MutationTaster - study a chromosomal position |
MTQE documentation |
genesymbol | prediction | probability | model | prediction problem | splicing | ClinVar | amino acid changes | variant type | dbSNP ID | protein length | file |
GOLGB1 | polymorphism_automatic | 3.66040531218914e-13 | simple_aae | G1765D | single base exchange | rs1127412 | show file | ||||
GOLGB1 | polymorphism_automatic | 3.66040531218914e-13 | simple_aae | G1770D | single base exchange | rs1127412 | show file |
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999999634 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr3:121414061C>TN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | GOLGB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000340645 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001256488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q14789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.5294G>A cDNA.5420G>A g.54542G>A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | G1765D Score: 94 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs1127412
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 1474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 9780 / 9780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 3260 / 3260 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 9906 / 9906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 127 / 127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 9772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 9595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 9780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 5294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 54542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 121414061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGGTAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGATAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGGTAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGATAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLSRLSGLAN VVLHELSGDD DTDQNMRAPL DPELHQESDM EFNNTTQEDV QERLAYAEQL VVELKDIIRQ KDVQLQQKDE ALQEERKAAD NKIKKLKLHA KAKLTSLNKY IEEMKAQGGT VLPTEPQSEE QLSKHDKSST EEEMEIEKIK HKLQEKEELI STLQAQLTQA QAEQPAQSST EMEEFVMMKQ QLQEKEEFIS TLQAQLSQTQ AEQAAQQVVR EKDARFETQV RLHEDELLQL VTQADVETEM QQKLRVLQRK LEEHEESLVG RAQVVDLLQQ ELTAAEQRNQ ILSQQLQQME AEHNTLRNTV ETEREESKIL LEKMELEVAE RKLSFHNLQE EMHHLLEQFE QAGQAQAELE SRYSALEQKH KAEMEEKTSH ILSLQKTGQE LQSACDALKD QNSKLLQDKN EQAVQSAQTI QQLEDQLQQK SKEISQFLNR LPLQQHETAS QTSFPDVYNE GTQAVTEENI ASLQKRVVEL ENEKGALLLS SIELEELKAE NEKLSSQITL LEAQNRTGEA DREVSEISIV DIANKRSSSA EESGQDVLEN TFSQKHKELS VLLLEMKEAQ EEIAFLKLQL QGKRAEEADH EVLDQKEMKQ MEGEGIAPIK MKVFLEDTGQ DFPLMPNEES SLPAVEKEQA STEHQSRTSE EISLNDAGVE LKSTKQDGDK SLSAVPDIGQ CHQDELERLK SQILELELNF HKAQEIYEKN LDEKAKEISN LNQLIEEFKK NADNNSSAFT ALSEERDQLL SQVKELSMVT ELRAQVKQLE MNLAEAERQR RLDYESQTAH DNLLTEQIHS LSIEAKSKDV KIEVLQNELD DVQLQFSEQS TLIRSLQSQL QNKESEVLEG AERVRHISSK VEELSQALSQ KELEITKMDQ LLLEKKRDVE TLQQTIEEKD QQVTEISFSM TEKMVQLNEE KFSLGVEIKT LKEQLNLLSR AEEAKKEQVE EDNEVSSGLK QNYDEMSPAG QISKEELQHE FDLLKKENEQ RKRKLQAALI NRKELLQRVS RLEEELANLK DESKKEIPLS ETERGEVEED KENKEYSEKC VTSKCQEIEI YLKQTISEKE VELQHIRKDL EEKLAAEEQF QALVKQMNQT LQDKTNQIDL LQAEISENQA IIQKLITSNT DASDGDSVAL VKETVVISPP CTGSSEHWKP ELEEKILALE KEKEQLQKKL QEALTSRKAI LKKAQEKERH LREELKQQKD DYNRLQEQFD EQSKENENIG DQLRQLQIQV RESIDGKLPS TDQQESCSST PGLEEPLFKA TEQHHTQPVL ESNLCPDWPS HSEDASALQG GTSVAQIKAQ LKEIEAEKVE LELKVSSTTS ELTKKSEEVF QLQEQINKQG LEIESLKTVS HEAEVHAESL QQKLESSQLQ IAGLEHLREL QPKLDELQKL ISKKEEDVSY LSGQLSEKEA ALTKIQTEII EQEDLIKALH TQLEMQAKEH DERIKQLQVE LCEMKQKPEE IGEESRAKQQ IQRKLQAALI SRKEALKENK SLQEELSLAR GTIERLTKSL ADVESQVSAQ NKEKDTVLGR LALLQEERDK LITEMDRSLL ENQSLSSSCE SLKLALEGLT EDKEKLVKEI ESLKSSKIAE STEWQEKHKE LQKEYEILLQ SYENVSNEAE RIQHVVEAVR QEKQELYGKL RSTEANKKET EKQLQEAEQE MEEMKEKMRK FAKSKQQKIL ELEEENDRLR AEVHPAGDTA KECMETLLSS NASMKEELER VKMEYETLSK KFQSLMSEKD SLSEEVQDLK HQIEGNVSKQ ANLEATEKHD NQTNVTEEGT QSIPGETEEQ DSLSMSTRPT CSESVPSAKS ANPAVSKDFS SHDEINNYLQ QIDQLKERIA GLEEEKQKNK EFSQTLENEK NTLLSQISTK DGELKMLQEE VTKMNLLNQQ IQEELSRVTK LKETAEEEKD DLEERLMNQL AELNGSIGNY CQDVTDAQIK NELLESEMKN LKKCVSELEE EKQQLVKEKT KVESEIRKEY LEKIQGAQKE PGNKSHAKEL QELLKEKQQE VKQLQKDCIR YQEKISALER TVKALEFVQT ESQKDLEITK ENLAQAVEHR KKAQAELASF KVLLDDTQSE AARVLADNLK LKKELQSNKE SVKSQMKQKD EDLERRLEQA EEKHLKEKKN MQEKLDALRR EKVHLEETIG EIQVTLNKKD KEVQQLQENL DSTVTQLAAF TKSMSSLQDD RDRVIDEAKK WERKFSDAIQ SKEEEIRLKE DNCSVLKDQL RQMSIHMEEL KINISRLEHD KQIWESKAQT EVQLQQKVCD TLQGENKELL SQLEETRHLY HSSQNELAKL ESELKSLKDQ LTDLSNSLEK CKEQKGNLEG IIRQQEADIQ NSKFSYEQLE TDLQASRELT SRLHEEINMK EQKIISLLSG KEEAIQVAIA ELRQQHDKEI KELENLLSQE EEENIVLEEE NKKAVDKTNQ LMETLKTIKK ENIQQKAQLD SFVKSMSSLQ NDRDRIVGDY QQLEERHLSI ILEKDQLIQE AAAENNKLKE EIRGLRSHMD DLNSENAKLD AELIQYREDL NQVITIKDSQ QKQLLEVQLQ QNKELENKYA KLEEKLKESE EANEDLRRSF NALQEEKQDL SKEIESLKVS ISQLTRQVTA LQEEGTLGLY HAQLKVKEEE VHRLSALFSS SQKRIAELEE ELVCVQKEAA KKVGEIEDKL KKELKHLHHD AGIMRNETET AEERVAELAR DLVEMEQKLL MVTKENKGLT AQIQSFGRSM SSLQNSRDHA NEELDELKRK YDASLKELAQ LKEQGLLNRE RDALLSETAF SMNSTEENSL SHLEKLNQQL LSKDEQLLHL SSQLEDSYNQ VQSFSKAMAS LQNERDHLWN ELEKFRKSEE GKQRSAAQPS TSPAEVQSLK KAMSSLQNDR DRLLKELKNL QQQYLQINQE ITELHPLKAQ LQEYQDKTKA FQIMQEELRQ ENLSWQHELH QLRMEKSSWE IHERRMKEQY LMAISDKDQQ LSHLQNLIRE LRSSSSQTQP LKVQYQRQAS PETSASPDGS QNLVYETELL RTQLNDSLKE IHQKELRIQQ LNSNFSQLLE EKNTLSIQLC DTSQSLRENQ QHYGDLLNHC AVLEKQVQEL QAGPLNIDVA PGAPQEKNGV HRKSDPEELR EPQQSFSEAQ QQLCNTRQEV NELRKLLEEE RDQRVAAENA LSVAEEQIRR LEHSEWDSSR TPIIGSCGTQ EQALLIDLTS NSCRRTRSGV GWKRVLRSLC HSRTRVPLLA AIYFLMIHVL LILCFTGHL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MLSRLSGLAN VVLHELSGDD DTDQNMRAPL DPELHQESDM EFNNTTQEDV QERLAYAEQL VVELKDIIRQ KDVQLQQKDE ALQEERKAAD NKIKKLKLHA KAKLTSLNKY IEEMKAQGGT VLPTEPQSEE QLSKHDKSST EEEMEIEKIK HKLQEKEELI STLQAQLTQA QAEQPAQSST EMEEFVMMKQ QLQEKEEFIS TLQAQLSQTQ AEQAAQQVVR EKDARFETQV RLHEDELLQL VTQADVETEM QQKLRVLQRK LEEHEESLVG RAQVVDLLQQ ELTAAEQRNQ ILSQQLQQME AEHNTLRNTV ETEREESKIL LEKMELEVAE RKLSFHNLQE EMHHLLEQFE QAGQAQAELE SRYSALEQKH KAEMEEKTSH ILSLQKTGQE LQSACDALKD QNSKLLQDKN EQAVQSAQTI QQLEDQLQQK SKEISQFLNR LPLQQHETAS QTSFPDVYNE GTQAVTEENI ASLQKRVVEL ENEKGALLLS SIELEELKAE NEKLSSQITL LEAQNRTGEA DREVSEISIV DIANKRSSSA EESGQDVLEN TFSQKHKELS VLLLEMKEAQ EEIAFLKLQL QGKRAEEADH EVLDQKEMKQ MEGEGIAPIK MKVFLEDTGQ DFPLMPNEES SLPAVEKEQA STEHQSRTSE EISLNDAGVE LKSTKQDGDK SLSAVPDIGQ CHQDELERLK SQILELELNF HKAQEIYEKN LDEKAKEISN LNQLIEEFKK NADNNSSAFT ALSEERDQLL SQVKELSMVT ELRAQVKQLE MNLAEAERQR RLDYESQTAH DNLLTEQIHS LSIEAKSKDV KIEVLQNELD DVQLQFSEQS TLIRSLQSQL QNKESEVLEG AERVRHISSK VEELSQALSQ KELEITKMDQ LLLEKKRDVE TLQQTIEEKD QQVTEISFSM TEKMVQLNEE KFSLGVEIKT LKEQLNLLSR AEEAKKEQVE EDNEVSSGLK QNYDEMSPAG QISKEELQHE FDLLKKENEQ RKRKLQAALI NRKELLQRVS RLEEELANLK DESKKEIPLS ETERGEVEED KENKEYSEKC VTSKCQEIEI YLKQTISEKE VELQHIRKDL EEKLAAEEQF QALVKQMNQT LQDKTNQIDL LQAEISENQA IIQKLITSNT DASDGDSVAL VKETVVISPP CTGSSEHWKP ELEEKILALE KEKEQLQKKL QEALTSRKAI LKKAQEKERH LREELKQQKD DYNRLQEQFD EQSKENENIG DQLRQLQIQV RESIDGKLPS TDQQESCSST PGLEEPLFKA TEQHHTQPVL ESNLCPDWPS HSEDASALQG GTSVAQIKAQ LKEIEAEKVE LELKVSSTTS ELTKKSEEVF QLQEQINKQG LEIESLKTVS HEAEVHAESL QQKLESSQLQ IAGLEHLREL QPKLDELQKL ISKKEEDVSY LSGQLSEKEA ALTKIQTEII EQEDLIKALH TQLEMQAKEH DERIKQLQVE LCEMKQKPEE IGEESRAKQQ IQRKLQAALI SRKEALKENK SLQEELSLAR GTIERLTKSL ADVESQVSAQ NKEKDTVLGR LALLQEERDK LITEMDRSLL ENQSLSSSCE SLKLALEGLT EDKEKLVKEI ESLKSSKIAE STEWQEKHKE LQKEYEILLQ SYENVSNEAE RIQHVVEAVR QEKQELYGKL RSTEANKKET EKQLQEAEQE MEEMKEKMRK FAKSKQQKIL ELEEENDRLR AEVHPAGDTA KECMETLLSS NASMKEELER VKMEYETLSK KFQSLMSEKD SLSEEVQDLK HQIEDNVSKQ ANLEATEKHD NQTNVTEEGT QSIPGETEEQ DSLSMSTRPT CSESVPSAKS ANPAVSKDFS SHDEINNYLQ QIDQLKERIA GLEEEKQKNK EFSQTLENEK NTLLSQISTK DGELKMLQEE VTKMNLLNQQ IQEELSRVTK LKETAEEEKD DLEERLMNQL AELNGSIGNY CQDVTDAQIK NELLESEMKN LKKCVSELEE EKQQLVKEKT KVESEIRKEY LEKIQGAQKE PGNKSHAKEL QELLKEKQQE VKQLQKDCIR YQEKISALER TVKALEFVQT ESQKDLEITK ENLAQAVEHR KKAQAELASF KVLLDDTQSE AARVLADNLK LKKELQSNKE SVKSQMKQKD EDLERRLEQA EEKHLKEKKN MQEKLDALRR EKVHLEETIG EIQVTLNKKD KEVQQLQENL DSTVTQLAAF TKSMSSLQDD RDRVIDEAKK WERKFSDAIQ SKEEEIRLKE DNCSVLKDQL RQMSIHMEEL KINISRLEHD KQIWESKAQT EVQLQQKVCD TLQGENKELL SQLEETRHLY HSSQNELAKL ESELKSLKDQ LTDLSNSLEK CKEQKGNLEG IIRQQEADIQ NSKFSYEQLE TDLQASRELT SRLHEEINMK EQKIISLLSG KEEAIQVAIA ELRQQHDKEI KELENLLSQE EEENIVLEEE NKKAVDKTNQ LMETLKTIKK ENIQQKAQLD SFVKSMSSLQ NDRDRIVGDY QQLEERHLSI ILEKDQLIQE AAAENNKLKE EIRGLRSHMD DLNSENAKLD AELIQYREDL NQVITIKDSQ QKQLLEVQLQ QNKELENKYA KLEEKLKESE EANEDLRRSF NALQEEKQDL SKEIESLKVS ISQLTRQVTA LQEEGTLGLY HAQLKVKEEE VHRLSALFSS SQKRIAELEE ELVCVQKEAA KKVGEIEDKL KKELKHLHHD AGIMRNETET AEERVAELAR DLVEMEQKLL MVTKENKGLT AQIQSFGRSM SSLQNSRDHA NEELDELKRK YDASLKELAQ LKEQGLLNRE RDALLSETAF SMNSTEENSL SHLEKLNQQL LSKDEQLLHL SSQLEDSYNQ VQSFSKAMAS LQNERDHLWN ELEKFRKSEE GKQRSAAQPS TSPAEVQSLK KAMSSLQNDR DRLLKELKNL QQQYLQINQE ITELHPLKAQ LQEYQDKTKA FQIMQEELRQ ENLSWQHELH QLRMEKSSWE IHERRMKEQY LMAISDKDQQ LSHLQNLIRE LRSSSSQTQP LKVQYQRQAS PETSASPDGS QNLVYETELL RTQLNDSLKE IHQKELRIQQ LNSNFSQLLE EKNTLSIQLC DTSQSLRENQ QHYGDLLNHC AVLEKQVQEL QAGPLNIDVA PGAPQEKNGV HRKSDPEELR EPQQSFSEAQ QQLCNTRQEV NELRKLLEEE RDQRVAAENA LSVAEEQIRR LEHSEWDSSR TPIIGSCGTQ EQALLIDLTS NSCRRTRSGV GWKRVLRSLC HSRTRVPLLA AIYFLMIHVL LILCFTGHL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.95 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutation t@sting |
documentation |
Prediction |
polymorphism |
Model: simple_aae, prob: 0.999999999999634 (classification due to TGP/ExAC, real probability is shown anyway) (explain) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
|
hyperlink | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
analysed issue | analysis result | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
name of alteration | no title | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration (phys. location) | chr3:121414061C>TN/A show variant in all transcripts IGV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HGNC symbol | GOLGB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl transcript ID | ENST00000393667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank transcript ID | NM_001256486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt peptide | Q14789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration type | single base exchange | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
alteration region | CDS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA changes | c.5309G>A cDNA.5420G>A g.54542G>A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA changes | G1770D Score: 94 explain score(s) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position(s) of altered AA if AA alteration in CDS | 1770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
frameshift | no | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
known variant | Reference ID: rs1127412
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
regulatory features | H3K36me3, Histone, Histone 3 Lysine 36 Tri-Methylation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
phyloP / phastCons |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
splice sites |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
distance from splice site | 1474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kozak consensus sequence altered? | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation protein level for non-synonymous changes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
protein features |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of protein | normal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AA sequence altered | yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu CDS | 9810 / 9810 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position (AA) of stopcodon in wt / mu AA sequence | 3270 / 3270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of stopcodon in wt / mu cDNA | 9921 / 9921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
poly(A) signal | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
conservation nucleotide level for all changes - no scoring up to now | N/A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
position of start ATG in wt / mu cDNA | 112 / 112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
strand | -1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
last intron/exon boundary | 9787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
theoretical NMD boundary in CDS | 9625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
length of CDS | 9810 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
coding sequence (CDS) position | 5309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
cDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 5420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
gDNA position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 54542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chromosomal position (for ins/del: last normal base / first normal base) | 121414061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original gDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGGTAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered gDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGATAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
original cDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGGTAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
altered cDNA sequence snippet | TTTAAAGCATCAGATAGAAGATAATGTATCTAAACAAGCTA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
wildtype AA sequence | MLSRLSGLAN VVLHELSGDD DTDQNMRAPL DPELHQESDM EFNNTTQEDV QERLAYAEQL VVELKDIIRQ KDVQLQQKDE ALQEERKAAD NKIKKLKLHA KAKLTSLNKY IEEMKAQGGT VLPTEPQSEE QLSKHDKSST EEEMEIEKIK HKLQEKEELI STLQAQLTQA QAEQPAQSST EMEEFVMMKQ QLQEKEEFIS TLQAQLSQTQ AEQAAQLSSM QQVVREKDAR FETQVRLHED ELLQLVTQAD VETEMQQKLR VLQRKLEEHE ESLVGRAQVV DLLQQELTAA EQRNQILSQQ LQQMEAEHNT LRNTVETERE ESKILLEKME LEVAERKLSF HNLQEEMHHL LEQFEQAGQA QAELESRYSA LEQKHKAEME EKTSHILSLQ KTGQELQSAC DALKDQNSKL LQDKNEQAVQ SAQTIQQLED QLQQKSKEIS QFLNRLPLQQ HETASQTSFP DVYNEGTQAV TEENIASLQK RVVELENEKG ALLLSSIELE ELKAENEKLS SQITLLEAQN RTGEADREVS EISIVDIANK RSSSAEESGQ DVLENTFSQK HKELSVLLLE MKEAQEEIAF LKLQLQGKRA EEADHEVLDQ KEMKQMEGEG IAPIKMKVFL EDTGQDFPLM PNEESSLPAV EKEQASTEHQ SRTSEEISLN DAGVELKSTK QDGDKSLSAV PDIGQCHQDE LERLKSQILE LELNFHKAQE IYEKNLDEKA KEISNLNQLI EEFKKNADNN SSAFTALSEE RDQLLSQVKE LSMVTELRAQ VKQLEMNLAE AERQRRLDYE SQTAHDNLLT EQIHSLSIEA KSKDVKIEVL QNELDDVQLQ FSEQSTLIRS LQSQLQNKES EVLEGAERVR HISSKVEELS QALSQKELEI TKMDQLLLEK KRDVETLQQT IEEKDQQVTE ISFSMTEKMV QLNEEKFSLG VEIKTLKEQL NLLSRAEEAK KEQVEEDNEV SSGLKQNYDE MSPAGQISKE ELQHEFDLLK KENEQRKRKL QAALINRKEL LQRVSRLEEE LANLKDESKK EIPLSETERG EVEEDKENKE YSEKCVTSKC QEIEIYLKQT ISEKEVELQH IRKDLEEKLA AEEQFQALVK QMNQTLQDKT NQIDLLQAEI SENQAIIQKL ITSNTDASDG DSVALVKETV VISPPCTGSS EHWKPELEEK ILALEKEKEQ LQKKLQEALT SRKAILKKAQ EKERHLREEL KQQKDDYNRL QEQFDEQSKE NENIGDQLRQ LQIQVRESID GKLPSTDQQE SCSSTPGLEE PLFKATEQHH TQPVLESNLC PDWPSHSEDA SALQGGTSVA QIKAQLKEIE AEKVELELKV SSTTSELTKK SEEVFQLQEQ INKQGLEIES LKTVSHEAEV HAESLQQKLE SSQLQIAGLE HLRELQPKLD ELQKLISKKE EDVSYLSGQL SEKEAALTKI QTEIIEQEDL IKALHTQLEM QAKEHDERIK QLQVELCEMK QKPEEIGEES RAKQQIQRKL QAALISRKEA LKENKSLQEE LSLARGTIER LTKSLADVES QVSAQNKEKD TVLGRLALLQ EERDKLITEM DRSLLENQSL SSSCESLKLA LEGLTEDKEK LVKEIESLKS SKIAESTEWQ EKHKELQKEY EILLQSYENV SNEAERIQHV VEAVRQEKQE LYGKLRSTEA NKKETEKQLQ EAEQEMEEMK EKMRKFAKSK QQKILELEEE NDRLRAEVHP AGDTAKECME TLLSSNASMK EELERVKMEY ETLSKKFQSL MSEKDSLSEE VQDLKHQIEG NVSKQANLEA TEKHDNQTNV TEEGTQSIPG ETEEQDSLSM STRPTCSESV PSAKSANPAV SKDFSSHDEI NNYLQQIDQL KERIAGLEEE KQKNKEFSQT LENEKNTLLS QISTKDGELK MLQEEVTKMN LLNQQIQEEL SRVTKLKETA EEEKDDLEER LMNQLAELNG SIGNYCQDVT DAQIKNELLE SEMKNLKKCV SELEEEKQQL VKEKTKVESE IRKEYLEKIQ GAQKEPGNKS HAKELQELLK EKQQEVKQLQ KDCIRYQEKI SALERTVKAL EFVQTESQKD LEITKENLAQ AVEHRKKAQA ELASFKVLLD DTQSEAARVL ADNLKLKKEL QSNKESVKSQ MKQKDEDLER RLEQAEEKHL KEKKNMQEKL DALRREKVHL EETIGEIQVT LNKKDKEVQQ LQENLDSTVT QLAAFTKSMS SLQDDRDRVI DEAKKWERKF SDAIQSKEEE IRLKEDNCSV LKDQLRQMSI HMEELKINIS RLEHDKQIWE SKAQTEVQLQ QKVCDTLQGE NKELLSQLEE TRHLYHSSQN ELAKLESELK SLKDQLTDLS NSLEKCKEQK GNLEGIIRQQ EADIQNSKFS YEQLETDLQA SRELTSRLHE EINMKEQKII SLLSGKEEAI QVAIAELRQQ HDKEIKELEN LLSQEEEENI VLEEENKKAV DKTNQLMETL KTIKKENIQQ KAQLDSFVKS MSSLQNDRDR IVGDYQQLEE RHLSIILEKD QLIQEAAAEN NKLKEEIRGL RSHMDDLNSE NAKLDAELIQ YREDLNQVIT IKDSQQKQLL EVQLQQNKEL ENKYAKLEEK LKESEEANED LRRSFNALQE EKQDLSKEIE SLKVSISQLT RQVTALQEEG TLGLYHAQLK VKEEEVHRLS ALFSSSQKRI AELEEELVCV QKEAAKKVGE IEDKLKKELK HLHHDAGIMR NETETAEERV AELARDLVEM EQKLLMVTKE NKGLTAQIQS FGRSMSSLQN SRDHANEELD ELKRKYDASL KELAQLKEQG LLNRERDALL SETAFSMNST EENSLSHLEK LNQQLLSKDE QLLHLSSQLE DSYNQVQSFS KAMASLQNER DHLWNELEKF RKSEEGKQRS AAQPSTSPAE VQSLKKAMSS LQNDRDRLLK ELKNLQQQYL QINQEITELH PLKAQLQEYQ DKTKAFQIMQ EELRQENLSW QHELHQLRME KSSWEIHERR MKEQYLMAIS DKDQQLSHLQ NLIRELRSSS SQTQPLKVQY QRQASPETSA SPDGSQNLVY ETELLRTQLN DSLKEIHQKE LRIQQLNSNF SQLLEEKNTL SIQLCDTSQS LRENQQHYGD LLNHCAVLEK QVQELQAVSK EKGPLNIDVA PGAPQEKNGV HRKSDPEELR EPQQSFSEAQ QQLCNTRQEV NELRKLLEEE RDQRVAAENA LSVAEEQIRR LEHSEWDSSR TPIIGSCGTQ EQALLIDLTS NSCRRTRSGV GWKRVLRSLC HSRTRVPLLA AIYFLMIHVL LILCFTGHL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mutated AA sequence | MLSRLSGLAN VVLHELSGDD DTDQNMRAPL DPELHQESDM EFNNTTQEDV QERLAYAEQL VVELKDIIRQ KDVQLQQKDE ALQEERKAAD NKIKKLKLHA KAKLTSLNKY IEEMKAQGGT VLPTEPQSEE QLSKHDKSST EEEMEIEKIK HKLQEKEELI STLQAQLTQA QAEQPAQSST EMEEFVMMKQ QLQEKEEFIS TLQAQLSQTQ AEQAAQLSSM QQVVREKDAR FETQVRLHED ELLQLVTQAD VETEMQQKLR VLQRKLEEHE ESLVGRAQVV DLLQQELTAA EQRNQILSQQ LQQMEAEHNT LRNTVETERE ESKILLEKME LEVAERKLSF HNLQEEMHHL LEQFEQAGQA QAELESRYSA LEQKHKAEME EKTSHILSLQ KTGQELQSAC DALKDQNSKL LQDKNEQAVQ SAQTIQQLED QLQQKSKEIS QFLNRLPLQQ HETASQTSFP DVYNEGTQAV TEENIASLQK RVVELENEKG ALLLSSIELE ELKAENEKLS SQITLLEAQN RTGEADREVS EISIVDIANK RSSSAEESGQ DVLENTFSQK HKELSVLLLE MKEAQEEIAF LKLQLQGKRA EEADHEVLDQ KEMKQMEGEG IAPIKMKVFL EDTGQDFPLM PNEESSLPAV EKEQASTEHQ SRTSEEISLN DAGVELKSTK QDGDKSLSAV PDIGQCHQDE LERLKSQILE LELNFHKAQE IYEKNLDEKA KEISNLNQLI EEFKKNADNN SSAFTALSEE RDQLLSQVKE LSMVTELRAQ VKQLEMNLAE AERQRRLDYE SQTAHDNLLT EQIHSLSIEA KSKDVKIEVL QNELDDVQLQ FSEQSTLIRS LQSQLQNKES EVLEGAERVR HISSKVEELS QALSQKELEI TKMDQLLLEK KRDVETLQQT IEEKDQQVTE ISFSMTEKMV QLNEEKFSLG VEIKTLKEQL NLLSRAEEAK KEQVEEDNEV SSGLKQNYDE MSPAGQISKE ELQHEFDLLK KENEQRKRKL QAALINRKEL LQRVSRLEEE LANLKDESKK EIPLSETERG EVEEDKENKE YSEKCVTSKC QEIEIYLKQT ISEKEVELQH IRKDLEEKLA AEEQFQALVK QMNQTLQDKT NQIDLLQAEI SENQAIIQKL ITSNTDASDG DSVALVKETV VISPPCTGSS EHWKPELEEK ILALEKEKEQ LQKKLQEALT SRKAILKKAQ EKERHLREEL KQQKDDYNRL QEQFDEQSKE NENIGDQLRQ LQIQVRESID GKLPSTDQQE SCSSTPGLEE PLFKATEQHH TQPVLESNLC PDWPSHSEDA SALQGGTSVA QIKAQLKEIE AEKVELELKV SSTTSELTKK SEEVFQLQEQ INKQGLEIES LKTVSHEAEV HAESLQQKLE SSQLQIAGLE HLRELQPKLD ELQKLISKKE EDVSYLSGQL SEKEAALTKI QTEIIEQEDL IKALHTQLEM QAKEHDERIK QLQVELCEMK QKPEEIGEES RAKQQIQRKL QAALISRKEA LKENKSLQEE LSLARGTIER LTKSLADVES QVSAQNKEKD TVLGRLALLQ EERDKLITEM DRSLLENQSL SSSCESLKLA LEGLTEDKEK LVKEIESLKS SKIAESTEWQ EKHKELQKEY EILLQSYENV SNEAERIQHV VEAVRQEKQE LYGKLRSTEA NKKETEKQLQ EAEQEMEEMK EKMRKFAKSK QQKILELEEE NDRLRAEVHP AGDTAKECME TLLSSNASMK EELERVKMEY ETLSKKFQSL MSEKDSLSEE VQDLKHQIED NVSKQANLEA TEKHDNQTNV TEEGTQSIPG ETEEQDSLSM STRPTCSESV PSAKSANPAV SKDFSSHDEI NNYLQQIDQL KERIAGLEEE KQKNKEFSQT LENEKNTLLS QISTKDGELK MLQEEVTKMN LLNQQIQEEL SRVTKLKETA EEEKDDLEER LMNQLAELNG SIGNYCQDVT DAQIKNELLE SEMKNLKKCV SELEEEKQQL VKEKTKVESE IRKEYLEKIQ GAQKEPGNKS HAKELQELLK EKQQEVKQLQ KDCIRYQEKI SALERTVKAL EFVQTESQKD LEITKENLAQ AVEHRKKAQA ELASFKVLLD DTQSEAARVL ADNLKLKKEL QSNKESVKSQ MKQKDEDLER RLEQAEEKHL KEKKNMQEKL DALRREKVHL EETIGEIQVT LNKKDKEVQQ LQENLDSTVT QLAAFTKSMS SLQDDRDRVI DEAKKWERKF SDAIQSKEEE IRLKEDNCSV LKDQLRQMSI HMEELKINIS RLEHDKQIWE SKAQTEVQLQ QKVCDTLQGE NKELLSQLEE TRHLYHSSQN ELAKLESELK SLKDQLTDLS NSLEKCKEQK GNLEGIIRQQ EADIQNSKFS YEQLETDLQA SRELTSRLHE EINMKEQKII SLLSGKEEAI QVAIAELRQQ HDKEIKELEN LLSQEEEENI VLEEENKKAV DKTNQLMETL KTIKKENIQQ KAQLDSFVKS MSSLQNDRDR IVGDYQQLEE RHLSIILEKD QLIQEAAAEN NKLKEEIRGL RSHMDDLNSE NAKLDAELIQ YREDLNQVIT IKDSQQKQLL EVQLQQNKEL ENKYAKLEEK LKESEEANED LRRSFNALQE EKQDLSKEIE SLKVSISQLT RQVTALQEEG TLGLYHAQLK VKEEEVHRLS ALFSSSQKRI AELEEELVCV QKEAAKKVGE IEDKLKKELK HLHHDAGIMR NETETAEERV AELARDLVEM EQKLLMVTKE NKGLTAQIQS FGRSMSSLQN SRDHANEELD ELKRKYDASL KELAQLKEQG LLNRERDALL SETAFSMNST EENSLSHLEK LNQQLLSKDE QLLHLSSQLE DSYNQVQSFS KAMASLQNER DHLWNELEKF RKSEEGKQRS AAQPSTSPAE VQSLKKAMSS LQNDRDRLLK ELKNLQQQYL QINQEITELH PLKAQLQEYQ DKTKAFQIMQ EELRQENLSW QHELHQLRME KSSWEIHERR MKEQYLMAIS DKDQQLSHLQ NLIRELRSSS SQTQPLKVQY QRQASPETSA SPDGSQNLVY ETELLRTQLN DSLKEIHQKE LRIQQLNSNF SQLLEEKNTL SIQLCDTSQS LRENQQHYGD LLNHCAVLEK QVQELQAVSK EKGPLNIDVA PGAPQEKNGV HRKSDPEELR EPQQSFSEAQ QQLCNTRQEV NELRKLLEEE RDQRVAAENA LSVAEEQIRR LEHSEWDSSR TPIIGSCGTQ EQALLIDLTS NSCRRTRSGV GWKRVLRSLC HSRTRVPLLA AIYFLMIHVL LILCFTGHL* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
speed | 0.63 s | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||