mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999957289 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
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hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr5:41018452A>TN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | MROH2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000399564 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_173489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q7Z745 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.2754T>A cDNA.3205T>A g.52993T>A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | N918K Score: 94 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs10054110
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regulatory features | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
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splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
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protein features |
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length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 4758 / 4758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 1586 / 1586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 5209 / 5209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 452 / 452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 5103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 4601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 4758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 2754 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 3205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 52993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 41018452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | ACTGCGAAAGTGCTGACAAATGATATTGAGGTAAGTAATCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | ACTGCGAAAGTGCTGACAAAAGATATTGAGGTAAGTAATCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | ACTGCGAAAGTGCTGACAAATGATATTGAGGCACCAGAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | ACTGCGAAAGTGCTGACAAAAGATATTGAGGCACCAGAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MTLSTEESIE MFGDINLTLG MLNKEDIVNK EDIYSHLTSV IQNTDILDDA IVQRLIYYAS KDMRDNNMLR EIRMLAGEVL VSLAAHDFNS VMYEVQSNFR ILELPDEFVV LALAELATSY VSQSIPFMMM TLLTMQTMLR LAEDERMKGT FCIALEKFSK AIYKYVNHWR DFPYPRLDAN RLSDKIFMLF WYIMEKWAPL ASPMQTLSIV KAHGPTVSLL LHREDFRGYA LGQVPWLLNQ YKDKEIDFHV TQSLKQILTA AVLYDIGLPR SLRRSIFINL LQQICRAPEP PVKENEMKAS SCFLILAHSN PGELMEFFDE QVRSNNEAIR VGILTLLRLA VNADEPRLRD HIISIERTVK IVMGDLSTKV RNSVLLLIQT MCEKSYIEAR EGWPLIDYVF SQFATLNRNL EKPVKTNFHE NEKEEESVRE TSLEVLKTLD PLVIGMPQVL WPRILTFVVP AEYTEALEPL FSIIRILIMA EEKKQHSAKE STALVVSTGA VKLPSPQQLL ARLLVISMPA SLGELRGAGA IGLLKILPEI IHPKLVDLWK TRLPELLQPL EGKNISTVLW ETMLLQLLKE SLWKISDVAW TIQLTQDFKQ QMGSYSNNST EKKFLWKALG TTLACCQDSD FVNSQIKEFL TAPNQLGDQR QGITSILGYC AENHLDIVLK VLKTFQNQEK FFMNRCKSLF SGKKSLTKTD VMVIYGAVAL HAPKKQLLSR LNQDIISQVL SLHGQCSQVL GMSVMNKDMD LQMSFTRSIT EIGIAVQDAE DQGFQFSYKE MLIGYMLDFI RDEPLDSLAS PIRWKALIAI RYLSKLKPQL SLQDHLNILE ENIRRLLPLP PLENLKSEGQ TDKDKEHIQF LYERSMDALG KLLKTMMWDN VNAEDCQEMF NLLQMWLVSQ KEWERERAFQ ITAKVLTNDI EAPENFKIGS LLGLLAPHSC DTLPTIRQAA ASSTIGLFYI KGIHLEVERL QGLQEGLESD DVQVQIKISS KIAKIVSKFI PNEEILMFLE EMLDGLESLN PTCTKACGIW MITVLKQQGA ALEDQLLEIL GTIYHHMPVL RQKEESFQFI LEAISQIASF HMDTVVVNLL QKPLPFDRDT KTLWKALAEK PASSGKLLQA LIDKLETELE DDIARVEAIS VACAMYEVIS MGTSVTGLYP ELFTLLLKLV SCTLGQKMLT CPWSHRRHVM QQGEQQQIPD PCRLSTATLK CLQAQAMREG LAKESDEGDN LWTLLSSPST HHIGVCSLAR SMAVWQHGVI LDIMEQLLSS LTSSSENYRI TGAAFFSELM KEPILWKHGN LRNVLILMDQ SAWDSNATLR QMAIRGLGNT ASGAPHKVKK HKQLMLESII RGLYHLARTE VVCESLKALK KILELLTDRD VSFYFKEIVL QTRTFFEDEQ DDVRLTAIFL FEDLAPLTGR RWKIFFAEEI KKSLISFLLH LWDPNPKIGV ACRDVLMVCI PFLGLQELYG VLDRLLDQDL PRARDFYRQF CVKLAKKNQE ILWILHTHSF TFFTSTWEVI RSAAVKLTDA VVLNLTSQYV ELLDREQLTT RLQALRQDPC ISVQRAAEAA LQTLLRRCKE TSIPL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MTLSTEESIE MFGDINLTLG MLNKEDIVNK EDIYSHLTSV IQNTDILDDA IVQRLIYYAS KDMRDNNMLR EIRMLAGEVL VSLAAHDFNS VMYEVQSNFR ILELPDEFVV LALAELATSY VSQSIPFMMM TLLTMQTMLR LAEDERMKGT FCIALEKFSK AIYKYVNHWR DFPYPRLDAN RLSDKIFMLF WYIMEKWAPL ASPMQTLSIV KAHGPTVSLL LHREDFRGYA LGQVPWLLNQ YKDKEIDFHV TQSLKQILTA AVLYDIGLPR SLRRSIFINL LQQICRAPEP PVKENEMKAS SCFLILAHSN PGELMEFFDE QVRSNNEAIR VGILTLLRLA VNADEPRLRD HIISIERTVK IVMGDLSTKV RNSVLLLIQT MCEKSYIEAR EGWPLIDYVF SQFATLNRNL EKPVKTNFHE NEKEEESVRE TSLEVLKTLD PLVIGMPQVL WPRILTFVVP AEYTEALEPL FSIIRILIMA EEKKQHSAKE STALVVSTGA VKLPSPQQLL ARLLVISMPA SLGELRGAGA IGLLKILPEI IHPKLVDLWK TRLPELLQPL EGKNISTVLW ETMLLQLLKE SLWKISDVAW TIQLTQDFKQ QMGSYSNNST EKKFLWKALG TTLACCQDSD FVNSQIKEFL TAPNQLGDQR QGITSILGYC AENHLDIVLK VLKTFQNQEK FFMNRCKSLF SGKKSLTKTD VMVIYGAVAL HAPKKQLLSR LNQDIISQVL SLHGQCSQVL GMSVMNKDMD LQMSFTRSIT EIGIAVQDAE DQGFQFSYKE MLIGYMLDFI RDEPLDSLAS PIRWKALIAI RYLSKLKPQL SLQDHLNILE ENIRRLLPLP PLENLKSEGQ TDKDKEHIQF LYERSMDALG KLLKTMMWDN VNAEDCQEMF NLLQMWLVSQ KEWERERAFQ ITAKVLTKDI EAPENFKIGS LLGLLAPHSC DTLPTIRQAA ASSTIGLFYI KGIHLEVERL QGLQEGLESD DVQVQIKISS KIAKIVSKFI PNEEILMFLE EMLDGLESLN PTCTKACGIW MITVLKQQGA ALEDQLLEIL GTIYHHMPVL RQKEESFQFI LEAISQIASF HMDTVVVNLL QKPLPFDRDT KTLWKALAEK PASSGKLLQA LIDKLETELE DDIARVEAIS VACAMYEVIS MGTSVTGLYP ELFTLLLKLV SCTLGQKMLT CPWSHRRHVM QQGEQQQIPD PCRLSTATLK CLQAQAMREG LAKESDEGDN LWTLLSSPST HHIGVCSLAR SMAVWQHGVI LDIMEQLLSS LTSSSENYRI TGAAFFSELM KEPILWKHGN LRNVLILMDQ SAWDSNATLR QMAIRGLGNT ASGAPHKVKK HKQLMLESII RGLYHLARTE VVCESLKALK KILELLTDRD VSFYFKEIVL QTRTFFEDEQ DDVRLTAIFL FEDLAPLTGR RWKIFFAEEI KKSLISFLLH LWDPNPKIGV ACRDVLMVCI PFLGLQELYG VLDRLLDQDL PRARDFYRQF CVKLAKKNQE ILWILHTHSF TFFTSTWEVI RSAAVKLTDA VVLNLTSQYV ELLDREQLTT RLQALRQDPC ISVQRAAEAA LQTLLRRCKE TSIPL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 1.32 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||