MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
SVEP1 | polymorphism_automatic | 9.99200722162641e-16 | simple_aae | K876R | single base exchange | rs10817025 | show file | ||||
SVEP1 | polymorphism_automatic | 9.99200722162641e-16 | simple_aae | K899R | single base exchange | rs10817025 | show file | ||||
SVEP1 | polymorphism_automatic | 9.99200722162641e-16 | simple_aae | K899R | single base exchange | rs10817025 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999999999 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr9:113234507T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | SVEP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000374469 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q4LDE5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.2627A>G cDNA.2891A>G g.107654A>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | K876R Score: 26 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs10817025
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites | no abrogation of potential splice sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 10647 / 10647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 3549 / 3549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 10911 / 10911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 265 / 265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 10890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 10575 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 10647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 2627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 2891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 107654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 113234507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAAGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAGGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAAGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAGGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MSPSRNFSFR LFPETAPGAP GSIPAPPAPG DEAAGSRVER LGQAFRRRVR LLRELSERLE LVFLVDDSSS VGEVNFRSEL MFVRKLLSDF PVVPTATRVA IVTFSSKNYV VPRVDYISTR RARQHKCALL LQEIPAISYR GGGTYTKGAF QQAAQILLHA RENSTKVVFL ITDGYSNGGD PRPIAASLRD SGVEIFTFGI WQGNIRELND MASTPKEEHC YLLHSFEEFE ALARRALHED LPSGSFIQDD MVHCSYLCDE GKDCCDRMGS CKCGTHTGHF ECICEKGYYG KGLQYECTAC PSGTYKPEGS PGGISSCIPC PDENHTSPPG STSPEDCVCR EGYRASGQTC ELVHCPALKP PENGYFIQNT CNNHFNAACG VRCHPGFDLV GSSIILCLPN GLWSGSESYC RVRTCPHLRQ PKHGHISCST REMLYKTTCL VACDEGYRLE GSDKLTCQGN SQWDGPEPRC VERHCSTFQM PKDVIISPHN CGKQPAKFGT ICYVSCRQGF ILSGVKEMLR CTTSGKWNVG VQAAVCKDVE APQINCPKDI EAKTLEQQDS ANVTWQIPTA KDNSGEKVSV HVHPAFTPPY LFPIGDVAIV YTATDLSGNQ ASCIFHIKVI DAEPPVIDWC RSPPPVQVSE KVHAASWDEP QFSDNSGAEL VITRSHTQGD LFPQGETIVQ YTATDPSGNN RTCDIHIVIK GSPCEIPFTP VNGDFICTPD NTGVNCTLTC LEGYDFTEGS TDKYYCAYED GVWKPTYTTE WPDCAKKRFA NHGFKSFEMF YKAARCDDTD LMKKFSEAFE TTLGKMVPSF CSDAEDIDCR LEENLTKKYC LEYNYDYENG FAIGPGGWGA ANRLDYSYDD FLDTVQETAT SIGNAKSSRI KRSAPLSDYK IKLIFNITAS VPLPDERNDT LEWENQQRLL QTLETITNKL KRTLNKDPMY SFQLASEILI ADSNSLETKK ASPFCRPGSV LRGRMCVNCP LGTYYNLEHF TCESCRIGSY QDEEGQLECK LCPSGMYTEY IHSRNISDCK AQCKQGTYSY SGLETCESCP LGTYQPKFGS RSCLSCPENT STVKRGAVNI SACGVPCPEG KFSRSGLMPC HPCPRDYYQP NAGKAFCLAC PFYGTTPFAG SRSITECSSF SSTFSAAEES VVPPASLGHI KKRHEISSQV FHECFFNPCH NSGTCQQLGR GYVCLCPLGY TGLKCETDID ECSPLPCLNN GVCKDLVGEF ICECPSGYTG QRCEENINEC SSSPCLNKGI CVDGVAGYRC TCVKGFVGLH CETEVNECQS NPCLNNAVCE DQVGGFLCKC PPGFLGTRCG KNVDECLSQP CKNGATCKDG ANSFRCLCAA GFTGSHCELN INECQSNPCR NQATCVDELN SYSCKCQPGF SGKRCETEQS TGFNLDFEVS GIYGYVMLDG MLPSLHALTC TFWMKSSDDM NYGTPISYAV DNGSDNTLLL TDYNGWVLYV NGREKITNCP SVNDGRWHHI AITWTSANGI WKVYIDGKLS DGGAGLSVGL PIPGGGALVL GQEQDKKGEG FSPAESFVGS ISQLNLWDYV LSPQQVKSLA TSCPEELSKG NVLAWPDFLS GIVGKVKIDS KSIFCSDCPR LGGSVPHLRT ASEDLKPGSK VNLFCDPGFQ LVGNPVQYCL NQGQWTQPLP HCERISCGVP PPLENGFHSA DDFYAGSTVT YQCNNGYYLL GDSRMFCTDN GSWNGVSPSC LDVDECAVGS DCSEHASCLN VDGSYICSCV PPYTGDGKNC AEPIKCKAPG NPENGHSSGE IYTVGAEVTF SCQEGYQLMG VTKITCLESG EWNHLIPYCK AVSCGKPAIP ENGCIEELAF TFGSKVTYRC NKGYTLAGDK ESSCLANSSW SHSPPVCEPV KCSSPENINN GKYILSGLTY LSTASYSCDT GYSLQGPSII ECTASGIWDR APPACHLVFC GEPPAIKDAV ITGNNFTFRN TVTYTCKEGY TLAGLDTIEC LADGKWSRSD QQCLAVSCDE PPIVDHASPE TAHRLFGDIA FYYCSDGYSL ADNSQLLCNA QGKWVPPEGQ DMPRCIAHFC EKPPSVSYSI LESVSKAKFA AGSVVSFKCM EGFVLNTSAK IECMRGGQWN PSPMSIQCIP VRCGEPPSIM NGYASGSNYS FGAMVAYSCN KGFYIKGEKK STCEATGQWS SPIPTCHPVS CGEPPKVENG FLEHTTGRIF ESEVRYQCNP GYKSVGSPVF VCQANRHWHS ESPLMCVPLD CGKPPPIQNG FMKGENFEVG SKVQFFCNEG YELVGDSSWT CQKSGKWNKK SNPKCMPAKC PEPPLLENQL VLKELTTEVG VVTFSCKEGH VLQGPSVLKC LPSQQWNDSF PVCKIVLCTP PPLISFGVPI PSSALHFGST VKYSCVGGFF LRGNSTTLCQ PDGTWSSPLP ECVPVECPQP EEIPNGIIDV QGLAYLSTAL YTCKPGFELV GNTTTLCGEN GHWLGGKPTC KAIECLKPKE ILNGKFSYTD LHYGQTVTYS CNRGFRLEGP SALTCLETGD WDVDAPSCNA IHCDSPQPIE NGFVEGADYS YGAIIIYSCF PGFQVAGHAM QTCEESGWSS SIPTCMPIDC GLPPHIDFGD CTKLKDDQGY FEQEDDMMEV PYVTPHPPYH LGAVAKTWEN TKESPATHSS NFLYGTMVSY TCNPGYELLG NPVLICQEDG TWNGSAPSCI SIECDLPTAP ENGFLRFTET SMGSAVQYSC KPGHILAGSD LRLCLENRKW SGASPRCEAI SCKKPNPVMN GSIKGSNYTY LSTLYYECDP GYVLNGTERR TCQDDKNWDE DEPICIPVDC SSPPVSANGQ VRGDEYTFQK EIEYTCNEGF LLEGARSRVC LANGSWSGAT PDCVPVRCAT PPQLANGVTE GLDYGFMKEV TFHCHEGYIL HGAPKLTCQS DGNWDAEIPL CKPVNCGPPE DLAHGFPNGF SFIHGGHIQY QCFPGYKLHG NSSRRCLSNG SWSGSSPSCL PCRCSTPVIE YGTVNGTDFD CGKAARIQCF KGFKLLGLSE ITCEADGQWS SGFPHCEHTS CGSLPMIPNA FISETSSWKE NVITYSCRSG YVIQGSSDLI CTEKGVWSQP YPVCEPLSCG SPPSVANAVA TGEAHTYESE VKLRCLEGYT MDTDTDTFTC QKDGRWFPER ISCSPKKCPL PENITHILVH GDDFSVNRQV SVSCAEGYTF EGVNISVCQL DGTWEPPFSD ESCSPVSCGK PESPEHGFVV GSKYTFESTI IYQCEPGYEL EGNRERVCQE NRQWSGGVAI CKETRCETPL EFLNGKADIE NRTTGPNVVY SCNRGYSLEG PSEAHCTENG TWSHPVPLCK PNPCPVPFVI PENALLSEKE FYVDQNVSIK CREGFLLQGH GIITCNPDET WTQTSAKCEK ISCGPPAHVE NAIARGVHYQ YGDMITYSCY SGYMLEGFLR SVCLENGTWT SPPICRAVCR FPCQNGGICQ RPNACSCPEG WMGRLCEEPI CILPCLNGGR CVAPYQCDCP PGWTGSRCHT AVCQSPCLNG GKCVRPNRCH CLSSWTGHNC SRKRRTGF* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MSPSRNFSFR LFPETAPGAP GSIPAPPAPG DEAAGSRVER LGQAFRRRVR LLRELSERLE LVFLVDDSSS VGEVNFRSEL MFVRKLLSDF PVVPTATRVA IVTFSSKNYV VPRVDYISTR RARQHKCALL LQEIPAISYR GGGTYTKGAF QQAAQILLHA RENSTKVVFL ITDGYSNGGD PRPIAASLRD SGVEIFTFGI WQGNIRELND MASTPKEEHC YLLHSFEEFE ALARRALHED LPSGSFIQDD MVHCSYLCDE GKDCCDRMGS CKCGTHTGHF ECICEKGYYG KGLQYECTAC PSGTYKPEGS PGGISSCIPC PDENHTSPPG STSPEDCVCR EGYRASGQTC ELVHCPALKP PENGYFIQNT CNNHFNAACG VRCHPGFDLV GSSIILCLPN GLWSGSESYC RVRTCPHLRQ PKHGHISCST REMLYKTTCL VACDEGYRLE GSDKLTCQGN SQWDGPEPRC VERHCSTFQM PKDVIISPHN CGKQPAKFGT ICYVSCRQGF ILSGVKEMLR CTTSGKWNVG VQAAVCKDVE APQINCPKDI EAKTLEQQDS ANVTWQIPTA KDNSGEKVSV HVHPAFTPPY LFPIGDVAIV YTATDLSGNQ ASCIFHIKVI DAEPPVIDWC RSPPPVQVSE KVHAASWDEP QFSDNSGAEL VITRSHTQGD LFPQGETIVQ YTATDPSGNN RTCDIHIVIK GSPCEIPFTP VNGDFICTPD NTGVNCTLTC LEGYDFTEGS TDKYYCAYED GVWKPTYTTE WPDCAKKRFA NHGFKSFEMF YKAARCDDTD LMKKFSEAFE TTLGKMVPSF CSDAEDIDCR LEENLTKKYC LEYNYDYENG FAIGPGGWGA ANRLDYSYDD FLDTVQETAT SIGNARSSRI KRSAPLSDYK IKLIFNITAS VPLPDERNDT LEWENQQRLL QTLETITNKL KRTLNKDPMY SFQLASEILI ADSNSLETKK ASPFCRPGSV LRGRMCVNCP LGTYYNLEHF TCESCRIGSY QDEEGQLECK LCPSGMYTEY IHSRNISDCK AQCKQGTYSY SGLETCESCP LGTYQPKFGS RSCLSCPENT STVKRGAVNI SACGVPCPEG KFSRSGLMPC HPCPRDYYQP NAGKAFCLAC PFYGTTPFAG SRSITECSSF SSTFSAAEES VVPPASLGHI KKRHEISSQV FHECFFNPCH NSGTCQQLGR GYVCLCPLGY TGLKCETDID ECSPLPCLNN GVCKDLVGEF ICECPSGYTG QRCEENINEC SSSPCLNKGI CVDGVAGYRC TCVKGFVGLH CETEVNECQS NPCLNNAVCE DQVGGFLCKC PPGFLGTRCG KNVDECLSQP CKNGATCKDG ANSFRCLCAA GFTGSHCELN INECQSNPCR NQATCVDELN SYSCKCQPGF SGKRCETEQS TGFNLDFEVS GIYGYVMLDG MLPSLHALTC TFWMKSSDDM NYGTPISYAV DNGSDNTLLL TDYNGWVLYV NGREKITNCP SVNDGRWHHI AITWTSANGI WKVYIDGKLS DGGAGLSVGL PIPGGGALVL GQEQDKKGEG FSPAESFVGS ISQLNLWDYV LSPQQVKSLA TSCPEELSKG NVLAWPDFLS GIVGKVKIDS KSIFCSDCPR LGGSVPHLRT ASEDLKPGSK VNLFCDPGFQ LVGNPVQYCL NQGQWTQPLP HCERISCGVP PPLENGFHSA DDFYAGSTVT YQCNNGYYLL GDSRMFCTDN GSWNGVSPSC LDVDECAVGS DCSEHASCLN VDGSYICSCV PPYTGDGKNC AEPIKCKAPG NPENGHSSGE IYTVGAEVTF SCQEGYQLMG VTKITCLESG EWNHLIPYCK AVSCGKPAIP ENGCIEELAF TFGSKVTYRC NKGYTLAGDK ESSCLANSSW SHSPPVCEPV KCSSPENINN GKYILSGLTY LSTASYSCDT GYSLQGPSII ECTASGIWDR APPACHLVFC GEPPAIKDAV ITGNNFTFRN TVTYTCKEGY TLAGLDTIEC LADGKWSRSD QQCLAVSCDE PPIVDHASPE TAHRLFGDIA FYYCSDGYSL ADNSQLLCNA QGKWVPPEGQ DMPRCIAHFC EKPPSVSYSI LESVSKAKFA AGSVVSFKCM EGFVLNTSAK IECMRGGQWN PSPMSIQCIP VRCGEPPSIM NGYASGSNYS FGAMVAYSCN KGFYIKGEKK STCEATGQWS SPIPTCHPVS CGEPPKVENG FLEHTTGRIF ESEVRYQCNP GYKSVGSPVF VCQANRHWHS ESPLMCVPLD CGKPPPIQNG FMKGENFEVG SKVQFFCNEG YELVGDSSWT CQKSGKWNKK SNPKCMPAKC PEPPLLENQL VLKELTTEVG VVTFSCKEGH VLQGPSVLKC LPSQQWNDSF PVCKIVLCTP PPLISFGVPI PSSALHFGST VKYSCVGGFF LRGNSTTLCQ PDGTWSSPLP ECVPVECPQP EEIPNGIIDV QGLAYLSTAL YTCKPGFELV GNTTTLCGEN GHWLGGKPTC KAIECLKPKE ILNGKFSYTD LHYGQTVTYS CNRGFRLEGP SALTCLETGD WDVDAPSCNA IHCDSPQPIE NGFVEGADYS YGAIIIYSCF PGFQVAGHAM QTCEESGWSS SIPTCMPIDC GLPPHIDFGD CTKLKDDQGY FEQEDDMMEV PYVTPHPPYH LGAVAKTWEN TKESPATHSS NFLYGTMVSY TCNPGYELLG NPVLICQEDG TWNGSAPSCI SIECDLPTAP ENGFLRFTET SMGSAVQYSC KPGHILAGSD LRLCLENRKW SGASPRCEAI SCKKPNPVMN GSIKGSNYTY LSTLYYECDP GYVLNGTERR TCQDDKNWDE DEPICIPVDC SSPPVSANGQ VRGDEYTFQK EIEYTCNEGF LLEGARSRVC LANGSWSGAT PDCVPVRCAT PPQLANGVTE GLDYGFMKEV TFHCHEGYIL HGAPKLTCQS DGNWDAEIPL CKPVNCGPPE DLAHGFPNGF SFIHGGHIQY QCFPGYKLHG NSSRRCLSNG SWSGSSPSCL PCRCSTPVIE YGTVNGTDFD CGKAARIQCF KGFKLLGLSE ITCEADGQWS SGFPHCEHTS CGSLPMIPNA FISETSSWKE NVITYSCRSG YVIQGSSDLI CTEKGVWSQP YPVCEPLSCG SPPSVANAVA TGEAHTYESE VKLRCLEGYT MDTDTDTFTC QKDGRWFPER ISCSPKKCPL PENITHILVH GDDFSVNRQV SVSCAEGYTF EGVNISVCQL DGTWEPPFSD ESCSPVSCGK PESPEHGFVV GSKYTFESTI IYQCEPGYEL EGNRERVCQE NRQWSGGVAI CKETRCETPL EFLNGKADIE NRTTGPNVVY SCNRGYSLEG PSEAHCTENG TWSHPVPLCK PNPCPVPFVI PENALLSEKE FYVDQNVSIK CREGFLLQGH GIITCNPDET WTQTSAKCEK ISCGPPAHVE NAIARGVHYQ YGDMITYSCY SGYMLEGFLR SVCLENGTWT SPPICRAVCR FPCQNGGICQ RPNACSCPEG WMGRLCEEPI CILPCLNGGR CVAPYQCDCP PGWTGSRCHT AVCQSPCLNG GKCVRPNRCH CLSSWTGHNC SRKRRTGF* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.85 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999999999 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr9:113234507T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | SVEP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000401783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_153366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q4LDE5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.2696A>G cDNA.3033A>G g.107654A>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | K899R Score: 26 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs10817025
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites | no abrogation of potential splice sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 10716 / 10716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 3572 / 3572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 11053 / 11053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 338 / 338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 11032 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 10644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 10716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 2696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 107654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 113234507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAAGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAGGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAAGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAGGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MWPRLAFCCW GLALVSGWAT FQQMSPSRNF SFRLFPETAP GAPGSIPAPP APGDEAAGSR VERLGQAFRR RVRLLRELSE RLELVFLVDD SSSVGEVNFR SELMFVRKLL SDFPVVPTAT RVAIVTFSSK NYVVPRVDYI STRRARQHKC ALLLQEIPAI SYRGGGTYTK GAFQQAAQIL LHARENSTKV VFLITDGYSN GGDPRPIAAS LRDSGVEIFT FGIWQGNIRE LNDMASTPKE EHCYLLHSFE EFEALARRAL HEDLPSGSFI QDDMVHCSYL CDEGKDCCDR MGSCKCGTHT GHFECICEKG YYGKGLQYEC TACPSGTYKP EGSPGGISSC IPCPDENHTS PPGSTSPEDC VCREGYRASG QTCELVHCPA LKPPENGYFI QNTCNNHFNA ACGVRCHPGF DLVGSSIILC LPNGLWSGSE SYCRVRTCPH LRQPKHGHIS CSTREMLYKT TCLVACDEGY RLEGSDKLTC QGNSQWDGPE PRCVERHCST FQMPKDVIIS PHNCGKQPAK FGTICYVSCR QGFILSGVKE MLRCTTSGKW NVGVQAAVCK DVEAPQINCP KDIEAKTLEQ QDSANVTWQI PTAKDNSGEK VSVHVHPAFT PPYLFPIGDV AIVYTATDLS GNQASCIFHI KVIDAEPPVI DWCRSPPPVQ VSEKVHAASW DEPQFSDNSG AELVITRSHT QGDLFPQGET IVQYTATDPS GNNRTCDIHI VIKGSPCEIP FTPVNGDFIC TPDNTGVNCT LTCLEGYDFT EGSTDKYYCA YEDGVWKPTY TTEWPDCAKK RFANHGFKSF EMFYKAARCD DTDLMKKFSE AFETTLGKMV PSFCSDAEDI DCRLEENLTK KYCLEYNYDY ENGFAIGPGG WGAANRLDYS YDDFLDTVQE TATSIGNAKS SRIKRSAPLS DYKIKLIFNI TASVPLPDER NDTLEWENQQ RLLQTLETIT NKLKRTLNKD PMYSFQLASE ILIADSNSLE TKKASPFCRP GSVLRGRMCV NCPLGTYYNL EHFTCESCRI GSYQDEEGQL ECKLCPSGMY TEYIHSRNIS DCKAQCKQGT YSYSGLETCE SCPLGTYQPK FGSRSCLSCP ENTSTVKRGA VNISACGVPC PEGKFSRSGL MPCHPCPRDY YQPNAGKAFC LACPFYGTTP FAGSRSITEC SSFSSTFSAA EESVVPPASL GHIKKRHEIS SQVFHECFFN PCHNSGTCQQ LGRGYVCLCP LGYTGLKCET DIDECSPLPC LNNGVCKDLV GEFICECPSG YTGQRCEENI NECSSSPCLN KGICVDGVAG YRCTCVKGFV GLHCETEVNE CQSNPCLNNA VCEDQVGGFL CKCPPGFLGT RCGKNVDECL SQPCKNGATC KDGANSFRCL CAAGFTGSHC ELNINECQSN PCRNQATCVD ELNSYSCKCQ PGFSGKRCET EQSTGFNLDF EVSGIYGYVM LDGMLPSLHA LTCTFWMKSS DDMNYGTPIS YAVDNGSDNT LLLTDYNGWV LYVNGREKIT NCPSVNDGRW HHIAITWTSA NGIWKVYIDG KLSDGGAGLS VGLPIPGGGA LVLGQEQDKK GEGFSPAESF VGSISQLNLW DYVLSPQQVK SLATSCPEEL SKGNVLAWPD FLSGIVGKVK IDSKSIFCSD CPRLGGSVPH LRTASEDLKP GSKVNLFCDP GFQLVGNPVQ YCLNQGQWTQ PLPHCERISC GVPPPLENGF HSADDFYAGS TVTYQCNNGY YLLGDSRMFC TDNGSWNGVS PSCLDVDECA VGSDCSEHAS CLNVDGSYIC SCVPPYTGDG KNCAEPIKCK APGNPENGHS SGEIYTVGAE VTFSCQEGYQ LMGVTKITCL ESGEWNHLIP YCKAVSCGKP AIPENGCIEE LAFTFGSKVT YRCNKGYTLA GDKESSCLAN SSWSHSPPVC EPVKCSSPEN INNGKYILSG LTYLSTASYS CDTGYSLQGP SIIECTASGI WDRAPPACHL VFCGEPPAIK DAVITGNNFT FRNTVTYTCK EGYTLAGLDT IECLADGKWS RSDQQCLAVS CDEPPIVDHA SPETAHRLFG DIAFYYCSDG YSLADNSQLL CNAQGKWVPP EGQDMPRCIA HFCEKPPSVS YSILESVSKA KFAAGSVVSF KCMEGFVLNT SAKIECMRGG QWNPSPMSIQ CIPVRCGEPP SIMNGYASGS NYSFGAMVAY SCNKGFYIKG EKKSTCEATG QWSSPIPTCH PVSCGEPPKV ENGFLEHTTG RIFESEVRYQ CNPGYKSVGS PVFVCQANRH WHSESPLMCV PLDCGKPPPI QNGFMKGENF EVGSKVQFFC NEGYELVGDS SWTCQKSGKW NKKSNPKCMP AKCPEPPLLE NQLVLKELTT EVGVVTFSCK EGHVLQGPSV LKCLPSQQWN DSFPVCKIVL CTPPPLISFG VPIPSSALHF GSTVKYSCVG GFFLRGNSTT LCQPDGTWSS PLPECVPVEC PQPEEIPNGI IDVQGLAYLS TALYTCKPGF ELVGNTTTLC GENGHWLGGK PTCKAIECLK PKEILNGKFS YTDLHYGQTV TYSCNRGFRL EGPSALTCLE TGDWDVDAPS CNAIHCDSPQ PIENGFVEGA DYSYGAIIIY SCFPGFQVAG HAMQTCEESG WSSSIPTCMP IDCGLPPHID FGDCTKLKDD QGYFEQEDDM MEVPYVTPHP PYHLGAVAKT WENTKESPAT HSSNFLYGTM VSYTCNPGYE LLGNPVLICQ EDGTWNGSAP SCISIECDLP TAPENGFLRF TETSMGSAVQ YSCKPGHILA GSDLRLCLEN RKWSGASPRC EAISCKKPNP VMNGSIKGSN YTYLSTLYYE CDPGYVLNGT ERRTCQDDKN WDEDEPICIP VDCSSPPVSA NGQVRGDEYT FQKEIEYTCN EGFLLEGARS RVCLANGSWS GATPDCVPVR CATPPQLANG VTEGLDYGFM KEVTFHCHEG YILHGAPKLT CQSDGNWDAE IPLCKPVNCG PPEDLAHGFP NGFSFIHGGH IQYQCFPGYK LHGNSSRRCL SNGSWSGSSP SCLPCRCSTP VIEYGTVNGT DFDCGKAARI QCFKGFKLLG LSEITCEADG QWSSGFPHCE HTSCGSLPMI PNAFISETSS WKENVITYSC RSGYVIQGSS DLICTEKGVW SQPYPVCEPL SCGSPPSVAN AVATGEAHTY ESEVKLRCLE GYTMDTDTDT FTCQKDGRWF PERISCSPKK CPLPENITHI LVHGDDFSVN RQVSVSCAEG YTFEGVNISV CQLDGTWEPP FSDESCSPVS CGKPESPEHG FVVGSKYTFE STIIYQCEPG YELEGNRERV CQENRQWSGG VAICKETRCE TPLEFLNGKA DIENRTTGPN VVYSCNRGYS LEGPSEAHCT ENGTWSHPVP LCKPNPCPVP FVIPENALLS EKEFYVDQNV SIKCREGFLL QGHGIITCNP DETWTQTSAK CEKISCGPPA HVENAIARGV HYQYGDMITY SCYSGYMLEG FLRSVCLENG TWTSPPICRA VCRFPCQNGG ICQRPNACSC PEGWMGRLCE EPICILPCLN GGRCVAPYQC DCPPGWTGSR CHTAVCQSPC LNGGKCVRPN RCHCLSSWTG HNCSRKRRTG F* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MWPRLAFCCW GLALVSGWAT FQQMSPSRNF SFRLFPETAP GAPGSIPAPP APGDEAAGSR VERLGQAFRR RVRLLRELSE RLELVFLVDD SSSVGEVNFR SELMFVRKLL SDFPVVPTAT RVAIVTFSSK NYVVPRVDYI STRRARQHKC ALLLQEIPAI SYRGGGTYTK GAFQQAAQIL LHARENSTKV VFLITDGYSN GGDPRPIAAS LRDSGVEIFT FGIWQGNIRE LNDMASTPKE EHCYLLHSFE EFEALARRAL HEDLPSGSFI QDDMVHCSYL CDEGKDCCDR MGSCKCGTHT GHFECICEKG YYGKGLQYEC TACPSGTYKP EGSPGGISSC IPCPDENHTS PPGSTSPEDC VCREGYRASG QTCELVHCPA LKPPENGYFI QNTCNNHFNA ACGVRCHPGF DLVGSSIILC LPNGLWSGSE SYCRVRTCPH LRQPKHGHIS CSTREMLYKT TCLVACDEGY RLEGSDKLTC QGNSQWDGPE PRCVERHCST FQMPKDVIIS PHNCGKQPAK FGTICYVSCR QGFILSGVKE MLRCTTSGKW NVGVQAAVCK DVEAPQINCP KDIEAKTLEQ QDSANVTWQI PTAKDNSGEK VSVHVHPAFT PPYLFPIGDV AIVYTATDLS GNQASCIFHI KVIDAEPPVI DWCRSPPPVQ VSEKVHAASW DEPQFSDNSG AELVITRSHT QGDLFPQGET IVQYTATDPS GNNRTCDIHI VIKGSPCEIP FTPVNGDFIC TPDNTGVNCT LTCLEGYDFT EGSTDKYYCA YEDGVWKPTY TTEWPDCAKK RFANHGFKSF EMFYKAARCD DTDLMKKFSE AFETTLGKMV PSFCSDAEDI DCRLEENLTK KYCLEYNYDY ENGFAIGPGG WGAANRLDYS YDDFLDTVQE TATSIGNARS SRIKRSAPLS DYKIKLIFNI TASVPLPDER NDTLEWENQQ RLLQTLETIT NKLKRTLNKD PMYSFQLASE ILIADSNSLE TKKASPFCRP GSVLRGRMCV NCPLGTYYNL EHFTCESCRI GSYQDEEGQL ECKLCPSGMY TEYIHSRNIS DCKAQCKQGT YSYSGLETCE SCPLGTYQPK FGSRSCLSCP ENTSTVKRGA VNISACGVPC PEGKFSRSGL MPCHPCPRDY YQPNAGKAFC LACPFYGTTP FAGSRSITEC SSFSSTFSAA EESVVPPASL GHIKKRHEIS SQVFHECFFN PCHNSGTCQQ LGRGYVCLCP LGYTGLKCET DIDECSPLPC LNNGVCKDLV GEFICECPSG YTGQRCEENI NECSSSPCLN KGICVDGVAG YRCTCVKGFV GLHCETEVNE CQSNPCLNNA VCEDQVGGFL CKCPPGFLGT RCGKNVDECL SQPCKNGATC KDGANSFRCL CAAGFTGSHC ELNINECQSN PCRNQATCVD ELNSYSCKCQ PGFSGKRCET EQSTGFNLDF EVSGIYGYVM LDGMLPSLHA LTCTFWMKSS DDMNYGTPIS YAVDNGSDNT LLLTDYNGWV LYVNGREKIT NCPSVNDGRW HHIAITWTSA NGIWKVYIDG KLSDGGAGLS VGLPIPGGGA LVLGQEQDKK GEGFSPAESF VGSISQLNLW DYVLSPQQVK SLATSCPEEL SKGNVLAWPD FLSGIVGKVK IDSKSIFCSD CPRLGGSVPH LRTASEDLKP GSKVNLFCDP GFQLVGNPVQ YCLNQGQWTQ PLPHCERISC GVPPPLENGF HSADDFYAGS TVTYQCNNGY YLLGDSRMFC TDNGSWNGVS PSCLDVDECA VGSDCSEHAS CLNVDGSYIC SCVPPYTGDG KNCAEPIKCK APGNPENGHS SGEIYTVGAE VTFSCQEGYQ LMGVTKITCL ESGEWNHLIP YCKAVSCGKP AIPENGCIEE LAFTFGSKVT YRCNKGYTLA GDKESSCLAN SSWSHSPPVC EPVKCSSPEN INNGKYILSG LTYLSTASYS CDTGYSLQGP SIIECTASGI WDRAPPACHL VFCGEPPAIK DAVITGNNFT FRNTVTYTCK EGYTLAGLDT IECLADGKWS RSDQQCLAVS CDEPPIVDHA SPETAHRLFG DIAFYYCSDG YSLADNSQLL CNAQGKWVPP EGQDMPRCIA HFCEKPPSVS YSILESVSKA KFAAGSVVSF KCMEGFVLNT SAKIECMRGG QWNPSPMSIQ CIPVRCGEPP SIMNGYASGS NYSFGAMVAY SCNKGFYIKG EKKSTCEATG QWSSPIPTCH PVSCGEPPKV ENGFLEHTTG RIFESEVRYQ CNPGYKSVGS PVFVCQANRH WHSESPLMCV PLDCGKPPPI QNGFMKGENF EVGSKVQFFC NEGYELVGDS SWTCQKSGKW NKKSNPKCMP AKCPEPPLLE NQLVLKELTT EVGVVTFSCK EGHVLQGPSV LKCLPSQQWN DSFPVCKIVL CTPPPLISFG VPIPSSALHF GSTVKYSCVG GFFLRGNSTT LCQPDGTWSS PLPECVPVEC PQPEEIPNGI IDVQGLAYLS TALYTCKPGF ELVGNTTTLC GENGHWLGGK PTCKAIECLK PKEILNGKFS YTDLHYGQTV TYSCNRGFRL EGPSALTCLE TGDWDVDAPS CNAIHCDSPQ PIENGFVEGA DYSYGAIIIY SCFPGFQVAG HAMQTCEESG WSSSIPTCMP IDCGLPPHID FGDCTKLKDD QGYFEQEDDM MEVPYVTPHP PYHLGAVAKT WENTKESPAT HSSNFLYGTM VSYTCNPGYE LLGNPVLICQ EDGTWNGSAP SCISIECDLP TAPENGFLRF TETSMGSAVQ YSCKPGHILA GSDLRLCLEN RKWSGASPRC EAISCKKPNP VMNGSIKGSN YTYLSTLYYE CDPGYVLNGT ERRTCQDDKN WDEDEPICIP VDCSSPPVSA NGQVRGDEYT FQKEIEYTCN EGFLLEGARS RVCLANGSWS GATPDCVPVR CATPPQLANG VTEGLDYGFM KEVTFHCHEG YILHGAPKLT CQSDGNWDAE IPLCKPVNCG PPEDLAHGFP NGFSFIHGGH IQYQCFPGYK LHGNSSRRCL SNGSWSGSSP SCLPCRCSTP VIEYGTVNGT DFDCGKAARI QCFKGFKLLG LSEITCEADG QWSSGFPHCE HTSCGSLPMI PNAFISETSS WKENVITYSC RSGYVIQGSS DLICTEKGVW SQPYPVCEPL SCGSPPSVAN AVATGEAHTY ESEVKLRCLE GYTMDTDTDT FTCQKDGRWF PERISCSPKK CPLPENITHI LVHGDDFSVN RQVSVSCAEG YTFEGVNISV CQLDGTWEPP FSDESCSPVS CGKPESPEHG FVVGSKYTFE STIIYQCEPG YELEGNRERV CQENRQWSGG VAICKETRCE TPLEFLNGKA DIENRTTGPN VVYSCNRGYS LEGPSEAHCT ENGTWSHPVP LCKPNPCPVP FVIPENALLS EKEFYVDQNV SIKCREGFLL QGHGIITCNP DETWTQTSAK CEKISCGPPA HVENAIARGV HYQYGDMITY SCYSGYMLEG FLRSVCLENG TWTSPPICRA VCRFPCQNGG ICQRPNACSC PEGWMGRLCE EPICILPCLN GGRCVAPYQC DCPPGWTGSR CHTAVCQSPC LNGGKCVRPN RCHCLSSWTG HNCSRKRRTG F* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.90 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999999999 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr9:113234507T>CN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | SVEP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000302728 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q4LDE5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.2696A>G cDNA.2696A>G g.107654A>G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | K899R Score: 26 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs10817025
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites | no abrogation of potential splice sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features | no protein features affected | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 4650 / 4650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1550 / 1550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 4650 / 4650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 1 / 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 4464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 4413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 4650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 2696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 2696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 107654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 113234507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAAGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAGGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAAGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | CACAAGCATCGGCAATGCCAGGTCCTCACGGATTAAAAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MWPRLAFCCW GLALVSGWAT FQQMSPSRNF SFRLFPETAP GAPGSIPAPP APGDEAAGSR VERLGQAFRR RVRLLRELSE RLELVFLVDD SSSVGEVNFR SELMFVRKLL SDFPVVPTAT RVAIVTFSSK NYVVPRVDYI STRRARQHKC ALLLQEIPAI SYRGGGTYTK GAFQQAAQIL LHARENSTKV VFLITDGYSN GGDPRPIAAS LRDSGVEIFT FGIWQGNIRE LNDMASTPKE EHCYLLHSFE EFEALARRAL HEDLPSGSFI QDDMVHCSYL CDEGKDCCDR MGSCKCGTHT GHFECICEKG YYGKGLQYEC TACPSGTYKP EGSPGGISSC IPCPDENHTS PPGSTSPEDC VCREGYRASG QTCELVHCPA LKPPENGYFI QNTCNNHFNA ACGVRCHPGF DLVGSSIILC LPNGLWSGSE SYCRVRTCPH LRQPKHGHIS CSTREMLYKT TCLVACDEGY RLEGSDKLTC QGNSQWDGPE PRCVERHCST FQMPKDVIIS PHNCGKQPAK FGTICYVSCR QGFILSGVKE MLRCTTSGKW NVGVQAAVCK DVEAPQINCP KDIEAKTLEQ QDSANVTWQI PTAKDNSGEK VSVHVHPAFT PPYLFPIGDV AIVYTATDLS GNQASCIFHI KVIDAEPPVI DWCRSPPPVQ VSEKVHAASW DEPQFSDNSG AELVITRSHT QGDLFPQGET IVQYTATDPS GNNRTCDIHI VIKGSPCEIP FTPVNGDFIC TPDNTGVNCT LTCLEGYDFT EGSTDKYYCA YEDGVWKPTY TTEWPDCAKK RFANHGFKSF EMFYKAARCD DTDLMKKFSE AFETTLGKMV PSFCSDAEDI DCRLEENLTK KYCLEYNYDY ENGFAIGPGG WGAANRLDYS YDDFLDTVQE TATSIGNAKS SRIKRSAPLS DYKIKLIFNI TASVPLPDER NDTLEWENQQ RLLQTLETIT NKLKRTLNKD PMYSFQLASE ILIADSNSLE TKKASPFCRP GSVLRGRMCV NCPLGTYYNL EHFTCESCRI GSYQDEEGQL ECKLCPSGMY TEYIHSRNIS DCKAQCKQGT YSYSGLETCE SCPLGTYQPK FGSRSCLSCP ENTSTVKRGA VNISACGVPC PEGKFSRSGL MPCHPCPRDY YQPNAGKAFC LACPFYGTTP FAGSRSITEC SSFSSTFSAA EESVVPPASL GHIKKRHEIS SRVFHECFFN PCHNSGTCQQ LGRGYVCLCP LGYTGLKCET DIDECSPLPC LNNGVCKDLV GEFICECPSG YTGQRCEENI NECSSSPCLN KGICVDGVAG YRCTCVKGFV GLHCETEVNE CQSNPCLNNA VCEDQVGGFL CKCPPGFLGT RCGKNVDECL SQPCKNGATC KDGANSFRCL CAAGFTGSHC ELNINECQSN PCRNQATCVD ELNSYSCKCQ PGFSGKRCET EQSTGFNLDF EVSGIYGYVM LDGMLPSLHA LTCTFWMKSS DDMNYGTPIS YAVDNGSDNT LLLTDYNGWV LYVNGREKIT NCPSVNDGRW HHIAITWTSA NGIWKVYIDG KLSDGGAGLS VGLPIPGMF* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MWPRLAFCCW GLALVSGWAT FQQMSPSRNF SFRLFPETAP GAPGSIPAPP APGDEAAGSR VERLGQAFRR RVRLLRELSE RLELVFLVDD SSSVGEVNFR SELMFVRKLL SDFPVVPTAT RVAIVTFSSK NYVVPRVDYI STRRARQHKC ALLLQEIPAI SYRGGGTYTK GAFQQAAQIL LHARENSTKV VFLITDGYSN GGDPRPIAAS LRDSGVEIFT FGIWQGNIRE LNDMASTPKE EHCYLLHSFE EFEALARRAL HEDLPSGSFI QDDMVHCSYL CDEGKDCCDR MGSCKCGTHT GHFECICEKG YYGKGLQYEC TACPSGTYKP EGSPGGISSC IPCPDENHTS PPGSTSPEDC VCREGYRASG QTCELVHCPA LKPPENGYFI QNTCNNHFNA ACGVRCHPGF DLVGSSIILC LPNGLWSGSE SYCRVRTCPH LRQPKHGHIS CSTREMLYKT TCLVACDEGY RLEGSDKLTC QGNSQWDGPE PRCVERHCST FQMPKDVIIS PHNCGKQPAK FGTICYVSCR QGFILSGVKE MLRCTTSGKW NVGVQAAVCK DVEAPQINCP KDIEAKTLEQ QDSANVTWQI PTAKDNSGEK VSVHVHPAFT PPYLFPIGDV AIVYTATDLS GNQASCIFHI KVIDAEPPVI DWCRSPPPVQ VSEKVHAASW DEPQFSDNSG AELVITRSHT QGDLFPQGET IVQYTATDPS GNNRTCDIHI VIKGSPCEIP FTPVNGDFIC TPDNTGVNCT LTCLEGYDFT EGSTDKYYCA YEDGVWKPTY TTEWPDCAKK RFANHGFKSF EMFYKAARCD DTDLMKKFSE AFETTLGKMV PSFCSDAEDI DCRLEENLTK KYCLEYNYDY ENGFAIGPGG WGAANRLDYS YDDFLDTVQE TATSIGNARS SRIKRSAPLS DYKIKLIFNI TASVPLPDER NDTLEWENQQ RLLQTLETIT NKLKRTLNKD PMYSFQLASE ILIADSNSLE TKKASPFCRP GSVLRGRMCV NCPLGTYYNL EHFTCESCRI GSYQDEEGQL ECKLCPSGMY TEYIHSRNIS DCKAQCKQGT YSYSGLETCE SCPLGTYQPK FGSRSCLSCP ENTSTVKRGA VNISACGVPC PEGKFSRSGL MPCHPCPRDY YQPNAGKAFC LACPFYGTTP FAGSRSITEC SSFSSTFSAA EESVVPPASL GHIKKRHEIS SRVFHECFFN PCHNSGTCQQ LGRGYVCLCP LGYTGLKCET DIDECSPLPC LNNGVCKDLV GEFICECPSG YTGQRCEENI NECSSSPCLN KGICVDGVAG YRCTCVKGFV GLHCETEVNE CQSNPCLNNA VCEDQVGGFL CKCPPGFLGT RCGKNVDECL SQPCKNGATC KDGANSFRCL CAAGFTGSHC ELNINECQSN PCRNQATCVD ELNSYSCKCQ PGFSGKRCET EQSTGFNLDF EVSGIYGYVM LDGMLPSLHA LTCTFWMKSS DDMNYGTPIS YAVDNGSDNT LLLTDYNGWV LYVNGREKIT NCPSVNDGRW HHIAITWTSA NGIWKVYIDG KLSDGGAGLS VGLPIPGMF* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.67 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||