MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
CEP290 | disease_causing_automatic | 0.999999960351185 | simple_aae | affected | 0 | W7C | single base exchange | rs62635288 | show file | ||
CEP290 | disease_causing_automatic | 0.999999960351185 | simple_aae | affected | 0 | W7C | single base exchange | rs62635288 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
disease causing |
Model: simple_aae, prob: 0.999999960351185 (classification due to ClinVar, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr12:88535064C>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CEP290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000552810 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_025114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | O15078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.21G>T cDNA.365G>T g.930G>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | W7C Score: 215 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs62635288
Allele 'A' was neither found in ExAC nor 1000G. known disease mutation: rs1335 (pathogenic for Nephronophthisis|Joubert syndrome 5|Leber congenital amaurosis|not provided) dbSNP NCBI variation viewer known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CI163032) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CI163032) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM061686) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CI163032) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM061686) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM061686) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K4me1, Histone, Histone 3 Lysine 4 Mono-Methylation H3K4me2, Histone, Histone 3 Lysine 4 Di-Methylation H3K4me3, Histone, Histone 3 Lysine 4 Tri-Methylation H3K9ac, Histone, Histone 3 Lysine 9 Acetylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 7440 / 7440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 2480 / 2480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 7784 / 7784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 345 / 345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 7554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 7159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 7440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 88535064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGGAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGTAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGGAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGTAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MPPNINWKEI MKVDPDDLPR QEELADNLLI SLSKVEVNEL KSEKQENVIH LFRITQSLMK MKAQEVELAL EEVEKAGEEQ AKFENQLKTK VMKLENELEM AQQSAGGRDT RFLRNEICQL EKQLEQKDRE LEDMEKELEK EKKVNEQLAL RNEEAENENS KLRRENKRLK KKNEQLCQDI IDYQKQIDSQ KETLLSRRGE DSDYRSQLSK KNYELIQYLD EIQTLTEANE KIEVQNQEMR KNLEESVQEM EKMTDEYNRM KAIVHQTDNV IDQLKKENDH YQLQVQELTD LLKSKNEEDD PIMVAVNAKV EEWKLILSSK DDEIIEYQQM LHNLREKLKN AQLDADKSNV MALQQGIQER DSQIKMLTEQ VEQYTKEMEK NTCIIEDLKN ELQRNKGAST LSQQTHMKIQ STLDILKEKT KEAERTAELA EADAREKDKE LVEALKRLKD YESGVYGLED AVVEIKNCKN QIKIRDREIE ILTKEINKLE LKISDFLDEN EALRERVGLE PKTMIDLTEF RNSKHLKQQQ YRAENQILLK EIESLEEERL DLKKKIRQMA QERGKRSATS GLTTEDLNLT ENISQGDRIS ERKLDLLSLK NMSEAQSKNE FLSRELIEKE RDLERSRTVI AKFQNKLKEL VEENKQLEEG MKEILQAIKE MQKDPDVKGG ETSLIIPSLE RLVNAIESKN AEGIFDASLH LKAQVDQLTG RNEELRQELR ESRKEAINYS QQLAKANLKI DHLEKETSLL RQSEGSNVVF KGIDLPDGIA PSSASIINSQ NEYLIHLLQE LENKEKKLKN LEDSLEDYNR KFAVIRHQQS LLYKEYLSEK ETWKTESKTI KEEKRKLEDQ VQQDAIKVKE YNNLLNALQM DSDEMKKILA ENSRKITVLQ VNEKSLIRQY TTLVELERQL RKENEKQKNE LLSMEAEVCE KIGCLQRFKE MAIFKIAALQ KVVDNSVSLS ELELANKQYN ELTAKYRDIL QKDNMLVQRT SNLEHLECEN ISLKEQVESI NKELEITKEK LHTIEQAWEQ ETKLGNESSM DKAKKSITNS DIVSISKKIT MLEMKELNER QRAEHCQKMY EHLRTSLKQM EERNFELETK FAELTKINLD AQKVEQMLRD ELADSVSKAV SDADRQRILE LEKNEMELKV EVSKLREISD IARRQVEILN AQQQSRDKEV ESLRMQLLDY QAQSDEKSLI AKLHQHNVSL QLSEATALGK LESITSKLQK MEAYNLRLEQ KLDEKEQALY YARLEGRNRA KHLRQTIQSL RRQFSGALPL AQQEKFSKTM IQLQNDKLKI MQEMKNSQQE HRNMENKTLE MELKLKGLEE LISTLKDTKG AQKVINWHMK IEELRLQELK LNRELVKDKE EIKYLNNIIS EYERTISSLE EEIVQQNKFH EERQMAWDQR EVDLERQLDI FDRQQNEILN AAQKFEEATG SIPDPSLPLP NQLEIALRKI KENIRIILET RATCKSLEEK LKEKESALRL AEQNILSRDK VINELRLRLP ATAEREKLIA ELGRKEMEPK SHHTLKIAHQ TIANMQARLN QKEEVLKKYQ RLLEKAREEQ REIVKKHEED LHILHHRLEL QADSSLNKFK QTAWDLMKQS PTPVPTNKHF IRLAEMEQTV AEQDDSLSSL LVKLKKVSQD LERQREITEL KVKEFENIKL QLQENHEDEV KKVKAEVEDL KYLLDQSQKE SQCLKSELQA QKEANSRAPT TTMRNLVERL KSQLALKEKQ QKALSRALLE LRAEMTAAAE ERIISATSQK EAHLNVQQIV DRHTRELKTQ VEDLNENLLK LKEALKTSKN RENSLTDNLN DLNNELQKKQ KAYNKILREK EEIDQENDEL KRQIKRLTSG LQGKPLTDNK QSLIEELQRK VKKLENQLEG KVEEVDLKPM KEKNAKEELI RWEEGKKWQA KIEGIRNKLK EKEGEVFTLT KQLNTLKDLF AKADKEKLTL QRKLKTTGMT VDQVLGIRAL ESEKELEELK KRNLDLENDI LYMRAHQALP RDSVVEDLHL QNRYLQEKLH ALEKQFSKDT YSKPSISGIE SDDHCQREQE LQKENLKLSS ENIELKFQLE QANKDLPRLK NQVRDLKEMC EFLKKEKAEV QRKLGHVRGS GRSGKTIPEL EKTIGLMKKV VEKVQRENEQ LKKASGILTS EKMANIEQEN EKLKAELEKL KAHLGHQLSM HYESKTKGTE KIIAENERLR KELKKETDAA EKLRIAKNNL EILNEKMTVQ LEETGKRLQF AESRGPQLEG ADSKSWKSIV VTRMYETKLK ELETDIAKKN QSITDLKQLV KEATEREQKV NKYNEDLEQQ IKILKHVPEG AETEQGLKRE LQVLRLANHQ LDKEKAELIH QIEANKDQSG AESTIPDADQ LKEKIKDLET QLKMSDLEKQ HLKEEIKKLK KELENFDPSF FEEIEDLKYN YKEEVKKNIL LEEKVKKLSE QLGVELTSPV AASEEFEDEE ESPVNFPIY* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MPPNINCKEI MKVDPDDLPR QEELADNLLI SLSKVEVNEL KSEKQENVIH LFRITQSLMK MKAQEVELAL EEVEKAGEEQ AKFENQLKTK VMKLENELEM AQQSAGGRDT RFLRNEICQL EKQLEQKDRE LEDMEKELEK EKKVNEQLAL RNEEAENENS KLRRENKRLK KKNEQLCQDI IDYQKQIDSQ KETLLSRRGE DSDYRSQLSK KNYELIQYLD EIQTLTEANE KIEVQNQEMR KNLEESVQEM EKMTDEYNRM KAIVHQTDNV IDQLKKENDH YQLQVQELTD LLKSKNEEDD PIMVAVNAKV EEWKLILSSK DDEIIEYQQM LHNLREKLKN AQLDADKSNV MALQQGIQER DSQIKMLTEQ VEQYTKEMEK NTCIIEDLKN ELQRNKGAST LSQQTHMKIQ STLDILKEKT KEAERTAELA EADAREKDKE LVEALKRLKD YESGVYGLED AVVEIKNCKN QIKIRDREIE ILTKEINKLE LKISDFLDEN EALRERVGLE PKTMIDLTEF RNSKHLKQQQ YRAENQILLK EIESLEEERL DLKKKIRQMA QERGKRSATS GLTTEDLNLT ENISQGDRIS ERKLDLLSLK NMSEAQSKNE FLSRELIEKE RDLERSRTVI AKFQNKLKEL VEENKQLEEG MKEILQAIKE MQKDPDVKGG ETSLIIPSLE RLVNAIESKN AEGIFDASLH LKAQVDQLTG RNEELRQELR ESRKEAINYS QQLAKANLKI DHLEKETSLL RQSEGSNVVF KGIDLPDGIA PSSASIINSQ NEYLIHLLQE LENKEKKLKN LEDSLEDYNR KFAVIRHQQS LLYKEYLSEK ETWKTESKTI KEEKRKLEDQ VQQDAIKVKE YNNLLNALQM DSDEMKKILA ENSRKITVLQ VNEKSLIRQY TTLVELERQL RKENEKQKNE LLSMEAEVCE KIGCLQRFKE MAIFKIAALQ KVVDNSVSLS ELELANKQYN ELTAKYRDIL QKDNMLVQRT SNLEHLECEN ISLKEQVESI NKELEITKEK LHTIEQAWEQ ETKLGNESSM DKAKKSITNS DIVSISKKIT MLEMKELNER QRAEHCQKMY EHLRTSLKQM EERNFELETK FAELTKINLD AQKVEQMLRD ELADSVSKAV SDADRQRILE LEKNEMELKV EVSKLREISD IARRQVEILN AQQQSRDKEV ESLRMQLLDY QAQSDEKSLI AKLHQHNVSL QLSEATALGK LESITSKLQK MEAYNLRLEQ KLDEKEQALY YARLEGRNRA KHLRQTIQSL RRQFSGALPL AQQEKFSKTM IQLQNDKLKI MQEMKNSQQE HRNMENKTLE MELKLKGLEE LISTLKDTKG AQKVINWHMK IEELRLQELK LNRELVKDKE EIKYLNNIIS EYERTISSLE EEIVQQNKFH EERQMAWDQR EVDLERQLDI FDRQQNEILN AAQKFEEATG SIPDPSLPLP NQLEIALRKI KENIRIILET RATCKSLEEK LKEKESALRL AEQNILSRDK VINELRLRLP ATAEREKLIA ELGRKEMEPK SHHTLKIAHQ TIANMQARLN QKEEVLKKYQ RLLEKAREEQ REIVKKHEED LHILHHRLEL QADSSLNKFK QTAWDLMKQS PTPVPTNKHF IRLAEMEQTV AEQDDSLSSL LVKLKKVSQD LERQREITEL KVKEFENIKL QLQENHEDEV KKVKAEVEDL KYLLDQSQKE SQCLKSELQA QKEANSRAPT TTMRNLVERL KSQLALKEKQ QKALSRALLE LRAEMTAAAE ERIISATSQK EAHLNVQQIV DRHTRELKTQ VEDLNENLLK LKEALKTSKN RENSLTDNLN DLNNELQKKQ KAYNKILREK EEIDQENDEL KRQIKRLTSG LQGKPLTDNK QSLIEELQRK VKKLENQLEG KVEEVDLKPM KEKNAKEELI RWEEGKKWQA KIEGIRNKLK EKEGEVFTLT KQLNTLKDLF AKADKEKLTL QRKLKTTGMT VDQVLGIRAL ESEKELEELK KRNLDLENDI LYMRAHQALP RDSVVEDLHL QNRYLQEKLH ALEKQFSKDT YSKPSISGIE SDDHCQREQE LQKENLKLSS ENIELKFQLE QANKDLPRLK NQVRDLKEMC EFLKKEKAEV QRKLGHVRGS GRSGKTIPEL EKTIGLMKKV VEKVQRENEQ LKKASGILTS EKMANIEQEN EKLKAELEKL KAHLGHQLSM HYESKTKGTE KIIAENERLR KELKKETDAA EKLRIAKNNL EILNEKMTVQ LEETGKRLQF AESRGPQLEG ADSKSWKSIV VTRMYETKLK ELETDIAKKN QSITDLKQLV KEATEREQKV NKYNEDLEQQ IKILKHVPEG AETEQGLKRE LQVLRLANHQ LDKEKAELIH QIEANKDQSG AESTIPDADQ LKEKIKDLET QLKMSDLEKQ HLKEEIKKLK KELENFDPSF FEEIEDLKYN YKEEVKKNIL LEEKVKKLSE QLGVELTSPV AASEEFEDEE ESPVNFPIY* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.71 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
disease causing |
Model: simple_aae, prob: 0.999999960351185 (classification due to ClinVar, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr12:88535064C>AN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | CEP290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000309041 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | O15078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.21G>T cDNA.119G>T g.930G>T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | W7C Score: 215 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs62635288
Allele 'A' was neither found in ExAC nor 1000G. known disease mutation: rs1335 (pathogenic for Nephronophthisis|Joubert syndrome 5|Leber congenital amaurosis|not provided) dbSNP NCBI variation viewer known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CI163032) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CI163032) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM061686) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CI163032) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM061686) known disease mutation at this position, please check HGMD for details (HGMD ID CM061686) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation H3K4me1, Histone, Histone 3 Lysine 4 Mono-Methylation H3K4me2, Histone, Histone 3 Lysine 4 Di-Methylation H3K4me3, Histone, Histone 3 Lysine 4 Tri-Methylation H3K9ac, Histone, Histone 3 Lysine 9 Acetylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 7446 / 7446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 2482 / 2482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 7544 / 7544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 99 / 99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 7314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 7165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 7446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 88535064 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGGAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGTAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGGAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | ATGCCACCTAATATAAACTGTAAAGAAATAATGAAAGTTGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MPPNINWKEI MKVDPDDLPR QEELADNLLI SLSKVEVNEL KSEKQENVIH LFRITQSLMK MKAQEVELAL EEVEKAGEEQ AKFENQLKTK VMKLENELEM AQQSAGGRDT RFLRNEICQL EKQLEQKDRE LEDMEKELEK EKKVNEQLAL RNEEAENENS KLRRENKRLK KKNEQLCQDI IDYQKQIDSQ KETLLSRRGE DSDYRSQLSK KNYELIQYLD EIQTLTEANE KIEVQNQEMR KNLEESVQEM EKMTDEYNRM KAIVHQTDNV IDQLKKENDH YQLQVQELTD LLKSKNEEDD PIMVAVNAKV EEWKLILSSK DDEIIEYQQM LHNLREKLKN AQLDADKSNV MALQQGIQER DSQIKMLTEQ VEQYTKEMEK NTCIIEDLKN ELQRNKGAST LSQQTHMKIQ STLDILKEKT KEAERTAELA EADAREKDKE LVEALKRLKD YESGVYGLED AVVEIKNCKN QIKIRDREIE ILTKEINKLE LKISDFLDEN EALRERVGLE PKTMIDLTEF RNSKHLKQQQ YRAENQILLK EASIESLEEE RLDLKKKIRQ MAQERGKRSA TSGLTTEDLN LTENISQGDR ISERKLDLLS LKNMSEAQSK NEFLSRELIE KERDLERSRT VIAKFQNKLK ELVEENKQLE EGMKEILQAI KEMQKDPDVK GGETSLIIPS LERLVNAIES KNAEGIFDAS LHLKAQVDQL TGRNEELRQE LRESRKEAIN YSQQLAKANL KIDHLEKETS LLRQSEGSNV VFKGIDLPDG IAPSSASIIN SQNEYLIHLL QELENKEKKL KNLEDSLEDY NRKFAVIRHQ QSLLYKEYLS EKETWKTESK TIKEEKRKLE DQVQQDAIKV KEYNNLLNAL QMDSDEMKKI LAENSRKITV LQVNEKSLIR QYTTLVELER QLRKENEKQK NELLSMEAEV CEKIGCLQRF KEMAIFKIAA LQKVVDNSVS LSELELANKQ YNELTAKYRD ILQKDNMLVQ RTSNLEHLEC ENISLKEQVE SINKELEITK EKLHTIEQAW EQETKLGNES SMDKAKKSIT NSDIVSISKK ITMLEMKELN ERQRAEHCQK MYEHLRTSLK QMEERNFELE TKFAELTKIN LDAQKVEQML RDELADSVSK AVSDADRQRI LELEKNEMEL KVEVSKLREI SDIARRQVEI LNAQQQSRDK EVESLRMQLL DYQAQSDEKS LIAKLHQHNV SLQLSEATAL GKLESITSKL QKMEAYNLRL EQKLDEKEQA LYYARLEGRN RAKHLRQTIQ SLRRQFSGAL PLAQQEKFSK TMIQLQNDKL KIMQEMKNSQ QEHRNMENKT LEMELKLKGL EELISTLKDT KGAQKVINWH MKIEELRLQE LKLNRELVKD KEEIKYLNNI ISEYERTISS LEEEIVQQNK FHEERQMAWD QREVDLERQL DIFDRQQNEI LNAAQKFEEA TGSIPDPSLP LPNQLEIALR KIKENIRIIL ETRATCKSLE EKLKEKESAL RLAEQNILSR DKVINELRLR LPATAEREKL IAELGRKEME PKSHHTLKIA HQTIANMQAR LNQKEEVLKK YQRLLEKARE EQREIVKKHE EDLHILHHRL ELQADSSLNK FKQTAWDLMK QSPTPVPTNK HFIRLAEMEQ TVAEQDDSLS SLLVKLKKVS QDLERQREIT ELKVKEFENI KLQLQENHED EVKKVKAEVE DLKYLLDQSQ KESQCLKSEL QAQKEANSRA PTTTMRNLVE RLKSQLALKE KQQKALSRAL LELRAEMTAA AEERIISATS QKEAHLNVQQ IVDRHTRELK TQVEDLNENL LKLKEALKTS KNRENSLTDN LNDLNNELQK KQKAYNKILR EKEEIDQEND ELKRQIKRLT SGLQGKPLTD NKQSLIEELQ RKVKKLENQL EGKVEEVDLK PMKEKNAKEE LIRWEEGKKW QAKIEGIRNK LKEKEGEVFT LTKQLNTLKD LFAKADKEKL TLQRKLKTTG MTVDQVLGIR ALESEKELEE LKKRNLDLEN DILYMRAHQA LPRDSVVEDL HLQNRYLQEK LHALEKQFSK DTYSKPSISG IESDDHCQRE QELQKENLKL SSENIELKFQ LEQANKDLPR LKNQVRDLKE MCEFLKKEKA EVQRKLGHVR GSGRSGKTIP ELEKTIGLMK KVVEKVQREN EQLKKASGIL TSEKMANIEQ ENEKLKAELE KLKAHLGHQL SMHYESKTKG TEKIIAENER LRKELKKETD AAEKLRIAKN NLEILNEKMT VQLEETGKRL QFAESRGPQL EGADSKSWKS IVVTRMYETK LKELETDIAK KNQSITDLKQ LVKEATEREQ KVNKYNEDLE QQIKILKHVP EGAETEQGLK RELQVLRLAN HQLDKEKAEL IHQIEANKDQ SGAESTIPDA DQLKEKIKDL ETQLKMSDLE KQHLKEEIKK LKKELENFDP SFFEEIEDLK YNYKEEVKKN ILLEEKVKKL SEQLGVELTS PVAASEEFED EEESPVNFPI Y* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MPPNINCKEI MKVDPDDLPR QEELADNLLI SLSKVEVNEL KSEKQENVIH LFRITQSLMK MKAQEVELAL EEVEKAGEEQ AKFENQLKTK VMKLENELEM AQQSAGGRDT RFLRNEICQL EKQLEQKDRE LEDMEKELEK EKKVNEQLAL RNEEAENENS KLRRENKRLK KKNEQLCQDI IDYQKQIDSQ KETLLSRRGE DSDYRSQLSK KNYELIQYLD EIQTLTEANE KIEVQNQEMR KNLEESVQEM EKMTDEYNRM KAIVHQTDNV IDQLKKENDH YQLQVQELTD LLKSKNEEDD PIMVAVNAKV EEWKLILSSK DDEIIEYQQM LHNLREKLKN AQLDADKSNV MALQQGIQER DSQIKMLTEQ VEQYTKEMEK NTCIIEDLKN ELQRNKGAST LSQQTHMKIQ STLDILKEKT KEAERTAELA EADAREKDKE LVEALKRLKD YESGVYGLED AVVEIKNCKN QIKIRDREIE ILTKEINKLE LKISDFLDEN EALRERVGLE PKTMIDLTEF RNSKHLKQQQ YRAENQILLK EASIESLEEE RLDLKKKIRQ MAQERGKRSA TSGLTTEDLN LTENISQGDR ISERKLDLLS LKNMSEAQSK NEFLSRELIE KERDLERSRT VIAKFQNKLK ELVEENKQLE EGMKEILQAI KEMQKDPDVK GGETSLIIPS LERLVNAIES KNAEGIFDAS LHLKAQVDQL TGRNEELRQE LRESRKEAIN YSQQLAKANL KIDHLEKETS LLRQSEGSNV VFKGIDLPDG IAPSSASIIN SQNEYLIHLL QELENKEKKL KNLEDSLEDY NRKFAVIRHQ QSLLYKEYLS EKETWKTESK TIKEEKRKLE DQVQQDAIKV KEYNNLLNAL QMDSDEMKKI LAENSRKITV LQVNEKSLIR QYTTLVELER QLRKENEKQK NELLSMEAEV CEKIGCLQRF KEMAIFKIAA LQKVVDNSVS LSELELANKQ YNELTAKYRD ILQKDNMLVQ RTSNLEHLEC ENISLKEQVE SINKELEITK EKLHTIEQAW EQETKLGNES SMDKAKKSIT NSDIVSISKK ITMLEMKELN ERQRAEHCQK MYEHLRTSLK QMEERNFELE TKFAELTKIN LDAQKVEQML RDELADSVSK AVSDADRQRI LELEKNEMEL KVEVSKLREI SDIARRQVEI LNAQQQSRDK EVESLRMQLL DYQAQSDEKS LIAKLHQHNV SLQLSEATAL GKLESITSKL QKMEAYNLRL EQKLDEKEQA LYYARLEGRN RAKHLRQTIQ SLRRQFSGAL PLAQQEKFSK TMIQLQNDKL KIMQEMKNSQ QEHRNMENKT LEMELKLKGL EELISTLKDT KGAQKVINWH MKIEELRLQE LKLNRELVKD KEEIKYLNNI ISEYERTISS LEEEIVQQNK FHEERQMAWD QREVDLERQL DIFDRQQNEI LNAAQKFEEA TGSIPDPSLP LPNQLEIALR KIKENIRIIL ETRATCKSLE EKLKEKESAL RLAEQNILSR DKVINELRLR LPATAEREKL IAELGRKEME PKSHHTLKIA HQTIANMQAR LNQKEEVLKK YQRLLEKARE EQREIVKKHE EDLHILHHRL ELQADSSLNK FKQTAWDLMK QSPTPVPTNK HFIRLAEMEQ TVAEQDDSLS SLLVKLKKVS QDLERQREIT ELKVKEFENI KLQLQENHED EVKKVKAEVE DLKYLLDQSQ KESQCLKSEL QAQKEANSRA PTTTMRNLVE RLKSQLALKE KQQKALSRAL LELRAEMTAA AEERIISATS QKEAHLNVQQ IVDRHTRELK TQVEDLNENL LKLKEALKTS KNRENSLTDN LNDLNNELQK KQKAYNKILR EKEEIDQEND ELKRQIKRLT SGLQGKPLTD NKQSLIEELQ RKVKKLENQL EGKVEEVDLK PMKEKNAKEE LIRWEEGKKW QAKIEGIRNK LKEKEGEVFT LTKQLNTLKD LFAKADKEKL TLQRKLKTTG MTVDQVLGIR ALESEKELEE LKKRNLDLEN DILYMRAHQA LPRDSVVEDL HLQNRYLQEK LHALEKQFSK DTYSKPSISG IESDDHCQRE QELQKENLKL SSENIELKFQ LEQANKDLPR LKNQVRDLKE MCEFLKKEKA EVQRKLGHVR GSGRSGKTIP ELEKTIGLMK KVVEKVQREN EQLKKASGIL TSEKMANIEQ ENEKLKAELE KLKAHLGHQL SMHYESKTKG TEKIIAENER LRKELKKETD AAEKLRIAKN NLEILNEKMT VQLEETGKRL QFAESRGPQL EGADSKSWKS IVVTRMYETK LKELETDIAK KNQSITDLKQ LVKEATEREQ KVNKYNEDLE QQIKILKHVP EGAETEQGLK RELQVLRLAN HQLDKEKAEL IHQIEANKDQ SGAESTIPDA DQLKEKIKDL ETQLKMSDLE KQHLKEEIKK LKKELENFDP SFFEEIEDLK YNYKEEVKKN ILLEEKVKKL SEQLGVELTS PVAASEEFED EEESPVNFPI Y* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 1.11 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||