MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
TP53BP1 | polymorphism_automatic | 1.68662303012823e-07 | simple_aae | K1136Q | single base exchange | rs2602141 | show file | ||||
TP53BP1 | polymorphism_automatic | 1.68662303012823e-07 | simple_aae | K1141Q | single base exchange | rs2602141 | show file | ||||
TP53BP1 | polymorphism_automatic | 1.68662303012823e-07 | simple_aae | K1141Q | single base exchange | rs2602141 | show file | ||||
TP53BP1 | polymorphism_automatic | 1.68662303012823e-07 | simple_aae | K1141Q | single base exchange | rs2602141 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999831337697 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr15:43724646T>GN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | TP53BP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000263801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_005657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q12888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.3406A>C cDNA.3659A>C g.78281A>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | K1136Q Score: 53 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2602141
known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM067476) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5919 / 5919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1973 / 1973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6172 / 6172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 254 / 254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5681 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5919 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 3406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 78281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 43724646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDPTGSQLDS DFSQQDTPCL IIEDSQPESQ VLEDDSGSHF SMLSRHLPNL QTHKENPVLD VVSNPEQTAG EERGDGNSGF NEHLKENKVA DPVDSSNLDT CGSISQVIEQ LPQPNRTSSV LGMSVESAPA VEEEKGEELE QKEKEKEEDT SGNTTHSLGA EDTASSQLGF GVLELSQSQD VEENTVPYEV DKEQLQSVTT NSGYTRLSDV DANTAIKHEE QSNEDIPIAE QSSKDIPVTA QPSKDVHVVK EQNPPPARSE DMPFSPKASV AAMEAKEQLS AQELMESGLQ IQKSPEPEVL STQEDLFDQS NKTVSSDGCS TPSREEGGCS LASTPATTLH LLQLSGQRSL VQDSLSTNSS DLVAPSPDAF RSTPFIVPSS PTEQEGRQDK PMDTSVLSEE GGEPFQKKLQ SGEPVELENP PLLPESTVSP QASTPISQST PVFPPGSLPI PSQPQFSHDI FIPSPSLEEQ SNDGKKDGDM HSSSLTVECS KTSEIEPKNS PEDLGLSLTG DSCKLMLSTS EYSQSPKMES LSSHRIDEDG ENTQIEDTEP MSPVLNSKFV PAENDSILMN PAQDGEVQLS QNDDKTKGDD TDTRDDISIL ATGCKGREET VAEDVCIDLT CDSGSQAVPS PATRSEALSS VLDQEEAMEI KEHHPEEGSS GSEVEEIPET PCESQGEELK EENMESVPLH LSLTETQSQG LCLQKEMPKK ECSEAMEVET SVISIDSPQK LAILDQELEH KEQEAWEEAT SEDSSVVIVD VKEPSPRVDV SCEPLEGVEK CSDSQSWEDI APEIEPCAEN RLDTKEEKSV EYEGDLKSGT AETEPVEQDS SQPSLPLVRA DDPLRLDQEL QQPQTQEKTS NSLTEDSKMA NAKQLSSDAE AQKLGKPSAH ASQSFCESSS ETPFHFTLPK EGDIIPPLTG ATPPLIGHLK LEPKRHSTPI GISNYPESTI ATSDVMSESM VETHDPILGS GKGDSGAAPD VDDKLCLRMK LVSPETEASE ESLQFNLEKP ATGERKNGST AVAESVASPQ KTMSVLSCIC EARQENEARS EDPPTTPIRG NLLHFPSSQG EEEKEKLEGD HTIRQSQQPM KPISPVKDPV SPASQKMVIQ GPSSPQGEAM VTDVLEDQKE GRSTNKENPS KALIERPSQN NIGIQTMECS LRVPETVSAA TQTIKNVCEQ GTSTVDQNFG KQDATVQTER GSGEKPVSAP GDDTESLHSQ GEEEFDMPQP PHGHVLHRHM RTIREVRTLV TRVITDVYYV DGTEVERKVT EETEEPIVEC QECETEVSPS QTGGSSGDLG DISSFSSKAS SLHRTSSGTS LSAMHSSGSS GKGAGPLRGK TSGTEPADFA LPSSRGGPGK LSPRKGVSQT GTPVCEEDGD AGLGIRQGGK APVTPRGRGR RGRPPSRTTG TRETAVPGPL GIEDISPNLS PDDKSFSRVV PRVPDSTRRT DVGAGALRRS DSPEIPFQAA AGPSDGLDAS SPGNSFVGLR VVAKWSSNGY FYSGKITRDV GAGKYKLLFD DGYECDVLGK DILLCDPIPL DTEVTALSED EYFSAGVVKG HRKESGELYY SIEKEGQRKW YKRMAVILSL EQGNRLREQY GLGPYEAVTP LTKAADISLD NLVEGKRKRR SNVSSPATPT ASSSSSTTPT RKITESPRAS MGVLSGKRKL ITSEEERSPA KRGRKSATVK PGAVGAGEFV SPCESGDNTG EPSALEEQRG PLPLNKTLFL GYAFLLTMAT TSDKLASRSK LPDGPTGSSE EEEEFLEIPP FNKQYTESQL RAGAGYILED FNEAQCNTAY QCLLIADQHC RTRKYFLCLA SGIPCVSHVW VHDSCHANQL QNYRNYLLPA GYSLEEQRIL DWQPRENPFQ NLKVLLVSDQ QQNFLELWSE ILMTGGAASV KQHHSSAHNK DIALGVFDVV VTDPSCPASV LKCAEALQLP VVSQEWVIQC LIVGERIGFK QHPKYKHDYV SH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDPTGSQLDS DFSQQDTPCL IIEDSQPESQ VLEDDSGSHF SMLSRHLPNL QTHKENPVLD VVSNPEQTAG EERGDGNSGF NEHLKENKVA DPVDSSNLDT CGSISQVIEQ LPQPNRTSSV LGMSVESAPA VEEEKGEELE QKEKEKEEDT SGNTTHSLGA EDTASSQLGF GVLELSQSQD VEENTVPYEV DKEQLQSVTT NSGYTRLSDV DANTAIKHEE QSNEDIPIAE QSSKDIPVTA QPSKDVHVVK EQNPPPARSE DMPFSPKASV AAMEAKEQLS AQELMESGLQ IQKSPEPEVL STQEDLFDQS NKTVSSDGCS TPSREEGGCS LASTPATTLH LLQLSGQRSL VQDSLSTNSS DLVAPSPDAF RSTPFIVPSS PTEQEGRQDK PMDTSVLSEE GGEPFQKKLQ SGEPVELENP PLLPESTVSP QASTPISQST PVFPPGSLPI PSQPQFSHDI FIPSPSLEEQ SNDGKKDGDM HSSSLTVECS KTSEIEPKNS PEDLGLSLTG DSCKLMLSTS EYSQSPKMES LSSHRIDEDG ENTQIEDTEP MSPVLNSKFV PAENDSILMN PAQDGEVQLS QNDDKTKGDD TDTRDDISIL ATGCKGREET VAEDVCIDLT CDSGSQAVPS PATRSEALSS VLDQEEAMEI KEHHPEEGSS GSEVEEIPET PCESQGEELK EENMESVPLH LSLTETQSQG LCLQKEMPKK ECSEAMEVET SVISIDSPQK LAILDQELEH KEQEAWEEAT SEDSSVVIVD VKEPSPRVDV SCEPLEGVEK CSDSQSWEDI APEIEPCAEN RLDTKEEKSV EYEGDLKSGT AETEPVEQDS SQPSLPLVRA DDPLRLDQEL QQPQTQEKTS NSLTEDSKMA NAKQLSSDAE AQKLGKPSAH ASQSFCESSS ETPFHFTLPK EGDIIPPLTG ATPPLIGHLK LEPKRHSTPI GISNYPESTI ATSDVMSESM VETHDPILGS GKGDSGAAPD VDDKLCLRMK LVSPETEASE ESLQFNLEKP ATGERKNGST AVAESVASPQ KTMSVLSCIC EARQENEARS EDPPTTPIRG NLLHFPSSQG EEEKEKLEGD HTIRQSQQPM KPISPVKDPV SPASQKMVIQ GPSSPQGEAM VTDVLEDQKE GRSTNQENPS KALIERPSQN NIGIQTMECS LRVPETVSAA TQTIKNVCEQ GTSTVDQNFG KQDATVQTER GSGEKPVSAP GDDTESLHSQ GEEEFDMPQP PHGHVLHRHM RTIREVRTLV TRVITDVYYV DGTEVERKVT EETEEPIVEC QECETEVSPS QTGGSSGDLG DISSFSSKAS SLHRTSSGTS LSAMHSSGSS GKGAGPLRGK TSGTEPADFA LPSSRGGPGK LSPRKGVSQT GTPVCEEDGD AGLGIRQGGK APVTPRGRGR RGRPPSRTTG TRETAVPGPL GIEDISPNLS PDDKSFSRVV PRVPDSTRRT DVGAGALRRS DSPEIPFQAA AGPSDGLDAS SPGNSFVGLR VVAKWSSNGY FYSGKITRDV GAGKYKLLFD DGYECDVLGK DILLCDPIPL DTEVTALSED EYFSAGVVKG HRKESGELYY SIEKEGQRKW YKRMAVILSL EQGNRLREQY GLGPYEAVTP LTKAADISLD NLVEGKRKRR SNVSSPATPT ASSSSSTTPT RKITESPRAS MGVLSGKRKL ITSEEERSPA KRGRKSATVK PGAVGAGEFV SPCESGDNTG EPSALEEQRG PLPLNKTLFL GYAFLLTMAT TSDKLASRSK LPDGPTGSSE EEEEFLEIPP FNKQYTESQL RAGAGYILED FNEAQCNTAY QCLLIADQHC RTRKYFLCLA SGIPCVSHVW VHDSCHANQL QNYRNYLLPA GYSLEEQRIL DWQPRENPFQ NLKVLLVSDQ QQNFLELWSE ILMTGGAASV KQHHSSAHNK DIALGVFDVV VTDPSCPASV LKCAEALQLP VVSQEWVIQC LIVGERIGFK QHPKYKHDYV SH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.74 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999831337697 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr15:43724646T>GN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | TP53BP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000382039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q12888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.3421A>C cDNA.3483A>C g.78281A>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | K1141Q Score: 53 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2602141
known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM067476) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5784 / 5784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1928 / 1928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 5846 / 5846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 63 / 63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 3421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 78281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 43724646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MPGEQMDPTG SQLDSDFSQQ DTPCLIIEDS QPESQVLEDD SGSHFSMLSR HLPNLQTHKE NPVLDVVSNP EQTAGEERGD GNSGFNEHLK ENKVADPVDS SNLDTCGSIS QVIEQLPQPN RTSSVLGMSV ESAPAVEEEK GEELEQKEKE KEEDTSGNTT HSLGAEDTAS SQLGFGVLEL SQSQDVEENT VPYEVDKEQL QSVTTNSGYT RLSDVDANTA IKHEEQSNED IPIAEQSSKD IPVTAQPSKD VHVVKEQNPP PARSEDMPFS PKASVAAMEA KEQLSAQELM ESGLQIQKSP EPEVLSTQED LFDQSNKTVS SDGCSTPSRE EGGCSLASTP ATTLHLLQLS GQRSLVQDSL STNSSDLVAP SPDAFRSTPF IVPSSPTEQE GRQDKPMDTS VLSEEGGEPF QKKLQSGEPV ELENPPLLPE STVSPQASTP ISQSTPVFPP GSLPIPSQPQ FSHDIFIPSP SLEEQSNDGK KDGDMHSSSL TVECSKTSEI EPKNSPEDLG LSLTGDSCKL MLSTSEYSQS PKMESLSSHR IDEDGENTQI EDTEPMSPVL NSKFVPAEND SILMNPAQDG EVQLSQNDDK TKGDDTDTRD DISILATGCK GREETVAEDV CIDLTCDSGS QAVPSPATRS EALSSVLDQE EAMEIKEHHP EEGSSGSEVE EIPETPCESQ GEELKEENME SVPLHLSLTE TQSQGLCLQK EMPKKECSEA MEVETSVISI DSPQKLAILD QELEHKEQEA WEEATSEDSS VVIVDVKEPS PRVDVSCEPL EGVEKCSDSQ SWEDIAPEIE PCAENRLDTK EEKSVEYEGD LKSGTAETEP VEQDSSQPSL PLVRADDPLR LDQELQQPQT QEKTSNSLTE DSKMANAKQL SSDAEAQKLG KPSAHASQSF CESSSETPFH FTLPKEGDII PPLTGATPPL IGHLKLEPKR HSTPIGISNY PESTIATSDV MSESMVETHD PILGSGKGDS GAAPDVDDKL CLRMKLVSPE TEASEESLQF NLEKPATGER KNGSTAVAES VASPQKTMSV LSCICEARQE NEARSEDPPT TPIRGNLLHF PSSQGEEEKE KLEGDHTIRQ SQQPMKPISP VKDPVSPASQ KMVIQGPSSP QGEAMVTDVL EDQKEGRSTN KENPSKALIE RPSQNNIGIQ TMECSLRVPE TVSAATQTIK NVCEQGTSTV DQNFGKQDAT VQTERGSGEK PVSAPGDDTE SLHSQGEEEF DMPQPPHGHV LHRHMRTIRE VRTLVTRVIT DVYYVDGTEV ERKVTEETEE PIVECQECET EVSPSQTGGS SGDLGDISSF SSKASSLHRT SSGTSLSAMH SSGSSGKGAG PLRGKTSGTE PADFALPSSR GGPGKLRETA VPGPLGIEDI SPNLSPDDKS FSRVVPRVPD STRRTDVGAG ALRRSDSPEI PFQAAAGPSD GLDASSPGNS FVGLRVVAKW SSNGYFYSGK ITRDVGAGKY KLLFDDGYEC DVLGKDILLC DPIPLDTEVT ALSEDEYFSA GVVKGHRKES GELYYSIEKE GQRKWYKRMA VILSLEQGNR LREQYGLGPY EAVTPLTKAA DISLDNLVEG KRKRRSNVSS PATPTASSSS STTPTRKITE SPRASMGVLS GKRKLITSEE ERSPAKRGRK SATVKPGAVG AGEFVSPCES GDNTGEPSAL EEQRGPLPLN KTLFLGYAFL LTMATTSDKL ASRSKLPDGP TGSSEEEEEF LEIPPFNKQY TESQLRAGAG YILEDFNEAQ CNTAYQCLLI ADQHCRTRKY FLCLASGIPC VSHVWVHDSC HANQLQNYRN YLLPAGYSLE EQRILDWQPR ENPFQNLKVL LVSDQQQNFL ELWSEILMTG GAASVKQHHS SAHNKDIALG VFDVVVTDPS CPASVLKCAE ALQLPVVSQE WVIQCLIVGE RIGFKQHPKY KHDYVSH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MPGEQMDPTG SQLDSDFSQQ DTPCLIIEDS QPESQVLEDD SGSHFSMLSR HLPNLQTHKE NPVLDVVSNP EQTAGEERGD GNSGFNEHLK ENKVADPVDS SNLDTCGSIS QVIEQLPQPN RTSSVLGMSV ESAPAVEEEK GEELEQKEKE KEEDTSGNTT HSLGAEDTAS SQLGFGVLEL SQSQDVEENT VPYEVDKEQL QSVTTNSGYT RLSDVDANTA IKHEEQSNED IPIAEQSSKD IPVTAQPSKD VHVVKEQNPP PARSEDMPFS PKASVAAMEA KEQLSAQELM ESGLQIQKSP EPEVLSTQED LFDQSNKTVS SDGCSTPSRE EGGCSLASTP ATTLHLLQLS GQRSLVQDSL STNSSDLVAP SPDAFRSTPF IVPSSPTEQE GRQDKPMDTS VLSEEGGEPF QKKLQSGEPV ELENPPLLPE STVSPQASTP ISQSTPVFPP GSLPIPSQPQ FSHDIFIPSP SLEEQSNDGK KDGDMHSSSL TVECSKTSEI EPKNSPEDLG LSLTGDSCKL MLSTSEYSQS PKMESLSSHR IDEDGENTQI EDTEPMSPVL NSKFVPAEND SILMNPAQDG EVQLSQNDDK TKGDDTDTRD DISILATGCK GREETVAEDV CIDLTCDSGS QAVPSPATRS EALSSVLDQE EAMEIKEHHP EEGSSGSEVE EIPETPCESQ GEELKEENME SVPLHLSLTE TQSQGLCLQK EMPKKECSEA MEVETSVISI DSPQKLAILD QELEHKEQEA WEEATSEDSS VVIVDVKEPS PRVDVSCEPL EGVEKCSDSQ SWEDIAPEIE PCAENRLDTK EEKSVEYEGD LKSGTAETEP VEQDSSQPSL PLVRADDPLR LDQELQQPQT QEKTSNSLTE DSKMANAKQL SSDAEAQKLG KPSAHASQSF CESSSETPFH FTLPKEGDII PPLTGATPPL IGHLKLEPKR HSTPIGISNY PESTIATSDV MSESMVETHD PILGSGKGDS GAAPDVDDKL CLRMKLVSPE TEASEESLQF NLEKPATGER KNGSTAVAES VASPQKTMSV LSCICEARQE NEARSEDPPT TPIRGNLLHF PSSQGEEEKE KLEGDHTIRQ SQQPMKPISP VKDPVSPASQ KMVIQGPSSP QGEAMVTDVL EDQKEGRSTN QENPSKALIE RPSQNNIGIQ TMECSLRVPE TVSAATQTIK NVCEQGTSTV DQNFGKQDAT VQTERGSGEK PVSAPGDDTE SLHSQGEEEF DMPQPPHGHV LHRHMRTIRE VRTLVTRVIT DVYYVDGTEV ERKVTEETEE PIVECQECET EVSPSQTGGS SGDLGDISSF SSKASSLHRT SSGTSLSAMH SSGSSGKGAG PLRGKTSGTE PADFALPSSR GGPGKLRETA VPGPLGIEDI SPNLSPDDKS FSRVVPRVPD STRRTDVGAG ALRRSDSPEI PFQAAAGPSD GLDASSPGNS FVGLRVVAKW SSNGYFYSGK ITRDVGAGKY KLLFDDGYEC DVLGKDILLC DPIPLDTEVT ALSEDEYFSA GVVKGHRKES GELYYSIEKE GQRKWYKRMA VILSLEQGNR LREQYGLGPY EAVTPLTKAA DISLDNLVEG KRKRRSNVSS PATPTASSSS STTPTRKITE SPRASMGVLS GKRKLITSEE ERSPAKRGRK SATVKPGAVG AGEFVSPCES GDNTGEPSAL EEQRGPLPLN KTLFLGYAFL LTMATTSDKL ASRSKLPDGP TGSSEEEEEF LEIPPFNKQY TESQLRAGAG YILEDFNEAQ CNTAYQCLLI ADQHCRTRKY FLCLASGIPC VSHVWVHDSC HANQLQNYRN YLLPAGYSLE EQRILDWQPR ENPFQNLKVL LVSDQQQNFL ELWSEILMTG GAASVKQHHS SAHNKDIALG VFDVVVTDPS CPASVLKCAE ALQLPVVSQE WVIQCLIVGE RIGFKQHPKY KHDYVSH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.74 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999831337697 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr15:43724646T>GN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | TP53BP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000382044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001141980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q12888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.3421A>C cDNA.3549A>C g.78281A>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | K1141Q Score: 53 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2602141
known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM067476) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5934 / 5934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1978 / 1978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6062 / 6062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 129 / 129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5875 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 3421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 78281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 43724646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MPGEQMDPTG SQLDSDFSQQ DTPCLIIEDS QPESQVLEDD SGSHFSMLSR HLPNLQTHKE NPVLDVVSNP EQTAGEERGD GNSGFNEHLK ENKVADPVDS SNLDTCGSIS QVIEQLPQPN RTSSVLGMSV ESAPAVEEEK GEELEQKEKE KEEDTSGNTT HSLGAEDTAS SQLGFGVLEL SQSQDVEENT VPYEVDKEQL QSVTTNSGYT RLSDVDANTA IKHEEQSNED IPIAEQSSKD IPVTAQPSKD VHVVKEQNPP PARSEDMPFS PKASVAAMEA KEQLSAQELM ESGLQIQKSP EPEVLSTQED LFDQSNKTVS SDGCSTPSRE EGGCSLASTP ATTLHLLQLS GQRSLVQDSL STNSSDLVAP SPDAFRSTPF IVPSSPTEQE GRQDKPMDTS VLSEEGGEPF QKKLQSGEPV ELENPPLLPE STVSPQASTP ISQSTPVFPP GSLPIPSQPQ FSHDIFIPSP SLEEQSNDGK KDGDMHSSSL TVECSKTSEI EPKNSPEDLG LSLTGDSCKL MLSTSEYSQS PKMESLSSHR IDEDGENTQI EDTEPMSPVL NSKFVPAEND SILMNPAQDG EVQLSQNDDK TKGDDTDTRD DISILATGCK GREETVAEDV CIDLTCDSGS QAVPSPATRS EALSSVLDQE EAMEIKEHHP EEGSSGSEVE EIPETPCESQ GEELKEENME SVPLHLSLTE TQSQGLCLQK EMPKKECSEA MEVETSVISI DSPQKLAILD QELEHKEQEA WEEATSEDSS VVIVDVKEPS PRVDVSCEPL EGVEKCSDSQ SWEDIAPEIE PCAENRLDTK EEKSVEYEGD LKSGTAETEP VEQDSSQPSL PLVRADDPLR LDQELQQPQT QEKTSNSLTE DSKMANAKQL SSDAEAQKLG KPSAHASQSF CESSSETPFH FTLPKEGDII PPLTGATPPL IGHLKLEPKR HSTPIGISNY PESTIATSDV MSESMVETHD PILGSGKGDS GAAPDVDDKL CLRMKLVSPE TEASEESLQF NLEKPATGER KNGSTAVAES VASPQKTMSV LSCICEARQE NEARSEDPPT TPIRGNLLHF PSSQGEEEKE KLEGDHTIRQ SQQPMKPISP VKDPVSPASQ KMVIQGPSSP QGEAMVTDVL EDQKEGRSTN KENPSKALIE RPSQNNIGIQ TMECSLRVPE TVSAATQTIK NVCEQGTSTV DQNFGKQDAT VQTERGSGEK PVSAPGDDTE SLHSQGEEEF DMPQPPHGHV LHRHMRTIRE VRTLVTRVIT DVYYVDGTEV ERKVTEETEE PIVECQECET EVSPSQTGGS SGDLGDISSF SSKASSLHRT SSGTSLSAMH SSGSSGKGAG PLRGKTSGTE PADFALPSSR GGPGKLSPRK GVSQTGTPVC EEDGDAGLGI RQGGKAPVTP RGRGRRGRPP SRTTGTRETA VPGPLGIEDI SPNLSPDDKS FSRVVPRVPD STRRTDVGAG ALRRSDSPEI PFQAAAGPSD GLDASSPGNS FVGLRVVAKW SSNGYFYSGK ITRDVGAGKY KLLFDDGYEC DVLGKDILLC DPIPLDTEVT ALSEDEYFSA GVVKGHRKES GELYYSIEKE GQRKWYKRMA VILSLEQGNR LREQYGLGPY EAVTPLTKAA DISLDNLVEG KRKRRSNVSS PATPTASSSS STTPTRKITE SPRASMGVLS GKRKLITSEE ERSPAKRGRK SATVKPGAVG AGEFVSPCES GDNTGEPSAL EEQRGPLPLN KTLFLGYAFL LTMATTSDKL ASRSKLPDGP TGSSEEEEEF LEIPPFNKQY TESQLRAGAG YILEDFNEAQ CNTAYQCLLI ADQHCRTRKY FLCLASGIPC VSHVWVHDSC HANQLQNYRN YLLPAGYSLE EQRILDWQPR ENPFQNLKVL LVSDQQQNFL ELWSEILMTG GAASVKQHHS SAHNKDIALG VFDVVVTDPS CPASVLKCAE ALQLPVVSQE WVIQCLIVGE RIGFKQHPKY KHDYVSH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MPGEQMDPTG SQLDSDFSQQ DTPCLIIEDS QPESQVLEDD SGSHFSMLSR HLPNLQTHKE NPVLDVVSNP EQTAGEERGD GNSGFNEHLK ENKVADPVDS SNLDTCGSIS QVIEQLPQPN RTSSVLGMSV ESAPAVEEEK GEELEQKEKE KEEDTSGNTT HSLGAEDTAS SQLGFGVLEL SQSQDVEENT VPYEVDKEQL QSVTTNSGYT RLSDVDANTA IKHEEQSNED IPIAEQSSKD IPVTAQPSKD VHVVKEQNPP PARSEDMPFS PKASVAAMEA KEQLSAQELM ESGLQIQKSP EPEVLSTQED LFDQSNKTVS SDGCSTPSRE EGGCSLASTP ATTLHLLQLS GQRSLVQDSL STNSSDLVAP SPDAFRSTPF IVPSSPTEQE GRQDKPMDTS VLSEEGGEPF QKKLQSGEPV ELENPPLLPE STVSPQASTP ISQSTPVFPP GSLPIPSQPQ FSHDIFIPSP SLEEQSNDGK KDGDMHSSSL TVECSKTSEI EPKNSPEDLG LSLTGDSCKL MLSTSEYSQS PKMESLSSHR IDEDGENTQI EDTEPMSPVL NSKFVPAEND SILMNPAQDG EVQLSQNDDK TKGDDTDTRD DISILATGCK GREETVAEDV CIDLTCDSGS QAVPSPATRS EALSSVLDQE EAMEIKEHHP EEGSSGSEVE EIPETPCESQ GEELKEENME SVPLHLSLTE TQSQGLCLQK EMPKKECSEA MEVETSVISI DSPQKLAILD QELEHKEQEA WEEATSEDSS VVIVDVKEPS PRVDVSCEPL EGVEKCSDSQ SWEDIAPEIE PCAENRLDTK EEKSVEYEGD LKSGTAETEP VEQDSSQPSL PLVRADDPLR LDQELQQPQT QEKTSNSLTE DSKMANAKQL SSDAEAQKLG KPSAHASQSF CESSSETPFH FTLPKEGDII PPLTGATPPL IGHLKLEPKR HSTPIGISNY PESTIATSDV MSESMVETHD PILGSGKGDS GAAPDVDDKL CLRMKLVSPE TEASEESLQF NLEKPATGER KNGSTAVAES VASPQKTMSV LSCICEARQE NEARSEDPPT TPIRGNLLHF PSSQGEEEKE KLEGDHTIRQ SQQPMKPISP VKDPVSPASQ KMVIQGPSSP QGEAMVTDVL EDQKEGRSTN QENPSKALIE RPSQNNIGIQ TMECSLRVPE TVSAATQTIK NVCEQGTSTV DQNFGKQDAT VQTERGSGEK PVSAPGDDTE SLHSQGEEEF DMPQPPHGHV LHRHMRTIRE VRTLVTRVIT DVYYVDGTEV ERKVTEETEE PIVECQECET EVSPSQTGGS SGDLGDISSF SSKASSLHRT SSGTSLSAMH SSGSSGKGAG PLRGKTSGTE PADFALPSSR GGPGKLSPRK GVSQTGTPVC EEDGDAGLGI RQGGKAPVTP RGRGRRGRPP SRTTGTRETA VPGPLGIEDI SPNLSPDDKS FSRVVPRVPD STRRTDVGAG ALRRSDSPEI PFQAAAGPSD GLDASSPGNS FVGLRVVAKW SSNGYFYSGK ITRDVGAGKY KLLFDDGYEC DVLGKDILLC DPIPLDTEVT ALSEDEYFSA GVVKGHRKES GELYYSIEKE GQRKWYKRMA VILSLEQGNR LREQYGLGPY EAVTPLTKAA DISLDNLVEG KRKRRSNVSS PATPTASSSS STTPTRKITE SPRASMGVLS GKRKLITSEE ERSPAKRGRK SATVKPGAVG AGEFVSPCES GDNTGEPSAL EEQRGPLPLN KTLFLGYAFL LTMATTSDKL ASRSKLPDGP TGSSEEEEEF LEIPPFNKQY TESQLRAGAG YILEDFNEAQ CNTAYQCLLI ADQHCRTRKY FLCLASGIPC VSHVWVHDSC HANQLQNYRN YLLPAGYSLE EQRILDWQPR ENPFQNLKVL LVSDQQQNFL ELWSEILMTG GAASVKQHHS SAHNKDIALG VFDVVVTDPS CPASVLKCAE ALQLPVVSQE WVIQCLIVGE RIGFKQHPKY KHDYVSH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 1.19 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999831337697 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr15:43724646T>GN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | TP53BP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000450115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001141979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q12888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.3421A>C cDNA.3505A>C g.78281A>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | K1141Q Score: 53 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs2602141
known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM067476) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
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splice sites |
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distance from splice site | 230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5928 / 5928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1976 / 1976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6012 / 6012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 85 / 85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 3421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 78281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 43724646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATAAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | AAGAAGGACGGAGTACTAATCAGGAAAATCCTAGTAAGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MPGEQMDPTG SQLDSDFSQQ DTPCLIIEDS QPESQVLEDD SGSHFSMLSR HLPNLQTHKE NPVLDVVSNP EQTAGEERGD GNSGFNEHLK ENKVADPVDS SNLDTCGSIS QVIEQLPQPN RTSSVLGMSV ESAPAVEEEK GEELEQKEKE KEEDTSGNTT HSLGAEDTAS SQLGFGVLEL SQSQDVEENT VPYEVDKEQL QSVTTNSGYT RLSDVDANTA IKHEEQSNED IPIAEQSSKD IPVTAQPSKD VHVVKEQNPP PARSEDMPFS PKASVAAMEA KEQLSAQELM ESGLQIQKSP EPEVLSTQED LFDQSNKTVS SDGCSTPSRE EGGCSLASTP ATTLHLLQLS GQRSLVQDSL STNSSDLVAP SPDAFRSTPF IVPSSPTEQE GRQDKPMDTS VLSEEGGEPF QKKLQSGEPV ELENPPLLPE STVSPQASTP ISQSTPVFPP GSLPIPSQPQ FSHDIFIPSP SLEEQSNDGK KDGDMHSSSL TVECSKTSEI EPKNSPEDLG LSLTGDSCKL MLSTSEYSQS PKMESLSSHR IDEDGENTQI EDTEPMSPVL NSKFVPAEND SILMNPAQDG EVQLSQNDDK TKGDDTDTRD DISILATGCK GREETVAEDV CIDLTCDSGS QAVPSPATRS EALSSVLDQE EAMEIKEHHP EEGSSGSEVE EIPETPCESQ GEELKEENME SVPLHLSLTE TQSQGLCLQK EMPKKECSEA MEVETSVISI DSPQKLAILD QELEHKEQEA WEEATSEDSS VVIVDVKEPS PRVDVSCEPL EGVEKCSDSQ SWEDIAPEIE PCAENRLDTK EEKSVEYEGD LKSGTAETEP VEQDSSQPSL PLVRADDPLR LDQELQQPQT QEKTSNSLTE DSKMANAKQL SSDAEAQKLG KPSAHASQSF CESSSETPFH FTLPKEGDII PPLTGATPPL IGHLKLEPKR HSTPIGISNY PESTIATSDV MSESMVETHD PILGSGKGDS GAAPDVDDKL CLRMKLVSPE TEASEESLQF NLEKPATGER KNGSTAVAES VASPQKTMSV LSCICEARQE NEARSEDPPT TPIRGNLLHF PSSQGEEEKE KLEGDHTIRQ SQQPMKPISP VKDPVSPASQ KMVIQGPSSP QGEAMVTDVL EDQKEGRSTN KENPSKALIE RPSQNNIGIQ TMECSLRVPE TVSAATQTIK NVCEQGTSTV DQNFGKQDAT VQTERGSGEK PVSAPGDDTE SLHSQGEEEF DMPQPPHGHV LHRHMRTIRE VRTLVTRVIT DVYYVDGTEV ERKVTEETEE PIVECQECET EVSPSQTGGS SGDLGDISSF SSKASSLHRT SSGTSLSAMH SSGSSGKGAG PLRGKTSGTE PADFALPSSR GGPGKLSPRK GVSQTGTPVC EEDGDAGLGI RQGGKAPVTP RGRGRRGRPP SRTTGTRETA VPGPLGIEDI SPNLSPDDKS FSRVVPRVPD STRRTDVGAG ALRRSDSPEI PFQAAAGPSD GLDASSPGNS FVGLRVVAKW SSNGYFYSGK ITRDVGAGKY KLLFDDGYEC DVLGKDILLC DPIPLDTEVT ALSEDEYFSA GVVKGHRKES GELYYSIEKE GQRKWYKRMA VILSLEQGNR LREQYGLGPY EAVTPLTKAA DISLDNLVEG KRKRRSNVSS PATPTASSSS STTPTRKITE SPRASMGVLS GKRKLITSEE ERSPAKRGRK SATVKPVGAG EFVSPCESGD NTGEPSALEE QRGPLPLNKT LFLGYAFLLT MATTSDKLAS RSKLPDGPTG SSEEEEEFLE IPPFNKQYTE SQLRAGAGYI LEDFNEAQCN TAYQCLLIAD QHCRTRKYFL CLASGIPCVS HVWVHDSCHA NQLQNYRNYL LPAGYSLEEQ RILDWQPREN PFQNLKVLLV SDQQQNFLEL WSEILMTGGA ASVKQHHSSA HNKDIALGVF DVVVTDPSCP ASVLKCAEAL QLPVVSQEWV IQCLIVGERI GFKQHPKYKH DYVSH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MPGEQMDPTG SQLDSDFSQQ DTPCLIIEDS QPESQVLEDD SGSHFSMLSR HLPNLQTHKE NPVLDVVSNP EQTAGEERGD GNSGFNEHLK ENKVADPVDS SNLDTCGSIS QVIEQLPQPN RTSSVLGMSV ESAPAVEEEK GEELEQKEKE KEEDTSGNTT HSLGAEDTAS SQLGFGVLEL SQSQDVEENT VPYEVDKEQL QSVTTNSGYT RLSDVDANTA IKHEEQSNED IPIAEQSSKD IPVTAQPSKD VHVVKEQNPP PARSEDMPFS PKASVAAMEA KEQLSAQELM ESGLQIQKSP EPEVLSTQED LFDQSNKTVS SDGCSTPSRE EGGCSLASTP ATTLHLLQLS GQRSLVQDSL STNSSDLVAP SPDAFRSTPF IVPSSPTEQE GRQDKPMDTS VLSEEGGEPF QKKLQSGEPV ELENPPLLPE STVSPQASTP ISQSTPVFPP GSLPIPSQPQ FSHDIFIPSP SLEEQSNDGK KDGDMHSSSL TVECSKTSEI EPKNSPEDLG LSLTGDSCKL MLSTSEYSQS PKMESLSSHR IDEDGENTQI EDTEPMSPVL NSKFVPAEND SILMNPAQDG EVQLSQNDDK TKGDDTDTRD DISILATGCK GREETVAEDV CIDLTCDSGS QAVPSPATRS EALSSVLDQE EAMEIKEHHP EEGSSGSEVE EIPETPCESQ GEELKEENME SVPLHLSLTE TQSQGLCLQK EMPKKECSEA MEVETSVISI DSPQKLAILD QELEHKEQEA WEEATSEDSS VVIVDVKEPS PRVDVSCEPL EGVEKCSDSQ SWEDIAPEIE PCAENRLDTK EEKSVEYEGD LKSGTAETEP VEQDSSQPSL PLVRADDPLR LDQELQQPQT QEKTSNSLTE DSKMANAKQL SSDAEAQKLG KPSAHASQSF CESSSETPFH FTLPKEGDII PPLTGATPPL IGHLKLEPKR HSTPIGISNY PESTIATSDV MSESMVETHD PILGSGKGDS GAAPDVDDKL CLRMKLVSPE TEASEESLQF NLEKPATGER KNGSTAVAES VASPQKTMSV LSCICEARQE NEARSEDPPT TPIRGNLLHF PSSQGEEEKE KLEGDHTIRQ SQQPMKPISP VKDPVSPASQ KMVIQGPSSP QGEAMVTDVL EDQKEGRSTN QENPSKALIE RPSQNNIGIQ TMECSLRVPE TVSAATQTIK NVCEQGTSTV DQNFGKQDAT VQTERGSGEK PVSAPGDDTE SLHSQGEEEF DMPQPPHGHV LHRHMRTIRE VRTLVTRVIT DVYYVDGTEV ERKVTEETEE PIVECQECET EVSPSQTGGS SGDLGDISSF SSKASSLHRT SSGTSLSAMH SSGSSGKGAG PLRGKTSGTE PADFALPSSR GGPGKLSPRK GVSQTGTPVC EEDGDAGLGI RQGGKAPVTP RGRGRRGRPP SRTTGTRETA VPGPLGIEDI SPNLSPDDKS FSRVVPRVPD STRRTDVGAG ALRRSDSPEI PFQAAAGPSD GLDASSPGNS FVGLRVVAKW SSNGYFYSGK ITRDVGAGKY KLLFDDGYEC DVLGKDILLC DPIPLDTEVT ALSEDEYFSA GVVKGHRKES GELYYSIEKE GQRKWYKRMA VILSLEQGNR LREQYGLGPY EAVTPLTKAA DISLDNLVEG KRKRRSNVSS PATPTASSSS STTPTRKITE SPRASMGVLS GKRKLITSEE ERSPAKRGRK SATVKPVGAG EFVSPCESGD NTGEPSALEE QRGPLPLNKT LFLGYAFLLT MATTSDKLAS RSKLPDGPTG SSEEEEEFLE IPPFNKQYTE SQLRAGAGYI LEDFNEAQCN TAYQCLLIAD QHCRTRKYFL CLASGIPCVS HVWVHDSCHA NQLQNYRNYL LPAGYSLEEQ RILDWQPREN PFQNLKVLLV SDQQQNFLEL WSEILMTGGA ASVKQHHSSA HNKDIALGVF DVVVTDPSCP ASVLKCAEAL QLPVVSQEWV IQCLIVGERI GFKQHPKYKH DYVSH* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.91 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||