MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
ZNF211 | polymorphism_automatic | 9.99200722162641e-15 | simple_aae | I88T | single base exchange | rs4801508 | show file | ||||
ZNF211 | polymorphism_automatic | 6.3948846218409e-14 | simple_aae | I14T | single base exchange | rs4801508 | show file | ||||
ZNF211 | polymorphism_automatic | 6.3948846218409e-14 | simple_aae | I14T | single base exchange | rs4801508 | show file | ||||
ZNF211 | polymorphism_automatic | 7.32773459688474e-08 | without_aae | single base exchange | rs4801508 | show file | |||||
ZNF211 | polymorphism_automatic | 7.32773459688474e-08 | without_aae | single base exchange | rs4801508 | show file | |||||
ZNF211 | polymorphism_automatic | 7.32773459688474e-08 | without_aae | single base exchange | rs4801508 | show file | |||||
ZNF211 | polymorphism_automatic | 7.32773459688474e-08 | without_aae | single base exchange | rs4801508 | show file | |||||
ZNF211 | polymorphism_automatic | 7.32773459688474e-08 | without_aae | single base exchange | rs4801508 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.99999999999999 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000299871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001265597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q13398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.263T>C cDNA.394T>C g.9526T>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | I88T Score: 89 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 1890 / 1890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 630 / 630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 2021 / 2021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 132 / 132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 1890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | TACGTCCTCCCTGGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | TACGTCCTCCCTGGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLGFPPGRPQ LPVQLRPQTR MATALRDPAS VPIATEVLFK LTQGSVTFED VAVYFSWEEW DLLDEAQKHL YFDVMLENFA LTSSLGLISS WSHVVAQLGL GEVPSVLHRM FMTPASARWD QRGPGLHEWH LGKGMSSGCW CGVEHEETPS EQRISGERVP QFRTSKEGSS SQNADSCEIC CLVLRDILHL AEHQGTNCGQ KLHTCGKQFY ISANLQQHQR QHITEAPFRS YVDTASFTQS CIVHVSEKPF TCREIRKDFL ANMRFLHQDA TQTGEKPNNS NKCAVAFYSG KSHHNWGKCS KAFSHIDTLV QDQRILTREG LFECSKCGKA CTRRCNLIQH QKVHSEERPY ECNECGKFFT YYSSFIIHQR VHTGERPYAC PECGKSFSQI YSLNSHRKVH TGERPYECGE CGKSFSQRSN LMQHRRVHTG ERPYECSECG KSFSQNFSLI YHQRVHTGER PHECNECGKS FSRSSSLIHH RRLHTGERPY ECSKCGKSFK QSSSFSSHRK VHTGERPYVC GECGKSFSHS SNLKNHQRVH TGERPVECSE CSKSFSCKSN LIKHLRVHTG ERPYECSECG KSFSQSSSLI QHRRVHTGKR PYQCSQCGKS FGCKSVLIQH QRVHIGEKP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MLGFPPGRPQ LPVQLRPQTR MATALRDPAS VPIATEVLFK LTQGSVTFED VAVYFSWEEW DLLDEAQKHL YFDVMLENFA LTSSLGLTSS WSHVVAQLGL GEVPSVLHRM FMTPASARWD QRGPGLHEWH LGKGMSSGCW CGVEHEETPS EQRISGERVP QFRTSKEGSS SQNADSCEIC CLVLRDILHL AEHQGTNCGQ KLHTCGKQFY ISANLQQHQR QHITEAPFRS YVDTASFTQS CIVHVSEKPF TCREIRKDFL ANMRFLHQDA TQTGEKPNNS NKCAVAFYSG KSHHNWGKCS KAFSHIDTLV QDQRILTREG LFECSKCGKA CTRRCNLIQH QKVHSEERPY ECNECGKFFT YYSSFIIHQR VHTGERPYAC PECGKSFSQI YSLNSHRKVH TGERPYECGE CGKSFSQRSN LMQHRRVHTG ERPYECSECG KSFSQNFSLI YHQRVHTGER PHECNECGKS FSRSSSLIHH RRLHTGERPY ECSKCGKSFK QSSSFSSHRK VHTGERPYVC GECGKSFSHS SNLKNHQRVH TGERPVECSE CSKSFSCKSN LIKHLRVHTG ERPYECSECG KSFSQSSSLI QHRRVHTGKR PYQCSQCGKS FGCKSVLIQH QRVHIGEKP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.93 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999999936 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000254182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q13398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.41T>C cDNA.234T>C g.9526T>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | I14T Score: 89 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 1668 / 1668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 556 / 556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 1861 / 1861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 194 / 194 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 1668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | TACGTCCTCCCTGGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | TACGTCCTCCCTGGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLENFALTSS LGLISSWSHV VAQLGLGEVP SVLHRMFMTP ASARWDQRGP GLHEWHLGKG MSSGCWCGVE HEETPSEQRI SGERVPQFRT SKEGSSSQNA DSCEICCLVL RDILHLAEHQ GTNCGQKLHT CGKQFYISAN LQQHQRQHIT EAPFRSYVDT ASFTQSCIVH VSEKPFTCRE IRKDFLANMR FLHQDATQTG EKPNNSNKCA VAFYSGKSHH NWGKCSKAFS HIDTLVQDQR ILTREGLFEC SKCGKACTRR CNLIQHQKVH SEERPYECNE CGKFFTYYSS FIIHQRVHTG ERPYACPECG KSFSQIYSLN SHRKVHTGER PYECGECGKS FSQRSNLMQH RRVHTGERPY ECSECGKSFS QNFSLIYHQR VHTGERPHEC NECGKSFSRS SSLIHHRRLH TGERPYECSK CGKSFKQSSS FSSHRKVHTG ERPYVCGECG KSFSHSSNLK NHQRVHTGER PVECSECSKS FSCKSNLIKH LRVHTGERPY ECSECGKSFS QSSSLIQHRR VHTGKRPYQC SQCGKSFGCK SVLIQHQRVH IGEKP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MLENFALTSS LGLTSSWSHV VAQLGLGEVP SVLHRMFMTP ASARWDQRGP GLHEWHLGKG MSSGCWCGVE HEETPSEQRI SGERVPQFRT SKEGSSSQNA DSCEICCLVL RDILHLAEHQ GTNCGQKLHT CGKQFYISAN LQQHQRQHIT EAPFRSYVDT ASFTQSCIVH VSEKPFTCRE IRKDFLANMR FLHQDATQTG EKPNNSNKCA VAFYSGKSHH NWGKCSKAFS HIDTLVQDQR ILTREGLFEC SKCGKACTRR CNLIQHQKVH SEERPYECNE CGKFFTYYSS FIIHQRVHTG ERPYACPECG KSFSQIYSLN SHRKVHTGER PYECGECGKS FSQRSNLMQH RRVHTGERPY ECSECGKSFS QNFSLIYHQR VHTGERPHEC NECGKSFSRS SSLIHHRRLH TGERPYECSK CGKSFKQSSS FSSHRKVHTG ERPYVCGECG KSFSHSSNLK NHQRVHTGER PVECSECSKS FSCKSNLIKH LRVHTGERPY ECSECGKSFS QSSSLIQHRR VHTGKRPYQC SQCGKSFGCK SVLIQHQRVH IGEKP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 1.16 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999999936 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000541801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001265598 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q13398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.41T>C cDNA.182T>C g.9526T>C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | I14T Score: 89 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 1668 / 1668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 556 / 556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 1809 / 1809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 142 / 142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 140 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 1668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | TACGTCCTCCCTGGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | TACGTCCTCCCTGGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLENFALTSS LGLISSWSHV VAQLGLGEVP SVLHRMFMTP ASARWDQRGP GLHEWHLGKG MSSGCWCGVE HEETPSEQRI SGERVPQFRT SKEGSSSQNA DSCEICCLVL RDILHLAEHQ GTNCGQKLHT CGKQFYISAN LQQHQRQHIT EAPFRSYVDT ASFTQSCIVH VSEKPFTCRE IRKDFLANMR FLHQDATQTG EKPNNSNKCA VAFYSGKSHH NWGKCSKAFS HIDTLVQDQR ILTREGLFEC SKCGKACTRR CNLIQHQKVH SEERPYECNE CGKFFTYYSS FIIHQRVHTG ERPYACPECG KSFSQIYSLN SHRKVHTGER PYECGECGKS FSQRSNLMQH RRVHTGERPY ECSECGKSFS QNFSLIYHQR VHTGERPHEC NECGKSFSRS SSLIHHRRLH TGERPYECSK CGKSFKQSSS FSSHRKVHTG ERPYVCGECG KSFSHSSNLK NHQRVHTGER PVECSECSKS FSCKSNLIKH LRVHTGERPY ECSECGKSFS QSSSLIQHRR VHTGKRPYQC SQCGKSFGCK SVLIQHQRVH IGEKP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MLENFALTSS LGLTSSWSHV VAQLGLGEVP SVLHRMFMTP ASARWDQRGP GLHEWHLGKG MSSGCWCGVE HEETPSEQRI SGERVPQFRT SKEGSSSQNA DSCEICCLVL RDILHLAEHQ GTNCGQKLHT CGKQFYISAN LQQHQRQHIT EAPFRSYVDT ASFTQSCIVH VSEKPFTCRE IRKDFLANMR FLHQDATQTG EKPNNSNKCA VAFYSGKSHH NWGKCSKAFS HIDTLVQDQR ILTREGLFEC SKCGKACTRR CNLIQHQKVH SEERPYECNE CGKFFTYYSS FIIHQRVHTG ERPYACPECG KSFSQIYSLN SHRKVHTGER PYECGECGKS FSQRSNLMQH RRVHTGERPY ECSECGKSFS QNFSLIYHQR VHTGERPHEC NECGKSFSRS SSLIHHRRLH TGERPYECSK CGKSFKQSSS FSSHRKVHTG ERPYVCGECG KSFSHSSNLK NHQRVHTGER PVECSECSKS FSCKSNLIKH LRVHTGERPY ECSECGKSFS QSSSLIQHRR VHTGKRPYQC SQCGKSFGCK SVLIQHQRVH IGEKP* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.98 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: without_aae, prob: 0.999999926722654 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000347302 | ||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_198855 | ||||||||||||||||
UniProt peptide | N/A | ||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||
alteration region | intron | ||||||||||||||||
DNA changes | g.9526T>C | ||||||||||||||||
AA changes | N/A | ||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | N/A | ||||||||||||||||
frameshift | N/A | ||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||
distance from splice site | 786 | ||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes | N/A | ||||||||||||||||
protein features | N/A | ||||||||||||||||
length of protein | N/A | ||||||||||||||||
AA sequence altered | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | N/A | ||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | N/A | ||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 180 / 180 | ||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 397 | ||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 167 | ||||||||||||||||
length of CDS | 1695 | ||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | N/A | ||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | N/A | ||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLGFPPGRPQ LPVQLRPQTR MATALRDPAS GSVTFEDVAV YFSWEEWDLL DEAQKHLYFD VMLENFALTS SLGCWCGVEH EETPSEQRIS GERVPQFRTS KEGSSSQNAD SCEICCLVLR DILHLAEHQG TNCGQKLHTC GKQFYISANL QQHQRQHITE APFRSYVDTA SFTQSCIVHV SEKPFTCREI RKDFLANMRF LHQDATQTGE KPNNSNKCAV AFYSGKSHHN WGKCSKAFSH IDTLVQDQRI LTREGLFECS KCGKACTRRC NLIQHQKVHS EERPYECNEC GKFFTYYSSF IIHQRVHTGE RPYACPECGK SFSQIYSLNS HRKVHTGERP YECGECGKSF SQRSNLMQHR RVHTGERPYE CSECGKSFSQ NFSLIYHQRV HTGERPHECN ECGKSFSRSS SLIHHRRLHT GERPYECSKC GKSFKQSSSF SSHRKVHTGE RPYVCGECGK SFSHSSNLKN HQRVHTGERP VECSECSKSF SCKSNLIKHL RVHTGERPYE CSECGKSFSQ SSSLIQHRRV HTGKRPYQCS QCGKSFGCKS VLIQHQRVHI GEKP* | ||||||||||||||||
mutated AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
speed | 0.85 s | ||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: without_aae, prob: 0.999999926722654 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000391703 | ||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001265600 | ||||||||||||||||
UniProt peptide | N/A | ||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||
alteration region | intron | ||||||||||||||||
DNA changes | g.9526T>C | ||||||||||||||||
AA changes | N/A | ||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | N/A | ||||||||||||||||
frameshift | N/A | ||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||
distance from splice site | 786 | ||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes | N/A | ||||||||||||||||
protein features | N/A | ||||||||||||||||
length of protein | N/A | ||||||||||||||||
AA sequence altered | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | N/A | ||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | N/A | ||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 142 / 142 | ||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 176 | ||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | cannot be calculated, too little distance between start ATG and last intron/exon boundary | ||||||||||||||||
length of CDS | 1512 | ||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | N/A | ||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | N/A | ||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLENFALTSS LGCWCGVEHE ETPSEQRISG ERVPQFRTSK EGSSSQNADS CEICCLVLRD ILHLAEHQGT NCGQKLHTCG KQFYISANLQ QHQRQHITEA PFRSYVDTAS FTQSCIVHVS EKPFTCREIR KDFLANMRFL HQDATQTGEK PNNSNKCAVA FYSGKSHHNW GKCSKAFSHI DTLVQDQRIL TREGLFECSK CGKACTRRCN LIQHQKVHSE ERPYECNECG KFFTYYSSFI IHQRVHTGER PYACPECGKS FSQIYSLNSH RKVHTGERPY ECGECGKSFS QRSNLMQHRR VHTGERPYEC SECGKSFSQN FSLIYHQRVH TGERPHECNE CGKSFSRSSS LIHHRRLHTG ERPYECSKCG KSFKQSSSFS SHRKVHTGER PYVCGECGKS FSHSSNLKNH QRVHTGERPV ECSECSKSFS CKSNLIKHLR VHTGERPYEC SECGKSFSQS SSLIQHRRVH TGKRPYQCSQ CGKSFGCKSV LIQHQRVHIG EKP* | ||||||||||||||||
mutated AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
speed | 0.79 s | ||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: without_aae, prob: 0.999999926722654 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000420680 | ||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||
UniProt peptide | N/A | ||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||
alteration region | intron | ||||||||||||||||
DNA changes | g.9526T>C | ||||||||||||||||
AA changes | N/A | ||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | N/A | ||||||||||||||||
frameshift | N/A | ||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||
distance from splice site | 786 | ||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes | N/A | ||||||||||||||||
protein features | N/A | ||||||||||||||||
length of protein | N/A | ||||||||||||||||
AA sequence altered | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | N/A | ||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | N/A | ||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 1 / 1 | ||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 230 | ||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 179 | ||||||||||||||||
length of CDS | 1707 | ||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | N/A | ||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | N/A | ||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MISAYCNLHL LGSSDSPASA SQVAGTTGMR HHAQGSVTFE DVAVYFSWEE WDLLDEAQKH LYFDVMLENF ALTSSLGCWC GVEHEETPSE QRISGERVPQ FRTSKEGSSS QNADSCEICC LVLRDILHLA EHQGTNCGQK LHTCGKQFYI SANLQQHQRQ HITEAPFRSY VDTASFTQSC IVHVSEKPFT CREIRKDFLA NMRFLHQDAT QTGEKPNNSN KCAVAFYSGK SHHNWGKCSK AFSHIDTLVQ DQRILTREGL FECSKCGKAC TRRCNLIQHQ KVHSEERPYE CNECGKFFTY YSSFIIHQRV HTGERPYACP ECGKSFSQIY SLNSHRKVHT GERPYECGEC GKSFSQRSNL MQHRRVHTGE RPYECSECGK SFSQNFSLIY HQRVHTGERP HECNECGKSF SRSSSLIHHR RLHTGERPYE CSKCGKSFKQ SSSFSSHRKV HTGERPYVCG ECGKSFSHSS NLKNHQRVHT GERPVECSEC SKSFSCKSNL IKHLRVHTGE RPYECSECGK SFSQSSSLIQ HRRVHTGKRP YQCSQCGKSF GCKSVLIQHQ RVHIGEKP* | ||||||||||||||||
mutated AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
speed | 0.80 s | ||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: without_aae, prob: 0.999999926722654 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000240731 | ||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_006385 | ||||||||||||||||
UniProt peptide | N/A | ||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||
alteration region | intron | ||||||||||||||||
DNA changes | g.9526T>C | ||||||||||||||||
AA changes | N/A | ||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | N/A | ||||||||||||||||
frameshift | N/A | ||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||
distance from splice site | 786 | ||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes | N/A | ||||||||||||||||
protein features | N/A | ||||||||||||||||
length of protein | N/A | ||||||||||||||||
AA sequence altered | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | N/A | ||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | N/A | ||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 120 / 120 | ||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 376 | ||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 206 | ||||||||||||||||
length of CDS | 1734 | ||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | N/A | ||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | N/A | ||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLGFPPGRPQ LPVQLRPQTR MATALRDPAS VPIATEVLFK LTQGSVTFED VAVYFSWEEW DLLDEAQKHL YFDVMLENFA LTSSLGCWCG VEHEETPSEQ RISGERVPQF RTSKEGSSSQ NADSCEICCL VLRDILHLAE HQGTNCGQKL HTCGKQFYIS ANLQQHQRQH ITEAPFRSYV DTASFTQSCI VHVSEKPFTC REIRKDFLAN MRFLHQDATQ TGEKPNNSNK CAVAFYSGKS HHNWGKCSKA FSHIDTLVQD QRILTREGLF ECSKCGKACT RRCNLIQHQK VHSEERPYEC NECGKFFTYY SSFIIHQRVH TGERPYACPE CGKSFSQIYS LNSHRKVHTG ERPYECGECG KSFSQRSNLM QHRRVHTGER PYECSECGKS FSQNFSLIYH QRVHTGERPH ECNECGKSFS RSSSLIHHRR LHTGERPYEC SKCGKSFKQS SSFSSHRKVH TGERPYVCGE CGKSFSHSSN LKNHQRVHTG ERPVECSECS KSFSCKSNLI KHLRVHTGER PYECSECGKS FSQSSSLIQH RRVHTGKRPY QCSQCGKSFG CKSVLIQHQR VHIGEKP* | ||||||||||||||||
mutated AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
speed | 0.81 s | ||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: without_aae, prob: 0.999999926722654 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr19:58151286T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||
HGNC symbol | ZNF211 | ||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000544273 | ||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||
UniProt peptide | N/A | ||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||
alteration region | intron | ||||||||||||||||
DNA changes | g.9526T>C | ||||||||||||||||
AA changes | N/A | ||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | N/A | ||||||||||||||||
frameshift | N/A | ||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs4801508
| ||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K79me3, Histone, Histone 3 Lysine 79 Tri-Methylation H3K9me3, Histone, Histone 3 Lysine 9 Tri-Methylation H4K20me3, Histone, Histone 4 Lysine 20 Tri-Methylation | ||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||
distance from splice site | 786 | ||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes | N/A | ||||||||||||||||
protein features | N/A | ||||||||||||||||
length of protein | N/A | ||||||||||||||||
AA sequence altered | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | N/A | ||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | N/A | ||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 328 / 328 | ||||||||||||||||
chromosome | 19 | ||||||||||||||||
strand | 1 | ||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 581 | ||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 203 | ||||||||||||||||
length of CDS | 1731 | ||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | N/A | ||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | N/A | ||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 9526 | ||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 58151286 | ||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTATATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TGTCTTTCCCTTAGGACTTACATCATCCTGGTCTCATGTAG | ||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | N/A | ||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MRTLRQREVE YFSKATQLVR GSTKDRGAQV PIATEVLFKL TQGSVTFEDV AVYFSWEEWD LLDEAQKHLY FDVMLENFAL TSSLGCWCGV EHEETPSEQR ISGERVPQFR TSKEGSSSQN ADSCEICCLV LRDILHLAEH QGTNCGQKLH TCGKQFYISA NLQQHQRQHI TEAPFRSYVD TASFTQSCIV HVSEKPFTCR EIRKDFLANM RFLHQDATQT GEKPNNSNKC AVAFYSGKSH HNWGKCSKAF SHIDTLVQDQ RILTREGLFE CSKCGKACTR RCNLIQHQKV HSEERPYECN ECGKFFTYYS SFIIHQRVHT GERPYACPEC GKSFSQIYSL NSHRKVHTGE RPYECGECGK SFSQRSNLMQ HRRVHTGERP YECSECGKSF SQNFSLIYHQ RVHTGERPHE CNECGKSFSR SSSLIHHRRL HTGERPYECS KCGKSFKQSS SFSSHRKVHT GERPYVCGEC GKSFSHSSNL KNHQRVHTGE RPVECSECSK SFSCKSNLIK HLRVHTGERP YECSECGKSF SQSSSLIQHR RVHTGKRPYQ CSQCGKSFGC KSVLIQHQRV HIGEKP* | ||||||||||||||||
mutated AA sequence | N/A | ||||||||||||||||
speed | 0.78 s | ||||||||||||||||