MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
CEP192 | polymorphism_automatic | 0.00653264238905904 | simple_aae | affected | S1552P | single base exchange | rs578208 | show file | |||
CEP192 | polymorphism_automatic | 0.00653264238905904 | simple_aae | affected | S1077P | single base exchange | rs578208 | show file | |||
CEP192 | polymorphism_automatic | 0.00653264238905904 | simple_aae | affected | S956P | single base exchange | rs578208 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.993467357610941 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr18:13068132T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CEP192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000506447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_032142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8TEP8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.4654T>C cDNA.4734T>C g.76772T>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | S1552P Score: 74 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs578208
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation Gene Associated, Regulatory Feature, Gene associated regulatory feature H3K9me1, Histone, Histone 3 Lysine 9 mono-methylation H4K20me1, Histone, Histone 4 Lysine 20 mono-methylation H3K4me1, Histone, Histone 3 Lysine 4 Mono-Methylation DNase1, Open Chromatin, DNase1 Hypersensitive Site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 7614 / 7614 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 2538 / 2538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 7694 / 7694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 81 / 81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 7556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 7425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 7614 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 4654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 4734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 76772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 13068132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAATCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAACCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAATCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAACCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MEDFRGIAEE SFPSFLTNSL FGNSGILENV TLSSNLGLPV AVSTLARDRS STDNRYPDIQ ASYLVEGRFS VPSGSSPGSQ SDAEPRERLQ LSFQDDDSIS RKKSYVESQR LSNALSKQSA LQMETAGPEE EPAGATESLQ GQDLFNRASP LEQAQDSPID FHLQSWMNNK EPKIVVLDAG KHFEDKTLKS DLSHTSLLEN EKLILPTSLE DSSDDDIDDE MFYDDHLEAY FEQLAIPGMI YEDLEGPEPP EKGFKLPTNG LRQANENGSL NCKFQSENNS SLISLDSHSS ETTHKESEES QVICLPGTSN SIGTGDSRRY TDGMLPFSSG TWGTEKEIEN LKGIVPDLNS ECASKDVLVK TLRAIDVKLN SDNFHDANAN RGGFDLTDPV KQGAECPHQN KTVLHMDGCL DTETPTVSIQ ENVDVASLKP ISDSGINFTD AIWSPTCERR TCECHESIEK NKDKTDLPQS VVYQNEEGRW VTDLAYYTSF NSKQNLNVSL SDEMNEDFRS GSEAFDLIAQ DEEEFNKEHQ FIQEENIDAH NTSVALGDTS WGATINYSLL RKSRSTSDLD KDDASYLRLS LGEFFAQRSE ALGCLGGGNN VKRPSFGYFI RSPEKREPIA LIRKSDVSRG NLEKEMAHLN HDLYSGDLNE QSQAQLSEGS ITLQVEAVES TSQVDENDVT LTADKGKTED TFFMSNKPQR YKDKLPDSGD SMLRISTIAS AIAEASVNTD PSQLAAMIKA LSNKTRDKTF QEDEKQKDYS HVRHFLPNDL EKSNGSNALD MEKYLKKTEV SRYESALENF SRASMSDTWD LSLPKEQTTQ DIHPVDLSAT SVSVRAPEEN TAAIVYVENG ESENQESFRT INSSNSVTNR ENNSAVVDVK TCSIDNKLQD VGNDEKATSI STPSDSYSSV RNPRITSLCL LKDCEEIRDN RENQRQNECV SEISNSEKHV TFENHRIVSP KNSDLKNTSP EHGGRGSEDE QESFRPSTSP LSHSSPSEIS GTSSSGCALE SFGSAAQQQQ PPCEQELSPL VCSPAGVSRL TYVSEPESSY PTTATDDALE DRKSDITSEL STTIIQGSPA ALEERAMEKL REKVPFQNRG KGTLSSIIQN NSDTRKATET TSLSSKPEYV KPDFRWSKDP SSKSGNLLET SEVGWTSNPE ELDPIRLALL GKSGLSCQVG SATSHPVSCQ EPIDEDQRIS PKDKSTAGRE FSGQVSHQTT SENQCTPIPS STVHSSVADM QNMPAAVHAL LTQPSLSAAP FAQRYLGTLP STGSTTLPQC HAGNATVCGF SGGLPYPAVA GEPVQNSVAV GICLGSNIGS GWMGTSSLCN PYSNTLNQNL LSTTKPFPVP SVGTNCGIEP WDSGVTSGLG SVRVPEELKL PHACCVGIAS QTLLSVLNPT DRWLQVSIGV LSISVNGEKV DLSTYRCLVF KNKAIIRPHA TEEIKVLFIP SSPGVFRCTF SVASWPCSTD AETIVQAEAL ASTVTLTAIA ESPVIEVETE KKDVLDFGDL TYGGWKALPL KLINRTHATV PIRLIINANA VAWRCFTFSK ESVRAPVEVA PCADVVTRLA GPSVVNHMMP ASYDGQDPEF LMIWVLFHSP KKQISSSDIL DSAEEFSAKV DIEVDSPNPT PVLRSVSLRA RAGIARIHAP RDLQTMHFLA KVASSRKQHL PLKNAGNIEV YLDIKVPEQG SHFSVDPKNL LLKPGEEHEV IVSFTPKDPE ACEERILKIF VQPFGPQYEV VLKGEVISSG SKPLSPGPCL DIPSILSNKQ FLAWGGVPLG RTQLQKLALR NNSASTTQHL RLLIRGQDQD CFQLQNTFGS EQRLTSNCEI RIHPKEDIFI SVLFAPTRLS CMLARLEIKQ LGNRSQPGIK FTIPLSGYGG TSNLILEGVK KLSDSYMVTV NGLVPGKESK IVFSVRNTGS RAAFVKAVGF KDSQKKVLLD PKVLRIFPDK FVLKERTQEN VTLIYNPSDR GINNKTATEL STVYLFGGDE ISRQQYRRAL LHKPEMIKQI LPEHSVLQNI NFVEAFQDEL LVTEVYDLPQ RPNDVQLFYG SMCKIILSVI GEFRDCISSR EFLQPSSKAS LESTSDLGAS GKHGGNVSLD VLPVKGPQGS PLLSRAARPP LDQLASEEPW TVLPEHLILV APSPCDMAKT GRFQIVNNSV RLLRFELCWP AHCLTVTPQH GCVAPESKLQ ILVSPNSSLS TKQSMFPWSG LIYIHCDDGQ KKIVKVQIRE DLTQVELLTR LTSKPFGILS PVSEPSVSHL VKPMTKPPST KVEIRNKSIT FPTTEPGETS ESCLELENHG TTDVKWHLSS LAPPYVKGVD ESGDVFRATY AAFRCSPISG LLESHGIQKV SITFLPRGRG DYAQFWDVEC HPLKEPHMKH TLRFQLSGQS IEAENEPENA CLSTDSLIKI DHLVKPRRQA VSEASARIPE QLDVTARGVY APEDVYRFRP TSVGESRTLK VNLRNNSFIT HSLKFLSPRE PFYVKHSKYS LRAQHYINMP VQFKPKSAGK FEALLVIQTD EGKSIAIRLI GEALGKN* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MEDFRGIAEE SFPSFLTNSL FGNSGILENV TLSSNLGLPV AVSTLARDRS STDNRYPDIQ ASYLVEGRFS VPSGSSPGSQ SDAEPRERLQ LSFQDDDSIS RKKSYVESQR LSNALSKQSA LQMETAGPEE EPAGATESLQ GQDLFNRASP LEQAQDSPID FHLQSWMNNK EPKIVVLDAG KHFEDKTLKS DLSHTSLLEN EKLILPTSLE DSSDDDIDDE MFYDDHLEAY FEQLAIPGMI YEDLEGPEPP EKGFKLPTNG LRQANENGSL NCKFQSENNS SLISLDSHSS ETTHKESEES QVICLPGTSN SIGTGDSRRY TDGMLPFSSG TWGTEKEIEN LKGIVPDLNS ECASKDVLVK TLRAIDVKLN SDNFHDANAN RGGFDLTDPV KQGAECPHQN KTVLHMDGCL DTETPTVSIQ ENVDVASLKP ISDSGINFTD AIWSPTCERR TCECHESIEK NKDKTDLPQS VVYQNEEGRW VTDLAYYTSF NSKQNLNVSL SDEMNEDFRS GSEAFDLIAQ DEEEFNKEHQ FIQEENIDAH NTSVALGDTS WGATINYSLL RKSRSTSDLD KDDASYLRLS LGEFFAQRSE ALGCLGGGNN VKRPSFGYFI RSPEKREPIA LIRKSDVSRG NLEKEMAHLN HDLYSGDLNE QSQAQLSEGS ITLQVEAVES TSQVDENDVT LTADKGKTED TFFMSNKPQR YKDKLPDSGD SMLRISTIAS AIAEASVNTD PSQLAAMIKA LSNKTRDKTF QEDEKQKDYS HVRHFLPNDL EKSNGSNALD MEKYLKKTEV SRYESALENF SRASMSDTWD LSLPKEQTTQ DIHPVDLSAT SVSVRAPEEN TAAIVYVENG ESENQESFRT INSSNSVTNR ENNSAVVDVK TCSIDNKLQD VGNDEKATSI STPSDSYSSV RNPRITSLCL LKDCEEIRDN RENQRQNECV SEISNSEKHV TFENHRIVSP KNSDLKNTSP EHGGRGSEDE QESFRPSTSP LSHSSPSEIS GTSSSGCALE SFGSAAQQQQ PPCEQELSPL VCSPAGVSRL TYVSEPESSY PTTATDDALE DRKSDITSEL STTIIQGSPA ALEERAMEKL REKVPFQNRG KGTLSSIIQN NSDTRKATET TSLSSKPEYV KPDFRWSKDP SSKSGNLLET SEVGWTSNPE ELDPIRLALL GKSGLSCQVG SATSHPVSCQ EPIDEDQRIS PKDKSTAGRE FSGQVSHQTT SENQCTPIPS STVHSSVADM QNMPAAVHAL LTQPSLSAAP FAQRYLGTLP STGSTTLPQC HAGNATVCGF SGGLPYPAVA GEPVQNSVAV GICLGSNIGS GWMGTSSLCN PYSNTLNQNL LSTTKPFPVP SVGTNCGIEP WDSGVTSGLG SVRVPEELKL PHACCVGIAS QTLLSVLNPT DRWLQVSIGV LSISVNGEKV DLSTYRCLVF KNKAIIRPHA TEEIKVLFIP SSPGVFRCTF SVASWPCSTD AETIVQAEAL ASTVTLTAIA ESPVIEVETE KKDVLDFGDL TYGGWKALPL KLINRTHATV PIRLIINANA VAWRCFTFSK EPVRAPVEVA PCADVVTRLA GPSVVNHMMP ASYDGQDPEF LMIWVLFHSP KKQISSSDIL DSAEEFSAKV DIEVDSPNPT PVLRSVSLRA RAGIARIHAP RDLQTMHFLA KVASSRKQHL PLKNAGNIEV YLDIKVPEQG SHFSVDPKNL LLKPGEEHEV IVSFTPKDPE ACEERILKIF VQPFGPQYEV VLKGEVISSG SKPLSPGPCL DIPSILSNKQ FLAWGGVPLG RTQLQKLALR NNSASTTQHL RLLIRGQDQD CFQLQNTFGS EQRLTSNCEI RIHPKEDIFI SVLFAPTRLS CMLARLEIKQ LGNRSQPGIK FTIPLSGYGG TSNLILEGVK KLSDSYMVTV NGLVPGKESK IVFSVRNTGS RAAFVKAVGF KDSQKKVLLD PKVLRIFPDK FVLKERTQEN VTLIYNPSDR GINNKTATEL STVYLFGGDE ISRQQYRRAL LHKPEMIKQI LPEHSVLQNI NFVEAFQDEL LVTEVYDLPQ RPNDVQLFYG SMCKIILSVI GEFRDCISSR EFLQPSSKAS LESTSDLGAS GKHGGNVSLD VLPVKGPQGS PLLSRAARPP LDQLASEEPW TVLPEHLILV APSPCDMAKT GRFQIVNNSV RLLRFELCWP AHCLTVTPQH GCVAPESKLQ ILVSPNSSLS TKQSMFPWSG LIYIHCDDGQ KKIVKVQIRE DLTQVELLTR LTSKPFGILS PVSEPSVSHL VKPMTKPPST KVEIRNKSIT FPTTEPGETS ESCLELENHG TTDVKWHLSS LAPPYVKGVD ESGDVFRATY AAFRCSPISG LLESHGIQKV SITFLPRGRG DYAQFWDVEC HPLKEPHMKH TLRFQLSGQS IEAENEPENA CLSTDSLIKI DHLVKPRRQA VSEASARIPE QLDVTARGVY APEDVYRFRP TSVGESRTLK VNLRNNSFIT HSLKFLSPRE PFYVKHSKYS LRAQHYINMP VQFKPKSAGK FEALLVIQTD EGKSIAIRLI GEALGKN* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.46 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.993467357610941 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr18:13068132T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CEP192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000430049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8TEP8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.3229T>C cDNA.3270T>C g.76772T>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | S1077P Score: 74 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs578208
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation Gene Associated, Regulatory Feature, Gene associated regulatory feature H3K9me1, Histone, Histone 3 Lysine 9 mono-methylation H4K20me1, Histone, Histone 4 Lysine 20 mono-methylation H3K4me1, Histone, Histone 3 Lysine 4 Mono-Methylation DNase1, Open Chromatin, DNase1 Hypersensitive Site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
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distance from splice site | 40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features |
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length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 6189 / 6189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 2063 / 2063 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 6230 / 6230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 42 / 42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 6092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 6000 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 6189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 3229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 76772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 13068132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAATCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAACCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAATCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAACCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MDGCLDTETP TVSIQENVDV ASLKPISDSG INFTDAIWSP TCERRTCECH ESIEKNKDKT DLPQSVVYQN EEGRWVTDLA YYTSFNSKQN LNVSLSDEMN EDFRSGSEAF DLIAQDEEEF NKEHQFIQPS FGYFIRSPEK REPIALIRKS DVSRGNLEKE MAHLNHDLYS GDLNEQSQAQ LSEGSITLQV EAVESTSQVD ENDVTLTADK GKTEDTFFMS NKPQRYKDKL PDSGDSMLRI STIASAIAEA SVNTDPSQLA AMIKALSNKT RDKTFQEDEK QKDYSHVRHF LPNDLEKSNG SNALDMEKYL KKTEVSRYES ALENFSRASM SDTWDLSLPK EQTTQDIHPV DLSATSVSVR APEENTAAIV YVENGESENQ ESFRTINSSN SVTNRENNSA VVDVKTCSID NKLQDVGNDE KATSISTPSD SYSSVRNPRI TSLCLLKDCE EIRDNRENQR QNECVSEISN SEKHVTFENH RIVSPKNSDL KNTSPEHGGR GSEDEQESFR PSTSPLSHSS PSEISGTSSS GCALESFGSA AQQQQPPCEQ ELSPLVCSPA GVSRLTYVSE PESSYPTTAT DDALEDRKSD ITSELSTTII QGSPAALEER AMEKLREKVP FQNRGKGTLS SIIQNNSDTR KATETTSLSS KPEYVKPDFR WSKDPSSKSG NLLETSEVGW TSNPEELDPI RLALLGKSGL SCQVGSATSH PVSCQEPIDE DQRISPKDKS TAGREFSGQV SHQTTSENQC TPIPSSTVHS SVADMQNMPA AVHALLTQPS LSAAPFAQRY LGTLPSTGST TLPQCHAGNA TVCGFSGGLP YPAVAGEPVQ NSVAVGICLG SNIGSGWMGT SSLCNPYSNT LNQNLLSTTK PFPVPSVGTN CGIEPWDSGV TSGLGSVRVP EELKLPHACC VGIASQTLLS VLNPTDRWLQ VSIGVLSISV NGEKVDLSTY RCLVFKNKAI IRPHATEEIK VLFIPSSPGV FRCTFSVASW PCSTDAETIV QAEALASTVT LTAIAESPVI EVETEKKDVL DFGDLTYGGW KALPLKLINR THATVPIRLI INANAVAWRC FTFSKESVRA PVEVAPCADV VTRLAGPSVV NHMMPASYDG QDPEFLMIWV LFHSPKKQIS SSDILDSAEE FSAKVDIEVD SPNPTPVLRS VSLRARAGIA RIHAPRDLQT MHFLAKVASS RKQHLPLKNA GNIEVYLDIK VPEQGSHFSV DPKNLLLKPG EEHEVIVSFT PKDPEACEER ILKIFVQPFG PQYEVVLKGE VISSGSKPLS PGPCLDIPSI LSNKQFLAWG GVPLGRTQLQ KLALRNNSAS TTQHLRLLIR GQDQDCFQLQ NTFGSEQRLT SNCEIRIHPK EDIFISVLFA PTRLSCMLAR LEIKQLGNRS QPGIKFTIPL SGYGGTSNLI LEGVKKLSDS YMVTVNGLVP GKESKIVFSV RNTGSRAAFV KAVGFKDSQK KVLLDPKVLR IFPDKFVLKE RTQENVTLIY NPSDRGINNK TATELSTVYL FGGDEISRQQ YRRALLHKPE MIKQILPEHS VLQNINFVEA FQDELLVTEV YDLPQRPNDV QLFYGSMCKI ILSVIGEFRD CISSREFLQP SSKASLESTS DLGASGKHGG NVSLDVLPVK GPQGSPLLSR AARPPLDQLA SEEPWTVLPE HLILVAPSPC DMAKTGRFQI VNNSVRLLRF ELCWPAHCLT VTPQHGCVAP ESKLQILVSP NSSLSTKQSM FPWSGLIYIH CDDGQKKIVK VQIREDLTQV ELLTRLTSKP FGILSPVSEP SVSHLVKPMT KPPSTKVEIR NKSITFPTTE PGETSESCLE LENHGTTDVK WHLSSLAPPY VKGVDESGDV FRATYAAFRC SPISGLLESH GIQKVSITFL PRGRGDYAQF WDVECHPLKE PHMKHTLRFQ LSGQSIEAEN EPENACLSTD SLIKIDHLVK PRRQAVSEAS ARIPEQLDVT ARGVYAPEDV YRFRPTSVGE SRTLKVNLRN NSFITHSLKF LSPREPFYVK HSKYSLRAQH YINMPVQFKP KSAGKFEALL VIQTDEGKSI AIRLIGEALG KN* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MDGCLDTETP TVSIQENVDV ASLKPISDSG INFTDAIWSP TCERRTCECH ESIEKNKDKT DLPQSVVYQN EEGRWVTDLA YYTSFNSKQN LNVSLSDEMN EDFRSGSEAF DLIAQDEEEF NKEHQFIQPS FGYFIRSPEK REPIALIRKS DVSRGNLEKE MAHLNHDLYS GDLNEQSQAQ LSEGSITLQV EAVESTSQVD ENDVTLTADK GKTEDTFFMS NKPQRYKDKL PDSGDSMLRI STIASAIAEA SVNTDPSQLA AMIKALSNKT RDKTFQEDEK QKDYSHVRHF LPNDLEKSNG SNALDMEKYL KKTEVSRYES ALENFSRASM SDTWDLSLPK EQTTQDIHPV DLSATSVSVR APEENTAAIV YVENGESENQ ESFRTINSSN SVTNRENNSA VVDVKTCSID NKLQDVGNDE KATSISTPSD SYSSVRNPRI TSLCLLKDCE EIRDNRENQR QNECVSEISN SEKHVTFENH RIVSPKNSDL KNTSPEHGGR GSEDEQESFR PSTSPLSHSS PSEISGTSSS GCALESFGSA AQQQQPPCEQ ELSPLVCSPA GVSRLTYVSE PESSYPTTAT DDALEDRKSD ITSELSTTII QGSPAALEER AMEKLREKVP FQNRGKGTLS SIIQNNSDTR KATETTSLSS KPEYVKPDFR WSKDPSSKSG NLLETSEVGW TSNPEELDPI RLALLGKSGL SCQVGSATSH PVSCQEPIDE DQRISPKDKS TAGREFSGQV SHQTTSENQC TPIPSSTVHS SVADMQNMPA AVHALLTQPS LSAAPFAQRY LGTLPSTGST TLPQCHAGNA TVCGFSGGLP YPAVAGEPVQ NSVAVGICLG SNIGSGWMGT SSLCNPYSNT LNQNLLSTTK PFPVPSVGTN CGIEPWDSGV TSGLGSVRVP EELKLPHACC VGIASQTLLS VLNPTDRWLQ VSIGVLSISV NGEKVDLSTY RCLVFKNKAI IRPHATEEIK VLFIPSSPGV FRCTFSVASW PCSTDAETIV QAEALASTVT LTAIAESPVI EVETEKKDVL DFGDLTYGGW KALPLKLINR THATVPIRLI INANAVAWRC FTFSKEPVRA PVEVAPCADV VTRLAGPSVV NHMMPASYDG QDPEFLMIWV LFHSPKKQIS SSDILDSAEE FSAKVDIEVD SPNPTPVLRS VSLRARAGIA RIHAPRDLQT MHFLAKVASS RKQHLPLKNA GNIEVYLDIK VPEQGSHFSV DPKNLLLKPG EEHEVIVSFT PKDPEACEER ILKIFVQPFG PQYEVVLKGE VISSGSKPLS PGPCLDIPSI LSNKQFLAWG GVPLGRTQLQ KLALRNNSAS TTQHLRLLIR GQDQDCFQLQ NTFGSEQRLT SNCEIRIHPK EDIFISVLFA PTRLSCMLAR LEIKQLGNRS QPGIKFTIPL SGYGGTSNLI LEGVKKLSDS YMVTVNGLVP GKESKIVFSV RNTGSRAAFV KAVGFKDSQK KVLLDPKVLR IFPDKFVLKE RTQENVTLIY NPSDRGINNK TATELSTVYL FGGDEISRQQ YRRALLHKPE MIKQILPEHS VLQNINFVEA FQDELLVTEV YDLPQRPNDV QLFYGSMCKI ILSVIGEFRD CISSREFLQP SSKASLESTS DLGASGKHGG NVSLDVLPVK GPQGSPLLSR AARPPLDQLA SEEPWTVLPE HLILVAPSPC DMAKTGRFQI VNNSVRLLRF ELCWPAHCLT VTPQHGCVAP ESKLQILVSP NSSLSTKQSM FPWSGLIYIH CDDGQKKIVK VQIREDLTQV ELLTRLTSKP FGILSPVSEP SVSHLVKPMT KPPSTKVEIR NKSITFPTTE PGETSESCLE LENHGTTDVK WHLSSLAPPY VKGVDESGDV FRATYAAFRC SPISGLLESH GIQKVSITFL PRGRGDYAQF WDVECHPLKE PHMKHTLRFQ LSGQSIEAEN EPENACLSTD SLIKIDHLVK PRRQAVSEAS ARIPEQLDVT ARGVYAPEDV YRFRPTSVGE SRTLKVNLRN NSFITHSLKF LSPREPFYVK HSKYSLRAQH YINMPVQFKP KSAGKFEALL VIQTDEGKSI AIRLIGEALG KN* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.46 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.993467357610941 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr18:13068132T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CEP192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000325971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q8TEP8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.2866T>C cDNA.4459T>C g.76772T>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | S956P Score: 74 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 956 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs578208
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation Gene Associated, Regulatory Feature, Gene associated regulatory feature H3K9me1, Histone, Histone 3 Lysine 9 mono-methylation H4K20me1, Histone, Histone 4 Lysine 20 mono-methylation H3K4me1, Histone, Histone 3 Lysine 4 Mono-Methylation DNase1, Open Chromatin, DNase1 Hypersensitive Site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 5826 / 5826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1942 / 1942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 7419 / 7419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 1594 / 1594 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 7281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 5637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 5826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 2866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 4459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 76772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 13068132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAATCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAACCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAATCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | GTTTCACGTTTTCCAAGGAACCCGTCCGAGCTCCTGTGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MKTSDLVPSF GYFIRSPEKR EPIALIRKSD VSRGNLEKEM AHLNHDLYSG DLNEQSQAQL SEGSITLQVE AVESTSQVDE NDVTLTADKG KTEDTFFMSN KPQRYKDKLP DSGDSMLRIS TIASAIAEAS VNTDPSQLAA MIKALSNKTR DKTFQEDEKQ KDYSHVRHFL PNDLEKSNGS NALDMEKYLK KTEVSRYESA LENFSRASMS DTWDLSLPKE QTTQDIHPVD LSATSVSVRA PEENTAAIVY VENGESENQE SFRTINSSNS VTNRENNSAV VDVKTCSIDN KLQDVGNDEK ATSISTPSDS YSSVRNPRIT SLCLLKDCEE IRDNRENQRQ NECVSEISNS EKHVTFENHR IVSPKNSDLK NTSPEHGGRG SEDEQESFRP STSPLSHSSP SEISGTSSSG CALESFGSAA QQQQPPCEQE LSPLVCSPAG VSRLTYVSEP ESSYPTTATD DALEDRKSDI TSELSTTIIQ GSPAALEERA MEKLREKVPF QNRGKGTLSS IIQNNSDTRK ATETTSLSSK PEYVKPDFRW SKDPSSKSGN LLETSEVGWT SNPEELDPIR LALLGKSGLS CQVGSATSHP VSCQEPIDED QRISPKDKST AGREFSGQVS HQTTSENQCT PIPSSTVHSS VADMQNMPAA VHALLTQPSL SAAPFAQRYL GTLPSTGSTT LPQCHAGNAT VCGFSGGLPY PAVAGEPVQN SVAVGICLGS NIGSGWMGTS SLCNPYSNTL NQNLLSTTKP FPVPSVGTNC GIEPWDSGVT SGLGSVRVPE ELKLPHACCV GIASQTLLSV LNPTDRWLQV SIGVLSISVN GEKVDLSTYR CLVFKNKAII RPHATEEIKV LFIPSSPGVF RCTFSVASWP CSTDAETIVQ AEALASTVTL TAIAESPVIE VETEKKDVLD FGDLTYGGWK ALPLKLINRT HATVPIRLII NANAVAWRCF TFSKESVRAP VEVAPCADVV TRLAGPSVVN HMMPASYDGQ DPEFLMIWVL FHSPKKQISS SDILDSAEEF SAKVDIEVDS PNPTPVLRSV SLRARAGIAR IHAPRDLQTM HFLAKVASSR KQHLPLKNAG NIEVYLDIKV PEQGSHFSVD PKNLLLKPGE EHEVIVSFTP KDPEACEERI LKIFVQPFGP QYEVVLKGEV ISSGSKPLSP GPCLDIPSIL SNKQFLAWGG VPLGRTQLQK LALRNNSAST TQHLRLLIRG QDQDCFQLQN TFGSEQRLTS NCEIRIHPKE DIFISVLFAP TRLSCMLARL EIKQLGNRSQ PGIKFTIPLS GYGGTSNLIL EGVKKLSDSY MVTVNGLVPG KESKIVFSVR NTGSRAAFVK AVGFKDSQKK VLLDPKVLRI FPDKFVLKER TQENVTLIYN PSDRGINNKT ATELSTVYLF GGDEISRQQY RRALLHKPEM IKQILPEHSV LQNINFVEAF QDELLVTEVY DLPQRPNDVQ LFYGSMCKII LSVIGEFRDC ISSREFLQPS SKASLESTSD LGASGKHGGN VSLDVLPVKG PQGSPLLSRA ARPPLDQLAS EEPWTVLPEH LILVAPSPCD MAKTGRFQIV NNSVRLLRFE LCWPAHCLTV TPQHGCVAPE SKLQILVSPN SSLSTKQSMF PWSGLIYIHC DDGQKKIVKV QIREDLTQVE LLTRLTSKPF GILSPVSEPS VSHLVKPMTK PPSTKVEIRN KSITFPTTEP GETSESCLEL ENHGTTDVKW HLSSLAPPYV KGVDESGDVF RATYAAFRCS PISGLLESHG IQKVSITFLP RGRGDYAQFW DVECHPLKEP HMKHTLRFQL SGQSIEAENE PENACLSTDS LIKIDHLVKP RRQAVSEASA RIPEQLDVTA RGVYAPEDVY RFRPTSVGES RTLKVNLRNN SFITHSLKFL SPREPFYVKH SKYSLRAQHY INMPVQFKPK SAGKFEALLV IQTDEGKSIA IRLIGEALGK N* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MKTSDLVPSF GYFIRSPEKR EPIALIRKSD VSRGNLEKEM AHLNHDLYSG DLNEQSQAQL SEGSITLQVE AVESTSQVDE NDVTLTADKG KTEDTFFMSN KPQRYKDKLP DSGDSMLRIS TIASAIAEAS VNTDPSQLAA MIKALSNKTR DKTFQEDEKQ KDYSHVRHFL PNDLEKSNGS NALDMEKYLK KTEVSRYESA LENFSRASMS DTWDLSLPKE QTTQDIHPVD LSATSVSVRA PEENTAAIVY VENGESENQE SFRTINSSNS VTNRENNSAV VDVKTCSIDN KLQDVGNDEK ATSISTPSDS YSSVRNPRIT SLCLLKDCEE IRDNRENQRQ NECVSEISNS EKHVTFENHR IVSPKNSDLK NTSPEHGGRG SEDEQESFRP STSPLSHSSP SEISGTSSSG CALESFGSAA QQQQPPCEQE LSPLVCSPAG VSRLTYVSEP ESSYPTTATD DALEDRKSDI TSELSTTIIQ GSPAALEERA MEKLREKVPF QNRGKGTLSS IIQNNSDTRK ATETTSLSSK PEYVKPDFRW SKDPSSKSGN LLETSEVGWT SNPEELDPIR LALLGKSGLS CQVGSATSHP VSCQEPIDED QRISPKDKST AGREFSGQVS HQTTSENQCT PIPSSTVHSS VADMQNMPAA VHALLTQPSL SAAPFAQRYL GTLPSTGSTT LPQCHAGNAT VCGFSGGLPY PAVAGEPVQN SVAVGICLGS NIGSGWMGTS SLCNPYSNTL NQNLLSTTKP FPVPSVGTNC GIEPWDSGVT SGLGSVRVPE ELKLPHACCV GIASQTLLSV LNPTDRWLQV SIGVLSISVN GEKVDLSTYR CLVFKNKAII RPHATEEIKV LFIPSSPGVF RCTFSVASWP CSTDAETIVQ AEALASTVTL TAIAESPVIE VETEKKDVLD FGDLTYGGWK ALPLKLINRT HATVPIRLII NANAVAWRCF TFSKEPVRAP VEVAPCADVV TRLAGPSVVN HMMPASYDGQ DPEFLMIWVL FHSPKKQISS SDILDSAEEF SAKVDIEVDS PNPTPVLRSV SLRARAGIAR IHAPRDLQTM HFLAKVASSR KQHLPLKNAG NIEVYLDIKV PEQGSHFSVD PKNLLLKPGE EHEVIVSFTP KDPEACEERI LKIFVQPFGP QYEVVLKGEV ISSGSKPLSP GPCLDIPSIL SNKQFLAWGG VPLGRTQLQK LALRNNSAST TQHLRLLIRG QDQDCFQLQN TFGSEQRLTS NCEIRIHPKE DIFISVLFAP TRLSCMLARL EIKQLGNRSQ PGIKFTIPLS GYGGTSNLIL EGVKKLSDSY MVTVNGLVPG KESKIVFSVR NTGSRAAFVK AVGFKDSQKK VLLDPKVLRI FPDKFVLKER TQENVTLIYN PSDRGINNKT ATELSTVYLF GGDEISRQQY RRALLHKPEM IKQILPEHSV LQNINFVEAF QDELLVTEVY DLPQRPNDVQ LFYGSMCKII LSVIGEFRDC ISSREFLQPS SKASLESTSD LGASGKHGGN VSLDVLPVKG PQGSPLLSRA ARPPLDQLAS EEPWTVLPEH LILVAPSPCD MAKTGRFQIV NNSVRLLRFE LCWPAHCLTV TPQHGCVAPE SKLQILVSPN SSLSTKQSMF PWSGLIYIHC DDGQKKIVKV QIREDLTQVE LLTRLTSKPF GILSPVSEPS VSHLVKPMTK PPSTKVEIRN KSITFPTTEP GETSESCLEL ENHGTTDVKW HLSSLAPPYV KGVDESGDVF RATYAAFRCS PISGLLESHG IQKVSITFLP RGRGDYAQFW DVECHPLKEP HMKHTLRFQL SGQSIEAENE PENACLSTDS LIKIDHLVKP RRQAVSEASA RIPEQLDVTA RGVYAPEDVY RFRPTSVGES RTLKVNLRNN SFITHSLKFL SPREPFYVKH SKYSLRAQHY INMPVQFKPK SAGKFEALLV IQTDEGKSIA IRLIGEALGK N* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.49 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||