QKIKEIILLK PEGDARIETI MKQAESSEAP LVQKTLTDIS NQWDNTLHLA STYLSHQEKL LLEGEKYLQS KEDLRLMLIE LKKKQEAGFA LQHGLQEKKA QLKIYKKFLK KAQDLTSLLK ELKSQGNYLL ECTKNPSFSE EPWLEIKHLH ESLLQQLQDS VQNLDGHVRE HDSYQVCVTD LNTTLDNFSK EFVSFSDKPV DQIAVEEKLQ KLQELENRLS LQDGTLKKIL ALAKSVKQNT SSVGQKIIKD DIKSLQCKQK DLENRLASAK QEMECCLNSI LKSKRSTEKK GKFTLPGREK QATSDVQEST QESAAVEKLE EDWEINKDSA VEMAMSKQLS LNAQESMKNT EDERKVNELQ NQPLELDTML RNEQLEEIEK LYTQLEAKKA AIKPLEQTEC LNKTETGALV LHNIGYSAQH LDNLLQALIT LKKNKESQYC VLRDFQEYLA AVESSMKALL TDKESLKVGP LDSVTYLDKI KKFIASIEKE KDSLGNLKIK WENLSNHVTD MDKKLLESQI KQLEHGWEQV EQQIQKKYSQ QVVEYDEFTT LMNKVQDTEI SLQQQQQHLQ LRLKSPEERA GNQSMIALTT DLQATKHGFS VLKGQAELQM KRIWGEKEKK NLEDGINNLK KQWETLEPLH LEAENQIKKC DIRNKMKETI LWAKNLLGEL NPSIPLLPDD ILSQIRKCKV THDGILARQQ SVESLAEEVK DKVPSLTTYE GSDLNNTLED LRNQYQMLVL KSTQRSQQLE FKLEERSNFF AIIRKFQLMV QESETLIIPR VETAATEAEL KHHHVTLEAS QKELQEIDSG ISTHLQELTN IYEELNVFER LFLEDQLKNL KIRTNRIQRF IQNTCNEVEH KVKFCRQFHE KTSALQEEAD SIQRNELLLN QEVNKGVKEE IYNLKDRLTA IKCCILQVLK LKKVFDYIGL NWDFSQLDQL QTQVFEKEKE LEEKIKQLDT FEEEHGKYQA LLSKMRAIDL QIKKMTEVVL KAPDSSPESR RLNAQILSQR IEKAKCLCDE IIKKLNENKT FDDSFKEKEI LQIKLNAEEN DKLYKVLQNM VLELSPKELD EKNCQDKLET SLHVLNQIKS QLQQPLLINL EIKHIQNEKD NCEAFQEQVW AEMCSIKAVT AIEKQREENS SEASDVETKL REFEDLQMQL NTSIDLRTNV LNDAYENLTR YKEAVTRAVE SITSLEAIII PYRVDVGNPE ESLEMPLRKQ EELESTVAHI QDLTEKLGMI SSPEAKLQLQ YTLQELVSKN SAMKEAFKAQ ETEAERYLEN YKCYRKMEED IYTNLSKMET VLGQSMSSLP LSYREALERL EQSKALVSNL ISTKEELMKL RQILRLLRLR CTENDGICLL KIVSALWEKW LSLLEAAKEW EMWCEELKQE WKFVSEEIER EAIILDNLQE ELPEISKTKE AATTEELSEL LDCLCQYGEN VEKQQLLLTL LLQRIRSIQN VPESSGAVET VPAFQEITSM KERCNKLLQK VQKNKELVQT EIQERHSFTK EIIALKNFFQ QTTTSFQNMA FQDHPEKSEQ FEELQSILKK GKLTFENIME KLRIKYSEMY TIVPAEIESQ VEECRKALED IDEKISNEVL KSSPSYAMRR KIEEINNGLH NVEKMLQQKS KNIEKAQEIQ KKMWDELDLW HSKLNELDSE VQDIVEQDPG QAQEWMDNLM IPFQQYQQVS QRAECRTSQL NKATVKMEEY SDLLKSTEAW IENTSHLLAN PADYDSLRTL SHHASTVQMA LEDSEQKHNL LHSIFMDLED LSIIFETDEL TQSIQELSNQ VTALQQKIME SLPQIQRMAD DVVAIESEVK SMEKRVSKIK TILLSKEIFD FSPEEHLKHG EVILENIRPM KKTIAEIVSY QVELRLPQTG MKPLPVFQRT NQLLQDIKLL ENVTQEQNEL LKVVIKQTNE WDEEIENLKQ ILNNYSAQFS LEHMSPDQAD KLPQLQGEIE RMEKQILSLN QRKEDLLVDL KATVLNLHQH LKQEQEGVER DRLPAVTSEE GGVAERDASE RKLNRRGSMS YLAAVEEEVE ESSVKSDNGD EKAEPSPQSW SSLWKHDKDM EEDRASSSSG TIVQEAYGKI STSDNSMAQI LTPDSLNTEQ GPECSLRPNQ TEEGTTPPIE ADTLDSSDAQ GGLEPRVEKT RPEPTEVLHA CKTQVAELEL WLQQANVAVE PETLNADMQQ VLEQQLVGCQ AMLTEIEHKV AFLLETCKDQ GLGDNGATQH EAEALSLKLK TVKCNLEKVQ MMLQEKHSED QHPTILKKSS EPEHQEALQP VNLSELESIV TERPQFSRQK DFQQQQVLEL KPMEQKDFIK FIEFNAKKMW PQYCQHDNDT TQESSASNQA SSPENDVPDS ILSPQGQNGD KWQYLHHELS SKIKLPLPQL VEPQVSTNMG ILPSVTMYNF RYPTTEELKT YTTQLEDLRQ EASNLQTQEN MTEEAYINLD KKLFELFLTL SQCLSSVEEM LEMPRLYRED GSGQQVHYET LALELKKLYL ALSDKKGDLL KAMTWPGENT NLLLECFDNL QVCLEHTQAA AVCRSKSLKA GLDYNRSYQN EIKRLYHQLI KSKTSLQQSL NEISGQSVAE QLQKADAYTV ELENAESRVA KLRDEGERLH LPYALLQEVY KLEDVLDSMW GMLRARYTEL SSPFVTESQQ DALLQGMVEL VKIGKEKLAH GHLKQTKSKV ALQAQIENHK VFFQKLVADM LLIQAYSAKI LPSLLQNRET FWAEQVTEVK ILEEKSRQCG MKLQSLLQKW EEFDENYASL EKDLEILIST LPSVSLVEET EERLVERISF YQQIKRNIGG KHARLYQTLN EGKQLVASVS CPELEGQIAK LEEQWLSLNK KIDHELHRLQ ALLKHLLSYN RDSDQLTKWL ESSQHTLNYW KEQSLNVSQD LDTIRSNINN FFEFSKEVDE KSSLKTAVIS IGNQLLHLKE TDTATLRASL AQFEQKWTML ITQLPDIQEK LHQLQMEKLP SRKAITEMIS WMNNVEHQTS DEDSVHSPSS ASQVKHLLQK HKEFRMEMDY KQWIVDFVNQ SLLQLSTCDV ESKRYERTEF AEHLGEMNRQ WHRVHGMLNR KIQHLEQLLE SITESENKIQ ILNNWLEAQE ERLKTLQKPE SVISVQKLLL DCQDIENQLA IKSKALDELK QSYLTLESGA VPLLEDTASR IDELFQKRSS VLTQVNQLKT SMQSVLQEWK IYDQLYDEVN MMTIRFWYCM EHSKPVVLSL ETLRCQVENL QSLQDEAESS EGSWEKLQEV IGKLKGLCPS VAEIIEEKCQ NTHKRWTQVN QAIADQLQKA QSLLQLWKAY SNAHGEAAAR LKQQEAKFQQ LANISMSGNN LAEILPPALQ DIKELQHDVQ KTKEAFLQNS SVLDRLPQPA ESSTHMLLPG PLHSLQRAAY LEKMLLVKAN EFEFVLSQFK DFGVRLESLK GLIMHEEENL DRLHQQEKEN PDSFLNHVLA LTAQSPDIEH LNEVSLKLPL SDVAVKTLQN MNRQWIRATA TALERCSELQ GIGLNEKFLY CCEKWIQLLE KIEEALKVDV ANSLPELLEQ QKTYKMLEAE VSINQTIADS YVTQSLQLLD TTEIENRPEF ITEFSKLTDR WQNAVQGVRQ RKGDVDGLVR QWQDFTTSVE NLFRFLTDTS HLLSAVKGQE RFSLYQTRSL IHELKNKEIH FQRRRTTCAL TLEAGEKLLL TTDLKTKESV GRRISQLQDS WKDMEPQLAE MIKQFQSTVE TWDQCEKKIK ELKSRLQVLK AQSEDPLPEL HEDLHNEKEL IKELEQSLAS WTQNLKELQT MKADLTRHVL VEDVMVLKEQ IEHLHRQWED LCLRVAIRKQ EIEDRLNTWV VFNEKNKELC AWLVQMENKV LQTADISIEE MIEKLQKDCM EEINLFSENK LQLKQMGDQL IKASNKSRAA EIDDKLNKIN DRWQHLFDVI GSRVKKLKET FAFIQQLDKN MSNLRTWLAR IESELSKPVV YDVCDDQEIQ KRLAEQQDLQ RDIEQHSAGV ESVFNICDVL LHDSDACANE TECDSIQQTT RSLDRRWRNI CAMSMERRMK IEETWRLWQK FLDDYSRFED WLKSAERTAA CPNSSEVLYT SAKEELKRFE AFQRQIHERL TQLELINKQY RRLARENRTD TASRLKQMVH EGNQRWDNLQ RRVTAVLRRL RHFTNQREEF EGTRESILVW LTEMDLQLTN VEHFSESDAD DKMRQLNGFQ QEITLNTNKI DQLIVFGEQL IQKSEPLDAV LIEDELEELH RYCQEVFGRV SRFHRRLTSC TPGLEDEKEA SENETDMEDP REIQTDSWRK RGESEEPSSP QSLCHLVAPG HERSGCETPV SVDSIPLEWD HTGDVGGSSS HEEDEEGPYY SALSDVEIPE NPEAYLKMTT KTLKASSGKS ISDGHSWHVP DSPSCPEHHY KQMEGDRNVP PVPPASSTPY KPPYGKLLLP PGTDGGKEGP RVLNGNPQQE DGGLAGITEQ QSGAFDRWEM IQAQELHNKL KIKQNLQQLN SDISAITTWL KKTEAELEML KMAKPPSDIQ EIELRVKRLQ EILKAFDTYK ALVVSVNVSS KEFLQTESPE STELQSRLRQ LSLLWEAAQG AVDSWRGGLR QSLMQCQDFH QLSQNLLLWL ASAKNRRQKA HVTDPKADPR ALLECRRELM QLEKELVERQ PQVDMLQEIS NSLLIKGHGE DCIEAEEKVH VIEKKLKQLR EQVSQDLMAL QGTQNPASPL PSFDEVDSGD QPPATSVPAP RAKFRAVRTT EGEEETESRV PGSTRPQRSF LSRVVRAALP LQLLLLLLLL LACLLPSSEE DYSCTQANNF ARSFYPMLRY TNGPPPT* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.58 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: without_aae, prob: 0.99936262490073 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr14:64519455A>GN/A show variant in all transcripts IGV | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | SYNE2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000357395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8WXH0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | 5'UTR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | cDNA.9054A>G g.199773A>G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs3829767
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
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splice sites | splice site change before start ATG (at aa -698) |
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distance from splice site | 921 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | no | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
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length of protein | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 11145 / 11145 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 20750 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 9555 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 9813 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9054 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 199773 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 64519455 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGATAAAGTTTTGCAGACAATTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTAATGAAGTGGAACACAAGGTAAAGTTTTGCAGACAATTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MEKLRIKYSE MYTIVPAEIE SQVEECRKAL EDIDEKISNE VLKSSPSYAM RRKIEEINNG LHNVEKMLQQ KSKNIEKAQE IQKKMWDELD LWHSKLNELD SEVQDIVEQD PGQAQEWMDN LMIPFQQYQQ VSQRAECRTS QLNKATVKME EYSDLLKSTE AWIENTSHLL ANPADYDSLR TLSHHASTVQ DSKCFRSGPR PNIYVSYYVT VIQMALEDSE QKHNLLHSIF MDLEDLSIIF ETDELTQSIQ ELSNQVTALQ QKIMESLPQI QRMADDVVAI ESEVKSMEKR VSKIKTILLS KEIFDFSPEE HLKHGEVILE NIRPMKKTIA EIVSYQVELR LPQTGMKPLP VFQRTNQLLQ DIKLLENVTQ EQNELLKVVI KQTNEWDEEI ENLKQILNNY SAQFSLEHMS PDQADKLPQL QGEIERMEKQ ILSLNQRKED LLVDLKATVL NLHQHLKQEQ EGVERDRLPA VTSEEGGVAE RDASERKLNR RGSMSYLAAV EEEVEESSVK SDNGDEKAEP SPQSWSSLWK HDKDMEEDRA SSSSGTIVQE AYGKISTSDN SMAQILTPDS LNTEQGPECS LRPNQTEEGT TPPIEADTLD SSDAQGGLEP RVEKTRPEPT EVLHACKTQV AELELWLQQA NVAVEPETLN ADMQQVLEQQ LVGCQAMLTE IEHKVAFLLE TCKDQGLGDN GATQHEAEAL SLKLKTVKCN LEKVQMMLQE KHSEDQHPTI LKKSSEPEHQ EALQPVNLSE LESIVTERPQ FSRQKDFQQQ QVLELKPMEQ KDFIKFIEFN AKKMWPQYCQ HDNDTTQESS ASNQASSPEN DVPDSILSPQ GQNGDKWQYL HHELSSKIKL PLPQLVEPQV STNMGILPSV TMYNFRYPTT EELKTYTTQL EDLRQEASNL QTQENMTEEA YINLDKKLFE LFLTLSQCLS SVEEMLEMPR LYREDGSGQQ VHYETLALEL KKLYLALSDK KGDLLKAMTW PGENTNLLLE CFDNLQVCLE HTQAAAVCRS KSLKAGLDYN RSYQNEIKRL YHQLIKSKTS LQQSLNEISG QSVAEQLQKA DAYTVELENA ESRVAKLRDE GERLHLPYAL LQEVYKLEDV LDSMWGMLRA RYTELSSPFV TESQQDALLQ GMVELVKIGK EKLAHGHLKQ TKSKVALQAQ IENHKVFFQK LVADMLLIQA YSAKILPSLL QNRETFWAEQ VTEVKILEEK SRQCGMKLQS LLQKWEEFDE NYASLEKDLE ILISTLPSVS LVEETEERLV ERISFYQQIK RNIGGKHARL YQTLNEGKQL VASVSCPELE GQIAKLEEQW LSLNKKIDHE LHRLQALLKH LLSYNRDSDQ LTKWLESSQH TLNYWKEQSL NVSQDLDTIR SNINNFFEFS KEVDEKSSLK TAVISIGNQL LHLKETDTAT LRASLAQFEQ KWTMLITQLP DIQEKLHQLQ MEKLPSRKAI TEMISWMNNV EHQTSDEDSV HSPSSASQVK HLLQKHKEFR MEMDYKQWIV DFVNQSLLQL STCDVESKRY ERTEFAEHLG EMNRQWHRVH GMLNRKIQHL EQLLESITES ENKIQILNNW LEAQEERLKT LQKPESVISV QKLLLDCQDI ENQLAIKSKA LDELKQSYLT LESGAVPLLE DTASRIDELF QKRSSVLTQV NQLKTSMQSV LQEWKIYDQL YDEVNMMTIR FWYCMEHSKP VVLSLETLRC QVENLQSLQD EAESSEGSWE KLQEVIGKLK GLCPSVAEII EEKCQNTHKR WTQVNQAIAD QLQKAQSLLQ LWKAYSNAHG EAAARLKQQE AKFQQLANIS MSGNNLAEIL PPALQDIKEL QHDVQKTKEA FLQNSSVLDR LPQPAESSTH MLLPGPLHSL QRAAYLEKML LVKANEFEFV LSQFKDFGVR LESLKGLIMH EEENLDRLHQ QEKENPDSFL NHVLALTAQS PDIEHLNEVS LKLPLSDVAV KTLQNMNRQW IRATATALER CSELQGIGLN EKFLYCCEKW IQLLEKIEEA LKVDVANSLP ELLEQQKTYK MLEAEVSINQ TIADSYVTQS LQLLDTTEIE NRPEFITEFS KLTDRWQNAV QGVRQRKGDV DGLVRQWQDF TTSVENLFRF LTDTSHLLSA VKGQERFSLY QTRSLIHELK NKEIHFQRRR TTCALTLEAG EKLLLTTDLK TKESVGRRIS QLQDSWKDME PQLAEMIKQF QSTVETWDQC EKKIKELKSR LQVLKAQSED PLPELHEDLH NEKELIKELE QSLASWTQNL KELQTMKADL TRHVLVEDVM VLKEQIEHLH RQWEDLCLRV AIRKQEIEDR LNTWVVFNEK NKELCAWLVQ MENKVLQTAD ISIEEMIEKL QKDCMEEINL FSENKLQLKQ MGDQLIKASN KSRAAEIDDK LNKINDRWQH LFDVIGSRVK KLKETFAFIQ QLDKNMSNLR TWLARIESEL SKPVVYDVCD DQEIQKRLAE QQDLQRDIEQ HSAGVESVFN ICDVLLHDSD ACANETECDS IQQTTRSLDR RWRNICAMSM ERRMKIEETW RLWQKFLDDY SRFEDWLKSA ERTAACPNSS EVLYTSAKEE LKRFEAFQRQ IHERLTQLEL INKQYRRLAR ENRTDTASRL KQMVHEGNQR WDNLQRRVTA VLRRLRHFTN QREEFEGTRE SILVWLTEMD LQLTNVEHFS ESDADDKMRQ LNGFQQEITL NTNKIDQLIV FGEQLIQKSE PLDAVLIEDE LEELHRYCQE VFGRVSRFHR RLTSCTPGLE DEKEASENET DMEDPREIQT DSWRKRGESE EPSSPQSLCH LVAPGHERSG CETPVSVDSI PLEWDHTGDV GGSSSHEEDE EGPYYSALSG KSISDGHSWH VPDSPSCPEH HYKQMEGDRN VPPVPPASST PYKPPYGKLL LPPGTDGGKE GPRVLNGNPQ QEDGGLAGIT EQQSGAFDRW EMIQAQELHN KLKIKQNLQQ LNSDISAITT WLKKTEAELE MLKMAKPPSD IQEIELRVKR LQEILKAFDT YKALVVSVNV SSKEFLQTES PESTELQSRL RQLSLLWEAA QGAVDSWRGG LRQSLMQCQD FHQLSQNLLL WLASAKNRRQ KAHVTDPKAD PRALLECRRE LMQLEKELVE RQPQVDMLQE ISNSLLIKGH GEDCIEAEEK VHVIEKKLKQ LREQVSQDLM ALQGTQNPAS PLPSFDEVDS GDQPPATSVP APRAKQFRAV RTTEGEEETE SRVPGSTRPQ RSFLSRVVRA ALPLQLLLLL LLLLACLLPS SEEDYSCTQA NNFARSFYPM LRYTNGPPPT * | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | N/A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.40 s | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||